• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • HSE University
  • Publications
  • Articles
  • Complete genomic and epigenetic maps of human centromeres
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Priority areas
  • business informatics
  • economics
  • engineering science
  • humanitarian
  • IT and mathematics
  • law
  • management
  • mathematics
  • sociology
  • state and public administration
by year
  • 2028
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • More
Subject
News
September 30, 2026
'We Did Not Limit the Time for Questions'
The International Laboratory for Supercomputer Atomistic Modelling and Multi-Scale Analysis at HSE University held a major conference on molecular dynamics. Participants had the opportunity to attend all the presentations, while speakers were given as much time as they needed to answer questions. The HSE News Service interviewed Grigory Smirnov, Head of the Laboratory, and Genri Norman, Chief Research Fellow, about the conference preparations and the discussions it generated.
September 25, 2026
AI Users Earn Up to 41.8% More Than Non-Users
Research conducted by economists at HSE University has revealed a significant correlation between the regular use of GenAI in the workplace and higher pay among Russian employees. The study found that individuals who frequently use GenAI in their professional activities earn notably more than those who reject these new tools or resort to them occasionally. The salary premium for highly qualified specialists reaches 41.8%. The article was published in the Voprosy Ekonomiki journal.
September 24, 2026
‘Feedback and Constructive Criticism Are Essential in Our Profession
Vincent Fardeau, Associate Professor at HSE ICEF, has reached a major career milestone: he recently published his paper ‘Asymmetric Thin Markets’ in the Journal of Financial Economics, successfully passed his major academic review, and received tenure. In this interview, Vincent discusses the story behind the paper, explains the concept of asymmetric thin markets, and shares his advice for young scholars aiming to publish in top-tier journals.

 

Have you spotted a typo?
Highlight it, click Ctrl+Enter and send us a message. Thank you for your help!

Publications
  • Books
  • Articles
  • Chapters of books
  • Working papers
  • Report a publication
  • Research at HSE

?

Complete genomic and epigenetic maps of human centromeres

Science. 2022. Vol. 376. No. 6588. Article eabl4178.
Altemose N., Logsdon G., Bzikadze A., Sidhwani P., Langley S., Caldas G., Hoy S., Fedor D. Ryabov

Существующие сборки генома человека почти полностью исключали повторяющиеся последовательности внутри и вблизи центромер, что ограничивало наше понимание их организации, эволюции и функций, которые включают в себя содействие правильной сегрегации хромосом. Теперь полная сборка генома человека от теломеры до теломеры (T2T-CHM13) позволила нам всесторонне охарактеризовать перицентромерные и центромерные повторы, составляющие 6,2% генома (189,9 мегабаз). Детальные карты этих регионов выявили многомегабазовые структурные перестройки, в том числе в активных массивах центромерных повторов. Анализ последовательностей, связанных с центромерой, выявил тесную связь между положением центромеры и эволюцией окружающей ДНК за счет расширения слоистых повторов. Кроме того, сравнение центромер хромосомы X у разных людей выявило высокую степень структурных, эпигенетических и последовательных вариаций в этих сложных и быстро эволюционирующих регионах.

Research target: Biology
Language: English
Full text
DOI
Text on another site
Keywords: геномикаHuman genomicscentromereT2T-con-sortiumcentromere genomicsцентромеры
Similar publications
A New Recruitable E3 Ligase UHRF1 Supporting Targeted Protein Degradation: A Minimal Azide as a Recruitment Ligand
Gureev M., Advanced Science 2026 P. 1–13
Targeted protein degradation represents a promising therapeutic strategy, yet its broader application is often limited by the scarcity of usable E3 ligases. Glutathione peroxidase 4 (GPX4) is a key target for inducing ferroptosis, but achieving sustained and potent inhibition remains challenging with conventional enzymatic inhibitors. Herein, we report the first small‐molecule GPX4 degraders that incorporate ...
Added: September 26, 2026
A28-04 Measuring the Polygenic Risk of Thrombosis May Accelerate the Detection of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Among Other Forms of Pulmonary Hypertension
Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. et al., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212
Accurate classification of a patient with pulmonary hypertension (PH) into one of five groups is fundamental for appropriate disease management strategies. The time from disease onset to correct diagnosis is unacceptably long in many cases. Chronic thromboembolic pulmonary hypertension (CTEPH) develops as a consequence of venous thromboemboli, resulting in a more pronounced hereditary predisposition to ...
Added: September 23, 2026
Haplotype-resolved DiMeLo-seq maps centromeric chromatin in a complete diploid human genome
Xu Y., Ryabov F., Alexandrov I. et al., USA 2026 Vol. 6 No. 8 Article 101324
Центромеры обеспечивают расхождение хромосом, однако организацию их хроматина в пределах повторяющейся альфа-сателлитной ДНК долгое время было трудно изучать. Для решения этой задачи мы создали гаплотип-разрешённые аннотации сателлитной ДНК для полной диплоидной сборки генома человека T2T-HG002. Затем с помощью метода направленного метилирования с секвенированием длинных прочтений (DiMeLo-seq) мы картировали центромерный белок A (CENP-A), модификацию H3K9me3 и ...
Added: September 23, 2026
A complete genome for the common marmoset
Hebbar P., Ryabov F., Alexandrov I. et al., Cell 2026 Vol. 189 P. 4891–4908.e12
The common marmoset is a New World monkey widely used to study primate evolution and human disease. We present a telomere-to-telomere (T2T) reference assembly for the species, plus three near-T2T haplotypes. These resolve previously inaccessible regions, including the centromeres, sex chromosomes, subterminal satellites, acrocentric chromosomes, and the major histocompatibility complex (MHC). We find marmoset centromeres ...
Added: September 23, 2026
Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction
Shaitan A., Ke Y., Shutao C. et al., 2026 No. 24 Article 181
Background Therapeutic peptides exert pivotal effects in diverse biological processes, and have attracted significant interest in the field of biomedicine in recent years. However, most existing methods often fail to adequately capture the intricate interactions among amino acid residues and the contextual dependencies within peptide sequences, which hampers the extraction of deep semantic representations and ...
Added: September 18, 2026
A functional systems view on neural tracking of natural speech
Anton Rogachev, Sysoeva O., Frontiers in Systems Neuroscience 2025 Vol. 19 Article 1658243
Added: September 17, 2026
Neural tracking of natural speech in children in relation to their receptive speech abilities
Rogachev A.O., Sysoeva O. V., Cognitive Systems Research 2024 Vol. 86 Article 101236
Receptive speech is the ability to understand speech addressed to a person. It is a crucial process for a child’s cognitive development. We examine the relationship between receptive speech and neural tracking of natural speech in 52 children aged 3–8 years to infer the neurophysiological mechanisms underlying speech development. We registered a 32-channel electroencephalogram (EEG) ...
Added: September 17, 2026
Vague stimulating ideas, images and metaphors in scientific thinking: researchers' work with horizons of unclear knowledge
Poddiakov A., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2026. No. 7437658.
Clarity of knowledge and reasoning is necessary in many cases. Yet vagueness in scientific thinking related to surprise, curiosity, "ability to engage with not-knowing" (de Freitas) and abductive reasoning is also a crucially important source of scientific creativity which supplements combinatorial logic when dealing with the already known. Starting from studies by C. S. Peirce ...
Added: September 15, 2026
Разработка методик на основе айтрекинга для диагностики когнитивных функций у детей
Ребрейкина А. Б., Liaukovich K., Современная зарубежная психология 2024 Т. 13 № 2 С. 33–43
Создание методик диагностики на основе анализа движений глаз является особенно актуальным для оценки когнитивных функций у детей, которые не могут дать речевой или моторный ответ в силу своего возраста или из-за нарушений развития. Для таких детей использование объективных методов оценки когнитивных функций на основе айтрекинга может стать полезным диагностическим инструментом, дополняющим традиционные поведенческие опросники и ...
Added: September 8, 2026
Развитие когнитивных функций детей с помощью методик, использующих видеоокулографию
Ребрейкина А. Б., Liaukovich K., Современная зарубежная психология 2023 Т. 12 № 4 С. 51–61
Активное развитие метода видеоокулографии, т. е. регистрации движений глаз, создает возможности для создания новых подходов для развития когнитивных функций и обучения. Методики, основанные на видеоокулографии, могут быть полезны не только для детей с серьезными нарушениями моторных функций, но и детей с нарушениями развития когнитивных функций, прежде всего внимания, так как контроль движений глаз тесно связан ...
Added: September 8, 2026
Вегетативные и поведенческие показатели при увеличении когнитивной нагрузки у здоровых добровольцев
Портнова Г. В., Liaukovich K., Васильева Л. Н. et al., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2022 Т. 72 № 4 С. 504–519
Когнитивная и эмоциональная нагрузка в ходе увеличения сложности задач приводит к активации различных звеньев вегетативной нервной системы и может сопровождаться как увеличением эффективности решения задач, так и способствовать дестабилизации эмоционального состояния и уменьшению продуктивности. Увеличение когнитивной нагрузки при условии высокой мотивации испытуемых является стрессовым фактором и выражается в различной реакции симпатического и парасимпатического звеньев в ...
Added: September 8, 2026
DSCA-HLAII: A dual-stream cross-attention model for predicting peptide–HLA class II interaction and presentation
Shaitan A., Ke Y., Hongjun Y. et al., PLoS Computational Biology 2026 Article e1013836
The interaction between peptides and human leukocyte antigen class II (HLA-II) molecules plays a pivotal role in adaptive immune responses, as HLA-II mediates the recognition of exogenous antigens and initiates T cell activation through peptide presentation. Accurate prediction of peptide-HLA-II binding serves as a cornerstone for deciphering cellular immune responses, and is essential for guiding the optimization of antibody therapeutics. ...
Added: September 7, 2026
Salivary Antioxidant Capacity and Magnesium in Generalized Anxiety Disorder
Proskurnina E., Liaukovich K., Bychkovskaya L. et al., Metabolites 2023 Vol. 13 No. 1 P. 73
Added: September 7, 2026
Event-Related Potential Study of Recovery of Consciousness during Forced Awakening from Slow-Wave Sleep and Rapid Eye Movement Sleep
Liaukovich K., Sazhin S., Bobrov P. et al., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 No. 19 P. 11785
Added: September 7, 2026
Implicit auditory perception of local and global irregularities in passive listening condition
Liaukovich K., Ukraintseva Y., Martynova O., Neuropsychologia 2022 Vol. 165 P. 108129
Added: September 7, 2026
Pupillometry and autonomic nervous system responses to cognitive load and false feedback: an unsupervised machine learning approach
Alshanskaia E., Portnova G., Liaukovich K. et al., Frontiers in Neuroscience 2024 Vol. 18
Added: September 7, 2026
Characteristics of the Frequency-Following Response to Changes in the Acoustic Parameters of a Speech Signal (Isolated Syllable)
Oknina L. B., Podlepich V. V., Sieber I. et al., Human Physiology 2026 Vol. 52 No. 3 P. 295–301
The aim of this study was to evaluate the potential use of the frequency-following response (FFR) for assessing preserved perception of simple speech stimuli in humans. To this end, event-related potentials (ERPs) elicited by isolated Russian syllables were recorded and analyzed in 29 healthy subjects in two frequency ranges, the standard range (1—40 Hz) and ...
Added: September 6, 2026
Что такое Свобода? Свобода воли, свободы личности, конституционная модель и законодательное регулирование
Момджян К. Х., Кржевов В. С., Poddiakov A. et al., М.: Новые печатные технологии, 2025.
При всей кажущейся ясности и недвусмысленности понятия «свобода» дать ему исчерпывающую научную дефиницию весьма затруднительно. У каждой отрасли знания свой подход к трактовке этого многоаспектного понятия. В ходе обсуждения, материалы которого вошли в настоящий сборник, свобода рассматривается с позиций философии, социологии, юриспруденции, психологии, нейрофизиологии и т.д. Участники дискуссии рассуждают о границах свободы воли и субъектности человека, о соотношении свободы и ...
Added: September 6, 2026
Event-related potentials and presaccadic activity in response to affective stimuli in participants with obsessive-compulsive disorder
Liaukovich K., Panfilova E., Khayrullina G. et al., International Journal of Psychophysiology 2025 Vol. 207 P. 112475
Added: September 5, 2026
The acoustic features of sincere joyful, sad, and fearful human non-verbal vocalizations and its effect on the emotional valence of cat’s meowing
Portnova G., Liaukovich K., Sharaev M., Cognitive Neurodynamics 2025 Vol. 19 Article 181
Added: September 5, 2026
Validation of the obsessive–compulsive disorder-triggering image set (OCD-TIS)
Liaukovich K., Bainbridge E., Khayrullina G. et al., Neuroscience and Behavioral Physiology 2026 Vol. 56 P. 10–19
Added: September 5, 2026
HPRC2: A human pangenome reference with near-complete coverage of common genetic variation
Lucas J., Hebbar P., Ryabov F. et al., / Series 10.64898/2026.07.21.739710 "10.64898/2026.07.21.739710". 2026.
A pangenome reference overcomes the inherent limitation of any individual reference genome by integrating the variation present in a population. We present the Human Pangenome Reference Consortium’s (HPRC) Release 2 (HPRC2), an openly available, second phase pangenome that is an approximately fivefold expansion in genome number over HPRC Release 1 (HPRC1) and measurable improvement in ...
Added: August 10, 2026
GENA-LM: a family of open-source foundational DNA language models for long sequences
Fishman V., Kuratov Y., Shmelev A. et al., Nucleic Acids Research 2025 Vol. 53 No. 2 Article gkae1310
Recent advancements in genomics, propelled by artificial intelligence, have unlocked unprecedented capabilities in interpreting genomic sequences, mitigating the need for exhaustive experimental analysis of complex, intertwined molecular processes inherent in DNA function. A significant challenge, however, resides in accurately decoding genomic sequences, which inherently involves comprehending rich contextual information dispersed across thousands of nucleotides. To ...
Added: August 1, 2025
Centromeric transposable elements and epigenetic status drive karyotypic variation in the eastern hoolock gibbon
Hartley G., Okhovat M., Hoyt S. et al., Cell Genomics 2025 Vol. 5 No. 4 Article 100808
У человекообразных обезьян сохраняется стабильный кариотип с небольшим числом крупномасштабных перестроек; у гиббонов, напротив, наблюдается высокий уровень хромосомных перестроек, сопровождающийся быстрой сменой центромер. Здесь мы охарактеризовали полностью собранные центромеры восточного гиббона Hoolock leuconedys (HLE), обнаружив разнообразную группу транспозируемых элементов (TEs), которые отличаются от канонических альфа-сателлитов, встречающихся на центромерах других приматов. Мы обнаружили, что центромеры HLE ...
Added: May 16, 2025
  • About
  • About
  • Key Figures & Facts
  • Sustainability at HSE University
  • Faculties & Departments
  • International Partnerships
  • Faculty & Staff
  • HSE Buildings
  • HSE University for Persons with Disabilities
  • Public Enquiries
  • Studies
  • Admissions
  • Programme Catalogue
  • Undergraduate
  • Graduate
  • Exchange Programmes
  • Summer University
  • Summer Schools
  • Semester in Moscow
  • Business Internship
  • Research
  • International Laboratories
  • Research Centres
  • Research Projects
  • Monitoring Studies
  • Conferences & Seminars
  • Academic Jobs
  • Yasin (April) International Academic Conference on Economic and Social Development
  • Media & Resources
  • Publications by staff
  • HSE Journals
  • Publishing House
  • iq.hse.ru: commentary by HSE experts
  • Library
  • Economic & Social Data Archive
  • Video
  • HSE Repository of Socio-Economic Information
  • HSE1993–2026
  • Contacts
  • Copyright
  • Privacy Policy
  • Site Map
Edit