Molecular Dynamics of DHHC20 Acyltransferase Suggests Principles of Lipid and Protein Substrate Selectivity

Публикации

?

Molecular Dynamics of DHHC20 Acyltransferase Suggests Principles of Lipid and Protein Substrate Selectivity

International Journal of Molecular Sciences. 2022. Vol. 23. No. 9. Article 5091.

Панина И. С., Крылов Н. А., Gadalla M. R., Aliper E., Kordyukova L., Veit M., Чугунов А. О., Ефремов Р. Г.

Язык: английский

Полный текст

DOI

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Суперкомпьютерные технологии, теория и атомистическое многомасштабное моделирование в физике материалов и науках о живом (2022)

Finding the Materials Harder than Diamond: Macroscale and Microscale Studies

Сысоэв, Э., Bashirov I., Sychov M. и др., ACS Applied Materials & Interfaces 2025 Vol. 17 No. 22 P. 33108 – 33120

Добавлено: 12 ноября 2025 г.

The coronavirus spike HR2 domain: an obscure player entering the limelight during membrane fusion?

Aliper E. T., Ефремов Р. Г., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2025 Vol. 1867 No. 8 Article 184445

The coronavirus spike protein, the key entity effectuating membrane fusion, cannot exist without membraneactive fragments. In addition to fusion peptides, among such domains are HR1 and HR2. Crucial to the spike’s refolding and membrane fusion, they are believed to both interact with each other and bind to the membranes that are merged. To elucidate HR2’s precise role in ...

Добавлено: 12 октября 2025 г.

Nanoscale lipid domains determine the dynamic molecular portraits of mixed DOPC/DOPS bilayers in a fluid phase: a computational insight

Veretenenko I. I., Trofimov Y. A., Krylov N. A. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2024 Vol. 1866 No. 7 Article 184376

Добавлено: 19 сентября 2024 г.

The study of peculiarities of parabens solvation in methanol- and acetone-modified supercritical carbon dioxide by computer simulation

Одинцова Е. Г., Journal of Supercritical Fluids 2017 Vol. 126 P. 47–54

Добавлено: 29 августа 2024 г.

Molecular dynamics simulation of the solvated environment of 18-crown-6 ether in methanol-acetonitrile mixed solvents

Одинцова Е. Г., Journal of Molecular Liquids 2021 Vol. 325 P. 115191–0

Добавлено: 29 августа 2024 г.

Molecular origin of structural defects in the zinc phthalocyanine film

Одинцова Е. Г., Physical Chemistry Chemical Physics 2022 Vol. 24 No. 33 P. 19956–19964

Добавлено: 29 августа 2024 г.

Structure of aqueous solutions of lignin treated by sub- and supercritical water: Experiment and simulation

Одинцова Е. Г., Journal of Molecular Liquids 2023 Vol. 383 P. 122030–0

Добавлено: 29 августа 2024 г.

Insights into the Self-Assembly of Water Reverse Micelles and Solubilization Process in Liquid and Supercritical Solvents: A Molecular Dynamics Study

Darya L. Gurina, Yury A. Budkov, Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects 2023 Vol. 676 Article 132200

Добавлено: 8 августа 2023 г.

First-principles calculations of the viscosity in multicomponent metallic melts: Al-Cu-Ni as a test case

Кондратюк Н. Д., Ryltsev R., Ankudinov V. и др., Journal of Molecular Liquids 2023 Vol. 380 Article 121751

Добавлено: 16 мая 2023 г.

Electronic resonances in expanding non-neutral ultracold plasma

Bronin S. Y., Vikhrov E. V., Саакян С. А. и др., Physics of Plasmas 2024 Vol. 31 No. 3 Article 033507

Добавлено: 13 февраля 2023 г.

The Mechanism of Selective Recognition of Lipid Substrate by hDHHC20 Enzyme

Панина И. С., Крылов Н. А., Чугунов А. О. и др., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 Article 14791

Добавлено: 9 декабря 2022 г.

A uniquely stable trimeric model of SARS-CoV-2 spike transmembrane domain

Aliper E. T., Krylov Nikolay A., Nolde Dmitry E. и др., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23(16) Article 9221

Добавлено: 25 августа 2022 г.

Molecular dynamics study of sucrose aqueous solutions: From solution structure to transport coefficients

Deshchenya V. I., N. D. Kondratyuk, Lankin A. V. и др., Journal of Molecular Liquids 2022 Vol. 367 Article 120456

Добавлено: 9 августа 2022 г.

АТОМИСТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ СТРУКТУРНЫХ И ДИНАМИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ВОДНЫХ РАСТВОРОВ NACL И NA2SO4 В МЕЖСЛОЕВОМ ПРОСТРАНСТВЕ ЭТТРИНГИТА

Тарарушкин Е. В., Писарев В. В., Калиничев А. Г., Журнал физической химии 2022 Т. 96 № 4 С. 607–612

Применение новой модификации силового поля ClayFF для молекулярно-динамического моделирования кристаллов эттрингита и взаимодействия с их поверхностью водных растворов NaCl и Na2SO4, показывает, что возможность явного учета взаимодействий металл–O–H в системе приводит к формированию более прочных водородных связей в структуре кристалла и на поверхности, большей локализации атомов как кристаллической фазы, так и растворов в приповерхностной зоне. ...

Добавлено: 16 мая 2022 г.