Force field comparison for molecular dynamics simulations of liquid membranes

Kashurin O.; N. Kondratyuk; Lankin A.; G. Norman

doi:10.1016/j.molliq.2024.126347

Публикации

?

Force field comparison for molecular dynamics simulations of liquid membranes

Journal of Molecular Liquids. 2024. Vol. 416. Article 126347.

Kashurin O., Кондратюк Н. Д., Lankin A., Норман Г. Э.

To accelerate the development of liquid ion-selective barriers based on ethers, we compare the all-atom
force fields GAFF, OPLS-AA with charge correction 1.14*CM1A (OPLS-AA/CM1A), CHARMM version 36
(CHARMM36), and COMPASS for diisopropyl ether (DIPE) to determine the most appropriate model for further
simulations of liquid membranes. Utilizing the selected force fields, we calculate the density and shear viscosity
of DIPE across a temperature range of 243–333 K. Furthermore, we use CHARMM36 with mTIP3P water model
and COMPASS with its own water model to evaluate the mutual solubility and interfacial tension between DIPE
and water, estimate the partition coefficients of ethanol in DIPE + Ethanol + Water systems. Based on our
comparative study, we conclude that CHARMM36 is the most suitable force field for modeling ether-based liquid
membranes.

Научное направление: Естественные науки Физика Компьютерные науки

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: shear viscosity Solubility molecular dynamics Force field diisopropyl ether Interfacial tension

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Суперкомпьютерное молекулярное моделирование в физике материалов (2024)

Local Fault-Tolerant Routing in 3D Mesh NoCs using Single-Hop Rollback

Edward R. Rzaev, Aleksandr Y. Romanov, Andrey M. Sukhov, IEEE Access 2026

Добавлено: 23 июля 2026 г.

Influence of Pulsed Laser Radiation on the Morphology and Surface Properties of Tungsten Implanted with Helium Ions

Borovitskaya I. V., Pimenov V. N., Korshunov S. N. и др., Physics of Atomic Nuclei 2026 Vol. 89 No. 1 P. S48–S55

Добавлено: 22 июля 2026 г.

Long-range machine-learning potentials with environment-dependent charges enable predicting LO-TO splitting and dielectric constants

Korogod D., Shapeev A., Новиков И. С., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 No. 2 Article 024104

Добавлено: 22 июля 2026 г.

Global optimization of atomic clusters via physically constrained tensor train decomposition

Sozykin K., Rybin N., Chertkov A. и др., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 113 No. 22 Article 224111

Добавлено: 22 июля 2026 г.

New bound on S1× S2-setting Bell locality of a nonseparable Werner state

Лубенец Е. Р., / Series arxiv.org "quant-ph". 2026. No. 2607.18050.

Добавлено: 21 июля 2026 г.

Optimal navigation in two-dimensional flows: Control theory and reinforcement learning

Парфеньев В. М., Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 2026 Vol. 114 P. 1–11

Добавлено: 17 июля 2026 г.

WSI-GT: Pseudo-Label Guided Graph Transformer for Whole-Slide Histology

Михайлов И. А., Machine Learning and Knowledge Extraction 2026 Vol. 8 No. 1 Article 8

Whole-slide histology images (WSIs) can exceed 100 k × 100 k pixels, making direct pixel-level segmentation infeasible and requiring patch-level classification as a practical alternative for downstream WSI segmentation. However, most approaches either treat patches independently, ignoring spatial and biological context, or rely on deep graph models prone to oversmoothing and loss of local tissue ...

Добавлено: 16 июля 2026 г.

On the construction of Barnes–Wall lattices and their application in cryptography

Кунинец А. А., Малыгина Е. С., Leevik A. G. и др., Journal of Computer Virology and Hacking Techniques 2026 No. 22 Article 62

Добавлено: 16 июля 2026 г.

Dynamical origin of extreme events in mutually coupled and networked Brusselator

Physical Review E - Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics 2026 Vol. 114 No. 1 P. 014217–014217

Добавлено: 15 июля 2026 г.

Matrix Kadomtsev—Petviashvili Hierarchy and Spin Generalization of Trigonometric Calogero—Moser Hierarchy

Прокофьев В. В., Забродин А. В., Proceedings of the Steklov Institute of Mathematics 2020 Vol. 309 P. 225–239

Добавлено: 14 июля 2026 г.

Elliptic solutions of the Toda lattice hierarchy and the elliptic Ruijsenaars–Schneider model

Прокофьев В. В., Забродин А. В., Theoretical and Mathematical Physics 2021 Vol. 208 P. 1093–115

Добавлено: 14 июля 2026 г.

Tencent и Open Source. Как относится к открытому ПО самый дорогой бренд Китая?

Силаков Д. В., Системный администратор 2026 № 5 С. 46–51

В предыдущей статье про Open Source в КНР [1] мы рассказали про Alibaba – крупную корпорацию, занимающую тридцатое место в рейтинге самых значимых мировых брэндов за 2025 год [2]. Место почетное, но не первое среди китайских компаний – на тринадцатом месте расположилась Tencent, разработчик WeChat и ряда других продуктов, широко используемых нашими восточными соседями. Tencent ...

Добавлено: 14 июля 2026 г.

2026 IEEE/CVF Conference on Computer Vision and Pattern Recognition (CVPR)

IEEE, 2026.

Добавлено: 13 июля 2026 г.

Mathematical Optimization Theory and Operations Research, 25th International Conference, MOTOR 2026 Irkutsk, Russia, July 6–11, 2026 Proceedings

Switzerland: Springer, 2026.

Добавлено: 12 июля 2026 г.

Kink oscillation of a system of two braided magnetic flux tubes

Petrukhin N. S., Ruderman M. S., Monthly Notices of the Royal Astronomical Society 2026 Vol. 549 No. 4 P. 1–13

Добавлено: 12 июля 2026 г.

Задачи бесконечной регулярной реализуемости

Шиманогов И. Н., Вялый М. Н., Дискретный анализ и исследование операций 2025 Т. 32 № 4(166) С. 213–230

Хорошо изученным классом алгоритмических задач являются задачи регулярной реализуемости: проверка непустоты пересечения регулярного языка с заданным языком. Данная задача имеет естественную алгебраическую интерпретацию: проверка принадлежности элемента булевой алгебры ядру определенного гомоморфизма. Это мотивирует рассмотрение аналогичной задачи бесконечной регулярной реализуемости: проверка бесконечности пересечения регулярного языка с заданным. В работе рассматриваются задачи регулярной реализуемости для разрешимых языков ...

Добавлено: 12 июля 2026 г.

Improving Differential Equation Solving in Compact Language Models via Activation Steering and Reinforcement Learning

Сурков А. Ю., Игнатенко В. В., Koltcov Sergei, Computers, Materials and Continua 2026

Добавлено: 8 июля 2026 г.

Computational Science and Its Applications – ICCSA 2026 Workshops

Springer, 2027.

Добавлено: 8 июля 2026 г.

Digital InGaAs/InAlAs short-period superlattices intended for 1.3-μm InP-lasers

V.I. Voitovich, I.S. Makhov, Andryushkin V. V. и др., Journal of Luminescence 2026 Vol. 295 Article 121936

Добавлено: 8 июля 2026 г.

Room-temperature, continuous wave lasing in planar microcavities with quantum dots

Babichev A., Bobrov M., Vasil'ev A. и др., Applied Physics Letters 2026 Vol. 128 Article 241102

Добавлено: 8 июля 2026 г.

Scaling Up Molecular Hydrodynamics of Non-Laminar Flows with GPU-Aware MPI

Khnkoian G., Галигеров В. С., Grishichkin Y. и др., , in: Parallel Computational Technologies, 19th International Conference, PCT 2025, Moscow, Russia, April 8–10, 2025, Revised Selected Papers. (CCIS, volume 2891)Vol. 2891.: Springer, 2026. P. 532–545.

Добавлено: 19 мая 2026 г.

Dataset of solubility values for organic compounds in binary mixtures of solvents at various temperatures

Malikov D., Krasnov L., Kiseleva M. и др., Scientific data 2026 Vol. 13 Article 727

Добавлено: 19 мая 2026 г.

Modeling cosolvent effects on solubility in supercritical CO2 using data-driven approaches

Makarov D. M., Каликин Н. Н., Gurikov P. и др., Journal of Supercritical Fluids 2026 Vol. 235 Article 106979

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

MDProcessing.jl: Julia Programming Language Application for Molecular Dynamics Trajectory Processing

Писарев В. В., Panov M., , in: Supercomputing: 9th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2023, Moscow, Russia, September 25–26, 2023, Revised Selected Papers, Part II* 2.: Springer, 2023. P. 209–222.

Добавлено: 11 ноября 2025 г.