?
HEDGE: Highly accurate GPU-powered protein-protein docking pipeline
P. 1–1.
В книге
Novosibirsk: Институт вычислительной математики и математической геофизики Сибирского отделения РАН, 2018.
Khnkoian G., Галигеров В. С., Grishichkin Y. и др., , in: Parallel Computational Technologies, 19th International Conference, PCT 2025, Moscow, Russia, April 8–10, 2025, Revised Selected Papers. (CCIS, volume 2891)Vol. 2891.: Springer, 2026. P. 532–545.
Добавлено: 19 мая 2026 г.
M.: Max press, 2025.
Добавлено: 12 сентября 2025 г.
Pavlov D., Галигеров В. С., Kolotinskii D. и др., International Journal of High Performance Computing Applications 2024 Vol. 38 No. 1 P. 34–49
Добавлено: 18 июля 2023 г.
Pugachev L., Umarov I., Popov V. и др., , in: Supercomputing: 8th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2022, Moscow, Russia, September 26–27, 2022, Revised Selected PapersVol. 13708.: Springer, 2022. P. 290–302.
Добавлено: 16 мая 2023 г.
Kolotinskii D., Alexei Timofeev, , in: Supercomputing: 8th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2022, Moscow, Russia, September 26–27, 2022, Revised Selected PapersVol. 13708.: Springer, 2022. P. 276–289.
Добавлено: 16 мая 2023 г.
Титов И. Ю., Stroylov V., Rusina P. V. и др., Russian Chemical Reviews 2021 Vol. 90 No. 7 P. 831–867
В обзоре представлены классификация и анализ применимости методов предварительного молекулярного моделирования для направленного органического, каталитического и биокаталитического синтеза. В качестве классификатора методов рассматриваются три основных подхода: моделирование координации лиганд–мишень при отсутствии информации как о мишени, так и о структуре полученного комплекса; вычисления на основе экспериментально полученной структурной информации о мишени; динамическое моделирование комплекса лиганд–мишень, а ...
Добавлено: 25 сентября 2021 г.
Аникин А. С., Большакова О. А., Гасников А. В. и др., Журнал вычислительной математики и математической физики 2019 Т. 59 № 12 С. 2060–2076
Большинство проблем структурной вычислительной биологии требуют решения задачи минимизации энергетической функции (силового поля), определенной на геометрии молекулы. Это позволяет определять свойства молекул, предсказывать правильное положение белковых цепей, находить лучшую состыковку молекул при предсказании комплексообразования (докинге), проверять гипотезы относительно белкового дизайна и решать многие другие задачи, возникающие при современной разработке лекарственных средств. В случае низкомолекулярных соединений ...
Добавлено: 24 сентября 2021 г.
Садовников А. В., Ermak T., Яковлев П. А., , in: Proceedings of the 26th Conference of Open Innovations Assosiation FRUCT.: IEEE, 2020. P. 646–651.
Добавлено: 24 сентября 2021 г.
Cadena L., Cadena F., Легалов А. И. и др., , in: Proceedings of The World Congress on Engineering and Computer Science 2018, 23-25 October, 2018. San Francisco, USAVol. 1.: Newswood Limited, 2018. P. 453–458.
Добавлено: 31 октября 2020 г.
Stroganov O., Novikov, FN, Medvedev, MG и др., Journal of Computer-Aided Molecular Design 2020 Vol. 34 No. 2 P. 121–130
The rapid development of new machine learning techniques led to significant progress in the area of computer-aided drug design. However, despite the enormous predictive power of new methods, they lack explainability and are often used as black boxes. The most important decisions in drug discovery are still made by human experts who rely on intuitions ...
Добавлено: 15 октября 2020 г.
Фомин Д. Б., Математические вопросы криптографии 2015 Vol. 6 No. 2 P. 99–108
Рассматриваются вопросы, связанные с реализацией на NVIDIA GPU блочного шифра типа XSL над конечным полем с MDS-матрицей линейного преобразования. Проводится сравнение полученных результатов с другими блочным шифрами ...
Добавлено: 4 мая 2019 г.
Фомин Д. Б., Математические вопросы криптографии 2016 Vol. 7 No. 2 P. 121–130
Предлагается атака на реализацию блочного шифра типа AES на процессорах CUDA, основанная на времени выполнения шифрования. Эксперименты показали, что можно найти секретный 128-битовый ключ AES по шифрованию 2^32 подобранных блоков открытого текста. Этот подход применим к AES с ключами других размеров и, более того, к любому блочному шифру, в котором линейное преобразование состоит из линейных преобразований двух типов, ...
Добавлено: 4 мая 2019 г.
Borovský M., Weigel M., Barash L.Yu. и др., EPJ Web of Conferences 2016 Vol. 108 P. 02016-p.1–02016-p.6
Добавлено: 31 января 2018 г.
Никольский В. П., Вечер В. С., Стегайлов В. В., , in: Supercomputing. RuSCDays 2016. Communications in Computer and Information Science. Revised Selected Papers.Vol. 687.: Springer, 2016. P. 199–211.
In this paper we consider the efficiency of hybrid systemson-a-chip for high-performance calculations. Firstly, we build Roofline performance models for the systems considered using Empirical Roofline Toolkit and compare the results with the theoretical estimates. Secondly, we use LAMMPS as an example of the molecular dynamic package to demonstrate its performance and efficiency in various ...
Добавлено: 31 мая 2017 г.
Гостев И. М., Sibirtseva E. A., RUDN Journal of Mathematics, Information Sciences and Physics 2014 No. 4 P. 68–84
В нынешнее время бюджетные системы слежения за взглядом пользуются большим спросом в связи с широким сектором их применения, как в промышленности, так и в персональном использовании. Как правило, для наблюдения за взглядом человека необ- ходимы дополнительные устройства (например, носимые на голове камеры), однако в данном исследовании отслеживание взгляда происходит в реальном времени и основано на ...
Добавлено: 7 декабря 2014 г.