Electron microscopy analysis of ATP-independent nucleosome unfolding by FACT

Communications Biology. 2022. Vol. 5. No. 1. Article 2.

Sivkina A., Karlova M., McCullough L., Formosa T., Шайтан А. К., Feofanov A., Kirpichnikov M., Sokolova O., Studitsky V.

FACT является шапероном гистонов, который участвует в удалении и повторной сборке нуклеосом во время транскрипции и репликации. Мы использовали электронную микроскопию для изучения комплексов FACT, FACT:Nhp6 и FACT:Nhp6:нуклеосома и обнаружили, что все комплексы принимают широкий диапазон конфигураций, что указывает на высокую гибкость. Мы неожиданно обнаружили, что ДНК-связывающий белок Nhp6 также связывается с С-концевыми хвостами субъединиц FACT, индуцируя более открытую геометрию FACT даже в отсутствие нуклеосом. Следовательно, Nhp6 поддерживает развертывание нуклеосом путем изменения как структуры FACT, так и свойств нуклеосом. Комплексы, образованные с FACT, Nhp6 и нуклеосомами, также продуцируют широкий спектр структур, обнаруживая большое количество потенциальных промежуточных соединений вдоль предполагаемого пути разворачивания. Данные предполагают, что Nhp6 играет несколько ролей до и во время разворачивания нуклеосом с помощью FACT, и что этот процесс протекает через ряд энергетически сходных промежуточных структур, что в конечном итоге приводит к экстенсивно развернутой форме.

Ключевые слова: DNA, ДНК, нуклеосомы, nucleosomes, chaperones, FACT, шапероны, FACT

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА: Анализ взаимосвязи альтернативных структур ДНК с эпигенетическим кодом (2022)