?
Molecular Dynamics Insight into the Lipid II Recognition by Type A Lantibiotics: Nisin, Epidermin, and Gallidermin
Micromachines. 2021. Vol. 12. No. 10. Article 1169.
Ключевые слова: molecular recognition molecular dynamicsnisinlantibioticsepidermingalliderminpyrophosphate pharmacophore
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Panina I., Balandin S., Tsarev A. и др., International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 2 P. 1
Добавлено: 21 февраля 2023 г.
Antibiotic resistance is one of the biggest public health challenges of our time and this is the motivation for finding new antibiotics. A class of bacteriocins — lantibiotics – are promising agents for drug discovery. Lantibiotics are ribosomally synthesized and posttranslationally modified cationic antimicrobial peptides. The specific target of type A (I) lantibiotics is the ...
Добавлено: 31 августа 2021 г.
Панина И. С., Крылов Н. А., Нольде Д. Е. и др., Scientific Reports 2020 Vol. 10 Article 8821
Добавлено: 1 июня 2020 г.
Gureev M.A., Порозов Ю. Б., Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 2021 Vol. 40 No. 12 P. 5481-5492
Добавлено: 22 марта 2024 г.
Goncharuk M., Baleeva N., Nolde Dmitry E. и др., Communications Biology 2022 Vol. 5 Article 706
Добавлено: 1 августа 2022 г.
Yarovaya O., Shcherbakov D., Borisevich S. и др., Viruses 2022 Vol. 14 No. 6 Article 1295
Добавлено: 8 февраля 2024 г.
Добавлено: 24 октября 2022 г.
Нольде Д. Е., Крылов Н. А., Телегин П. Н. и др., Труды НИИСИ РАН 2018 Т. 7 № 4 С. 157-161
На примере программного пакета Gromacs проведено исследование скорости расчета
классической молекулярной динамики на различных компьютерных системах: настольных компьютерах,
кластеров на основе процессоров x86_64, многоядерных процессоров архитектуры MIC, а также
гетерогенных систем с использованием «игровых» видеокарт или графических ускорителей. Рассмотрен
вопрос выбора оптимальной платформы для проведения расчетов молекулярной динамики. ...
Добавлено: 10 февраля 2020 г.
Lohan S., Mandal D., Choi W. и др., Journal of Medicinal Chemistry 2022 Vol. 65 No. 1 P. 665-687
We report the synthesis and antibacterial activities of a series of amphiphilic membrane-active peptides composed, in part, of various non-genetically coded hydrophobic amino acids. Lead cyclic peptides, 8C and 9C, showed broad-spectrum activity against drug-resistant Gram-positive (MIC=1.5-6.2 µg/mL) and Gram-negative (MIC=12.5-25 µg/mL) bacteria. Cytotoxicity study showed the predominant lethal action of the peptides against bacteria ...
Добавлено: 1 февраля 2022 г.
Nadezhdin K., Neuberger A., Trofimov Y. и др., Nature Structural and Molecular Biology 2021 Vol. 28 P. 564-572
Добавлено: 24 августа 2021 г.
Стройлов В. С., Панова М. А., Тоукач Ф. В., International Journal of Molecular Sciences 2020 Vol. 21 No. 20 Article 7626
Добавлено: 31 января 2022 г.
Chugunov A.O., Volynsky P. E., Krylov N.A. и др., Scientific Reports 2016 Vol. 6 P. 33112
Добавлено: 10 февраля 2020 г.
Gigolaev A., Kuzmenkov A., Peigneur S. и др., Frontiers in Pharmacology 2020 Vol. 11 P. 1010
Добавлено: 27 августа 2020 г.
Volynsky P. E., Nolde D.E., Zakharova G. S. и др., Scientific Reports 2019 Vol. 9 P. 413
Добавлено: 10 февраля 2020 г.
Bershatsky Y., Kuznetsov A., Idiatullina A. и др., International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 4 Article 3906
Добавлено: 19 мая 2023 г.
Панина И. С., Крылов Н. А., Чугунов А. О. и др., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 Article 14791
Добавлено: 9 декабря 2022 г.
Shenkarev Z., Chesnokov Y., Zaigraev M. и др., Communications Biology 2022 Vol. 5 Article 1344
Добавлено: 9 декабря 2022 г.
Коншина А. Г., Дубовский П. В., Ефремов Р. Г., Journal of Chemical Information and Modeling 2021 Vol. 61 No. 1 P. 385-399
Добавлено: 24 января 2021 г.
Lohan S., Konshina A. G., Ефремов Р. Г. и др., Journal of Medicinal Chemistry 2023 Vol. 66 No. 1 P. 855-874
Добавлено: 21 февраля 2023 г.
Tamaian R., Porozov Yu., Shityakov S., Journal of Biomolecular Structure and Dynamics 2023 Vol. 41 No. 24 P. 14849-14870
Добавлено: 27 января 2024 г.
Панина И. С., Чугунов А. О., Нольде Д. Е. и др., FEBS Open Bio 2021 Vol. 11 No. Suppl.1 P. 356-356
Given the challenge of global antibiotic resistance, the development of new medications is indispensable. Lipid II - bacterial cell wall precursor – is a promising pharmaceutical target for innovative antibiotics, whereas lantibiotic nisin, effectively capturing lipid II’s conservative pyrophosphate group, is a potential prototype of a new generation of antibiotics. Because the structure of membrane-bound ...
Добавлено: 31 августа 2021 г.
Goryacheva E., Ефремов Р. Г., Krylov N. и др., International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 7 Article 6403
Добавлено: 19 мая 2023 г.
Добавлено: 8 февраля 2024 г.
Chugunov A. O., Koromyslova A. D., Berkut A. и др., Journal of biological chemistry 2013 Vol. 88 No. 26 P. 19014-19027
To gain success in the evolutionary “arms race”, venomous animals such as scorpions produce diverse neurotoxins selected to hit targets in the nervous system of prey. Scorpion α-toxins affect insect and/or mammalian voltage-gated sodium channels (Nav’s) and thereby modify the excitability of muscle and nerve cells. Although more than a hundred α-toxins are known and ...
Добавлено: 13 ноября 2013 г.