The Potential of Usnic-Acid-Based Thiazolo-Thiophenes as Inhibitors of the Main Protease of SARS-CoV-2 Viruses

Yarovaya O.; Filimonov A.; Baev D.; Borisevich S.; Zaykovskaya A.; Chirkova V.; Marenina M.; Meshkova Y.; Belenkaya S.; Shcherbakov D.; Maxim A. Gureev; Luzina O.; Pyankov O.; Salakhutdinov N.; Khvostov M.

doi:10.3390/v16020215

?

The Potential of Usnic-Acid-Based Thiazolo-Thiophenes as Inhibitors of the Main Protease of SARS-CoV-2 Viruses

Viruses. 2024. Vol. 16. No. 2. Article 215.

Yarovaya O., Filimonov A., Baev D., Borisevich S., Zaykovskaya A., Chirkova V., Marenina M., Meshkova Y., Belenkaya S., Shcherbakov D., Maxim A. Gureev, Luzina O., Pyankov O., Salakhutdinov N., Khvostov M.

Научное направление: Химия Компьютерные науки Биология

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: molecular modeling SARS-CoV-2 main protease usnic acid 3CLpro

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Молекулярная эволюция, подвижность белков и компьютерное молекулярное конструирование (2024)

Proceedings of the 11th Workshop on Automated Knowledge Base Construction (AKBC 2026)

[б.и.], 2026.

Добавлено: 28 октября 2026 г.

A Novel Tetrazole-Oxadiazole Hybrid: Synthesis, Computational Insights, and Biological Evaluation as a Potential Anticancer Agent

Antonenko D., Skryl’nikova M., Mikolaichuk O. и др., Journal of Molecular Structure 2027 Vol. 1382 No. 1 Article 147918

This study reports the design, synthesis, and comprehensive experimental and computational evaluation of a novel isopropyl 2-((5-((5-phenyl-2H-tetrazol-2-yl)methyl)-1,3,4-oxadiazol-2-yl)thio)acetate. As the first investigation in a planned series, this proof-of-concept study concentrates on a single model compound to validate the virtually unexplored tetrazole–oxadiazole hybrid class as a promising scaffold for anticancer agents. The target compound was synthesized via S-alkylation of ...

Добавлено: 28 октября 2026 г.

Molecular dynamics and machine learning insights into oil-brine interfacial tension: Uncovering roles of dissolved gases and salinity

Nikitiuk B., Lenev D., Писарев В. В. и др., Journal of Colloid and Interface Science 2026 Vol. 718 Article 140444

Добавлено: 28 октября 2026 г.

Predicting multi-component oil viscosity using machine learning methods

Deshchenya V., Nikolay D. Kondratyuk, Sivakova A. и др., Chemical Engineering Sciences 2027 Vol. 337 Article 124616

Добавлено: 28 октября 2026 г.

PARSE: Physical attribute representativity and stationarity evaluator open-source library for 3D images using scalar and vector metrics

Zubov A., Zubov A., Малявко, Я. и др., Computer Physics Communications 2025 Vol. 317 Article 109860

Добавлено: 28 октября 2026 г.

Amplifying Latent Safety in Large Language Models via Gated Activation Steering

Roman Prosvirnin, Suslov A., Aleksei Soldatov и др., Computation 2026 Vol. 14 No. 10 Article 261

Добавлено: 27 октября 2026 г.

PACTraD: Multi-Task Benchmark and Domain-Specific Attention Mechanism for Wildlife Classification, Detection, and Segmentation in Protected Area Camera Trap Data

Aleksei Samarin, Назаренко А. А., Nazarenko D. и др., Big Data and Cognitive Computing 2026 Vol. 10 No. 11 P. 1–52

Добавлено: 27 октября 2026 г.

Молекулярные механизмы резистентности клеток рака мочевого пузыря RT112/GR к гемцитабину

Четверикова М. М., Потемкин А. Н., Степанова Е. В., Бюллетень экспериментальной биологии и медицины 2026 Т. 182 № 9 С. 242–247

Препарат первой линии при раке мочевого пузыря гемцитабин часто теряет эффективность из-за резистентности, механизмы которой изучены недостаточно. Путём длительной селекции получена высокорезистентная к гемцитабину клеточная линия RT112/GR. МТТ-тест показал 9312-кратное снижение чувствительности к гемцитабину и умеренную резистентность к цисплатину (2,60×, p < 0,0001). Резистентные клетки приобрели мезенхимальные признаки. ОТ-ПЦР выявила гиперэкспрессию цитидиндезаминазы (CDA) (FC = 7,2) и гипоэкспрессию дезоксицитидинкиназы ...

Добавлено: 26 октября 2026 г.

2026 10th Scientific School Dynamics of Complex Networks and their Applications

IEEE, 2026.

Добавлено: 26 октября 2026 г.

A Curated Dataset for Chemical Characterization of Heated Tobacco Product Aerosol

Maddalena L., Yildiz B., Del Vecchio Blanco F. и др., Scientific data 2026 P. 1–20

Добавлено: 26 октября 2026 г.

A 2D chlorobismuthate(III) framework built via Cl2-mediated halogen bonding

Новиков А. С., Polyhedron 2026 Vol. 301 Article 118454

New dichloro-chlorobismuthate supramolecular hybrid, (Me3NH)2{[BiCl5](Cl2)}, has been prepared and characterized by X-ray diffractometry as well as Raman spectroscopy. The self-assembly of 2D dihalogen-halometalate architecture succeeds via Cl⋯Cl halogen bonds (3.066 and 3.543 Å). These features were assessed with DFT calculations and Interaction region indicator analysis. ...

Добавлено: 23 октября 2026 г.

Molecular mechanisms regulating differential expression of individual miRNAs within polycistronic clusters

Мальцева Д. В., Тоневицкий А. Г., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 P. 1–28

Добавлено: 23 октября 2026 г.

Intentionally versus spontaneously prolonged Gaze: A MEG study of active gaze-based interaction

Vasilyev A., Svirin EP, Dubynin I. и др., Cortex 2025 Vol. 189 P. 76–96

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Role of Bach1 Transcription Factor in the Mechanisms of Cell Death

Karina V. Klycheva, Mariia O. Silkina, Dmitry M. Hushpulian и др., Biochemistry. Biokhimiia 2026 Vol. 91 P. 1842–1858

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Десинхронизация сенсомоторных ритмов при совершении квазидвижений, основанных на естественных движениях пальцев руки

Свирин Е. П., Бердышев Д. А., Шишкин С. Л., Вестник Российского государственного медицинского университета 2026 № 3 С. 42–50

Квазидвижения (КД) — попытки движения, минимизированные до исчезновения движения, — вызывают ЭЭГ-паттерны, схожие с реальным движением. КД могут моделировать попытки движения у здоровых участников и потому представляют интерес как альтернатива представлению движений (ПД) для реабилитационных интерфейсов мозг–компьютер (ИМК), в которых попытка движения парализованной конечностью используется как управляющий сигнал. КД ранее исследовали на отведении большого пальца. ...

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Large amyloid plaques associate with early behavioral alterations in 6-month-old APPswe/PS1dE9 mice

Sitdikova K., Tsoy A., Chaprov K. и др., Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 2026 Article nlag078

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Effects of Wheat Malt Extract on Molecular and Behavioral Markers in Aged APP/PS1 and Wild-Type Mice

Kassenova A., Svirin E., Sitdikova K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2026 Vol. 27 No. 11 Article 4994

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Partial Serotonin Transporter Deficiency Modulates Plasma Metabolome, Arginine-Nitric Oxide Pathway and Emotional Behavior in Mice Exposed to Western Diet

Cespuglio R., Schmitt-Böhrer A., Deykin A. и др., Metabolites 2026 Vol. 16 No. 2 Article 117

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Stress tensor in fundamental measure theory of hard-sphere fluids: A thermomechanical approach

Будков Ю. А., Каликин Н. Н., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 165 No. 16 Article 164108

Добавлено: 22 октября 2026 г.

A Multi-Feature Fusion Deep Neural Network with Attention for Multi-Task Crop Monitoring

Obsie E. Y., Zhan Y., Liu Y., Engineering Research Express 2026 Article 7

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Anionic dysprosium complexes with two axial photochromic spirooxazine ligands, {(TMI-NSO)2.DyIIII4)(-), with TBA+ and Cp*2Co+ counter cations: zero-field SIM behaviour with high magnetization blocking barriers

Nazarov D., Фараонов М. А., Gritsan N. P. и др., Dalton Transactions 2026 Vol. 55 P. 14394–14408

Добавлено: 21 октября 2026 г.

The advent of generative chemistry

Ванхэлен К. Б., Lin Y., Zhavoronkov A., ACS Medicinal Chemistry Letters 2020 Vol. 11 No. 8 P. 1496–1505

Генеративные состязательные сети (GAN), впервые описанные в 2014 году, являются одними из важнейших концепций в современном искусственном интеллекте (ИИ). Объединяя глубокое обучение и теорию игр, GAN используются для генерации или «воображения» новых объектов с желаемыми свойствами. С 2016 года множество GAN с подкреплением (RL) успешно применяются в фармакологии для проектирования молекул de novo. Эти методы ...

Добавлено: 1 июня 2026 г.

Immune Antibodies Recognizing the Stem Region of SARS-CoV-2 Spike Protein: Molecular Modelling and In Vitro Study of Synthetic Peptides Presentation to the Antibodies

Aliper E., Ryzhov I., Obukhova P. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2026 Vol. 1868 No. 1 Article 184472

Antibodies to peptide 1147 (amino acids 1147-61) of the SARS-CoV-2 protein S are highly diagnostic. Peptide 1147, although located in a region that is partly spatially hidden in the intact protein, is not subject to mutations, suggesting therapeutic potential. The aim of this study was to elucidate the architecture of this region and the way ...

Добавлено: 20 октября 2025 г.

Differences in Presentation of SARS-CoV-2 Omicron Strain Variant BA.1–BA.5 Peptides by HLA Molecules

Нерсисян С. А., Шкурников М. Ю., Жиянов А. П. и др., Doklady Biochemistry and Biophysics 2022 Vol. 507 No. 1 P. 298 – 301

Добавлено: 1 сентября 2025 г.