Nucleoid-Associated Proteins HU and IHF: Oligomerization in Solution and Hydrodynamic Properties

?

Nucleoid-Associated Proteins HU and IHF: Oligomerization in Solution and Hydrodynamic Properties

Biochemistry (Moscow). 2023. Vol. 88. No. 5. P. 640–654.

Dadinova L. A., Petoukhov M. V., Gordienko A. M., Manuvera V. A., Lazarev V. N., Rakitina T. V., Mozhaev A.A., Peters G. S., Shtykova E. V.

Научное направление: Биология

Язык: английский

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: small-angle X-ray scattering dynamic light scattering (DLS)Oligomerization nucleoid-associated proteins histone-like proteins HU and IHF

Исследование движения сферического фронта клеток в вязком матриксе: роль клеточных делений и взаимодействия клеток с матриксом при развитии опухолей

Логвенков С. А., Известия РАН. Механика жидкости и газа 2026 № 3 С. 59–75

Решена задача об эволюции объемной концентрации клеток в сферическом агрегате, состоящем из клеток, внеклеточного матрикса и жидкости. Агрегат окружен внеклеточным матриксом. Постановка задачи использует разработанную автором ранее модель многофазной биологической сплошной среды, образованной двумя активно взаимодействующими твердыми фазами и жидкостью. Исследовано распространение сферического фронта клеток в вязком матриксе в результате деления клеток и активных взаимодействий клеток с ...

Добавлено: 20 октября 2026 г.

Mismatch Negativity as a Neural Correlate of Auditory Learning: Evidence From Implicit and Explicit Fine Frequency Discrimination Training

Левкович К. М., Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova 2026 Vol. 76 No. 5 P. 587–598

Добавлено: 19 октября 2026 г.

Interpreting antiviral effects: from experimental measurements to mechanistic viral dynamics

Нерсисян А. Л., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 Article 1995001

Добавлено: 15 октября 2026 г.

Low-frequency vibrational modes in G-quadruplexes reveal the mechanical properties of nucleic acids

Тукачев Н. В., González-Jiménez M., Ramakrishnan G. и др., Physical Chemistry Chemical Physics 2021 Vol. 23 No. 23 P. 13250–13260

Добавлено: 14 октября 2026 г.

Динамика изолированного поселения Spermophilus Suslicus (Rodentia, Sciuridae) в Липецке (Европейская Россия), его перспективы и роль в сохранении вида

Батова О. Н., Савинецкая Л. Е., Проявка С. В. и др., Nature Conservation Research. Заповедная наука 2026 Т. 11 № 4 С. 25–39

Spermophilus suslicus – находящийся под угрозой исчезновения вид, внесенный в Красные книги всех уровней (от региональных до международного Красного списка) и нуждающийся в настоящее время в особых мерах охраны. За последние 30–50 лет его ареал из сплошного стал мозаичным, а численность повсеместно сократилась. В начавшихся в России в 2015 г. экспериментальных работах по реинтродукции вида ...

Добавлено: 13 октября 2026 г.

Detailed data on anatomy of the coelomic system and ultrastructure of the lophophore coelom in brachiopod Novocrania anomala with discussion of the phylogenetic significance

Темерева Е. Н., Zoologischer Anzeiger 2026 Vol. 325 P. 182–195

Добавлено: 11 октября 2026 г.

HLA class I escape drives the evolution of SARS-CoV-2 in human populations

Ekaterina D. Riumina, Клинк Г. В., Alekseeva E. и др., PNAS, США 2026 Vol. 123 No. 35 P. 1–20

Добавлено: 2 октября 2026 г.

Pericyte-derived cancer-associated fibroblasts correlate with poor survival and are enriched after chemoradiotherapy in glioblastoma

Aly Ismailov, Попцова М. С., Plos One 2026 Vol. 21 No. 9 Article e0355902

Добавлено: 2 октября 2026 г.

Профессиональная учебная практика: I курс. Введение в биотехнологию, клеточную и молекулярную биологию : учебно-методическое пособие для студентов и преподавателей. Третье издание, пересмотренное

Князев Е. Н., Чеботарева О. Е., М.: Издательский дом НИУ ВШЭ, 2026.

В пособии кратко изложены теоретические и практические аспекты первичных навыков, необходимых для работы в биологической лаборатории, а также приведены протоколы практических занятий в рамках профессиональной учебной практики (ознакомительной) I курса бакалаврской программы «Клеточная и молекулярная биотехнология» факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ. Учебно-методическое пособие предназначено для студентов и преподавателей факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ и ...

Добавлено: 30 сентября 2026 г.

Анализ in silico вероятных зависимостей «структура-активность» этанола

Рыскина Е. А., Князев Е. Н., Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии 2026 Т. 29 № 9 С. 84–91

Введение. Активная интеграция стремительно развивающихся омиксных и компьютерных технологий в XXI веке позволяет осуществить прорыв в понимании принципов функционирования живых систем. Одним из динамично развивающихся интегративных направлений в биологии является биологическое моделирование. Фундаментальной парадигмой стала методология, позволяющая спрогнозировать биологическую активность молекул на основе анализа их структуры Structure-Activity Relationship (SAR). Цель работы - предсказать in silico возможность ...

Добавлено: 29 сентября 2026 г.

A New Recruitable E3 Ligase UHRF1 Supporting Targeted Protein Degradation: A Minimal Azide as a Recruitment Ligand

Lin Z., Duan K., Wan R. и др., Advanced Science 2026 P. 1–13

Добавлено: 26 сентября 2026 г.

A28-04 Measuring the Polygenic Risk of Thrombosis May Accelerate the Detection of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Among Other Forms of Pulmonary Hypertension

Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. и др., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Haplotype-resolved DiMeLo-seq maps centromeric chromatin in a complete diploid human genome

Xu Y., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., USA 2026 Vol. 6 No. 8 Article 101324

Centromeres ensure chromosome segregation, but their chromatin organization within repetitive alpha-satellite DNA has been difficult to resolve. To address this, we generated haplotype-resolved satellite DNA annotations for the complete diploid T2T-HG002 human genome assembly, then we mapped centromere protein A (CENP-A), H3K9me3, and CpG methylation on ultra-long, adaptively sampled nanopore reads using directed methylation with ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

A complete genome for the common marmoset

Hebbar P., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., Cell 2026 Vol. 189 P. 4891–4908.e12

Обыкновенная игрунка — обезьяна Нового Света, широко используемая для изучения эволюции приматов и заболеваний человека. Мы представляем референсную сборку генома этого вида «от теломеры до теломеры» (T2T), а также три гаплотипа, собранных почти до уровня T2T. Эти сборки позволяют охарактеризовать ранее недоступные участки генома, включая центромеры, половые хромосомы, субтеломерные сателлитные повторы, акроцентрические хромосомы и главный ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction

Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., 2026 No. 24 Article 181

Добавлено: 18 сентября 2026 г.

Transmembrane Domains of Bitopic Proteins as a Key to Understand the Cellular Signaling (A Review)

Polyansky A. A., R. G. Efremov, Russian Journal of Bioorganic Chemistry 2024 Vol. 50 No. 4 P. 1202–1214

В работе систематически представлены результаты, полученные авторами с помощью вычислительных методов и подкрепленные экспериментальными биофизическими данными в ходе многолетних исследований битопных мембранных белков (БМБ) – важнейших участников клеточной сигнализации. Представленный материал не претендует на роль обзора, поскольку авторы не ставили своей задачей скрупулезно изложить состояние проблемы и дать исчерпывающую информацию из литературных источников. Скорее это ...

Добавлено: 15 сентября 2024 г.

Protective Dps–DNA co‐crystallization in stressed cells: an in vitro structural study by small‐angle X‐ray scattering and cryo‐electron tomography

Dadinova L., Chesnokov Y., Kamyshinsky R. и др., FEBS Letters 2019 Vol. 593 No. 12 P. 1360–1371

Добавлено: 4 февраля 2024 г.

The dimeric ectodomain of the alkali-sensing insulin receptor–related receptor (ectoIRR) has a droplike shape

Shtykova E., Petoukhov M., Mozhaev AA и др., Journal of biological chemistry 2019 Vol. 294 No. 47 P. 17790–17798

Добавлено: 4 февраля 2024 г.

Polymorphic Protective Dps–DNA Co-Crystals by Cryo Electron Tomography and Small Angle X-Ray Scattering

Kamyshinsky R., Chesnokov Y., Dadinova L. и др., Biomolecules 2019 Vol. 10 No. 1 P. 39–0

Добавлено: 4 февраля 2024 г.

The Ambiguity Issue in Solving Inverse Problems of Small-Angle Scattering: A Consistent Approach Using an Insulin Receptor-Related Receptor as an Example. Methods for Interpreting SAXS Data

Petoukhov M., Konarev P., Volkov V. и др., Biochemistry, Supplemental Series A 2021 Vol. 15 No. 3 P. 270–283

Добавлено: 4 февраля 2024 г.

An Anomalous Small-Angle X-Ray Scattering Study of the Formation of Iron Clusters in the Inner Cavity of the Ferritin-Like Protein Dps

Gordienko A. M., Mozhaev A.A., Gibizova V. V. и др., Moscow University Physics Bulletin 2022 Vol. 77 No. 6 P. 858–867

Добавлено: 4 февраля 2024 г.

Optical and Electron Microscopy of Clusters of Nd3+:LaF3 Nanoparticles Synthesized by the HTMW Method

G. O. Silaev, Krasheninnikov V., A. T. Shaidulin и др., Physics of Wave Phenomena 2023 Vol. 31 No. 3 P. 160–170

Проведено сравнительное исследование размеров и пространственной структуры одиночных диэлектрических коллоидных наночастиц фторида лантана, допированного редкоземельными ионами неодима (Nd3+:LaF3), и их конгломератов в водном растворе. Наночастицы были синтезированы методом водного соосаждения с последующей гидротермальной микроволновой (ГТМВ) обработкой. Эксперименты проводились с использованием трех методов: просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ), трекинг-анализа наночастиц (АТН) и динамического рассеяния света (ДРС). Анализ ...

Добавлено: 5 сентября 2023 г.

Proceedings of SPIE

SPIE, 2018.

Добавлено: 22 июня 2021 г.

Fluorescence Lifetime and Intensity of Thioflavin T as Reporters of Different Fibrillation Stages:Insights Obtained from Fluorescence Up-Conversionand Particle Size Distribution Measurements

Yu.G. Vainer, Rovnyagina N. R., Budylin G. S. и др., International Journal of Molecular Sciences 2020 Vol. 21 P. 6169

Добавлено: 14 января 2021 г.