Система in vitro для детекции маркеров рака предстательной железы методом LAMP

Фомичева К. А.; Ю. А. Макарова

doi:10.21519/0234-2758-2020-36-1-3-6

Публикации

?

Система in vitro для детекции маркеров рака предстательной железы методом LAMP

Биотехнология. 2020. Т. 36. № 1. С. 3–6.

Фомичева К. А., Макарова Ю. А.

Петлевая изотермическая амплификация (LAMP) – это метод быстрой и высокоспецифичной
амплификации нуклеиновых кислот, позволяющий детектировать продукты реакции уже через
10‒20 мин после ее начала. На его основе разработан интраоперационный способ определения
метастазов в лимфатических узлах, получивший название одноэтапная амплификация нуклеиновых
кислот (OSNA) и заключающийся в быстрой детекции мРНК эпителийспецифичного гена KRT19.
Протокол OSNA был разработан более 10 лет назад для детекции метастазов рака молочной
железы в лимфатических узлах. За это время появилась новая версия ключевого фермента,
задействованного в реакции ‒ Bst-полимеразы, которая теперь обладает одновременно активностью
обратной транскриптазы, а также назрела необходимость адаптировать метод для других видов
злокачественных заболеваний, в частности рака предстательной железы (РПЖ). Первым шагом
является создание in vitro системы, моделирующей условия OSNA и позволяющей проводить LАMP
на клеточных линиях РПЖ. В исследовании подобраны клеточные линии: модель РПЖ DU-145
и отрицательный контроль Molt-4, ‒ имитирующие реальные условия проведения OSNA. Кроме
того, проведена оптимизация работы новой версии Bst-полимеразы, Bst 3.0, в условиях LAMP:
подобраны оптимальные концентрации нуклеозидтрифосфатов и отработана постановка LAMP
без применения обратной транскриптазы. В результате получена in vitro система, позволяющая
детектировать мРНК гена-маркера РПЖ KRT19 методом LAMP.

Научное направление: Медицинские биотехнологии Клиническая медицина Биология

Язык: русский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: prostate cancer рак предстательной железы LAMP LAMP OSNA петлевая изотермическая амплификация одноэтапная амплификация нуклеиновых кислот OSNA

A28-04 Measuring the Polygenic Risk of Thrombosis May Accelerate the Detection of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Among Other Forms of Pulmonary Hypertension

Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. и др., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Haplotype-resolved DiMeLo-seq maps centromeric chromatin in a complete diploid human genome

Xu Y., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., USA 2026 Vol. 6 No. 8 Article 101324

Centromeres ensure chromosome segregation, but their chromatin organization within repetitive alpha-satellite DNA has been difficult to resolve. To address this, we generated haplotype-resolved satellite DNA annotations for the complete diploid T2T-HG002 human genome assembly, then we mapped centromere protein A (CENP-A), H3K9me3, and CpG methylation on ultra-long, adaptively sampled nanopore reads using directed methylation with ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

A complete genome for the common marmoset

Hebbar P., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., Cell 2026 Vol. 189 P. 4891–4908.e12

Обыкновенная игрунка — обезьяна Нового Света, широко используемая для изучения эволюции приматов и заболеваний человека. Мы представляем референсную сборку генома этого вида «от теломеры до теломеры» (T2T), а также три гаплотипа, собранных почти до уровня T2T. Эти сборки позволяют охарактеризовать ранее недоступные участки генома, включая центромеры, половые хромосомы, субтеломерные сателлитные повторы, акроцентрические хромосомы и главный ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction

Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., BMC Biology 2026 No. 24 Article 181

Добавлено: 18 сентября 2026 г.

A functional systems view on neural tracking of natural speech

Anton Rogachev, Сысоева О. В., Frontiers in Systems Neuroscience 2025 Vol. 19 Article 1658243

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Neural tracking of natural speech in children in relation to their receptive speech abilities

Rogachev A.O., Sysoeva O. V., Cognitive Systems Research 2024 Vol. 86 Article 101236

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Vague stimulating ideas, images and metaphors in scientific thinking: researchers' work with horizons of unclear knowledge

Поддьяков А. Н., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2026. No. 7437658.

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Структура потребления табачных и никотинсодержащих изделий среди взрослых в Российской Федерации: репрезентативные исследования 2019–2024 гг.

Салагай О. О., Сахарова Г. М., Антонов Н. С. и др., Здоровье населения и среда обитания 2026 Т. 34 № 6 С. 7-17

Введение. Употребление табака и никотина является фактором риска НИЗ, злокачественных новообразований и влияет на развитие и течение инфекционных болезней. При этом данный фактор риска является управляемым и может регулироваться профилактическими программами, учитывающими тенденции и особенности употребления различных видов табачной и никотинсодержащей продукции. Цель исследования: провести анализ динамики распространенности употребления различных видов табачной и никотинсодержащей продукции среди взрослого населения ...

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Структура потребления табачных и никотинсодержащих изделий участниками СВО

Салагай О. О., Сахарова Г. М., Антонов Н. С. и др., Медицинский вестник Юга России 2026 Т. 17 № 2 С. 109–119

Цель: анализ структуры и особенностей потребления участниками СВО различных видов табачной и никотинсодержащей продукции. Материалы и методы: анализ проводился по результатам опроса участников СВО с использованием разработанного вопросника. Вопросник включал 44 вопроса. Опрос проводился на базе офисов Фонда «Защитники Отечества». Рассчитаны доли респондентов, потреблявших различные виды изделий и подвергавшихся пассивному курению, показатели интенсивности курения и знаний о вреде ...

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Surgery for gliomas of Broca’s area

Dimertsev A. V., Batmanova Y. V., Zhikhar T. V. и др., Zhurnal Voprosy Neirokhirurgii Imeni N.N. Burdenko 2025 Vol. 6 P. 38–45

Добавлено: 14 сентября 2026 г.

“Reading the Mind in the Eyes Test”: Development of a Russian-Language Version Expanded for Neuroimaging Applications

Zheltyakova M., Korotkov A., Бурсов К. Г. и др., Herald of the Russian Academy of Sciences 2026 Vol. 95 No. 6 P. 1048–1057

Добавлено: 13 сентября 2026 г.

Разработка методик на основе айтрекинга для диагностики когнитивных функций у детей

Ребрейкина А. Б., Левкович К. М., Современная зарубежная психология 2024 Т. 13 № 2 С. 33–43

Создание методик диагностики на основе анализа движений глаз является особенно актуальным для оценки когнитивных функций у детей, которые не могут дать речевой или моторный ответ в силу своего возраста или из-за нарушений развития. Для таких детей использование объективных методов оценки когнитивных функций на основе айтрекинга может стать полезным диагностическим инструментом, дополняющим традиционные поведенческие опросники и ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

Развитие когнитивных функций детей с помощью методик, использующих видеоокулографию

Ребрейкина А. Б., Левкович К. М., Современная зарубежная психология 2023 Т. 12 № 4 С. 51–61

Активное развитие метода видеоокулографии, т. е. регистрации движений глаз, создает возможности для создания новых подходов для развития когнитивных функций и обучения. Методики, основанные на видеоокулографии, могут быть полезны не только для детей с серьезными нарушениями моторных функций, но и детей с нарушениями развития когнитивных функций, прежде всего внимания, так как контроль движений глаз тесно связан ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

Вегетативные и поведенческие показатели при увеличении когнитивной нагрузки у здоровых добровольцев

Портнова Г. В., Левкович К. М., Васильева Л. Н. и др., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2022 Т. 72 № 4 С. 504–519

Когнитивная и эмоциональная нагрузка в ходе увеличения сложности задач приводит к активации различных звеньев вегетативной нервной системы и может сопровождаться как увеличением эффективности решения задач, так и способствовать дестабилизации эмоционального состояния и уменьшению продуктивности. Увеличение когнитивной нагрузки при условии высокой мотивации испытуемых является стрессовым фактором и выражается в различной реакции симпатического и парасимпатического звеньев в ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

DSCA-HLAII: A dual-stream cross-attention model for predicting peptide–HLA class II interaction and presentation

Шайтан А. К., Ke Y., Hongjun Y. и др., PLoS Computational Biology 2026 Article e1013836

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Salivary Antioxidant Capacity and Magnesium in Generalized Anxiety Disorder

Proskurnina E., Liaukovich K., Bychkovskaya L. и др., Metabolites 2023 Vol. 13 No. 1 P. 73

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Enhancement of Rotenone Cytotoxicity in the Presence of Bach1 Inhibitors

S. V. Nikulin, Olkhovik D., A.V. Razumovskaya и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2026 Vol. 526 P. 59–64

Добавлено: 13 апреля 2026 г.

Expression of antioxidant defense genes determines synergistic ferroptosis induction by the combination of erastin and omega-3 docosahexaenoic acid in prostate cancer cells

Силкина М. О., T.A. Kulagin, K.V. Klycheva и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2026 Vol. 526 P. 11–16

Ферроптоз рассматривается как перспективная стратегия индуцирования гибели опухолевых клеток. Однако эффективность известных индукторов ферроптоза, таких как эрастин, в ряде случаев оказывается ограниченной, что стимулирует поиск новых комбинированных стратегий их применения. В данной работе в динамике было изучено совместное действие эрастина и докозагексаеновой кислоты (ДГК) на клетки рака предстательной железы. Показано, что комбинация этих агентов является ...

Добавлено: 11 декабря 2025 г.

Omega-3 Docosahexaenoic Acid as a Promising Inducer of Ferroptosis: Dynamics of Action in Prostate and Colorectal Cancer Models

D. M. Olkhovik, M. O. Silkina, A. V. Razumovskaya и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2025 Vol. 520 P. 25–28

Ferroptosis is an iron-dependent form of programmed cell death (PCD) associated with lipid membrane peroxidation. It has gained attention in cancer research because some tumor cells that are resistant to other forms of PCD are sensitive to ferroptosis. Despite the significant amount of research on ferroptosis, the list of known inducers remains limited, creating opportunities ...

Добавлено: 31 октября 2024 г.

Оценка уровня miR-21-5p, miR-451a и miR-144-3p в моче при дифференциальной диагностике локализованного рака предстательной железы

Долотказин Д. Р., Аверинская Д. А., Князев Е. Н. и др., Онкоурология 2024 Т. 20 № 1 С. 36–43

Введение. Ограниченные чувствительность и специфичность имеющихся методов диагностики рака предстательной железы (РПЖ) являются определяющими факторами для поиска новых маркеров. В ряде работ продемонстрирована потенциальная возможность определения экспрессии некоторых микроРНК в моче. Цель исследования – оценка диагностического потенциала определения экспрессии микроРНК в моче при РПЖ. Материалы и методы. Проанализирована коллекция из осадка образцов мочи 19 пациентов с доброкачественной гиперплазией предстательной железы ...

Добавлено: 27 мая 2024 г.

Оптимизация метода определения чувствительности к доцетакселу с помощью опухолевых органоидов рака предстательной железы

Никулин С. В., Силкина М. О., Разумовская А. В. и др., Онкоурология 2024 Т. 20 № 1 С. 44–51

Введение. Исследование чувствительности полученных от пациентов опухолевых органоидов к противоопухолевым препаратам представляет собой перспективный подход к персонализированному выбору схемы лечения. Цель исследования – получение 2 культур опухолевых органоидов предстательной железы, подбор оптимального состава культуральной среды и оценка на полученных органоидных культурах эффективности химиотерапевтического препарата доцетаксел, применяемого для лечения рака предстательной железы. Материалы и методы. Исходную ткань диссоциировали ...

Добавлено: 18 мая 2024 г.

Assessing the Efficacy of Anti-Cancer Drugs on Organoid Models Derived from Prostate Cancer

M. O. Silkina, A. V. Razumovskaya, S. V. Nikulin и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2023 Vol. 513 No. 1 P. S96–S99

Доказано, что опухолевые органоиды хорошо отражают фенотипические и генетические характеристики исходного биоматериала. Сообщалось, что результаты тестирования лекарственных препаратов на органоидных культурах могут передавать клинический ответ пациентов. В данной работе из биопсийного материала рака предстательной железы (РПЖ) была получена органоидная культура, на которой были протестированы препараты доцетаксел и энзалутамид, применяющиеся в клинической практике для лечения РПЖ. ...

Добавлено: 1 марта 2024 г.

Using a Recurrent Neural Network To Inform the Use of Prostate- specific Antigen (PSA) and PSA Density for Dynamic Monitoring of the Risk of Prostate Cancer Progression on Active Surveillance

Sushentsev N., Abrego L., Colarieti A. и др., EUROPEAN UROLOGY OPEN SCIENCE 2023 Vol. 52 P. 36–39

Добавлено: 28 февраля 2024 г.

Differential co-expression network analysis with DCoNA reveals isomiR targeting aberrations in prostate cancer

Жиянов А. П., Narek Engibaryan, Нерсисян С. А. и др., Bioinformatics 2023 Vol. 39 No. 2 Article btad051

Добавлено: 23 ноября 2022 г.