Docking and Molecular Dynamics Studies on DNA-Heterocyclic Enediynes Interaction to Identify the Preferred Binding Mode

В пособии кратко изложены теоретические и практические аспекты первичных навыков, необходимых для работы в биологической лаборатории, а также приведены протоколы практических занятий в рамках профессиональной учебной практики (ознакомительной) I курса бакалаврской программы «Клеточная и молекулярная биотехнология» факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ. Учебно-методическое пособие предназначено для студентов и преподавателей факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ и ...

Добавлено: 30 сентября 2026 г.

Анализ in silico вероятных зависимостей «структура-активность» этанола

Рыскина Е. А., Князев Е. Н., Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии 2026 Т. 29 № 9 С. 84–91

Введение. Активная интеграция стремительно развивающихся омиксных и компьютерных технологий в XXI веке позволяет осуществить прорыв в понимании принципов функционирования живых систем. Одним из динамично развивающихся интегративных направлений в биологии является биологическое моделирование. Фундаментальной парадигмой стала методология, позволяющая спрогнозировать биологическую активность молекул на основе анализа их структуры Structure-Activity Relationship (SAR). Цель работы - предсказать in silico возможность ...

Добавлено: 29 сентября 2026 г.

MPI+OpenMP implementation of resolution-of-the-identity Hartree-Fock method exploiting permutational symmetry of three-center electron repulsion integrals

Kashpurovich I., Oleynichenko A., Стегайлов В. В., Supercomputing Frontiers and Innovations 2026 Vol. 13 No. 1 P. 52–73

Добавлено: 28 сентября 2026 г.

A New Recruitable E3 Ligase UHRF1 Supporting Targeted Protein Degradation: A Minimal Azide as a Recruitment Ligand

Гуреев М. А., Advanced Science 2026 P. 1–13

Добавлено: 26 сентября 2026 г.

Critical dynamics of conformational exchange in a nearcritical solvent: A statistical-mechanical three-mode theory

Будков Ю. А., Kiselev M. G., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 165 No. 12 Article 124508

Добавлено: 24 сентября 2026 г.

Multilayer Membranes Based on MK-40 for Electrodialysis Separation of Ions

Юрова П. А., Стенина И. А., Ярославцев А. Б., Membranes and Membrane Technologies 2026 Vol. 8 No. 1 P. 1–8

Добавлено: 24 сентября 2026 г.

Effect of crack size and its position on cyclic deformation behavior of refractory highentropy alloy HfNbTiZr

Корзникова Е. А., Babicheva R. I., Davletbakov A. A. и др., JOURNAL OF MATERIALS SCIENCE: MATERIALS IN ENGINEERING 2026 Vol. 21 Article 84

С помощью комбинированного моделирования методами Монте-Карло (МК) и молекулярной динамики (МД) исследовано влияние положения и размера трещины на ближний порядок (SRO) и поведение при высокотемпературном циклическом деформировании тугоплавкого высокоэнтропийного сплава (RHEA) HfNbTiZr с использованием моделей бикристаллов. Установлено, что на процесс формирования ближнего порядка влияет не только размер трещины (а именно величина ее раскрытия), но и ...

Добавлено: 24 сентября 2026 г.

A28-04 Measuring the Polygenic Risk of Thrombosis May Accelerate the Detection of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Among Other Forms of Pulmonary Hypertension

Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. и др., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Haplotype-resolved DiMeLo-seq maps centromeric chromatin in a complete diploid human genome

Xu Y., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., USA 2026 Vol. 6 No. 8 Article 101324

Centromeres ensure chromosome segregation, but their chromatin organization within repetitive alpha-satellite DNA has been difficult to resolve. To address this, we generated haplotype-resolved satellite DNA annotations for the complete diploid T2T-HG002 human genome assembly, then we mapped centromere protein A (CENP-A), H3K9me3, and CpG methylation on ultra-long, adaptively sampled nanopore reads using directed methylation with ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

A complete genome for the common marmoset

Hebbar P., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., Cell 2026 Vol. 189 P. 4891–4908.e12

Обыкновенная игрунка — обезьяна Нового Света, широко используемая для изучения эволюции приматов и заболеваний человека. Мы представляем референсную сборку генома этого вида «от теломеры до теломеры» (T2T), а также три гаплотипа, собранных почти до уровня T2T. Эти сборки позволяют охарактеризовать ранее недоступные участки генома, включая центромеры, половые хромосомы, субтеломерные сателлитные повторы, акроцентрические хромосомы и главный ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Exact screening constraints for theories of inhomogeneous electrolytes: Generalized Stillinger–Lovett relations and a nonlinear Ward hierarchy

Будков Ю. А., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 165 No. 12 Article 124105

Добавлено: 22 сентября 2026 г.

Formation of Singly Bonded {CpCo(CO)-η 2 -C 60 – } 2 Dimers upon the Dimerization of the CpCo(CO)-η 2 -C 60 •– Radical Anions

sobov P., Yakushev I., Shestakov A. и др., Organometallics 2025 Vol. 44 No. 24 P. 2873–2881

Добавлено: 20 сентября 2026 г.

Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction

Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., 2026 No. 24 Article 181

Добавлено: 18 сентября 2026 г.

A functional systems view on neural tracking of natural speech

Anton Rogachev, Сысоева О. В., Frontiers in Systems Neuroscience 2025 Vol. 19 Article 1658243

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Neural tracking of natural speech in children in relation to their receptive speech abilities

Anton Rogachev, Сысоева О. В., Cognitive Systems Research 2024 Vol. 86 Article 101236

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Substituent-driven supramolecular assembly in Hg(II) bromide complexes with pyridine-based hydrazone ligands: crystal structures, Hirshfeld surface analysis, and DFT/QTAIM study

Новиков А. С., Polyhedron 2026 Vol. 299 Article 118383

Three new Hg(II) bromide complexes, HgBr2L (1–3) (L1 = N′-(pyridin-2-ylmethylene)isonicotinohydrazide, L2 = N′-(1-(pyridin-2-yl)ethylidene)isonicotinohydrazide, L3 = N′-(phenyl(pyridin-2-yl)methylene)isonicotinohydrazide), have been synthesized in good yields and thoroughly characterized. Single-crystal X-ray diffraction analyses unveil that complexes 1 and 3 are mononuclear, while complex 2 is dinuclear. All complexes further assemble into one-dimensional supramolecular chains mediated by N–H···N hydrogen bonds, which are reinforced by π···π stacking and Br···Br halogen interactions. Systematic variation ...

Добавлено: 16 сентября 2026 г.

Изоформы микроРНК hsa-miR‐143-3p как регуляторы HK2 и SERPINE1 при гипоксии трофобласта и преэклампсии

Чеботарева О. Е., Пирогов А. А., Антипенко И. Д. и др., Доклады российской академии наук. Науки о жизни 2026 Т. 529 № 1 С. 389–395

Преэклампсия (ПЭ) – это тяжелое осложнение беременности, обусловленное хронической ишемией плаценты. Полногеномный скрининг изоформ микроРНК в двух моделях гипоксии трофобласта (CoCl2 и производное оксихинолина нейрадапт, клетки BeWo b30) и в клинических образцах при ПЭ (ткань плаценты, везикулы синцитиотрофобласта) выявил согласованное снижение изоформ hsa-miR‐143-3p. При строгом пороге кратности во всех условиях снижены каноническая изоформа (21 нт) и уридинилированная miR‐143-3p|0|–1(+1U) ...

Добавлено: 16 сентября 2026 г.

Vague stimulating ideas, images and metaphors in scientific thinking: researchers' work with horizons of unclear knowledge

Поддьяков А. Н., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2026. No. 7437658.

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Water confined in heterogeneous clay–quartz pores: Structure and dynamics from atomistic simulations

Глушак А. А., Тарарушкин Е. В., Смирнов Г. С., Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects 2027 Vol. 752 Article 141756

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Coordination-driven assemblies of thioindigo and phthalocyanine chromophores: tuning optical absorption and magnetic interactions

Kolin N., Nazarov D., Krivenko K. и др., Dyes and Pigments 2026 Vol. 254 Article 113957

Добавлено: 14 сентября 2026 г.

Doubly Reduced Phthalocyanine Complexes of V(IV), Cu(II), and Sn(II): Synthesis, Structure, and Spin Dynamics

Фараонов М. А., Romanenko N., Ivanov T. и др., Dalton Transactions 2026 Vol. 55 No. 24 P. 9428–9438

Добавлено: 14 сентября 2026 г.

Scaling Up Molecular Hydrodynamics of Non-Laminar Flows with GPU-Aware MPI

Khnkoian G., Галигеров В. С., Grishichkin Y. и др., , in: Parallel Computational Technologies, 19th International Conference, PCT 2025, Moscow, Russia, April 8–10, 2025, Revised Selected Papers. (CCIS, volume 2891)Vol. 2891.: Springer, 2026. P. 532–545.

Добавлено: 19 мая 2026 г.

MDProcessing.jl: Julia Programming Language Application for Molecular Dynamics Trajectory Processing

Писарев В. В., Panov M., , in: Supercomputing: 9th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2023, Moscow, Russia, September 25–26, 2023, Revised Selected Papers, Part II* 2.: Springer, 2023. P. 209–222.

Добавлено: 11 ноября 2025 г.

Immune Antibodies Recognizing the Stem Region of SARS-CoV-2 Spike Protein: Molecular Modelling and In Vitro Study of Synthetic Peptides Presentation to the Antibodies

Aliper E., Ryzhov I., Obukhova P. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2026 Vol. 1868 No. 1 Article 184472

Antibodies to peptide 1147 (amino acids 1147-61) of the SARS-CoV-2 protein S are highly diagnostic. Peptide 1147, although located in a region that is partly spatially hidden in the intact protein, is not subject to mutations, suggesting therapeutic potential. The aim of this study was to elucidate the architecture of this region and the way ...

Добавлено: 20 октября 2025 г.