Docking and Molecular Dynamics Studies on DNA-Heterocyclic Enediynes Interaction to Identify the Preferred Binding Mode

M. A. Gureev; Danilkina N. A.; Khlebnikov A. F.; Balova I. A.

doi:10.1134/S1070363224140111

Публикации

?

Docking and Molecular Dynamics Studies on DNA-Heterocyclic Enediynes Interaction to Identify the Preferred Binding Mode

Russian Journal of General Chemistry. 2024. Vol. 94. No. 1. P. S100–S119.

M. A. Gureev, Danilkina N. A., Khlebnikov A. F., Balova I. A.

Научное направление: Химия Биология

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: Molecular Docking molecular dynamics enediyne antibiotics

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Молекулярная эволюция, подвижность белков и компьютерное молекулярное конструирование (2024)

Multimodal EEG, ECG, and video dataset of yoga practitioners during concentration and mind-wandering tasks

Kashevnik A., Glekler E., Артёменко Е. Д. и др., Scientific data 2026 Article 7209

Добавлено: 23 апреля 2026 г.

Machine Learning Approach to Anticancer Activity Prediction of Transition-Metal Complexes Based on a Large-Scale Experimental Database

Krasnov L., Malikov D., Kiseleva M. и др., Journal of Medicinal Chemistry 2026 Vol. 69 No. 8 P. 8838–8851

Добавлено: 23 апреля 2026 г.

Cu(I) acetylide clusters decorated with pyridylphosphine ligands: structural diversity, cuprophilic interactions and phosphorescence properties

Новиков А. С., Inorganic Chemistry Communications 2026 Article 116670

Добавлено: 22 апреля 2026 г.

Rapid synthesis of redox-responsive trithiocyanuric acid-based nanocarriers: in vitro multidrug resistance reversal and In vivo safety assessment

Kopoleva E., Sergey A. Tsymbal, Кучур О. А. и др., Drug Delivery and Translational Research 2026 P. 1–16

Добавлено: 20 апреля 2026 г.

Dipolar [3+2] Cycloaddition of Nitrones to 3-Aroylpyrrolo[2,1-c][1,4]benzothiazine-1,2,4-triones

Новиков А. С., Russian Journal of Organic Chemistry 2026 Vol. 62 Article 12

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

Modeling cosolvent effects on solubility in supercritical CO2 using data-driven approaches

Makarov D. M., Каликин Н. Н., Gurikov P. и др., Journal of Supercritical Fluids 2026 Vol. 235 Article 106979

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

Функциональные признаки листьев и экологические стратегии важны для формирования растительных сообществ субальпийских болот и высокотравья

G.V.Klink, Gulov D. M., Elumeeva T. G. и др., Журнал общей биологии 2024 Т. 85 № 2 С. 83–94

Функциональные признаки растений важны для формирования состава растительных сообществ и доминирования в них. Сравнение средних значений признаков у организмов внутри сообщества с таковым для случайных выборок местной биоты позволяет оценить значимость признака для формирования состава сообществ. Сравнение средних и средневзвешенных значений признаков позволяет оценить их роль для доминирования в том или ином сообществе. Мы исследовали ...

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

The partitioning of mobile fractions of chemical elements in the mineral loamy soils during natural regeneration after plowing in Western Russia

G.V.Klink, Semenkov I. N., Enchilik P. R., Science of the Total Environment 2025 Vol. 998 Article 180219

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

Theory of capillary-induced self-coacervation in zwitterionic polymer solutions

Каликин Н. Н., Брандышев П. Е., Будков Ю. А., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 164 Article 154904

Добавлено: 18 апреля 2026 г.

Self-face viewing attenuates cardiac modulation of corticospinal excitability

Макарова М. М., Федосов Н. П., Mikhailova I. и др., FRONTIERS IN SIGNAL PROCESSING 2026

Добавлено: 17 апреля 2026 г.

Inactivation of NONO by Auranofin or RNA Interference Triggers Lethal Oxidative Stress in Neuroblastoma Cells

Pogodaeva S. S., Miletina O. O., Mammadova L. V. и др., Frontiers in Bioscience - Landmark 2026 Vol. 31 No. 4 P. 48544–48557

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Discovery of Novel 1,3,5-Triazine Derivative as Potent Anticancer Agent: DNA and HSA Binding, MTT Assay

Chernov I., Protas A., Popova E. и др., Biochemistry. Biokhimiia 2025 Vol. 19 No. 3 P. 279–287

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Saying “Yes” to NONO: A Therapeutic Target for Neuroblastoma and Beyond

Pogodaeva S., Miletina O., Antipova N. и др., Cancers 2025 Vol. 17 No. 19 Article 3228

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Metal-Based Therapeutic Approaches for Overcoming Cancer Drug Resistance: Mechanisms, Drug Delivery Strategies, and Clinical Perspectives

Chernov K., Savin A., Otvodnikova D. и др., Oncology Research 2026 Vol. - No. -

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Взаимодействие аффективных и когнитивных компонентов рабочей памяти при удержании эмоционально-окрашенной информации. Нейрокогнитивный анализ

Кочеткова Е. В., Мачинская Р. И., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2025 Т. 75 № 2 С. 170–188

В обзоре представлен анализ современных психологических теорий эмоций и соответствующих им концепций нейронального обеспечения обработки и удержания в рабочей памяти эмоциональ но окрашенной информации. Общей тенденцией современных нейрокогнитивных исследований является отказ от локализации отдельных когнитивных функций в пользу сетевых моделей, в кото рых обеспечение психических процессов осуществляется распределенными сетями, объединяющи ми функционально специфичные структуры коры и глубинных образований. Такие сети ...

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Metal-Based Therapeutic Approaches for Overcoming Cancer Drug Resistance: Mechanisms, Drug Delivery Strategies, and Clinical Perspectives

Chernov K. V., Savin A. M., Otvodnikova D. E. и др., Oncology Research 2026 Vol. 34 No. 5 P. 1–40

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Retention of Emotional and Socio-Emotional Information in Working Memory: EEG Functional Connectivity Study

Кочеткова Е. В., Machinskaya R., Human Physiology 2025 Vol. 51 No. 6 P. 580–590

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

The Complex of Copper (II) and Zoledronic Acid: Relevance to Oxidative Death of Leukemia Cells in the Bone Marrow

Barskaya E. S., Savin A. M., Chernov K. V. и др., International Journal of Molecular Sciences 2026 Vol. 27 No. 6 Article 2800

Добавлено: 15 апреля 2026 г.

Enhancement of Rotenone Cytotoxicity in the Presence of Bach1 Inhibitors

S. V. Nikulin, Olkhovik D., A.V. Razumovskaya и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2026

Добавлено: 13 апреля 2026 г.

MDProcessing.jl: Julia Programming Language Application for Molecular Dynamics Trajectory Processing

Писарев В. В., Panov M., , in: Supercomputing: 9th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2023, Moscow, Russia, September 25–26, 2023, Revised Selected Papers, Part II* 2.: Springer, 2023. P. 209–222.

Добавлено: 11 ноября 2025 г.

Immune Antibodies Recognizing the Stem Region of SARS-CoV-2 Spike Protein: Molecular Modelling and In Vitro Study of Synthetic Peptides Presentation to the Antibodies

Aliper E., Ryzhov I., Obukhova P. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2026 Vol. 1868 No. 1 Article 184472

Antibodies to peptide 1147 (amino acids 1147-61) of the SARS-CoV-2 protein S are highly diagnostic. Peptide 1147, although located in a region that is partly spatially hidden in the intact protein, is not subject to mutations, suggesting therapeutic potential. The aim of this study was to elucidate the architecture of this region and the way ...

Добавлено: 20 октября 2025 г.

Diverse Interactions of Sterols with Amyloid Precursor Protein Transmembrane Domain Can Shift Distribution Between Alternative Amyloid-β Production Cascades in Manner Dependent on Local Lipid Environment

Volynsky P., Urban A., Pavlov K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2025 Vol. 26 No. 2 Article 553

Alzheimer’s disease (AD) pathogenesis is correlated with the membrane content of various lipid species, including cholesterol, whose interactions with amyloid precursor protein (APP) have been extensively explored. Amyloid-β peptides triggering AD are products of APP cleavage by secretases, which differ depending on the APP and secretase location relative to ordered or disordered membrane microdomains. We used high-resolution NMR to probe ...

Добавлено: 12 октября 2025 г.

Combining Experimental and Computational Methods to Produce Conjugates of Anticholinesterase and Antioxidant Pharmacophores with Linker Chemistries Affecting Biological Activities Related to Treatment of Alzheimer's Disease

Махаева Г. Ф., Ковалева Н. В., Рудакова Е. В. и др., Molecules 2024 Vol. 29 No. 2 Article 321

В мире весьма высока потребность в эффективных препаратах для лечения болезни Альцгеймера (БА). В нашей предыдущей работе в этом направлении были синтезированы новые кандидатные препараты, состоящие из 4-амино-2,3-полиметиленхинолинов, конъюгированных с бутилированным гидрокситолуолом с помощью алкилиминовых или алкиламиновых линкеров фиксированной длины (спейсеров), и исследована их биологическая активность, важная для лечения БА. Здесь мы сообщаем о значительном ...

Добавлено: 14 сентября 2025 г.

3-(3-Azabicyclo[2, 2, 1]heptan-2-yl)-1,2,4-oxadiazoles as Novel Potent DPP-4 Inhibitors to Treat T2DM

Zinevich T., Maslov I., Kirichenko O. и др., Pharmaceuticals 2025 Vol. 18 No. 5 Article 642

Добавлено: 17 июля 2025 г.