• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • Secreted Isoform of Human Lynx1 (SLURP-2): Spatial Structure and Pharmacology of Interactions with Different Types of Acetylcholine Receptors
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
25 августа 2026 г.
Исследователи ВШЭ сравнили рекомендательные алгоритмы по правилам спортивного турнира
Исследователи Института искусственного интеллекта и цифровых наук ФКН НИУ ВШЭ разработали подход, который помогает эффективнее подбирать рекомендательные алгоритмы. В нем разные методы попарно соревнуются, а по результатам всех поединков составляется общий рейтинг. Это помогает сократить число алгоритмов, которые нужно проверять при разработке новых сервисов, и сэкономить денежные и временные ресурсы.Исследование было представлено на  32-й конференции ACM SIGKDD Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD 2026).
20 августа 2026 г.
<a>Исследователи НИУ ВШЭ и Сбера научили нейросети лучше угадывать предпочтения пользователей
Институт искусственного интеллекта и цифровых наук ФКН НИУ ВШЭ и Сбер представили новую архитектуру для рекомендательных систем: благодаря объединению двух классов моделей алгоритмы лучше угадывают интересы и потребности пользователей. Препринт работы опубликован на сайте arxiv.org и представлен на летнем фестивале «Урбан ML».
19 августа 2026 г.
Ученые ВШЭ разработали алгоритм, позволяющий производить более надежные процессоры для ЦОД
Ученые из МИЭМ ВШЭ и Самарского университета создали алгоритм LRF-3D для автоматического обхода неработающих узлов в трехмерных сетях на кристалле. Благодаря своей иерархической организации он превосходит аналоги по быстродействию и точности пути, повышая надежность процессоров для использования в ЦОД, суперкомпьютерах и ИИ-вычислениях. Исходные коды алгоритмов и тестов опубликованы в открытом доступе.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Secreted Isoform of Human Lynx1 (SLURP-2): Spatial Structure and Pharmacology of Interactions with Different Types of Acetylcholine Receptors

Scientific Reports. 2016. Vol. 6. No. 30698. P. 1–17.
Lyukmanova E. N., Shulepko M. A., Shenkarev Z. O., Bychkov M. L., Paramonov A. S., Chugunov A. O., Kulbatskii D. S., Arvaniti M., Dolejsi E., Schaer T., Arseniev A. S., Ефремов Р. Г., Thomsen M. S., Dolezal V., Bertrand D., Dolgikh D. A., Kirpichnikov M. P.

Human-secreted Ly-6/uPAR-related protein-2 (SLURP-2) regulates the growth and differentiation of epithelial cells. Previously, the auto/paracrine activity of SLURP-2 was considered to be mediated via its interaction with the α3β2 subtype of the nicotinic acetylcholine receptors (nAChRs). Here, we describe the structure and pharmacology of a recombinant analogue of SLURP-2. Nuclear magnetic resonance spectroscopy revealed a three-finger' fold of SLURP-2 with a conserved β-structural core and three protruding loops. Affinity purification using cortical extracts revealed that SLURP-2 could interact with the α3, α4, α5, α7, β2, and β4 nAChR subunits, revealing its broader pharmacological profile. SLURP-2 inhibits acetylcholine-evoked currents at α4β2 and α3β2-nAChRs (IC 50 ∼0.17 and >3 μM, respectively) expressed in Xenopus oocytes. In contrast, at α7-nAChRs, SLURP-2 significantly enhances acetylcholine-evoked currents at concentrations <1 μM but induces inhibition at higher concentrations. SLURP-2 allosterically interacts with human M1 and M3 muscarinic acetylcholine receptors (mAChRs) that are overexpressed in CHO cells. SLURP-2 was found to promote the proliferation of human oral keratinocytes via interactions with α3β2-nAChRs, while it inhibited cell growth via α7-nAChRs. SLURP-2/mAChRs interactions are also probably involved in the control of keratinocyte growth. Computer modeling revealed possible SLURP-2 binding to the classical' orthosteric agonist/antagonist binding sites at α7 and α3β2-nAChRs.

Язык: английский
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: nicotinic acetylcholine receptorникотиновый ацетилхолиновый рецепторcomputer modeling and simulationHuman-secreted Ly-6/uPAR-related protein-2 (SLURP-2)белок SLURP-2компьютерное молекулярное моделирование
Похожие публикации
Add-Ons To Molecular Modeling Methods: Improvement In Activity Prediction
Svitanko I. V., Novikov F. N., Medvedev M. G., , in: XXII Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry, October 7-12, 2024, Federal Territory “Sirius”, Russia. Book of abstracts in 7 volumesVol. 5.: “Admiral Print” LLC, 2024.
Надстройки к методам молекулярного моделирования, улучшающие точность прогнозирования активности ...
Добавлено: 14 октября 2024 г.
Molecular Dynamics Simulations of Nucleosomes Are Coming of Age
Fedulova A., Armeev G., Romanova T. и др., Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science 2024 Vol. 14 No. 4 Article e1728
Understanding the function of eukaryotic genomes, including the human genome, is undoubtedly one of the major scientific challenges of the 21st century. The cornerstone of eukaryotic genome organization is nucleosomes—elementary building blocks of chromatin about 10 nm in size that wrap DNA around an octamer of histone proteins. Nucleosomes are integral players in all genomic processes, ...
Добавлено: 29 августа 2024 г.
Imidazole-4-N-acetamide Derivatives as a Novel Scaffold for Selective Targeting of Cyclin Dependent Kinases
Rusina P., Gandalipov E., Abdyusheva Y. и др., Cancers 2023 Vol. 15 No. 15 Article 3766
Добавлено: 1 ноября 2023 г.
Proceedings of the Conference on Modeling and Analysis of Complex Systems and Processes 2021 (MACSPro 2021)
Aachen: CEUR Workshop Proceedings, 2022.
Добавлено: 6 февраля 2022 г.
Computational modeling and target synthesis of monomethoxy-substituted o-diphenylisoxazoles with unexpectedly high antimitotic microtubule destabilizing activity
Stroylov Viktor S., Свитанько И. В., Maksimenko A. и др., Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters 2020 Vol. 30 Article 127608
Добавлено: 24 декабря 2021 г.
Data transfer from satellite to ground station emulator
M. A. Bubnova, V. A. Baleskin, A. N. Kosinov и др., Journal of Physics: Conference Series 2021 Vol. 2134 Article 012026
Веб приложение «Передача данных со спутника на  наземную станциию» разработаное для моделирования передачи данных между малым космическим аппаратом на низкой околоземной орбите и управляющим центр на Земле. Приложение учитывает несколько параметров, позволяющих заменить количество экспериментов. Кроме того, модель SGP4 и модели с такими параметрами, как коэффициент битовых ошибок и ослабление интенсивности дождя изучаются и используются ...
Добавлено: 22 декабря 2021 г.
Biochemical basis of skin disease Mal de Meleda: SLURP-1 mutants differently affect keratinocyte proliferation and apoptosis
Shulepko M., Bychkov M., Shenkarev Z. и др., Journal of Investigative Dermatology 2021 P. 1–9
Добавлено: 18 мая 2021 г.
Proceedings of the 32nd European Modeling & Simulation Symposium (EMSS 2020)
Dime University of Genoa, 2020.
Добавлено: 27 сентября 2020 г.
Environmental and dynamic effects explain how nisin captures membrane-bound lipid II
Панина И. С., Крылов Н. А., Нольде Д. Е. и др., Scientific Reports 2020 Vol. 10 Article 8821
Добавлено: 1 июня 2020 г.
Dielectric-dependent strength of interlipid H-bonding in biomembranes: a model case study.
Ефремов Р. Г., Journal of Chemical Information and Modeling 2019 Vol. 59 No. 6 P. 2765–2775
Добавлено: 7 августа 2019 г.
Specific refolding pathway of viscumin A chain in membrane-like medium reveals a possible mechanism of toxin entry into cell.
Ефремов Р. Г., Нольде Д. Е., Волынский П. Е. и др., Scientific Reports 2019 Vol. 9 No. 413 P. 1–12
Добавлено: 6 февраля 2019 г.
Competitive Adsorption of H2O and CO2 in 2-Dimensional Nano-Confinement: GCMD Simulations of Cs- and Ca-Hectorite
Loganathan N., Bowers G. M., Yazaydin A. O. и др., Journal of Physical Chemistry C 2018 Vol. 122 No. 41 P. 23460–23469
The intercalation of H2O, CO2, and other fluid species in expandable clay minerals (smectites) may play a significant role in controlling the behavior of these species in geological C-sequestration and enhanced petroleum production and has been the subject of intensive study in recent years. This paper reports the results of a computational study of the ...
Добавлено: 20 октября 2018 г.
Clay swelling in dry supercritical carbon dioxide: Effects of interlayer cations on the structure, dynamics, and energetics of CO2 intercalation probed by XRD, NMR and GCMD simulations.
Loganathan N., Bowers G. M., Yazaydin A. O. и др., Journal of Physical Chemistry C 2018 Vol. 122 No. 8 P. 4391–4402
In situ XRD and NMR experiments combined with molecular dynamics simulations using the grand canonical ensemble (GCMD) show that cation size, charge and solvation energy play critical roles in determining the interlayer expansion of smectite clay minerals when exposed to dry supercritical CO2 under conditions relevant to the earth’s upper crust, petroleum reservoirs, and geological ...
Добавлено: 31 мая 2018 г.
Proceedings - 31th European Conference on Modelling and Simulation, ECMS 2017
[б.и.], 2017.
Добавлено: 27 октября 2017 г.
Structural Insight into Specificity of Interactions between Non-conventional Three-Finger Toxin WTX and Muscarinic Acetylcholine Receptors
Lyukmanova E., Shenkarev Z., Shulepko M. и др., Journal of biological chemistry 2015 Vol. 290 P. 23616–23630
Добавлено: 14 марта 2017 г.
Central loop of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is important for interaction with nicotinic acetylcholine receptors.
Lyukmanova E., Shulepko M., Shenkarev Z. и др., Toxicon 2016 Vol. 119 P. 274–279
Добавлено: 14 марта 2017 г.
Central loop of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is important for interaction with nicotinic acetylcholine receptors
Lyukmanova E. N., Shulepko M. A., Shenkarev Z. O. и др., Toxicon 2016 Vol. 119 No. September P. 274–279
Highlights   • Mutagenesis of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is performed. • Activity of WTX and its mutants on muscle-type and α7-type of nAChRs was studied. • R31 and R32 from the loop II is important for binding to both types of receptors. • Modeling revealed the loop II entering into the orthosteric site of the α7 nAChRs.   <hr /> Abstract ‘Three-finger’ toxin WTX from Naja kaouthia interacts with ...
Добавлено: 14 сентября 2016 г.
Enterprise and Organizational Modeling and Simulation. 11th International Workshop, EOMAS 2015, Held at CAiSE 2015, Stockholm, Sweden, June 8-9, 2015, Selected Papers
Springer, 2015.
This book constitutes the refereed proceedings of the 11th International Workshop on Enterprise and Organizational Modeling and Simulation, EOMAS 2015, held at CAiSE 2015, in June 2015 in Stockholm, Sweden. EOMAS was founded with the purpose to become a forum among researchers and practitioners to share their research and practical findings by encouraging the dissemination of research ...
Добавлено: 20 октября 2015 г.
Рациональное конструирование новых лигандов никотиновых рецепторов на основе альфа-конотоксина PnIA
Ефремов Р. Г., Кашеверов И. Е., Кудрявцев Д. С. и др., Доклады Академии наук 2015 Т. 461 № 4 С. 476–479
Настоящее исследование продолжает предыдущую работу и нацелено на создание более эффективного лиганда  α 7 нАХР на основе  α -конотоксина PnIA. На этот раз мы использовали разработанный в Институте биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН вычислительный метод “белковой топографии” (PST, protein surface topography) и впервые применили его для выбора нужных мутаций в конотоксинах. ...
Добавлено: 21 июля 2015 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика обработки персональных данных
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору