• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • HSE University
  • Publications
  • Book chapter
  • Разработка тест-системы для мониторинга минимальной остаточной болезни с использованием высокопроизводительного секвенирования
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Priority areas
  • business informatics
  • economics
  • engineering science
  • humanitarian
  • IT and mathematics
  • law
  • management
  • mathematics
  • sociology
  • state and public administration
by year
  • 2028
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • More
Subject
News
October 1, 2026
HSE Researchers Show How Congenital Motor Disorders Affect Brain Development
Researchers from HSE University’s Institute for Cognitive Neuroscience have synthesised the findings of their previous studies on brain development in children with obstetric brachial plexus palsy and arthrogryposis. Their analysis shows that impaired motor function in early childhood not only limits children’s motor experience but also affects memory, categorical thinking, and information processing. The study has been published in Frontiers in Psychology.
October 1, 2026
Window into the Body: Scientists Develop Neural Network to Detect Risk of 15 Diseases from Retinal Images
Russian universities, with the participation of HSE University, Sber, and Z-union, have developed a neural network that can simultaneously assess the risk of 15 types of pathology from retinal photographs, including not only eye diseases but also cardiovascular conditions. The AI system can help clinicians detect potentially concerning changes at an early stage, identify signs reflecting the condition of retinal blood vessels, and determine whether a patient may need further examination. The paper has been published in Frontiers in Medicine.
September 30, 2026
'We Did Not Limit the Time for Questions'
The International Laboratory for Supercomputer Atomistic Modelling and Multi-Scale Analysis at HSE University held a major conference on molecular dynamics. Participants had the opportunity to attend all the presentations, while speakers were given as much time as they needed to answer questions. The HSE News Service interviewed Grigory Smirnov, Head of the Laboratory, and Genri Norman, Chief Research Fellow, about the conference preparations and the discussions it generated.

 

Have you spotted a typo?
Highlight it, click Ctrl+Enter and send us a message. Thank you for your help!

Publications
  • Books
  • Articles
  • Chapters of books
  • Working papers
  • Report a publication
  • Research at HSE

?

Разработка тест-системы для мониторинга минимальной остаточной болезни с использованием высокопроизводительного секвенирования

.
Минервина А. А., Комков А. Ю., Nazarov V. I., Звягин И. В., Мамедов И. З., Лебедев Ю. Б.
Language: Russian
Keywords: биоинформатика

In book

XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии"
ИБХ РАН, 2016.
Similar publications
Multimodal graph, surface, and language-based model for protein protein interaction prediction
Arteaga Moreano B. D., Chervov N., Poptsova M., Scientific Reports 2026 Vol. 16 No. 1 Article 4772
Accurate prediction of protein-protein interactions (PPIs) is fundamental to understanding biological processes and disease mechanisms. While deep learning offers a powerful alternative to costly experimental methods, existing approaches often overlook critical protein-surface information and rely on simplistic feature fusion techniques, thereby limiting performance. To address this, we introduce GSMFormer-PPI, a novel multimodal framework that integrates ...
Added: February 4, 2026
Transcriptomic Maps of Colorectal Liver Metastasis: Machine Learning of Gene Activation Patterns and Epigenetic Trajectories in Support of Precision Medicine
KUDRYAVTSEVA A., Cancers 2023
Liver metastasis is a significant factor contributing to mortality associated with colorectal cancer. Establishing the biological mechanisms of metastasis is crucial for refining diagnostics and identifying therapeutic windows for interventions. Currently, little is known of the processes that govern the development of liver metastases, the role of the tumor microenvironment, the role of epigenetics, and ...
Added: July 1, 2025
Новая эра биоинформатики
Аксенова А. Ю., Жук А. С., Степченкова Е. И. et al., Экологическая генетика 2025 Т. 23 № 2 С. 1–14
Биоинформатика — это быстро развивающаяся дисциплина на стыке биологии, информатики и математики. Научно-технический прогресс в области биологических и биомедицинских наук за последние годы привел к стремительному росту объемов данных. Для анализа и интерпретации больших данных нужны мощные вычислительные инструменты и специалисты с глубокими знаниями в различных областях, включая молекулярную биологию, генетику, программирование и математику. В ...
Added: May 20, 2025
Identification of key genes of the ccRCC subtype with poor prognosis
Grigory Andreevich Puzanov, Scientific Reports 2022 Vol. 12 No. 1 Article 14588
Clear cell renal carcinoma has been reported in many research studies as a rather heterogeneous disease. Identification of different subtypes and their molecular characteristics can help in choosing a more effective treatment and predicting a response to it. In this study, using multi-omics clustering of RNA-Seq data of patients with clear cell renal carcinoma from ...
Added: September 23, 2022
Proceedings of 10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB'21
M.: IITP RAS, 2021.
10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB'21 ISBN 978-5-901158-32-6 ...
Added: September 10, 2021
ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21
Bukley G., St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021.
Bioinformatics Institute 2020/21. Project abstracts. Bioinformatics Summer School 2021. Abstracts. ...
Added: August 14, 2021
AGE-RELATED CHANGES IN METHYLATION PATTERNS AT SITES OF ACTIVE HUMAN DNA REPLICATION
Konstantinovskiy N., Kirillova E., Cherniatchik R., , in: ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21.: St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021. P. 59–60.
Added: August 9, 2021
IMPROVE CASUAL GENE PRIORITIZATION BY PATIENT,S PHENOTYPE. IDENTIFICATION AND PARSING OF RELEVANT MENDELIAN DISEASE ARTICLES
Konstantinovskiy N., Smirnov D., Holger P., , in: ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21.: St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021. P. 24–24.
Added: August 9, 2021
ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21
St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021.
Bioinformatics Institute 2020/21. Project abstracts. Bioinformatics Summer School 2021. Abstracts. ...
Added: August 9, 2021
Сборник трудов конференции "Информационные Технологии и Системы (ИТиС) 2015"
ИППИ РАН, 2015.
Издание соддержит труды ежегоднной конференции молодых ученых и специалистов «Информационные технологии и системы» (ИТиС'15), традиционно организуемой Советом молодых ученых и специалистов ИППИ РАН. Основная цель Конференции ИТиС’15 - дать возможность молодым ученым и специалистам различных подразделений ИППИ РАН, а также студентам, аспирантам и молодым ученым других институтов РАН, от траслевых институтов, и университетов и вузов, ...
Added: January 29, 2018
Большие данные в биоинформатике
Назипова Н. Н., Isaev E., Kornilov V. et al., Математическая биология и биоинформатика 2017 Т. 12 № 1 С. 102–119
Секвенирование человеческого генома началось в 1994 году. Понадобилось 10 лет работы многих научных коллективов для того, чтобы получить черновую последовательность ДНК человека. Современные технологии секвенирования позволяют получать геном конкретного человека за несколько дней. Обсуждаются успехи современной биоинформатики, связанные с появлением высокопроизводительных платформ секвенирования, которые не только способствовали расширению возможностей различных направлений биологии и других смежных ...
Added: March 3, 2017
The utilization of information technology in biomedicine
Isaev E., Tarasov P., Journal of Physics: Conference Series 2017 Vol. 784 No. 012023 P. 1–5
Biomedicine is a branch of medicine that studies the human body, its structure and function in health and disease, pathological condition, methods of diagnosis, treatment and correction [1]. At the moment, to solve their diverse problems associated with the collection, storage, and data analysis, process modeling, biomedicine extensively uses modern technical equipment. The goal of ...
Added: February 3, 2017
Разработка системы для HLA-генотипирования человека с использованием высокопроизводительного секвенирования
Комеч Е. А., Звягин И. В., Nazarov V. I. et al., В кн.: XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии".: ИБХ РАН, 2016.
Разработка системы для HLA-генотипирования человека с использованием высокопроизводительного секвенирования и биоинформатического анализа данных. ...
Added: June 14, 2016
XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии"
ИБХ РАН, 2016.
Сборник тезисов конференции. ...
Added: June 14, 2016
Reliability of immune receptor rearrangements as genetic markers for minimal residual disease monitoring
Nazarov V. I., Minervina A. A., Komkov A. Y. et al., Bone Marrow Transplantation 2016 Vol. 1 No. 3
Detection of minimal residual disease (MRD) is a powerful prognostic tool in many hematological malignancies including ALL.1 Several groups of markers are widely used to monitor the concentration of a malignant clone including the detection of 'clonal B-cell (BCR) or T-cell (TCR) gene receptor rearrangements2 in ALL. Identification of a clonal rearrangement specific for the ...
Added: June 14, 2016
Статистический вывод параметров селекции иммунных рецепторов с помощью алгоритма градиентного спуска с переменным шагом
Офицеров Е. П., Воеводская А. А., Nazarov V. I., В кн.: Новые информационные технологии в автоматизированных системах: материалы девятнадцатого научно-практического семинара.: М.: Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша РАН, 2016.
Иммунитет - сложнейшая система орга- низма человека. Технологии секвенирова- ния нового поколения позволили получать большие массивы данных Т-клеток и Б- клеток, реализующие самообучающуюся ветвь иммунитета - адаптивный иммунитет. В данной работе мы применяем метод гра- диентного спуска с переменным шагом для вывода параметров модели селекции - про- цесса, влияющего на появления и числен- ность клеток ...
Added: June 14, 2016
Потоковый ЕМ алгоритм для статистического вывода параметров модели генерации иммунных рецепторов
Nazarov V. I., В кн.: Новые информационные технологии в автоматизированных системах: материалы девятнадцатого научно-практического семинара.: М.: Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша РАН, 2016.
Технологии секвенирования нового поколе- ния открыли совершенно новые возможно- сти для анализа данных иммунных рецепто- ров, позволив анализировать данные боль- ших объемов. С улучшением технологий растут объемы данных, получаемых в лабо- раториях и медицинских центрах. Для их обработки и анализа необходимы эффек- тивные алгоритмы. В данной работе пред- ставлен алгоритм для статистического вы- вода параметров ...
Added: June 14, 2016
VDJtools: Unifying Post-analysis of T Cell Receptor Repertoires
Shugay M., Bagaev D., Turchaninova M. et al., PLoS Computational Biology 2015 Vol. 11 No. 11 P. e1004503
Despite the growing number of immune repertoire sequencing studies, the field still lacks software for analysis and comprehension of this high-dimensional data. Here we report VDJtools, a complementary software suite that solves a wide range of T cell receptor (TCR) repertoires post-analysis tasks, provides a detailed tabular output and publication-ready graphics, and is built on ...
Added: February 17, 2016
Efficient algorithm for computing the generation probability of an immune receptor nucleotide sequence
Nazarov V. I., Pogorelyy M. V., Zvyagin I. V. et al., , in: Abstract Book of the 4th European Congress of Immunology.: Вена: [б.и.], 2015. P. 435–435.
Added: September 13, 2015
  • About
  • About
  • Key Figures & Facts
  • Sustainability at HSE University
  • Faculties & Departments
  • International Partnerships
  • Faculty & Staff
  • HSE Buildings
  • HSE University for Persons with Disabilities
  • Public Enquiries
  • Studies
  • Admissions
  • Programme Catalogue
  • Undergraduate
  • Graduate
  • Exchange Programmes
  • Summer University
  • Summer Schools
  • Semester in Moscow
  • Business Internship
  • Research
  • International Laboratories
  • Research Centres
  • Research Projects
  • Monitoring Studies
  • Conferences & Seminars
  • Academic Jobs
  • Yasin (April) International Academic Conference on Economic and Social Development
  • Media & Resources
  • Publications by staff
  • HSE Journals
  • Publishing House
  • iq.hse.ru: commentary by HSE experts
  • Library
  • Economic & Social Data Archive
  • Video
  • HSE Repository of Socio-Economic Information
  • HSE1993–2026
  • Contacts
  • Copyright
  • Privacy Policy
  • Site Map
Edit