• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • Метод быстрого множественного попарного выравнивания на основе префиксных деревьев
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2028
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
18 сентября 2026 г.
«Время на содержательные вопросы у нас не лимитировалось»
Международная лаборатория атомистического суперкомпьютерного моделирования и многомасштабного анализа НИУ ВШЭ провела масштабную конференцию «Молекулярная динамика». Участники могли услышать всех докладчиков, а сами докладчики — ответить на любое количество содержательных вопросов. О подготовке конференции и дискуссиях «Вышка.Главное» поговорила с заведующим лабораторией Григорием Смирновым и ее главным научным сотрудником Генри Норманом.
18 сентября 2026 г.
Ученые ВШЭ займутся изучением очарованных адронов в рамках BESIII
Высшая школа экономики стала университетом — участником международной коллаборации BESIII (Beijing Spectrometer III) в области физики высоких энергий. Присоединение к коллаборации стало первым практическим результатом реализации меморандума о сотрудничестве, подписанного в 2025 году между НИУ ВШЭ и Институтом физики высоких энергий (IHEP) в Пекине (КНР).
17 сентября 2026 г.
<a>НИУ ВШЭ представил в Китае исследование о безопасности нейросетей для анализа видео
Ученые Высшей школы экономики презентавали на международной конференции ChinaMM 2026 в Китае исследование о том, как искажения при передаче видео влияют на работу нейросетей. Авторы предложили новый способ проверять устойчивость таких моделей в условиях, близких к реальному использованию видеосервисов.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Метод быстрого множественного попарного выравнивания на основе префиксных деревьев

Доклады Академии наук. 2019. Т. 484. № 4. С. 401–404.
Яковлев П. А.

Представлен метод для эффективного сравнения символьной последовательности со всеми строками из некоторого множества, работающий существенно быстрее, чем наивный перебор сравнений со всеми строками подряд. Для ускорения процедуры предлагается оригинальный алгоритм, объединяющий использование префиксного дерева и стандартного алгоритма динамического программирования для поиска редакционного расстояния (метрики Левенштейна) между строками. Эффективность метода подтверждена в вычислительных экспериментах на массивах в десятки миллионов биологических последовательностей вариабельных доменов моноклональных антител.

Научное направление: Компьютерные науки Медицинские биотехнологии
Язык: русский
Полный текст
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: динамическое программированиебиоинфоматикастроковые алгоритмывыравнивание последовательностейпрефиксные структуры данных
Похожие публикации
Lecture Notes in Artificial Intelligence
Springer, 2026.
Добавлено: 20 сентября 2026 г.
Improving the Accuracy of Automatic Wildlife Detection in Nature Reserves Using Infrared Imaging
Aleksei Samarin, Alexander Savelev, Aleksei Toropov и др., Pattern Recognition and Image Analysis 2026 Vol. 36 No. 2 P. 323–334
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
IDAP++: Advancing Divergence-Aware Pruning with Joint Filter and Layer Optimization
Aleksei Samarin, Назаренко А. А., Kotenko E. и др., Proceedings of the ACM on Management of Data, USA 2026 Vol. 4 No. 1 P. 1–28
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Automated Feature Engineering-Based Approach for Micrococci Microscopic Image Classification and Taxonomic Characteristics Determination
Aleksei Samarin, Alexander Savelev, Aleksei Toropov и др., Pattern Recognition and Image Analysis 2025 Vol. 35 No. 2 P. 148–158
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Improvement in Microbial Classification Quality Using Synthetic Microscopic Images Generated by Large Visual-Language Models
Aleksei Samarin, Alexander Savelev, Aleksei Toropov и др., Pattern Recognition and Image Analysis 2026 Vol. 36 No. 2 P. 302–312
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Advances in Neural Computation, Machine Learning, and Cognitive Research IX
Springer, Cham, 2026.
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Proceedings of 18th International Conference on Machine Learning and Computing
Springer, Cham, 2026.
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Proceedings of the 35th Conference of Open Innovations Association FRUCT
FRUCT Oy, 2024.
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Proceedings of the 36th Conference of Open Innovations Association FRUCT
FRUCT Oy, 2024.
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Proceedings of the 37th Conference of Open Innovations Association FRUCT
FRUCT Oy, 2025.
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Proceedings of the 39th Conference of Open Innovations Association FRUCT
FRUCT Oy, 2026.
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Flow-Guided Neural Pruning: Signal-Flow Framework for Multi-Architecture Model Compression
Aleksei Samarin, Назаренко А. А., Kotenko E. и др., Machine Learning and Knowledge Extraction 2026 Vol. 8 No. 8 P. 1–26
Добавлено: 19 сентября 2026 г.
Dynamic Pattern Analysis: Method Overview and Trajectory Assessment of Object Development
Мячин А. Л., Procedia Computer Science 2026 Vol. 287 P. 193–200
Добавлено: 18 сентября 2026 г.
On the Efficiency of Bounded Multi-Source Shortest Path Algorithm
Громов Р. С., Нестеров Р.А., Proceedings of the Institute for System Programming of the RAS 2026 Vol. 38 No. 4 P. 23–44
В статье исследуются критерии эффективности новейшего алгоритма для решения задачи поиска кратчайших путей на графе из заданной вершины – BM-SSP. Алгоритм был опубликован в 2025 году и, как утверждают его создатели, асимптотически превосходит детерминированный алгоритм Дейкстры. Однако в публикации, посвященной этому алгоритму, был дан только теоретический асимптотический анализ времени выполнения, и не было приведено ни ...
Добавлено: 18 сентября 2026 г.
Робототехника и искусственный интеллект: международные практики и возможности для России, Дальнего Востока и Арктики
Кузнецов М. Е., Полякова М., Лукьянович В. и др., ФАНУ "Востокгосплан", 2026.
Обзор международных практик развития робототехники и искусственного интеллекта и оценка возможностей их применения в условиях России, в первую очередь для Дальнего Востока и Арктической зоны РФ ...
Добавлено: 16 сентября 2026 г.
Semi-fragile image watermarking: A comprehensive survey, classification, and research directions
Мельман А. С., Евсютин О. О., Computer Science Review 2027 Vol. 63 (A) Article 101066
Добавлено: 15 сентября 2026 г.
Автоматизированное формирование журналов событий на основе неструктурированных Интернет-источников для задач анализа процессов
Воронова К. Д., Лядова Л. Н., Proceedings of the Institute for System Programming of the RAS 2026 Vol. 38 No. 4 P. 153–170
Заголовок: Автоматизированное формирование журналов событий на основе неструктурированных Интернет-источников для задач анализа процессов. Аннотация: В статье представлен подход к автоматизированному структурированию информации о событиях, извлекаемой из неструктурированных текстовых Интернет-источников, для задач углублённого анализа процессов. Во многих практических случаях сведения о событиях, происходящих в рамках различных процессов, представлены не в виде готовых журналов событий, а распределены по новостным публикациям, отчётам ...
Добавлено: 14 сентября 2026 г.
Intelligent Decision Technologies. Proceedings of the 17th KES-IDT 2025 Conference
Springer, 2026.
Добавлено: 13 сентября 2026 г.
Интегральная оценка сценариев кибератак на АСУ ТП с применением цифрового двойника и киберполигона
Лебедев О. Б., Митяков Е. С., Саенко И. Б. и др., Информация и космос 2026 № 1 С. 53–58
В статье представлена методика интегральной оценки кибератак на автоматизированные системы управления технологическим процессом с использованием связки «киберполигон Ampire + цифровой двойник». Подход базируется на расчете пяти критериев (тяжесть, возможности нарушителя, уязвимость, сложность, эффективность защиты), формирующих интегральный индекс угрозы. Проверка на трех сценариях подтвердила устойчивость индекса и чувствительность к настройкам защиты. Результаты позволяют количественно ранжировать угрозы и ...
Добавлено: 13 сентября 2026 г.
Zero-Sum Continuous-Time Markov Games with One-Side Stopping
Авербух Ю. В., Journal of the Operations Research Society of China 2024 Vol. 12 P. 169–187
Добавлено: 20 октября 2023 г.
Построение алгоритмов поиска и устранения дефектов пассажирских воздушных судов гражданской авиации
Марон А. И., Марон М. А., Вестник Московского авиационного института 2022 Т. 29 № 2 С. 158–165
Актуальность исследования обусловлена тем, что уменьшение времени поиска и устранения дефектов пассажирских воздушных судов гражданской авиации позволяет существенно уменьшить задержки вылета и связанные с этим потери авиакомпаний. Как показывает статистика, потери растут экспоненциально с увеличением времени, затрачиваемого на ручной поиск и устранение дефекта, являющегося причиной неисправности, зафиксированной бортовыми системами контроля. Цель статьи заключается в том, ...
Добавлено: 30 сентября 2022 г.
Guaranteed Deterministic Approach to Superhedging: A Numerical Experiment
Андреев Н. А., Смирнов С. Н., Computational Mathematics and Modeling 2021 Vol. 32 P. 22–44
Добавлено: 30 сентября 2021 г.
Model of optimal producer’s behavior in the presence of random moments of receiving loans and investment
Поспелов И. Г., Жукова А. А., , in: 2020 European Control Conference (ECC).: Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2020. P. 1129–1134.
Добавлено: 8 декабря 2020 г.
Корректировка расписания движения на частично заблокированном сегменте железной дороги с разъездом
Zinder Y., Лазарев А. А., Мусатова Е. Г., Автоматика и телемеханика 2020 Т. 5 С. 91–104
Представлен полиномиальный алгоритм корректировки расписания движения поездов для случая, когда один из путей двухпутной железной дороги становится недоступным, оставшийся путь содержит разъезд, а все поезда делятся на две категории: приоритетные поезда, например пассажирские, и обычные поезда, к которым относятся большинство грузовых поездов. Представленный алгоритм минимизирует негативное влияние, оказываемое блокировкой пути, сначала для приоритетных поездов, а ...
Добавлено: 2 сентября 2020 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика обработки персональных данных
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору