Structure-based rational design of an enhanced fluorogen-activating protein for fluorogens based on GFP chromophore

Goncharuk M.; Baleeva N.; Nolde Dmitry E.; Gavrikov A.; Mishin A.; Mishin A.; Sosorev A.; Arseniev A.; Goncharuk S.; Borshchevskiy V.; Efremov Roman G.; Mineev K.; Baranov M.

doi:10.1038/s42003-022-03662-9

?

Structure-based rational design of an enhanced fluorogen-activating protein for fluorogens based on GFP chromophore

Communications Biology. 2022. Vol. 5. Article 706.

Goncharuk M., Baleeva N., Nolde Dmitry E., Gavrikov A., Mishin A., Mishin A., Sosorev A., Arseniev A., Goncharuk S., Borshchevskiy V., Efremov Roman G., Mineev K., Baranov M.

Научное направление: Химия Физика Биология

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: молекулярная динамика chemical synthesis химический синтез NMR molecular dynamics ЯМР fluorescent proteins флуоресцентные белки

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Суперкомпьютерные технологии, теория и атомистическое многомасштабное моделирование в физике материалов и науках о живом (2022)

Metastability of lipid vesicle shapes in uniaxial extensional flow

Пикина Е. С., Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 2026 Vol. 113 No. 5

Добавлено: 1 сентября 2026 г.

HF Heating Effects as Seen From Below and Above: First Results of Joint SURA–Ionosfera-M Experiment

Чернышов А. А., Padokhin A. M., Grach S. M. и др., Geophysical Research Letters 2026 Vol. 53 P. 1–11

Добавлено: 31 августа 2026 г.

Hectometric Continuum Radiation Observations on Different Temporal Scales in Near-Earth Space

D. A. Dorofeev, A. A. Chernyshov, Mogilevsky M. M. и др., JOURNAL OF GEOPHYSICAL RESEARCH-SPACE PHYSICS 2025 Vol. 130 Article e2025JA033900

Добавлено: 31 августа 2026 г.

On the nature of hectometric continuum-type emissions in the near-Earth plasma

Mogilevsky M. M., Шапошников В. Е., Чернышов А. А. и др., Physics of Plasmas 2025 Vol. 32 P. 1–10

Добавлено: 31 августа 2026 г.

(111)-Textured p-Type PbTe Films Grown on Muscovite Micawith High Room-Temperature Hole Mobility

Kobtsev Danil, Albert J., Nitzan M. и др., Applied Sciences (Switzerland) 2026 Vol. 16 No. 17 Article 8577

Добавлено: 30 августа 2026 г.

Сборник трудов XXXII Международной научно-технической конференции «Радиолокация, навигация, связь»

Воронеж: Издательский дом ВГУ, 2026.

В сборник вошли материалы XXXII Международной научно-технической конференции «Радиолокация, навигация, связь» (RLNC*2026), прошедшие ре цензирование членами программного комитета конференции. Основной целью конференции является организация взаимодействия научных и научно технических коллективов для обмена опытом и новыми творческими успехами. Достижение этой цели также способствует внедрению перспективных разрабо ток, имеющих практическое значение для дальнейшего развития промышленно сти, экономики ...

Добавлено: 29 августа 2026 г.

Pyramidal solitons: existence, instability, and interactions

Мельников И. Е., Пелиновский Е. Н., Nonlinear Dynamics 2026 No. 114 Article 934

Добавлено: 27 августа 2026 г.

Non-epitaxial perovskite polariton laser diode operating under direct current

Жуков А. Е., Крыжановская Н. В., Моисеев Э. И. и др., Nature 2026 Vol. 656 P. 80–85

Добавлено: 27 августа 2026 г.

Monometallic Ln3+ and heterometallic Ln3+–Cd2+ complexes based on pentafluorophenylacetic acid: efficient control of dimension and luminescent properties

Белоусов Ю. А., Кискин М. А., Сидорук А. В. и др., Australian Journal of Chemistry 2022 Vol. 75 No. 9 P. 572–580

Добавлено: 26 августа 2026 г.

Прогностическое значение полигенного профиля риска при дилатационной кардиомиопатии: анализ краткосрочной выживаемости

Кубкин Я. В., Российский кардиологический журнал 2026 Т. 31 № 8S

Цель. Оценить вклад полигенных шкал риска в модель краткосрочного прогнозирования летальности у пациентов с дилатационной кардиомиопатией (ДКМП). Материал и методы. В исследование включены 137 пациентов с ДКМП. Средний возраст составил 56,8±13,5 года; мужчин было 115 (83,9%). Медиана периода наблюдения составила 17 [13; 22] месяцев. За время наблюдения умерли 26 пациентов (19,0%). Для выявления предикторов краткосрочной общей летальности построена ...

Добавлено: 24 августа 2026 г.

Understanding the electric double layer at electrode–electrolyte interfaces, Part III: crystallographic-face dependence of silver capacitance in aqueous NaF solutions

Мазур Д. А., Брандышев П. Е., Doronin S. V. и др., Electrochimica Acta 2026 Vol. 577 Article 149729

Добавлено: 20 августа 2026 г.

Giant magnetocaloric effect in the quaternary Fe–Rh–Pd–Ir alloy: Experimental and first-principles study

Gimaev R., Karpenkov A., Shelkovyi F. и др., Journal of Alloys and Compounds 2026 No. 1080 Article 190307

Магнитотермические свойства четвертичного сплава Fe49Rh46.1Pd3.1Ir1.8 исследованы с помощью комбинации расчетов из первых принципов, структурной характеристики, магнитометрии, калориметрии и прямых измерений адиабатического изменения температуры. Получен исключительный магнитокалорический отклик: ΔTad достигает −11,9 К в поле 1,85 Т в прерывистом режиме и −8,6 К в непрерывном (циклическом) режиме, причем оба значения превышают значения, зарегистрированные на сегодняшний день для ...

Добавлено: 18 августа 2026 г.

Quantum viscosity mechanism of dissipative dynamics in the Dicke model expressed via Lindblad equation of motion

Beck M. E., Сеидов С. С., Mukhin S., Physical Review A: Atomic, Molecular, and Optical physics 2026 Vol. 113 No. 6 Article 063706

Добавлено: 13 августа 2026 г.

Analytical solution of coupled self-consistency and linearized Usadel equations for dirty superconductors near 𝑇𝑐 and with the proximity effect

S. S. Seidov, N. G. Pugach, Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 No. 7 Article 074504

Добавлено: 13 августа 2026 г.

Hadrons in N = 2 supersymmetric QCD from non-Abelian string on 2D black hole

Ievlev E., Marshakov A., Sumbatian G. и др., Physical Review D - Particles, Fields, Gravitation and Cosmology 2026 Vol. 114 Article 046006

Добавлено: 13 августа 2026 г.

Reconstruction of EEG signals using next-generation reservoir computing

Badarin A., Ратников Ф. Д., Andreev A., European Physical Journal: Special Topics 2026 P. 1–10

Добавлено: 12 августа 2026 г.

Production of Λ hyperons in 4.0A GeV and 4.5A GeV carbon-nucleus interactions at the Nuclotron

Afanasiev S., Agakishiev G., Aleksandrov A. и др., Journal of High Energy Physics 2026 Vol. 2026 Article 48

Добавлено: 12 августа 2026 г.

Hall effect in electrolyte solutions: Self-consistent Debye–Hückel–Onsager theory

Будков Ю. А., Каликин Н. Н., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 165 Article 064506

Добавлено: 12 августа 2026 г.

Cytometric proteome profiling of GFP-tagged yeast for characterizing novel antifungals

Ghazy E., Bidiuk V., Рябов Ф. Д. и др., Communications Biology 2026 Vol. 9 Article 885

Анализ клеточных ответов на антимикробные молекулы — один из способов понять механизмы действия потенциальных лекарственных препаратов. Часто это делают с помощью транскриптомики и протеомики, однако простых и недорогих методов для быстрой характеристики таких ответов не хватает. Чтобы восполнить этот пробел, мы оценили изменения в количестве панели из 64 «сигнальных» белков, слитых с GFP, у дрожжей ...

Добавлено: 10 июня 2026 г.

Revealing Structure-Reporting Patterns of Pyruvylation Effects on 13C NMR Chemical Shifts in Natural Saccharides

Тоукач Ф. В., Smirnova N. S., Zdorovenko E. L. и др., Analytical Chemistry 2026 Vol. 98 No. 15 P. 10988–10996

Добавлено: 25 мая 2026 г.

Scaling Up Molecular Hydrodynamics of Non-Laminar Flows with GPU-Aware MPI

Khnkoian G., Галигеров В. С., Grishichkin Y. и др., , in: Parallel Computational Technologies, 19th International Conference, PCT 2025, Moscow, Russia, April 8–10, 2025, Revised Selected Papers. (CCIS, volume 2891)Vol. 2891.: Springer, 2026. P. 532–545.

Добавлено: 19 мая 2026 г.

КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ МЕХАНИЗМА ЭКСТРАКЦИИ Fe(III) ИЗ СОЛЯНОКИСЛОГО ВОДНОГО РАСТВОРА ЭВТЕКТИЧЕСКИМИ РАСТВОРИТЕЛЯМИ НА ОСНОВЕ 1-ОКТАНОЛА

Мальцева В. Е., Милевская А. В., Милевский Н. А. и др., Теоретические основы химической технологии 2025 Т. 59 № 3 С. 13–22

Проведено квантово-химическое моделирование механизма экстракции Fe(III) из солянокислого раствора с использованием гидрофобных эвтектических растворителей на основе 1-октанола. Установлено, что путь реакции существенно различается в зависимости от того, является ли инертный компонент донором или акцептором водородной связи в димере с октанолом. На основе оценки прочности водородных связей показано, что более слабое взаимодействие между компонентами упрощает протекание ...

Добавлено: 13 мая 2026 г.

Multiphosphorylated molecules for buried interface regulation of inverted perovskite solar cells in a two-step process

Luo S., Bi Z., Xiong L. и др., Energy and Environmental Sciences 2026 Vol. 19 No. 6 P. 2069–2083

Добавлено: 25 февраля 2026 г.

Compression-Induced Lattice Tilting Quenches Ion Migration at Metal Halide Perovskite Grain Boundaries: A Machine Learning Molecular Dynamics Study

Mikhail R. Samatov, Лю Д., Emir S. Amirov и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2025 Vol. 16 No. 51 P. 13068–13074

Добавлено: 20 декабря 2025 г.