Роль длинных некодирующих РНК CCAT1 и SNHG14 в активации ряда белок-кодирующих генов, связанных с развитием рака яичников

Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2021. Т. 172. № 12. С. 764–768.

Бровкина О. И., Пронина И. В., Бурденный А. М., Урошлев Л. А., Филиппова Е. А., Фридман М. В., Казубская Т. П., Жорданиа К. И., Логинов В. И., Кушлинский Н. Е., Брага Э. А.

Поздняя диагностика рака яичников представляет одну из важнейших проблем в его лечении. Длинные некодирующие РНК (днРНК) мало изучены, но перспективны в качестве диагностических биомаркеров. Изучали интерактом днРНК для выявления биомаркеров с потенциальной значимостью для молекулярной диагностики рака яичников. С помощью скрининга базы данных TCGA выявили дифференциально экспрессируемые днРНК CCAT1 и SNHG14. На основании показателей комплементарности CCAT1 и SNHG14 последовательностям мРНК были выбраны 5 белок-кодирующих генов: MAPK1 , с-MET , TGFB2 , SNAIL1 , WNT4 , которые связаны с эпителиально-мезенхимальным переходом. Методом ПЦР в реальном времени в 54 образцах рака яичника подтверждена высокая экспрессия CCAT1 и SNHG14 (logFC>1.5, p <0.05). Установлена положительная корреляция между уровнями экспрессии двух днРНК и мРНК пяти генов эпителиально-мезенхимального перехода в шести парах. Активирующее влияние CCAT1 и SNHG14 на экспрессию этих генов может реализовываться при посредничестве miR-203 и miR-124.

Ключевые слова: микроРНК, биомаркеры, biomarkers, эпителиально-мезенхимальная трансформация, Ovarian cancer, рак яичников, epithelial-mesenchymal transition, long non-coding RNA, длинные некодирующие РНК