?
XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии"
-, 2016.
Under the general editorship: Т. В. Овчинникова, Л. И. Петрова
Compiler: Н. А. Потапенко, Е. А. Стукачева
Chapters
Комеч Е. А., Звягин И. В., Nazarov V. I. et al., В кн.: XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии".: ИБХ РАН, 2016.
Разработка системы для HLA-генотипирования человека с использованием высокопроизводительного секвенирования и биоинформатического анализа данных. ...
Added: June 14, 2016
Минервина А. А., Комков А. Ю., Nazarov V. I. et al., В кн.: XXVIII Зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии".: ИБХ РАН, 2016.
Разработка тест-системы для мониторинга минимальной остаточной болезни с использованием высокопроизводительного секвенирования и биоинформатического анализа данных. ...
Added: June 14, 2016
Priority areas:
IT and mathematics
Language:
Russian
Keywords: биоинформатика
Gorbunov A. A., Анатольевич И. Е., Приборы и системы. Управление, контроль, диагностика 2026 № 1 С. 42–46
В статье рассматриваются современные тенденции в развитии дата-центров, специализирующихся на обработке биоинформатических и
биомедицинских данных. Особое внимание уделено применению искусственного интеллекта для оптимизации работы дата-центров и анализа больших объемов биологических данных. Представлен обзор современных технологий и архитектурных решений, позволяющих обрабатывать растущие объемы данных в области биоинформатики и биомедицины. Обсуждаются перспективы развития специализированных
дата-центров в контексте экспоненциального роста ...
Added: October 12, 2026
Gorbunov A. A., ГРИГОРЬЕВ А. А., ДЕМИДОВ Л. Н. et al., Приборы и системы. Управление, контроль, диагностика 2025 № 7 С. 20–24
Быстрое развитие технологии квантовых вычислений потенциально может произвести революцию в сложных вычислениях в
физических, химических и биологических областях за счет использования квантовой суперпозиции и запутанности. Квантовые компьютеры используют кубиты, способные существовать в нескольких состояниях одновременно, в отличие от классических битов.
Эта функция позволяет хранить и обрабатывать больше информации, что дает значительное преимущество при решении задач с
обширным пространством ...
Added: October 12, 2026
Teregulov T., Loubenets E. R., / Series Quantum Physics "arXiv". 2026. No. 2609.31472.
We develop a new three-party quantum secret-sharing (QSS) protocol based on a three-qubit W state. This protocol encodes the secret-sequence bits using X gates and employs randomly selected Hadamard operations and measurement bases to generate information and security-test rounds. We evaluate the efficiency of the proposed protocol and analyze its security against an internal adversary ...
Added: September 28, 2026
Shabanov N., Kuricheva O., Kurbatova J. et al., / Series Working Papers SSRN "Department of Economics Ca’ Foscari University of Venice". 2026.
The carbon balance of an ecosystem is the difference between Gross Primary Productivity (GPP) and Ecosystem Respiration (Reco) as expressed by Net Ecosystem Exchange (NEE). While remote sensing retrievals of GPP have reached maturity, Reco estimation remains underexplored and ultimately cast bias on NEE. Here we present an end-to-end multi-scale analysis of the mechanism of ...
Added: August 21, 2026
Ponomarenko A., / Series Computer Science "arxiv.org". 2025.
This paper addresses the challenge of merging hierarchical navigable small world (HNSW) graphs, a critical operation for distributed systems, incremental indexing, and database compaction. We propose three algorithms for this task: Naive Graph Merge (NGM), Intra Graph Traversal Merge (IGTM), and Cross Graph Traversal Merge (CGTM). These algorithms differ in their approach to vertex selection ...
Added: July 30, 2026
Piontkovski D., / Series arXiv "math". 2026.
A noncommutative projective variety is defined, following Artin and Zhang, by a graded coherent algebra 𝐴. The category of coherent sheaves is then the quotient qgr(𝐴) of the category of finitely presented graded modules by the subcategory of torsion modules. We consider the categorical and polynomial entropies of the Serre twist, that is, of the ...
Added: June 23, 2026
Piontkovski D., / Series arXiv "math". 2025.
If a symmetric multilinear algebra is weakly nil, then it is Engel. This result may be regarded as an infinite-dimensional analogue of the well-known Jacobian theorem, which states that if a polynomial mapping has a polynomial inverse, then its Jacobian matrix is invertible. This refines a theorem of Gerstenhaber and partially answers a question posed ...
Added: June 23, 2026
Shipilov F., Barnyakov A., Ivanov A. et al., / Series Physics "arxiv.org". 2026.
A fast simulation of the detector response is a vital task in high-energy physics (HEP). Traditional Monte-Carlo methods form the backbone of modern particle physics simulation software but are computationally expensive. We present a machine-learning-based approach to fast simulation of the Focusing Aerogel Ring Imaging Cherenkov (FARICH) detector response. Given a particle track and momentum, ...
Added: May 19, 2026
Derkacheva A., Sakirkina M., Kraev G. et al., /. 2026.
Comprehensive data on natural hazards and their consequences are crucial for effective for risk assessment, adaptation planning, and emergency response. However, many countries face challenges with fragmented, inconsistent, and inaccessible data, particularly regarding local-scale events. To address this data gap in Russia, we developed an end-to-end processing pipeline that scrapes news from various online sources, ...
Added: April 28, 2026
Pilé I., Deng Y., Shchur L., / Series arXiv "math". 2026. No. 2604.10254.
We investigate the spatial overlap of successive spin configurations in Markov chain Monte Carlo simulations using the local Metropolis algorithm and the Svendsen-Wang and Wolff cluster algorithms. We examine the dynamics of these algorithms for two models in different universality classes: the Ising model and the Potts model with three components. The overlap of two ...
Added: April 20, 2026
Gabdullin N., Androsov I., / Series Computer Science "arxiv.org". 2026.
Label prediction in neural networks (NNs) has O(n) complexity proportional to the number of classes. This holds true for classification using fully connected layers and cosine similarity with some set of class prototypes. In this paper we show that if NN latent space (LS) geometry is known and possesses specific properties, label prediction complexity can ...
Added: April 2, 2026
Arteaga Moreano B. D., Chervov N., Poptsova M., Scientific Reports 2026 Vol. 16 No. 1 Article 4772
Accurate prediction of protein-protein interactions (PPIs) is fundamental to understanding biological processes and disease mechanisms. While deep learning offers a powerful alternative to costly experimental methods, existing approaches often overlook critical protein-surface information and rely on simplistic feature fusion techniques, thereby limiting performance. To address this, we introduce GSMFormer-PPI, a novel multimodal framework that integrates ...
Added: February 4, 2026
Sorokin K., Beketov M., Онучин А. et al., / arxiv.org. Серия cs.SI "Social and Information Networks ". 2025.
Community detection in complex networks is a fundamental problem, open to new approaches in various scientific settings. We introduce a novel community detection method, based on Ricci flow on graphs. Our technique iteratively updates edge weights (their metric lengths) according to their (combinatorial) Foster version of Ricci curvature computed from effective resistance distance between the ...
Added: January 15, 2026
Petrovanov I., Sergeev A., / Series Computer Science "arxiv.org". 2025. No. 2512.18332.
Transport coding reduces message delay in packet-switched networks by introducing controlled redundancy at the transport layer: original packets are encoded into coded packets, and the message is reconstructed after the first successful deliveries, effectively shifting latency from the maximum packet delay to the -th order statistic. We present a concise, reproducible discrete-event implementation of transport coding in OMNeT++, including ...
Added: December 24, 2025
KUDRYAVTSEVA A., Cancers 2023
Liver metastasis is a significant factor contributing to mortality associated with colorectal cancer. Establishing the biological mechanisms of metastasis is crucial for refining diagnostics and identifying therapeutic windows for interventions. Currently, little is known of the processes that govern the development of liver metastases, the role of the tumor microenvironment, the role of epigenetics, and ...
Added: July 1, 2025
Аксенова А. Ю., Жук А. С., Степченкова Е. И. et al., Экологическая генетика 2025 Т. 23 № 2 С. 1–14
Биоинформатика — это быстро развивающаяся дисциплина на стыке биологии, информатики и математики. Научно-технический прогресс в области биологических и биомедицинских наук за последние годы привел к стремительному росту объемов данных. Для анализа и интерпретации больших данных нужны мощные вычислительные инструменты и специалисты с глубокими знаниями в различных областях, включая молекулярную биологию, генетику, программирование и математику. В ...
Added: May 20, 2025
Grigory Andreevich Puzanov, Scientific Reports 2022 Vol. 12 No. 1 Article 14588
Clear cell renal carcinoma has been reported in many research studies as a rather heterogeneous disease. Identification of different subtypes and their molecular characteristics can help in choosing a more effective treatment and predicting a response to it. In this study, using multi-omics clustering of RNA-Seq data of patients with clear cell renal carcinoma from ...
Added: September 23, 2022
M.: IITP RAS, 2021.
10th Moscow Conference on Computational Molecular Biology MCCMB'21
ISBN 978-5-901158-32-6 ...
Added: September 10, 2021
Bukley G., St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021.
Bioinformatics Institute 2020/21. Project abstracts. Bioinformatics Summer School 2021. Abstracts. ...
Added: August 14, 2021
Konstantinovskiy N., Kirillova E., Cherniatchik R., , in: ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21.: St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021. P. 59–60.
Added: August 9, 2021
Konstantinovskiy N., Smirnov D., Holger P., , in: ИНСТИТУТ БИОИНФОРМАТИКИ. СБОРНИК ТЕЗИСОВ 2020/21.: St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021. P. 24–24.
Added: August 9, 2021
St. Petersburg: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого", 2021.
Bioinformatics Institute 2020/21. Project abstracts. Bioinformatics Summer School 2021. Abstracts. ...
Added: August 9, 2021
ИППИ РАН, 2015.
Издание соддержит труды ежегоднной конференции молодых ученых и специалистов «Информационные технологии и системы» (ИТиС'15), традиционно организуемой Советом молодых ученых и специалистов ИППИ РАН. Основная цель Конференции ИТиС’15 - дать возможность молодым ученым и специалистам различных подразделений ИППИ РАН, а также студентам, аспирантам и молодым ученым других институтов РАН, от траслевых институтов, и университетов и вузов, ...
Added: January 29, 2018
Назипова Н. Н., Isaev E., Kornilov V. et al., Математическая биология и биоинформатика 2017 Т. 12 № 1 С. 102–119
Секвенирование человеческого генома началось в 1994 году. Понадобилось 10 лет работы многих научных коллективов для того, чтобы получить черновую последовательность ДНК человека. Современные технологии секвенирования позволяют получать геном конкретного человека за несколько дней. Обсуждаются успехи современной биоинформатики, связанные с появлением высокопроизводительных платформ секвенирования, которые не только способствовали расширению возможностей различных направлений биологии и других смежных ...
Added: March 3, 2017