?
ЭКСПРЕССИЯ ИЗОФОРМ CD44 В ОПУХОЛЯХ И КЛЕТОЧНЫХ ЛИНИЯХ КОЛОРЕКТАЛЬНОГО РАКА ЧЕЛОВЕКА
Выявление биомаркеров колоректального рака (КРР) остаётся актуальной задачей для диа- гностики и прогнозирования течения заболевания. Перспективным подходом считается изу- чение маркеров раковых стволовых клеток. Гликопротеин клеточной поверхности CD44 имеет особое значение для колоректального рака и его раковых стволовых клеток. Альтернативный сплайсинг 9 вариабельных экзонов мРНК CD44 приводит к образованию различных изоформ белка, роли которых в прогрессировании опухолевых заболеваний различны и требуют под- робного изучения. Для проведения таких исследований необходимы адекватные модели, отражающие распределение изоформ CD44 в образцах реальных опухолей. Оценивали про- филь экспрессии изоформ CD44 в образцах колоректального рака на основе общедоступных данных секвенирования мРНК клинических опухолей пациентов из базы данных TCGA-COAD. Было показано, что нормальные ткани экспрессировали преимущественно изоформы 3 и 4 почти на одном уровне, тогда как опухоли — в основном изоформы 2, 3 и 4, при этом уро- вень экспрессии изоформы 3 был наиболее высоким. Кроме того, на основе анализа данных секвенирования мРНК для 55 клеточных линий колоректального рака из базы данных CCLE были определены наиболее подходящие клеточные линии для изучения роли CD44.