Comparative Analysis of Spacer Targets in CRISPR-Cas Systems of Starter Cultures

A. A. Fatkulin; T. A. Chuksina; Sorokina N. P.; Smykov I. T.; Kuraeva E. V.; Masezhnaya E. S.; Smagina K. A.; M. Yu. Shkurnikov

doi:10.32607/actanaturae.27533

?

Comparative Analysis of Spacer Targets in CRISPR-Cas Systems of Starter Cultures

Acta Naturae. 2024. Vol. 16. No. 4. P. 81–85.

A. A. Fatkulin, T. A. Chuksina, Sorokina N. P., Smykov I. T., Kuraeva E. V., Masezhnaya E. S., Smagina K. A., M. Yu. Shkurnikov

Предприятия молочной промышленности представляют собой уникальную экологическую нишу для бактериофагов молочнокислых бактерий. В ходе эволюции бактерии выработали широкий спектр защитных механизмов, направленных против инфекций, вызванных бактериофагами. Особый интерес представляет система CRISPR-Cas, которая позволяет бактериям приобретать специфичную устойчивость к определенным бактериофагам. В представленной работе изучены системы CRISPR-Cas молочнокислых бактерий. Особое внимание было уделено специфичности спейсеров CRISPR-кассет. Системы CRISPR-Cas выявлены в геномах 43% исследованных молочнокислых бактерий. Кроме того, лишь 13.1% от общего числа спейсеров CRISPR-кассет совпадали с геномами бактериофагов, что свидетельствует о том, что многие из предсказанных спейсеров либо не имеют известных фаговых мишеней, либо направлены против других видов мобильных генетических элементов, например, плазмид.

Научное направление: Биология Промышленные биотехнологии

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: bacteriophage CRISPR-Cas One Health starter cultures cheesemaking CRISPR-Cas единое здоровье сыроделие заквасочные культуры бактериофаг

Multimodal EEG, ECG, and video dataset of yoga practitioners during concentration and mind-wandering tasks

Kashevnik A., Glekler E., Артёменко Е. Д. и др., Scientific data 2026 Article 7209

Добавлено: 23 апреля 2026 г.

Rapid synthesis of redox-responsive trithiocyanuric acid-based nanocarriers: in vitro multidrug resistance reversal and In vivo safety assessment

Kopoleva E., Sergey A. Tsymbal, Кучур О. А. и др., Drug Delivery and Translational Research 2026 P. 1–16

Добавлено: 20 апреля 2026 г.

Функциональные признаки листьев и экологические стратегии важны для формирования растительных сообществ субальпийских болот и высокотравья

G.V.Klink, Gulov D. M., Elumeeva T. G. и др., Журнал общей биологии 2024 Т. 85 № 2 С. 83–94

Функциональные признаки растений важны для формирования состава растительных сообществ и доминирования в них. Сравнение средних значений признаков у организмов внутри сообщества с таковым для случайных выборок местной биоты позволяет оценить значимость признака для формирования состава сообществ. Сравнение средних и средневзвешенных значений признаков позволяет оценить их роль для доминирования в том или ином сообществе. Мы исследовали ...

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

The partitioning of mobile fractions of chemical elements in the mineral loamy soils during natural regeneration after plowing in Western Russia

G.V.Klink, Semenkov I. N., Enchilik P. R., Science of the Total Environment 2025 Vol. 998 Article 180219

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

Self-face viewing attenuates cardiac modulation of corticospinal excitability

Макарова М. М., Федосов Н. П., Mikhailova I. и др., FRONTIERS IN SIGNAL PROCESSING 2026

Добавлено: 17 апреля 2026 г.

Inactivation of NONO by Auranofin or RNA Interference Triggers Lethal Oxidative Stress in Neuroblastoma Cells

Pogodaeva S. S., Miletina O. O., Mammadova L. V. и др., Frontiers in Bioscience - Landmark 2026 Vol. 31 No. 4 P. 48544–48557

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Discovery of Novel 1,3,5-Triazine Derivative as Potent Anticancer Agent: DNA and HSA Binding, MTT Assay

Chernov I., Protas A., Popova E. и др., Biochemistry. Biokhimiia 2025 Vol. 19 No. 3 P. 279–287

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Saying “Yes” to NONO: A Therapeutic Target for Neuroblastoma and Beyond

Pogodaeva S., Miletina O., Antipova N. и др., Cancers 2025 Vol. 17 No. 19 Article 3228

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Metal-Based Therapeutic Approaches for Overcoming Cancer Drug Resistance: Mechanisms, Drug Delivery Strategies, and Clinical Perspectives

Chernov K., Savin A., Otvodnikova D. и др., Oncology Research 2026 Vol. - No. -

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Взаимодействие аффективных и когнитивных компонентов рабочей памяти при удержании эмоционально-окрашенной информации. Нейрокогнитивный анализ

Кочеткова Е. В., Мачинская Р. И., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2025 Т. 75 № 2 С. 170–188

В обзоре представлен анализ современных психологических теорий эмоций и соответствующих им концепций нейронального обеспечения обработки и удержания в рабочей памяти эмоциональ но окрашенной информации. Общей тенденцией современных нейрокогнитивных исследований является отказ от локализации отдельных когнитивных функций в пользу сетевых моделей, в кото рых обеспечение психических процессов осуществляется распределенными сетями, объединяющи ми функционально специфичные структуры коры и глубинных образований. Такие сети ...

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Metal-Based Therapeutic Approaches for Overcoming Cancer Drug Resistance: Mechanisms, Drug Delivery Strategies, and Clinical Perspectives

Chernov K. V., Savin A. M., Otvodnikova D. E. и др., Oncology Research 2026 Vol. 34 No. 5 P. 1–40

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Retention of Emotional and Socio-Emotional Information in Working Memory: EEG Functional Connectivity Study

Кочеткова Е. В., Machinskaya R., Human Physiology 2025 Vol. 51 No. 6 P. 580–590

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

The Complex of Copper (II) and Zoledronic Acid: Relevance to Oxidative Death of Leukemia Cells in the Bone Marrow

Barskaya E. S., Savin A. M., Chernov K. V. и др., International Journal of Molecular Sciences 2026 Vol. 27 No. 6 Article 2800

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Enhancement of Rotenone Cytotoxicity in the Presence of Bach1 Inhibitors

S. V. Nikulin, Olkhovik D., A.V. Razumovskaya и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2026

Добавлено: 13 апреля 2026 г.

Возможности индивидуального фМРТ-картирования мозговых основ рабочей памяти с помощью задачи «N шагов назад»

Печенкова Е. В., Паникратова Я. Р., Королькова О. А. и др., Вестник рентгенологии и радиологии 2025 Т. 106 № 6 С. 192–206

Актуальность. Использование индивидуальных карт активации мозга по данным функциональной магнитно-резонансной томографии (фМРТ) для уточнения диагноза и прогноза пациента на текущий момент невозможно, однако отслеживание изменений активации в ходе лечения или реабилитации может быть полезным для оценки их эффективности. Популяционные исследования чаще всего не позволяют выделить клинически значимые параметры активации и интерпретировать их изменения. Чтобы восполнить этот ...

Добавлено: 2 апреля 2026 г.

The role of prefrontal cortex in emotion regulation: A more naturalistic magnetoencephalographic study

Медведева А. Д., Nikita Rudenkiy, Danila Shelepenkov и др., Behavioural Brain Research 2026 Vol. 507 Article 116169

Добавлено: 1 апреля 2026 г.

Результаты комплексного исследования протомеотского погребения всадника из Адыгеи

Леонтьева А. С., Эрлих В. Р., Ерёменко К. Ю. и др., История, археология и этнография Кавказа 2025 Т. 21 № 1 С. 124–140

В статье публикуется комплекс погребения протомеотского воина-всадника, открытого в 2023 г. в предгорьях Адыгеи (N 44.2278780 E 40.1298390). Погребение сопровождалось вооружением, включающим топор-скипетр, колхидской фибулой, скелетом лошади, а также набором бронзовой конской узды, относящейся ко времени Новочеркасского клада. Авторы датируют погребение концом VIII в. до н.э. Погребение было комплексно исследовано, в том числе с помощью ...

Добавлено: 26 марта 2026 г.

The Diversity and Biochemical Composition of Zooplankton as a Potential Indicator of Dietary Requirements for Pikeperch Larvae (Sander lucioperca)

Lyutikov A., Korolev A., Trifonov A. и др., HYDROBIOLOGY 2025 Vol. 4 No. 2 Article 13

Добавлено: 26 марта 2026 г.

Koban culture genome-wide and archeological data open the bridge between Bronze and Iron Ages in the North Caucasus

Недолужко А. В., European Journal of Human Genetics 2024 Vol. 32 P. 1483–1491

Добавлено: 26 марта 2026 г.

Phytogenics enhance welfare and vaccine efficacy against Vibrio anguillarum in European seabass (Dicentrarchus labrax) juveniles

Недолужко А. В., Aquaculture 2024 Vol. 585 Article 740714

Добавлено: 26 марта 2026 г.

Ocean warming shapes embryonic developmental prospects of the next generation in Atlantic cod

Skjærven K. H., Alix M., Kleppe L. и др., ICES Journal of Marine Science 2024 Vol. 81 No. 4 P. 733–747

Добавлено: 26 марта 2026 г.

Комплексная характеристика пяти штаммов Lactococcus: от фенотипических свойств к геномным особенностям

Антипенко И. Д., Сорокина Н. П., Кучеренко И. В. и др., Acta Naturae 2025 Т. 17 № 4 С. 83–92

Эффективность ферментации молочных продуктов зависит от характеристик молочнокислых бактерий, прежде всего от их метаболической активности и устойчивости к бактериофагам, поэтому важно понимать связь между генетическими и фенотипическими особенностями штаммов, используемых в промышленности. Нами проведен комплексный анализ пяти широко применяемых в России штаммов Lactococcus с использованием полногеномного секвенирования и оценки фенотипических свойств. Несмотря на генетическое сходство четырех штаммов L. ...

Добавлено: 30 января 2026 г.

An updated evolutionary classification of CRISPR–Cas systems including rare variants

Makarova K., Sergey A. Shmakov, Wolf Y. и др., Nature Microbiology 2025 Vol. 10 No. 12 P. 3346–3361

Добавлено: 10 ноября 2025 г.

Reprogrammable RNA-targeting CRISPR systems evolved from RNA toxin-antitoxins

Altae-Tran H., Zilberzwige-Tal S., Kannan S. и др., Cell 2025 Vol. 188 No. 7 P. 1925–1940

Добавлено: 10 ноября 2025 г.