?
Статистический вывод параметров селекции иммунных рецепторов с помощью алгоритма градиентного спуска с переменным шагом
.
Офицеров Е. П., Воеводская А. А., Nazarov V. I.
Language:
Russian
Keywords: биоинформатика
In book
М.: Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша РАН, 2016.
Arteaga Moreano B. D., Chervov N., Poptsova M., Scientific Reports 2026 Vol. 16 No. 1 Article 4772
Accurate prediction of protein-protein interactions (PPIs) is fundamental to understanding biological processes and disease mechanisms. While deep learning offers a powerful alternative to costly experimental methods, existing approaches often overlook critical protein-surface information and rely on simplistic feature fusion techniques, thereby limiting performance. To address this, we introduce GSMFormer-PPI, a novel multimodal framework that integrates ...
Added: February 4, 2026
KUDRYAVTSEVA A., Cancers 2023
Liver metastasis is a significant factor contributing to mortality associated with colorectal cancer. Establishing the biological mechanisms of metastasis is crucial for refining diagnostics and identifying therapeutic windows for interventions. Currently, little is known of the processes that govern the development of liver metastases, the role of the tumor microenvironment, the role of epigenetics, and ...
Added: July 1, 2025
Аксенова А. Ю., Жук А. С., Степченкова Е. И. et al., Экологическая генетика 2025 Т. 23 № 2 С. 1–14
Биоинформатика — это быстро развивающаяся дисциплина на стыке биологии, информатики и математики. Научно-технический прогресс в области биологических и биомедицинских наук за последние годы привел к стремительному росту объемов данных. Для анализа и интерпретации больших данных нужны мощные вычислительные инструменты и специалисты с глубокими знаниями в различных областях, включая молекулярную биологию, генетику, программирование и математику. В ...
Added: May 20, 2025
Grigory Andreevich Puzanov, Scientific Reports 2022 Vol. 12 No. 1 Article 14588
Clear cell renal carcinoma has been reported in many research studies as a rather heterogeneous disease. Identification of different subtypes and their molecular characteristics can help in choosing a more effective treatment and predicting a response to it. In this study, using multi-omics clustering of RNA-Seq data of patients with clear cell renal carcinoma from ...
Added: September 23, 2022
M.: IITP RAS, 2021.
10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB'21
ISBN 978-5-901158-32-6 ...
Added: September 10, 2021
Bukley G., St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021.
Bioinformatics Institute 2020/21. Project abstracts. Bioinformatics Summer School 2021. Abstracts. ...
Added: August 14, 2021
Konstantinovskiy N., Kirillova E., Cherniatchik R., , in: ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21.: St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021. P. 59–60.
Added: August 9, 2021
Konstantinovskiy N., Smirnov D., Holger P., , in: ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21.: St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021. P. 24–24.
Added: August 9, 2021
St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021.
Bioinformatics Institute 2020/21. Project abstracts. Bioinformatics Summer School 2021. Abstracts. ...
Added: August 9, 2021
ИППИ РАН, 2015.
Издание соддержит труды ежегоднной конференции молодых ученых и специалистов «Информационные технологии и системы» (ИТиС'15), традиционно организуемой Советом молодых ученых и специалистов ИППИ РАН. Основная цель Конференции ИТиС’15 - дать возможность молодым ученым и специалистам различных подразделений ИППИ РАН, а также студентам, аспирантам и молодым ученым других институтов РАН, от траслевых институтов, и университетов и вузов, ...
Added: January 29, 2018
Назипова Н. Н., Isaev E., Kornilov V. et al., Математическая биология и биоинформатика 2017 Т. 12 № 1 С. 102–119
Секвенирование человеческого генома началось в 1994 году. Понадобилось 10 лет работы многих научных коллективов для того, чтобы получить черновую последовательность ДНК человека. Современные технологии секвенирования позволяют получать геном конкретного человека за несколько дней. Обсуждаются успехи современной биоинформатики, связанные с появлением высокопроизводительных платформ секвенирования, которые не только способствовали расширению возможностей различных направлений биологии и других смежных ...
Added: March 3, 2017
Isaev E., Tarasov P., Journal of Physics: Conference Series 2017 Vol. 784 No. 012023 P. 1–5
Biomedicine is a branch of medicine that studies the human body, its structure and function in health and disease, pathological condition, methods of diagnosis, treatment and correction [1]. At the moment, to solve their diverse problems associated with the collection, storage, and data analysis, process modeling, biomedicine extensively uses modern technical equipment. The goal of ...
Added: February 3, 2017
Минервина А. А., Комков А. Ю., Nazarov V. I. et al., В кн.: XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии".: ИБХ РАН, 2016.
Разработка тест-системы для мониторинга минимальной остаточной болезни с использованием высокопроизводительного секвенирования и биоинформатического анализа данных. ...
Added: June 14, 2016
Комеч Е. А., Звягин И. В., Nazarov V. I. et al., В кн.: XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии".: ИБХ РАН, 2016.
Разработка системы для HLA-генотипирования человека с использованием высокопроизводительного секвенирования и биоинформатического анализа данных. ...
Added: June 14, 2016
ИБХ РАН, 2016.
Сборник тезисов конференции. ...
Added: June 14, 2016
Nazarov V. I., Minervina A. A., Komkov A. Y. et al., Bone Marrow Transplantation 2016 Vol. 1 No. 3
Detection of minimal residual disease (MRD) is a powerful prognostic tool in many hematological malignancies including ALL.1 Several groups of markers are widely used to monitor the concentration of a malignant clone including the detection of 'clonal B-cell (BCR) or T-cell (TCR) gene receptor rearrangements2 in ALL. Identification of a clonal rearrangement specific for the ...
Added: June 14, 2016
Nazarov V. I., В кн.: Новые информационные технологии в автоматизированных системах: материалы девятнадцатого научно-практического семинара.: М.: Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша РАН, 2016.
Технологии секвенирования нового поколе- ния открыли совершенно новые возможно- сти для анализа данных иммунных рецепто- ров, позволив анализировать данные боль- ших объемов. С улучшением технологий растут объемы данных, получаемых в лабо- раториях и медицинских центрах. Для их обработки и анализа необходимы эффек- тивные алгоритмы. В данной работе пред- ставлен алгоритм для статистического вы- вода параметров ...
Added: June 14, 2016
Shugay M., Bagaev D., Turchaninova M. et al., PLoS Computational Biology 2015 Vol. 11 No. 11 P. e1004503
Despite the growing number of immune repertoire sequencing studies, the field still lacks software for analysis and comprehension of this high-dimensional data. Here we report VDJtools, a complementary software suite that solves a wide range of T cell receptor (TCR) repertoires post-analysis tasks, provides a detailed tabular output and publication-ready graphics, and is built on ...
Added: February 17, 2016
Nazarov V. I., Pogorelyy M. V., Zvyagin I. V. et al., , in: Abstract Book of the 4th European Congress of Immunology.: Вена: [б.и.], 2015. P. 435–435.
Added: September 13, 2015