Central loop of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is important for interaction with nicotinic acetylcholine receptors

Toxicon. 2016. Vol. 119. No. September . P. 274–279.

Lyukmanova E. N., Shulepko M. A., Shenkarev Z. O., Kasheverov I. E., Chugunov A. O., Kulbatskii D. S., Myshkin M. Y., Utkin Y. N., Ефремов Р. Г., Tsetlin V. I., Arseniev A. S., Kirpichnikov M. P., Dolgikh D. A.

Highlights

 

•

Mutagenesis of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is performed.

•

Activity of WTX and its mutants on muscle-type and α7-type of nAChRs was studied.

•

R31 and R32 from the loop II is important for binding to both types of receptors.

•

Modeling revealed the loop II entering into the orthosteric site of the α7 nAChRs.

 

---

Abstract

‘Three-finger’ toxin WTX from Naja kaouthia interacts with nicotinic and muscarinic acetylcholine receptors (nAChRs and mAChRs). Mutagenesis and competition experiments with ^{125I-α-bungarotoxin revealed that Arg31 and Arg32 residues from the WTX loop II are important for binding to Torpedo californica and human α7 nAChRs. Computer modeling suggested that loop II occupies the orthosteric binding site at α7 nAChR. The similar toxin interface was previously described as a major determinant of allosteric interactions with mAChRs.}

 

Ключевые слова: computer modeling, nicotinic acetylcholine receptor, Three-finger protein, Snake neurotoxin, Ly-6/uPAR, Site-directed mutagenesis

Похожие публикации

Липид-опосредованная адаптация белков и пептидов в клеточных мембранах

Полянский А. А., Ефремов Р. Г., Биологические мембраны 2024 Т. 41 № 4 С. 403–421

Представлены результаты исследований в компьютерном эксперименте молекулярных механизмов адаптации модельных клеточных мембран, реализующейся в ходе их взаимодействия с белками и пептидами. Речь идет об изменении структурно-динамических параметров водно-липидной среды, гидрофобной/гидрофильной организации поверхности липидного бислоя (так называемой «мозаичности») и пр. Взятые в совокупности, эти эффекты получили название «мембранного ответа» (МО) – важнейшей способности клеточных мембран специфично и устойчиво ...

Добавлено: 19 сентября 2024 г.

Crystal Structure of Bright Fluorescent Protein BrUSLEE with Subnanosecond Fluorescence Lifetime; Electric and Dynamic Properties

Goryacheva E., Ефремов Р. Г., Krylov N. и др., International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 7 Article 6403

Добавлено: 19 мая 2023 г.

Structure-Based Rational Design of Small α-Helical Peptides with Broad-Spectrum Activity Against Multidrug-Resistant Pathogens

Lohan S., Konshina A. G., Ефремов Р. Г. и др., Journal of Medicinal Chemistry 2023 Vol. 66 No. 1 P. 855–874

Добавлено: 21 февраля 2023 г.

The Mechanism of Selective Recognition of Lipid Substrate by hDHHC20 Enzyme

Панина И. С., Крылов Н. А., Чугунов А. О. и др., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 Article 14791

Добавлено: 9 декабря 2022 г.

Моделирование широкополосного усилителя на печатной плате с диэлектриком повышенной проводимости

Абрамешин Д.А., Пожидаев Е.Д., Саенко В.С. и др., Известия вузов. Электроника. РФ 2022 Т. 27 № 5 С. 635–644

На космические аппараты воздействуют электроны космической плазмы, что обусловливает электризацию их диэлектрических материалов. В результате возникают электростатические разряды, приводящие к отказам в работе бортовой радиоэлектроники, уменьшающим сроки активного существования космических аппаратов. Один из перспективных методов защиты от воздействия электростатических разрядов - применение композитных полимерных диэлектриков с повышенной проводимостью. В работе изложены результаты моделирования характеристик широкополосного ...

Добавлено: 2 ноября 2022 г.

ICCTA '22: Proceedings of the 2022 8th International Conference on Computer Technology Applications

NY: Association for Computing Machinery (ACM), 2022.

Добавлено: 26 сентября 2022 г.

SimDB in Action: Road Traffic Simulations Completely Inside Array DBMS

Родригес Залепинос Р. А., PROCEEDINGS OF THE VLDB ENDOWMENT 2022 Vol. 15 No. 12 P. 3742–3745

Добавлено: 30 августа 2022 г.

The Method of Fault Tolerance Evaluation of Reconfigurable Navigation System

Y. N. Kofanov, V. M. N., N. E. K. и др., , in: Proceedings of 2022 IEEE Moscow Workshop on Electronic and Networking Technologies (MWENT).: M.: IEEE, 2022. P. 1–6.

Добавлено: 7 июля 2022 г.

Engineering Methodology for the Selection of a Composite Polymer Dielectric that Ensures the Absence of Electrostatic Discharges in the Design of the Onboard Electronic Equipment of the Spacecraft

D. Abrameshin, S. Tumkovskiy, V. Saenko и др., , in: Proceedings of 2022 IEEE Moscow Workshop on Electronic and Networking Technologies (MWENT).: M.: IEEE, 2022. P. 1–4.

Добавлено: 5 июля 2022 г.

Method of Computer Simulation of Thermal Processes in Optoelectronic Devices

Kuznetsov N., Кофанов Ю. Н., , in: Proceedings of the 2021 IEEE International Conference "Quality Management, Transport and Information Security, Information Technologies" (IT&QM&IS).: IEEE, 2021. P. 443–447.

Добавлено: 4 января 2022 г.

Biochemical basis of skin disease Mal de Meleda: SLURP-1 mutants differently affect keratinocyte proliferation and apoptosis

Shulepko M., Bychkov M., Shenkarev Z. и др., Journal of Investigative Dermatology 2021 P. 1–9

Добавлено: 18 мая 2021 г.

ABO Blood Group Antigens as a Model of Studying Protein-Protein Interactions

Gylmiyarova F., Ryskina E.A., Kolotyeva N. и др., , in: Blood Groups.: IntechOpen, 2019. Ch. 5 P. 63–77.

Добавлено: 23 октября 2020 г.

Probing temperature and capsaicin-induced activation of TRPV1 channel via computationally guided point mutations in its pore and TRP domains

Лубова К., Чугунов А. О., Волынский П. и др., International Journal of Biological Macromolecules 2020 Vol. 158 P. 1175–1183

Добавлено: 10 июня 2020 г.

Which cytochrome P450 metabolizes phenazepam? Step by step in silico, in vitro, and in vivo studies

Ivashchenko D., Rudik A., Полозников А. А. и др., Drug Metabolism and Personalized Therapy 2018 Vol. 33 No. 2 P. 65–73

Добавлено: 15 апреля 2020 г.

ИССЛЕДОВАНИЕ ВОЗМОЖНОСТЕЙ ПЕРЕЛЕТА МЕЖДУ ОРБИТАМИ ВОКРУГ ТОЧЕК ЛАГРАНЖА L2 И L1 В СИСТЕМЕ СОЛНЦЕ-ЗЕМЛЯ

Бобер С. А., Аксенов С. А., В кн.: XII Всероссийский съезд по фундаментальным проблемам теоретической и прикладной механикиТ. 1: Общая и прикладная механика.: Уфа: РИЦ БашГУ, 2019. С. 461–463.

Добавлено: 23 января 2020 г.

Formal Description of Possible Input Logical Signal Data Sequences for Digital Systems and Their Blocks

Ivannikov A.D., Levchenko N., Romanova I.I., , in: Proceedings of IEEE East-West Design & Test Symposium (EWDTS'2018).: IEEE Computer Society, 2018. Ch. 8524675 P. 1–5.

Добавлено: 15 ноября 2019 г.

The Foresight Modeling in Ensuring High Quality of Space Electronic Equipment

Кофанов Ю. Н., Сотникова С. Ю., , in: 2019 International Seminar on Electron Devices Design and Production (SED).: IEEE, 2019. P. 1–6.

Добавлено: 24 июня 2019 г.

Математическое и компьютерное моделирование в экономике, страховании и управлении рисками: Материалы VII Международной молодежной научно-практической конференции

Саратов: ООО "Издательство "Научная книга", 2018.

В сборнике опубликованы материалы VII Международной молодежной научно-практической конференции "Маитематическое и компьютерное моделирование в экономике, страховании и управлении рисками". Тематика статей затрагивает круг вопросов, связанных с экономико-математическим и компьютерным моделированием и управлением рисками в финансовой деятельности, страховании, банковском деле, инвестировании, государственном управлении экономикой, бизнес-информатике и других разделах экономико-математических знаний. Для сотрудников банков, финансовых и страховых компаний, ...

Добавлено: 5 апреля 2019 г.

Extended Modeling of Banks’ Credit Ratings

Карминский А. М., Khromova E., Procedia Computer Science 2016 Vol. 91 P. 201–210

Добавлено: 12 января 2018 г.

The program for selection of vertical forming-, filling- and sealing machines for dry product packing in soft package, based on the criteria analysis method

Савенкова И. А., Journal of International Scientific Publications: Materials, Methods & Technology 2012 Vol. 6 P. 182–189

Добавлено: 20 сентября 2017 г.

Structural Insight into Specificity of Interactions between Non-conventional Three-Finger Toxin WTX and Muscarinic Acetylcholine Receptors

Lyukmanova E., Shenkarev Z., Shulepko M. и др., Journal of biological chemistry 2015 Vol. 290 P. 23616–23630

Добавлено: 14 марта 2017 г.

Central loop of non-conventional toxin WTX from Naja kaouthia is important for interaction with nicotinic acetylcholine receptors.

Lyukmanova E., Shulepko M., Shenkarev Z. и др., Toxicon 2016 Vol. 119 P. 274–279

Добавлено: 14 марта 2017 г.