• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Глава
  • Performance and portability of state-of-art molecular dynamics software on modern GPUs
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
20 мая 2026 г.
Творческая работа как лекарство от выгорания
Творческая и доброжелательная атмосфера, новые методы в Международной лаборатории (впоследствии центре) социокультурных исследований привлекают молодых исследователей. За годы работы в Вышке они становятся учеными и преподавателями, известными в России и за рубежом. О своем пути в центре и в Вышке, исследованиях и роли наставников в научных успехах рассказали главный научный сотрудник ЦСКИ Зарина Лепшокова и ведущий научный сотрудник Екатерина Бушина.
19 мая 2026 г.
Физики НИУ ВШЭ выяснили, что происходит внутри устойчивого вихря
В атмосфере и в океане часто наблюдаются крупные вихри с характерными спиральными рукавами. Физики из НИУ ВШЭ объяснили, как они формируются и почему сохраняют свою структуру. Оказалось, что скорости в точках, расположенных вдоль одной дуги вихря, остаются связанными даже на больших расстояниях. При этом в направлении от центра вихря эта связь быстро ослабевает. Такие различия помогают объяснить образование рукавов и могут улучшить модели атмосферных и океанических течений. Результаты опубликованы в Physical Review Fluids.
18 мая 2026 г.
В Вышке прошла XXX юбилейная научно-техническая конференция имени Е.В. Арменского
Организатором научного события выступает Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова ВШЭ. В этом году главный инженерный студенческий форум проходил 30-й раз и собрал рекордное число участников. Студенты, аспиранты и молодые специалисты из 50 вузов и организаций России представили научно-исследовательские доклады в ИТ-области. Отдельная секция была посвящена научно-исследовательским работам школьников.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Performance and portability of state-of-art molecular dynamics software on modern GPUs

P. 324–334.
Kuznetsov E., Кондратюк Н. Д., Logunov M., Никольский В. П., Стегайлов В. В.
Язык: английский
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: CUDAOpenCLGromacsAMD ROCm HIPHOOMDOpenMM
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Методы анализа эффективности суперкомпьютерного комплекса, новые параллельные алгоритмы для молекулярно-динамических расчетов и моделирование транспортных процессов в жидкостях и биомембранах (2020)

В книге

PPAM 2019: Parallel Processing and Applied Mathematics. Lecture Notes in Computer Science
Vol. 12043: 13th International Conference, PPAM 2019, Bialystok, Poland, September 8–11, 2019, Revised Selected Papers, Part I. , Springer, 2020.
Похожие публикации
GEMM Algorithm for Multi-GPU Platforms with Regular Uneven Data Transfer Links
Чой Е. Р., Malkovsky S., Стегайлов В. В., , in: 11th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2025, Moscow, Russia, September 29–30, 2025, Revised Selected Papers.: Springer, 2026. Ch. 3 P. 32–47.
Добавлено: 3 января 2026 г.
GPU-based molecular dynamics of fluid flows: Reaching for turbulence
Pavlov D., Галигеров В. С., Kolotinskii D. и др., International Journal of High Performance Computing Applications 2024 Vol. 38 No. 1 P. 34–49
Добавлено: 18 июля 2023 г.
Multi-GPU GEMM Algorithm Performance Analysis for Nvidia and AMD GPUs Connected by NVLink and PCIe
Чой Е. Р., Стегайлов В. В., , in: 22nd International Conference, MMST 2022, Nizhny Novgorod, Russia, November 14–17, 2022, Revised Selected Papers.: Springer, 2022. Ch. 23 P. 281–292.
Добавлено: 26 декабря 2022 г.
Tuning of a Matrix-Matrix Multiplication Algorithm for Several GPUs Connected by Fast Communication Links
Чой Е. Р., Никольский В. П., Стегайлов В. В., , in: Parallel Computational Technologies: 16th International Conference, PCT 2022, Dubna, Russia, March 29–31, 2022, Revised Selected Papers.: Springer, 2022. Ch. 12 P. 158–171.
Добавлено: 11 августа 2022 г.
Algorithm for Adaptive Mesh Redistribution in Lattice Boltzmann Simulations
Ziganurova L., Щур Л. Н., Lobachevskii Journal of Mathematics 2022 Vol. 43 No. 2 P. 513–518
Добавлено: 25 мая 2022 г.
GPU-accelerated molecular dynamics: State-of-art software performance and porting from Nvidia CUDA to AMD HIP
Кондратюк Н. Д., Никольский В. П., Pavlov D. и др., International Journal of High Performance Computing Applications 2021 Vol. 35 No. 4 P. 312–324
Добавлено: 25 июня 2021 г.
Algorithm for replica redistribution in an implementation of the population annealing method on a hybrid supercomputer architecture
Russkov A., Чулкевич Р. А., Щур Л. Н., Computer Physics Communications 2021 Vol. 261 P. 107786
Добавлено: 28 декабря 2020 г.
Matrix-Matrix Multiplication Using Multiple GPUs Connected by Nvlink
Чой Е. Р., Никольский В. П., Стегайлов В. В., , in: 2020 Global Smart Industry Conference (GloSIC).: IEEE, 2020. P. 354–361.
Добавлено: 3 декабря 2020 г.
Evaluating OpenMP, OpenACC and CUDA parallel programming models for the GPU: Performance Analysis
Тимофеев А. В., Халилов М. Р., , in: Параллельные вычислительные технологии (ПаВТ'2020).: Chelyabinsk: ., 2020. P. 40–51.
Добавлено: 23 октября 2020 г.
Algorithm for the replica redistribution in the implementation of parallel annealing method on the hybrid supercomputer architecture
Russkov A., Roman Chulkevich, Щур Л. Н., / Series arXiv "math". 2020. No. 2006.00561.
Добавлено: 2 июня 2020 г.
Производительность современных вычислительных платформ в расчетах молекулярной динамики белок - мембранных систем
Нольде Д. Е., Крылов Н. А., Телегин П. Н. и др., Труды НИИСИ РАН 2018 Т. 7 № 4 С. 157–161
На примере программного пакета Gromacs проведено исследование скорости расчета классической молекулярной динамики на различных компьютерных системах: настольных компьютерах, кластеров на основе процессоров x86_64, многоядерных процессоров архитектуры MIC, а также гетерогенных систем с использованием «игровых» видеокарт или графических ускорителей. Рассмотрен вопрос выбора оптимальной платформы для проведения расчетов молекулярной динамики. ...
Добавлено: 10 февраля 2020 г.
Performance and Scalability of Materials Science and Machine Learning Codes on the State-of-Art Hybrid Supercomputer Architecture
Кондратюк Н. Д., Смирнов Г. С., Agarkov A. и др., , in: Supercomputing. RuSCDays 2019. Communications in Computer and Information ScienceVol. 1129: Supercomputing. RuSCDays 2019.: Springer, 2019. P. 597–609.
Добавлено: 11 декабря 2019 г.
Implementation of an XSL block cipher with MDS-matrix linear transformation on NVIDIA CUDA
Фомин Д. Б., Математические вопросы криптографии 2015 Vol. 6 No. 2 P. 99–108
Рассматриваются вопросы, связанные с реализацией на NVIDIA GPU блочного шифра типа XSL над конечным полем с MDS-матрицей линейного преобразования. Проводится сравнение полученных результатов с другими блочным шифрами ...
Добавлено: 4 мая 2019 г.
A timing attack on CUDA implementations of an AES-type block cipher
Фомин Д. Б., Математические вопросы криптографии 2016 Vol. 7 No. 2 P. 121–130
Предлагается атака на реализацию блочного шифра типа AES на процессорах CUDA, основанная на времени выполнения шифрования. Эксперименты показали, что можно найти секретный 128-битовый ключ AES по шифрованию 2^32 подобранных блоков открытого текста. Этот подход применим к AES с ключами других размеров и, более того, к любому блочному шифру, в котором линейное преобразование состоит из линейных преобразований двух типов, ...
Добавлено: 4 мая 2019 г.
Parallel algorithms for reducing derivation time of distinguishing experiments for nondeterministic finite state machines
El-Fakih K., Barlas G., Ali M. и др., International Journal of Parallel, Emergent and Distributed Systems 2018 Vol. 33 No. 2 P. 197–210
Добавлено: 31 октября 2018 г.
Инструменты анализа и разработки эффективного кода для параллельных архитектур
Монаков А. В., Платонов В. А., Аветисян А. И., Труды Института системного программирования РАН 2014 Т. 26 № 1 С. 357–374
В работе предлагаются методы поддержки разработки эффективных программ для современных параллельных архитектур, включая гибридные. Описываются специализированные методы профилирования, предназначенные для программиста, занимающегося распараллеливанием существующего кода, либо для поиска неэффективного использования кеша в многопоточных программах. Рассматривается задача автоматической генерации параллельного кода для гибридных архитектур. В задачах, где для повышения производительности на гибридных архитектурах необходима существенная переработка ...
Добавлено: 22 марта 2017 г.
Использование технологии CUDA в обучении сверточной нейросети для распознавания пыльцевых зерен
Замятина Елена Борисовна, Ханжина Н. Е., В кн.: Высокопроизводительные вычисления на графических процессорах: материалы III Всерос. науч.-практ. конф. с междунар. участием с элементами науч. шк. для молодежи (ВВГП–2016).: Пермь: Пермский государственный национальный исследовательский университет, 2016. С. 70–81.
В работе описывается проблема автоматизации распознавания изображений пыльцевых зерен, полученных с помощью оптического микроскопа. Автоматизация распознавания пыльцы является актуальной в таких задачах, как анализ качества меда с целью выявления фальсификата, проверка качества воздуха для предупреждения аллергиков и астматиков, палеопалинология, судебная палинология. Описывается метод решения проблемы, основанный на машинном обучении и применении технологии CUDA. Описывается алгоритм ...
Добавлено: 12 марта 2017 г.
Библиотека PRAND: генерация параллельных потоков случайных чисел для расчетов Монте-Карло с использованием GPU
Бараш Л. Ю., Щур Л. Н., Cuda Альманах 2014 № 3 С. 17–17
Разработаны библиотека RNGSSELIB и библиотека PRAND по параллельной генерации псевдослучайных чисел для расчетов Монте-Карло. Библиотека RNGSSELIB содержит только реализации для CPU и не требует при использовании наличия GPU или компилятора CUDA, в то время как библиотека PRAND содержит все разработанные реализации и предназначена для использования с CUDA версии 5.0 или более поздней. ...
Добавлено: 10 марта 2016 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • http://www.edu.ru
    Федеральный портал «Российское образование»
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика конфиденциальности
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору