?
A uniquely stable trimeric model of SARS-CoV-2 spike transmembrane domain
International Journal of Molecular Sciences. 2022. Vol. 23(16). Article 9221.
Ключевые слова: molecular hydrophobicity potentialмолекулярный гидрофобный потенциалtransmembrane domainтрансмембранный доменМоделирование молекулярной динамикиMolecular dynamics simulationstructure predictionviral fusion proteinhelical trimertemplate-based modelingMonte Carlo conformational searchпредсказание структурывирусные белки слияниятример из спиралей моделирование на основании шаблонаконформационный поиск методом Монте-Карло
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Батова О. Н., Савинецкая Л. Е., Проявка С. В. и др., Nature Conservation Research. Заповедная наука 2026 Т. 11 № 4 С. 25–39
Spermophilus suslicus – находящийся под угрозой исчезновения вид, внесенный в Красные книги всех уровней (от региональных до международного Красного списка) и нуждающийся в настоящее время в особых мерах охраны. За последние 30–50 лет его ареал из сплошного стал мозаичным, а численность повсеместно сократилась. В начавшихся в России в 2015 г. экспериментальных работах по реинтродукции вида ...
Добавлено: 13 октября 2026 г.
Singapore: Springer Singapore, 2026.
Добавлено: 12 октября 2026 г.
Goncharov A., Чибисов А. Н., Advanced Theory and Simulations 2023 Vol. 12 No. 13 Article 2200816
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Prokhorenko A., Чибисов А. Н., Gnidenko A. и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2024 Vol. 15 No. 41 P. 10295–10300
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Чибисов А. Н., Chibisova M., Modern Electronic Materials 2025 Vol. 71 P. 99–103
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Tyagi V., Srivastava A., Mangal A. и др., Surfaces and Interfaces 2025 Vol. 73 Article 107591
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Добавлено: 11 октября 2026 г.
Vangapandu E., Agrawal S., Kumar S. и др., Materials Science in Semiconductor Processing 2026 Vol. 211 Article 110752
Добавлено: 10 октября 2026 г.
В данной работе исследуются теоретические пределы обнаружения объектов в изотропных рассеивающих средах с использованием однофотонного лидара. В рамках упрощенной модели мы выводим фундаментальную зависимость между максимальной достижимой дальностью обнаружения и необходимым количеством фотонов в импульсе. Анализируются два различных предельных режима: режим баллистических фотонов, который сохраняет высокое пространственное разрешение, но требует экспоненциального увеличения мощности источника с ...
Добавлено: 8 октября 2026 г.
Добавлено: 8 октября 2026 г.
Добавлено: 8 октября 2026 г.
Кузькин В. А., Кривцов А. М., Wang Y. и др., Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 2026 Vol. 113 Article 65305
Мы предлагаем подход к моделированию молекулярной динамики на основе анализа временных рядов, получивший название ChronoCast; в нем используется усовершенствованная авторегрессионная эквивариантная графовая нейронная сеть, преобразующая традиционно трудоемкий процесс интегрирования уравнений движения в задачу прогнозирования. Такое переосмысление задачи открывает перспективный путь к преодолению проблемы огромных вычислительных затрат, характерной для исследования сложных физических систем с помощью классических ...
Добавлено: 24 сентября 2026 г.
Сысоэв, Э., Bashirov I., Sychov M. и др., ACS Applied Materials & Interfaces 2025 Vol. 17 No. 22 P. 33108 – 33120
Добавлено: 12 ноября 2025 г.
Aliper E. T., Ефремов Р. Г., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2025 Vol. 1867 No. 8 Article 184445
The coronavirus spike protein, the key entity effectuating membrane fusion, cannot exist without membraneactive
fragments. In addition to fusion peptides, among such domains are HR1 and HR2. Crucial to the spike’s
refolding and membrane fusion, they are believed to both interact with each other and bind to the membranes
that are merged. To elucidate HR2’s precise role in ...
Добавлено: 12 октября 2025 г.
Volynsky P., Urban A., Pavlov K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2025 Vol. 26 No. 2 Article 553
Alzheimer’s disease (AD) pathogenesis is correlated with the membrane content
of various lipid species, including cholesterol, whose interactions with amyloid precursor
protein (APP) have been extensively explored. Amyloid-β peptides triggering AD are
products of APP cleavage by secretases, which differ depending on the APP and secretase location
relative to ordered or disordered membrane microdomains. We used high-resolution
NMR to probe ...
Добавлено: 12 октября 2025 г.
Veretenenko I. I., Trofimov Y. A., Krylov N. A. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2024 Vol. 1866 No. 7 Article 184376
Добавлено: 19 сентября 2024 г.
Aliper E., Roman G. Efremov, International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 22 Article 16421
Добавлено: 15 сентября 2024 г.
Одинцова Е. Г., Journal of Supercritical Fluids 2017 Vol. 126 P. 47–54
Добавлено: 29 августа 2024 г.
Одинцова Е. Г., Journal of Molecular Liquids 2021 Vol. 325 P. 115191–0
Добавлено: 29 августа 2024 г.
Одинцова Е. Г., Physical Chemistry Chemical Physics 2022 Vol. 24 No. 33 P. 19956–19964
Добавлено: 29 августа 2024 г.
Одинцова Е. Г., Journal of Molecular Liquids 2023 Vol. 383 P. 122030–0
Добавлено: 29 августа 2024 г.