?
Настройка нелинейной модели данных экспериментов с экспрессионными ДНК-микрочипами
Математическая биология и биоинформатика. 2012. Т. 7. № 2. С. 554-566.
Рябенко Е.А.
Priority areas:
IT and mathematics
Language:
Russian
Il'icheva I., Khodikov M., Nechipurenko D. et al., BMC Genomics 2016 Vol. 17 No. 1 P. 973
Abstract BACKGROUND:
The general structure and action of all eukaryotic and archaeal RNA polymerases machinery have an astonishing similarity despite the diversity of core promoter sequences in different species. The goal of our work is to find common characteristics of DNA region that define it as a promoter for the RNA polymerase II (Pol II).
RESULTS:
The profiles ...
Added: March 8, 2017
Смоленск : Смоленский государственный университет, 2012
Сборник включает материалы, представленные на Международную конференцию ИнтерКарто-ИнтерГИС-18. Рассматриваются теоретические и методические аспекты геоинформационного обеспечения задач устойчивого развития, в том числе вопросы разработки и создания различных геоинформационных систем и новых геоинформационных технологий и виртуальных сред, создания инфраструктур пространственных данных, баз данных, их интеграций и метаданных, геосервисов, обработки дистанционных изображений и исследования Земли из космоса. Предлагаются ...
Added: March 20, 2013
Bukharov O., Bogolyubov D., Федоров В. М. et al., Криосфера Земли 2016 № 3 С. 43-50
The medium-term forecasting of the sea ice extent has been carried out by determining of the relationship between incoming solar radiation and the sea ice extent in the Northern Hemisphere. Different methods of the statistic and neural modeling have been used. Forecast shows that the main factor determining the variation of the maximum and minimum ...
Added: August 18, 2016
Valba O. V., Tamm M., Nechaev S., Physical Review Letters 2012 Vol. 109 P. 018102
We study the fraction f of nucleotides involved in the formation of a cactuslike secondary structure of random heteropolymer RNA-like molecules. In the low-temperature limit, we study this fraction as a function of the number c of different nucleotide species. We show, that with changing c, the secondary structures of random RNAs undergo a morphological transition:f(c)→1 for c≤ccr as the chain length n goes ...
Added: November 18, 2013
Каз. : СМУиС, 2013
Вторая Всероссийская молодежная научная Интернет-конференция «Грани науки» проводится Казанским (Приволжским) федеральным университетом, Советом молодых ученых и специалистов города Казани (http://kznscience.ru) и Комитетом по делам детей и молодежи Исполкома Казани. ...
Added: July 7, 2016
Назипова Н. Н., Isaev E., Kornilov V. et al., Математическая биология и биоинформатика 2017 Т. 12 № 1 С. 102-119
Секвенирование человеческого генома началось в 1994 году. Понадобилось 10 лет работы многих научных коллективов для того, чтобы получить черновую последовательность ДНК человека. Современные технологии секвенирования позволяют получать геном конкретного человека за несколько дней. Обсуждаются успехи современной биоинформатики, связанные с появлением высокопроизводительных платформ секвенирования, которые не только способствовали расширению возможностей различных направлений биологии и других смежных ...
Added: March 3, 2017
M. : HSE, 2013
Human reasoning uses to distinguish things that do change and things do not. The latter are commonly expressed in the reasoning as objects, which may represent classes or instances, and classes being further divided into concept types and relation types. These became the main issue of knowledge engineering and have been well tractable by computer. ...
Added: October 27, 2013
Dubois J., Poupon C., Thirion B. et al., Cerebral Cortex 2015 Vol. 26 No. 5 P. 2283-2298
Linguistic processing is based on a close collaboration between temporal and frontal regions connected by two pathways: the “dorsal” and “ventral pathways” (assumed to support phonological and semantic processing, respectively, in adults). We investigated here the development of these pathways at the onset of language acquisition, during the first post-natal weeks, using cross-sectional diffusion imaging ...
Added: October 22, 2015
М. : Государственное учреждение Институт математических проблем биологии РАН, 2016
A usual way to determine the evolutionary relatedness, or homology, of two DNA sequences is to search for traces of sequence conservation. However the lack of sequence conservation does not necessarily mean the lack of homology. Not detectable at the primary sequence level, it can be inferred when moving to the level of DNA/RNA secondary ...
Added: March 8, 2017
Roytberg M. A., Lecture Notes in Computer Science 2011 No. 6744 P. 17-20
Pair-wise sequence alignment is the basic method of comparative analysis of proteins and nucleic acids. Studying the results of alignment one has to consider two questions^ (1) did the program find all the interesting similarities (“sensitivity”) and (2) are all the found similarities interesting (“selectivity‘’). Definitely, one has to specify, what alignments are considered as ...
Added: March 5, 2012
Baulin E., Roytberg M. A., Математическая биология и биоинформатика 2015 Т. 10 № 1 С. 54-59
пространственная структура РНК, мультиплет, стем, псевдоузел, линк, граф ...
Added: March 30, 2015
Боброва Е. В., Решетникова В. В., Volkova K. et al., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2017 Т. 67 № 4 С. 485-492
Исследовали обучение управлению системой “Интерфейс мозг-компьютер” (ИМК) с помощью специально разработанного тренинга. Тренинг включал осуществление медленных циклических движений правой и левой рукой (длительность каждого движения соответствовала длительности представлений движений руки при работе с ИМК), представление этих движений, а также спокойное сидение до начала движений. До проведения тренинга и после него осуществлялось управление ИМК. По тесту ...
Added: October 20, 2017
Baulin E., Roytberg M. A., Астахова Т. В., Математическая биология и биоинформатика 2012 Т. 7 № 2 С. 567-571
Предложена классификация элементов вторичной структуры РНК, которая является обобщением классификации петель, предложенной Мэтьюзом и Тернером. Эта классификация позволяет единообразно описывать структуры как содержащие, так и не содержащие псевдоузлы. ...
Added: January 30, 2013
Goncharov R., Сапанов П. М., Яшунский А. Д., Социология власти 2013 № 3 С. 57-72
В статье представлена технология, позволяющая собирать в полевых исследованиях пространственно локализованные данные об объектах городской среды. Технология основана на автоматической привязке фотографий к пространственным координатам. Приведен план полевых и камеральных мероприятий, предложены варианты ГИС-обработки собираемых таким образом данных. В качестве примера приведены данные об использовании белорусского языка в общественном пространстве городов Белоруссии. ...
Added: April 12, 2015
М. : Издательский дом "Типография" Россельхозакадемии, 2014
Vserossiyskaya nauchnaya konferentsiya 31 yanvarya 2014 g. "Matematika, informatika, estestvoznanie v ekonomike i v obshchestve". ...
Added: February 7, 2014
Ижевск : Ижевский институт компьютерных исследований, 2017
Процессы трансформации энергии и регуляции этих процессов при изменении характеристик внешней и внутренней среды лежат в основе устойчивого существования всех живых систем. Монография содержит главы, посвященные физико-химическим механизмам регуляции процессов на молекулярном, субклеточном и клеточном уровнях. В книге описаны результаты последних достижений отечественной науки в области фолдинга белка (Финкельштейн и др.), молекулярных основ взаимодействия белков ...
Added: November 14, 2017
Kertesz-Farkas A., Noble W., Journal or Proteome Research 2015 Vol. 14 No. 8 P. 3027-3038
Added: September 25, 2015
Nurk S., Bankevich A., Antipov D. et al., Journal of Computational Biology 2013 Vol. 20 No. 10 P. 714-737
Recent advances in single-cell genomics provide an alternative to largely gene-centric metagenomics studies, enabling whole-genome sequencing of uncultivated bacteria. However, single-cell assembly projects are challenging due to (i) the highly nonuniform read coverage and (ii) a greatly elevated number of chimeric reads and read pairs. While recently developed single-cell assemblers have addressed the former challenge, ...
Added: March 21, 2014
Zakhodiakin G., Успехи в химии и химической технологии 2014 Т. 28 № 10 (159) С. 97-100
This paper describes an approach to supply chain network optimization for a petrochemical enterprise. The state-task network is used for supply chain representation. A framework for comprehensive economic and environmental assessment based on life cycle assessment is proposed. The software implementation of proposed methodology is described. ...
Added: February 27, 2016
Korotayev A., Вестник Института экономики Российской академии наук 2015 № 1 С. 149-162
The 19th century saw an explosive growth of the gap between the “First” and the “Third” World as regards per capita incomes and levels of life that has become to be known as the “Great Divergence”. In the 20th century the Great Divergence continued up to the early 1970s, and then – in the late ...
Added: December 3, 2015
Korotayev A., de Munck V., Cross - Cultural Research 2007 Vol. 41 P. 307-335
This article hypothesizes that in societies where spouses are considered to have relatively equal status, they are more likely to be intimate with one another than in societies where there is spousal status inequality. The authors ask: What are the core attributes of intimacy between husband and wife cross-culturally? And what sociocultural norms and practices are ...
Added: March 8, 2013
Красноярск : ИВМ СО РАН, 2013
Труды Пятой Международной конференции «Системный анализ и информационные технологии» САИТ-2013 (19–25 сентября 2013 г., г.Красноярск, Россия): ...
Added: November 18, 2013
NY : Nova Science Publishers, Inc., 2017
In this book, the original papers have been collected that demonstrate the efficient use of the computer molecular dynamics (MD) simulation methods for the studying of nanoscale phenomena in the materials and life sciences. This volume contains the Proceedings of the International Symposium KSCMBS-2016 ”Khujand Symposium on Computational Materials and Biological Sciences” (10 th Japan–Russia ...
Added: November 14, 2017