Specific refolding pathway of viscumin A chain in membrane-like medium reveals a possible mechanism of toxin entry into cell.

Публикации

?

Specific refolding pathway of viscumin A chain in membrane-like medium reveals a possible mechanism of toxin entry into cell.

Scientific Reports. 2019. Vol. 9. No. 413. P. 1–12.

Ефремов Р. Г., Нольде Д. Е., Волынский П. Е., Захарова Г. С., Palmer R., Тоневицкий А. Г.

Научное направление: Биология Физика Нанотехнологии

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Суперкомпьютерные технологии атомистического моделирования в науках о материалах и физике биомембран (2019)

Electrically driven Rabi dynamics of magnetic field induced corner states in a two-dimensional topological insulator

D.V. Khomitsky, Lavrukhina E. A., Krasavin D. P. и др., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 No. 22 Article 225414

Добавлено: 23 октября 2026 г.

Molecular mechanisms regulating differential expression of individual miRNAs within polycistronic clusters

Мальцева Д. В., Тоневицкий А. Г., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 P. 1–28

Добавлено: 23 октября 2026 г.

Intentionally versus spontaneously prolonged Gaze: A MEG study of active gaze-based interaction

Vasilyev A., Svirin EP, Dubynin I. и др., Cortex 2025 Vol. 189 P. 76–96

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Role of Bach1 Transcription Factor in the Mechanisms of Cell Death

Karina V. Klycheva, Mariia O. Silkina, Dmitry M. Hushpulian и др., Biochemistry. Biokhimiia 2026 Vol. 91 P. 1842–1858

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Десинхронизация сенсомоторных ритмов при совершении квазидвижений, основанных на естественных движениях пальцев руки

Свирин Е. П., Бердышев Д. А., Шишкин С. Л., Вестник Российского государственного медицинского университета 2026 № 3 С. 42–50

Квазидвижения (КД) — попытки движения, минимизированные до исчезновения движения, — вызывают ЭЭГ-паттерны, схожие с реальным движением. КД могут моделировать попытки движения у здоровых участников и потому представляют интерес как альтернатива представлению движений (ПД) для реабилитационных интерфейсов мозг–компьютер (ИМК), в которых попытка движения парализованной конечностью используется как управляющий сигнал. КД ранее исследовали на отведении большого пальца. ...

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Large amyloid plaques associate with early behavioral alterations in 6-month-old APPswe/PS1dE9 mice

Sitdikova K., Tsoy A., Chaprov K. и др., Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 2026 Article nlag078

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Effects of Wheat Malt Extract on Molecular and Behavioral Markers in Aged APP/PS1 and Wild-Type Mice

Kassenova A., Svirin E., Sitdikova K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2026 Vol. 27 No. 11 Article 4994

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Partial Serotonin Transporter Deficiency Modulates Plasma Metabolome, Arginine-Nitric Oxide Pathway and Emotional Behavior in Mice Exposed to Western Diet

Cespuglio R., Schmitt-Böhrer A., Deykin A. и др., Metabolites 2026 Vol. 16 No. 2 Article 117

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Stress tensor in fundamental measure theory of hard-sphere fluids: A thermomechanical approach

Будков Ю. А., Каликин Н. Н., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 165 No. 16 Article 164108

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Отсутствие отражения фонон-поляритона от края металлической маски на поверхности SiC

Ивченко В. С., Иевлева В. А., Матиенко Д. А. и др., Журнал технической физики 2026 № 9 С. 1738–1749

Задача о возбуждении бегущих фонон-поляритонных волн на поверхности полярного кристалла падающей извне световой волной (с частотой, близкой к частоте решеточных колебаний) решена теоретически только для бесконечной открытой поверхности кристалла. В случаях, когда часть поверхности покрыта металлической маской, препятствующей проникновению возбуждающего излучения к атомам среды, и эта маска имеет произвольную форму, общепризнанного решения неоднородной задачи нет. ...

Добавлено: 20 октября 2026 г.

Исследование движения сферического фронта клеток в вязком матриксе: роль клеточных делений и взаимодействия клеток с матриксом при развитии опухолей

Логвенков С. А., Известия РАН. Механика жидкости и газа 2026 № 3 С. 59–75

Решена задача об эволюции объемной концентрации клеток в сферическом агрегате, состоящем из клеток, внеклеточного матрикса и жидкости. Агрегат окружен внеклеточным матриксом. Постановка задачи использует разработанную автором ранее модель многофазной биологической сплошной среды, образованной двумя активно взаимодействующими твердыми фазами и жидкостью. Исследовано распространение сферического фронта клеток в вязком матриксе в результате деления клеток и активных взаимодействий клеток с ...

Добавлено: 20 октября 2026 г.

Electrically driven Rabi dynamics of magnetic field induced corner states in a two-dimensional topological insulator

Lavrukhina E. A., Krasavin D. P., Krishtopenko S. S. и др., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 No. 22 Article 225414

Добавлено: 19 октября 2026 г.

Mismatch Negativity as a Neural Correlate of Auditory Learning: Evidence From Implicit and Explicit Fine Frequency Discrimination Training

Левкович К. М., Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova 2026 Vol. 76 No. 5 P. 587–598

Добавлено: 19 октября 2026 г.

Phase Transitions in the Ni2.14Mn0.81Fe0.05Ga Heusler Alloy under the Influence of a Magnetic Fild and Hydrostatic Pressure

Смерчанский П. С., Koledov V. V., Kamantsev A. P. и др., Physics of Metals and Metallography 2026 Vol. 127 No. 6-7 P. 689–693

Добавлено: 19 октября 2026 г.

Dissipative quantum mechanics of Andreev bound states

Заикин А. Д., Kalenkov M. S., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 Article 214502

We propose a microscopic scheme that allows to describe ac Josephson effect in superconducting junctions in terms of dissipative quantum dynamics of subgap Andreev bound states. This approach is particularly useful for highly transparent junctions at subgap bias voltages in which case a nontrivial combination of Landau-Zener tunneling between Andreev levels and their instability due to quasiparticle escape ...

Добавлено: 18 октября 2026 г.

Landau-Zener Tunneling and Quantum Interference of Andreev States

Заикин А. Д., Kalenkov M. S., Physical Review Letters 2026 Vol. 137 Article 076004

With the aid of a microscopic theory we derive an effective Hamiltonian that controls quantum dynamics of Andreev states in superconducting nanojunctions out of equilibrium. Resolving the corresponding Schrödinger-like equation we obtain the “wave functions” for Andreev levels and evaluate electric current across the junction in the presence of an external voltage bias.We demonstrate that quantum interference of Andreev ...

Добавлено: 18 октября 2026 г.

Effect of crack size and its position on cyclic deformation behavior of refractory highentropy alloy HfNbTiZr

Корзникова Е. А., Babicheva R. I., Davletbakov A. A. и др., JOURNAL OF MATERIALS SCIENCE: MATERIALS IN ENGINEERING 2026 Vol. 21 Article 84

С помощью комбинированного моделирования методами Монте-Карло (МК) и молекулярной динамики (МД) исследовано влияние положения и размера трещины на ближний порядок (SRO) и поведение при высокотемпературном циклическом деформировании тугоплавкого высокоэнтропийного сплава (RHEA) HfNbTiZr с использованием моделей бикристаллов. Установлено, что на процесс формирования ближнего порядка влияет не только размер трещины (а именно величина ее раскрытия), но и ...

Добавлено: 24 сентября 2026 г.

The advent of generative chemistry

Ванхэлен К. Б., Lin Y., Zhavoronkov A., ACS Medicinal Chemistry Letters 2020 Vol. 11 No. 8 P. 1496–1505

Генеративные состязательные сети (GAN), впервые описанные в 2014 году, являются одними из важнейших концепций в современном искусственном интеллекте (ИИ). Объединяя глубокое обучение и теорию игр, GAN используются для генерации или «воображения» новых объектов с желаемыми свойствами. С 2016 года множество GAN с подкреплением (RL) успешно применяются в фармакологии для проектирования молекул de novo. Эти методы ...

Добавлено: 1 июня 2026 г.

КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ МЕХАНИЗМА ЭКСТРАКЦИИ Fe(III) ИЗ СОЛЯНОКИСЛОГО ВОДНОГО РАСТВОРА ЭВТЕКТИЧЕСКИМИ РАСТВОРИТЕЛЯМИ НА ОСНОВЕ 1-ОКТАНОЛА

Мальцева В. Е., Милевская А. В., Милевский Н. А. и др., Теоретические основы химической технологии 2025 Т. 59 № 3 С. 13–22

Проведено квантово-химическое моделирование механизма экстракции Fe(III) из солянокислого раствора с использованием гидрофобных эвтектических растворителей на основе 1-октанола. Установлено, что путь реакции существенно различается в зависимости от того, является ли инертный компонент донором или акцептором водородной связи в димере с октанолом. На основе оценки прочности водородных связей показано, что более слабое взаимодействие между компонентами упрощает протекание ...

Добавлено: 13 мая 2026 г.

Multiphosphorylated molecules for buried interface regulation of inverted perovskite solar cells in a two-step process

Luo S., Bi Z., Xiong L. и др., Energy and Environmental Sciences 2026 Vol. 19 No. 6 P. 2069–2083

Добавлено: 25 февраля 2026 г.

Compression-Induced Lattice Tilting Quenches Ion Migration at Metal Halide Perovskite Grain Boundaries: A Machine Learning Molecular Dynamics Study

Mikhail R. Samatov, Лю Д., Emir S. Amirov и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2025 Vol. 16 No. 51 P. 13068–13074

Добавлено: 20 декабря 2025 г.

Assessing the Effects of Chemical Composition and Short-Range Ordering on the Tensile Deformation Behavior of Nanocrystalline High-Entropy Alloys Nb–Ta–Hf–Zr: A Combined Study on Molecular Dynamics and Monte Carlo Simulation

Babicheva R., Kumar A., Kiran R. и др., Metallurgical and Materials Transactions A: Physical Metallurgy and Materials Science 2025 Vol. 56 P. 5646–5663

В работе проводятся моделирования методами Монте-Карло (МК) и молекулярной динамики (МД) для исследования тугоплавких высокоэнтропийных сплавов (ВЭС) на основе системы Nb–Ta–Hf–Zr. В частности, в рамках комбинированного МК/МД-моделирования релаксации, имитирующей диффузионные процессы, исследуется влияние химического состава и структуры границ зёрен (ГЗ) на короткодальний порядок (КДП) в монокристаллических и нанокристаллических (НК) ВЭС. Кроме того, с помощью МД-моделирования ...

Добавлено: 27 ноября 2025 г.

Immune Antibodies Recognizing the Stem Region of SARS-CoV-2 Spike Protein: Molecular Modelling and In Vitro Study of Synthetic Peptides Presentation to the Antibodies

Aliper E., Ryzhov I., Obukhova P. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2026 Vol. 1868 No. 1 Article 184472

Antibodies to peptide 1147 (amino acids 1147-61) of the SARS-CoV-2 protein S are highly diagnostic. Peptide 1147, although located in a region that is partly spatially hidden in the intact protein, is not subject to mutations, suggesting therapeutic potential. The aim of this study was to elucidate the architecture of this region and the way ...

Добавлено: 20 октября 2025 г.

Diverse Interactions of Sterols with Amyloid Precursor Protein Transmembrane Domain Can Shift Distribution Between Alternative Amyloid-β Production Cascades in Manner Dependent on Local Lipid Environment

Volynsky P., Urban A., Pavlov K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2025 Vol. 26 No. 2 Article 553

Alzheimer’s disease (AD) pathogenesis is correlated with the membrane content of various lipid species, including cholesterol, whose interactions with amyloid precursor protein (APP) have been extensively explored. Amyloid-β peptides triggering AD are products of APP cleavage by secretases, which differ depending on the APP and secretase location relative to ordered or disordered membrane microdomains. We used high-resolution NMR to probe ...

Добавлено: 12 октября 2025 г.