• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • Cobra cardiotoxins: membrane interactions and pharmacological potential
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
18 мая 2026 г.
В Вышке прошла XXX юбилейная научно-техническая конференция имени Е.В. Арменского
Организатором научного события выступает Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова ВШЭ. В этом году главный инженерный студенческий форум проходил 30-й раз и собрал рекордное число участников. Студенты, аспиранты и молодые специалисты из 50 вузов и организаций России представили научно-исследовательские доклады в ИТ-области. Отдельная секция была посвящена научно-исследовательским работам школьников.
15 мая 2026 г.
В НИУ ВШЭ разрабатывают нейросеть для сферы науки и инноваций
Исследователи НИУ ВШЭ учат большие языковые модели понимать русскоязычную научную терминологию, увеличивая при этом их энергоэффективность. Адаптированная модель работает в 2,7 раза быстрее и требует на 73% меньше памяти, чем исходная открытая модель, что позволяет запускать ее на более доступном оборудовании. Программа прошла государственную регистрацию.
15 мая 2026 г.
Стартовал совместный спецпроект бренд-медиа Вышки IQ Media и iFORA ИСИЭЗ
В мае 2026 года стартовал научно-популярный проект «Искусственный интеллект: технологии, данные и будущее», который стал результатом работы двух команд — проекта iFORA Института статистических исследований и экономики знаний НИУ ВШЭ и редакции бренд-медиа IQMedia. Медийно-аналитический спецпроект посвящен современному развитию искусственного интеллекта и аналитике больших данных.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Cobra cardiotoxins: membrane interactions and pharmacological potential

Current Medicinal Chemistry. 2013. Vol. 21. No. 3. P. 270–287.
Ефремов Р. Г., Konshina A., Dubovskii P.

Natural polycationic membrane-active peptides typically lack disulfide bonds and exhibit fusion, cell-penetrating, antimicrobial activities. They are mostly unordered in solution, but adopt a helical structure, when bound to phospholipid membranes. Structurally different are cardiotoxins (or cytotoxins, СTs) from cobra venom. They are fully b-structured molecules, characterized by the three-finger fold (TFF). Affinity of CTs to lipid bilayer was shown to depend on amino acid sequence in the tips of the three loops. In the present review, CT-membrane interactions are analyzed through the prism of data on binding of the toxins to phospholipid liposomes and detergent micelles, as well as their structural and computational studies in membrane mimicking environments. We assess different hydrophobicity scales to compare membrane partitioning of various CTs and their membrane effects. A comparison of hydrophobic/hydrophilic properties of CTs and linear polycationic peptides provides a key to their biological activity and reveal rationality for design of new membrane-interacting compounds. Finally, since the viewpoint of the data obtained on model lipid membranes, cytotoxic activity of CTs against cancer cells is discussed.

Приоритетные направления: компьютерно-математическое
Язык: английский
Полный текст
Текст на другом сайте
Ключевые слова: молекулярное моделированиеmolecular modelingcardiotoxinmembrane-active peptidesprotein-membrane interactionsкардиотоксинмембрано-активные пептидыбелок-мембранные взаимодействия
Похожие публикации
Natural hazard database from Internet publications: text mining with a large language model
Деркачева А. А., Сакиркина М. А., Краев Г. Н. и др., /. 2026.
Добавлено: 28 апреля 2026 г.
Ising models on the hydrogen peroxide and other lattices
Qin X., Deng Y., Щур Л. Н. и др., / Series arXiv "math". 2026. No. 2603.02962.
Добавлено: 20 апреля 2026 г.
Algorithmic overlaps as thermodynamic variables: from local to cluster Monte Carlo dynamics in critical phenomena
Пиле Я. Э., Deng Y., Щур Л. Н., / Series arXiv "math". 2026. No. 2604.10254.
Добавлено: 20 апреля 2026 г.
Using predefined vector systems to speed up neural network multimillion class classification
Gabdullin N., Андросов И. А., / Series Computer Science "arxiv.org". 2026.
Добавлено: 2 апреля 2026 г.
Iterative Ricci-Foster Curvature Flow with GMM-Based Edge Pruning: A Novel Approach to Community Detection
Сорокин К. С., Бекетов М. Е., Онучин А. и др., / arxiv.org. Серия cs.SI "Social and Information Networks ". 2025.
Обнаружение сообществ в сложных сетях — фундаментальная проблема, открытая для новых подходов в различных научных областях. Мы представляем новый метод обнаружения сообществ, основанный на потоке Риччи на графах. Наша техника итеративно обновляет веса ребер (их метрические длины) в соответствии с их (комбинаторной) версией кривизны Риччи Фостера, вычисленной на основе эффективного расстояния сопротивления между узлами. Известно, ...
Добавлено: 15 января 2026 г.
Implementing Transport Coding in OMNeT++ for Message Delay Reduction
Петрованов И. С., Сергеев А. В., / Series Computer Science "arxiv.org". 2025. No. 2512.18332.
Добавлено: 24 декабря 2025 г.
Hessian-based lightweight neural network for brain vessel segmentation on a minimal training dataset
Меньшиков И. А., Бернадотт А. К., Елфимов Н. С., / Series arXie "Statistical mechanics". 2025.
Добавлено: 1 декабря 2025 г.
Determining the boundary of dynamical chaos in the generalized Chirikov map via machine learning
Чернышов Д. П., Сатанин А. М., Щур Л. Н., / Series arXiv "math". 2025.
Добавлено: 21 ноября 2025 г.
Эффективный алгоритм торговли на фондовом рынке: ретроспективный анализ, основанный на данных по S&P-500.
Рубчинский А. А., Чубарова Д. А., / Series WP7 "Математические методы анализа решений в экономике, бизнесе и политике". 2025. No. WP7/2025/01.
Добавлено: 9 ноября 2025 г.
The coronavirus spike HR2 domain: an obscure player entering the limelight during membrane fusion?
Aliper E. T., Ефремов Р. Г., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2025 Vol. 1867 No. 8 Article 184445
The coronavirus spike protein, the key entity effectuating membrane fusion, cannot exist without membraneactive fragments. In addition to fusion peptides, among such domains are HR1 and HR2. Crucial to the spike’s refolding and membrane fusion, they are believed to both interact with each other and bind to the membranes that are merged. To elucidate HR2’s precise role in ...
Добавлено: 12 октября 2025 г.
Diffusion on language model embeddings for protein sequence generation
Мещанинов В. П., Strashnov, P., Shevtsov A. и др., / Cornell University. Серия CoRR, arXiv:2403.03726 "Computing Research Repository,". 2025.
Дизайн белков требует глубокого понимания присущей сложности «белкового вселенной». Хотя многие работы ориентируются на условную генерацию или сосредоточены на отдельных семействах белков, базовая задача безусловной генерации остаётся недостаточно изученной и недооценённой. В этой работе мы исследуем именно этот ключевой аспект и представляем DiMA — модель, которая использует непрерывную диффузию по эмбеддингам, полученным из языковой модели для белков ESM-2, ...
Добавлено: 5 октября 2025 г.
Smoothie: Smoothing Diffusion on Token Embeddings for Text Generation
Шабалин А. М., Мещанинов В. П., Vetrov D., / Series cs.CL, arXiv:2505.18853 "Computation and Language". 2025.
Диффузионные модели достигли передовых результатов в генерации изображений, аудио и видео, однако их адаптация к тексту остаётся сложной из-за его дискретной природы. Ранее подходы либо применяют гауссовскую диффузию в непрерывных латентных пространствах, что наследует семантическую структуру, но затрудняет декодирование токенов, либо работают в пространстве категориального симплекса, что учитывает дискретность, но игнорирует семантические связи между токенами. ...
Добавлено: 5 октября 2025 г.
A Feature Engineering Framework for Computer Vision Based on Topological Data Analysis
Абрамов А. С., Чернышев В. Л., Михайлец Е. В. и др., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2025.
Добавлено: 23 сентября 2025 г.
On the construction of frieze patterns from partitions of convex polygons by nonintersecting diagonals
Кочетков Ю. Ю., / Series arXiv.org e-print archive "arXiv.math". 2025. No. 07600.
Добавлено: 17 сентября 2025 г.
On one property of Catalan numbers
Кочетков Ю. Ю., / Series arXiv.org e-print archive "arXiv.math". 2025. No. 20584.
Добавлено: 9 сентября 2025 г.
Structural Basis of Activity of HER2-Targeting Construct Composed of DARPin G3 and Albumin-Binding Domains
Konshina A., Bocharov E., Konovalova E. и др., International Journal of Molecular Sciences (Швейцария) 2024 Vol. 25 No. 21 Article 11370
Добавлено: 9 декабря 2024 г.
Add-Ons To Molecular Modeling Methods: Improvement In Activity Prediction
Svitanko I. V., Novikov F. N., Medvedev M. G., , in: XXII Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry, October 7-12, 2024, Federal Territory “Sirius”, Russia. Book of abstracts in 7 volumesVol. 5.: “Admiral Print” LLC, 2024.
Надстройки к методам молекулярного моделирования, улучшающие точность прогнозирования активности ...
Добавлено: 14 октября 2024 г.
Inconspicuous yet indispensable: the coronavirus spike transmembrane domain
Aliper E., Roman G. Efremov, International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 22 Article 16421
Добавлено: 15 сентября 2024 г.
Molecular Dynamics Simulations of Nucleosomes Are Coming of Age
Fedulova A., Armeev G., Romanova T. и др., Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science 2024 Vol. 14 No. 4 Article e1728
Understanding the function of eukaryotic genomes, including the human genome, is undoubtedly one of the major scientific challenges of the 21st century. The cornerstone of eukaryotic genome organization is nucleosomes—elementary building blocks of chromatin about 10 nm in size that wrap DNA around an octamer of histone proteins. Nucleosomes are integral players in all genomic processes, ...
Добавлено: 29 августа 2024 г.
Molecular modeling in synthesis: from statistical methods to quantum chemistry and practical applications
I. V. Svitanko, Pivina T. S., Russian Chemical Bulletin 2024 Vol. 73 No. 5 P. 1093–1108
Добавлено: 21 июня 2024 г.
Discovery and In Vivo Efficacy of Trace Amine-Associated Receptor 1 (TAAR1) Agonist 4-(2-Aminoethyl)-N-(3,5-dimethylphenyl)piperidine-1-carboxamide Hydrochloride (AP163) for the Treatment of Psychotic Disorders
Krasavin M., Peshkov A., Lukin A. и др., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 No. 19 Article 11579
Добавлено: 8 февраля 2024 г.
The Potential of Usnic-Acid-Based Thiazolo-Thiophenes as Inhibitors of the Main Protease of SARS-CoV-2 Viruses
Yarovaya O., Filimonov A., Baev D. и др., Viruses 2024 Vol. 16 No. 2 Article 215
Добавлено: 31 января 2024 г.
Imidazole-4-N-acetamide Derivatives as a Novel Scaffold for Selective Targeting of Cyclin Dependent Kinases
Rusina P., Gandalipov E., Abdyusheva Y. и др., Cancers 2023 Vol. 15 No. 15 Article 3766
Добавлено: 1 ноября 2023 г.
Analysis of Ion Atmosphere Around Nucleosomes Using Supercomputer MD Simulations
Nikita A. Kosarim, Armeev G., Alexey K. Shaytan и др., Supercomputing Frontiers and Innovations 2022 Vol. 9 No. 2 P. 56–67
Добавлено: 4 сентября 2023 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • http://www.edu.ru
    Федеральный портал «Российское образование»
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика конфиденциальности
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору