Ультраметрическое случайное блуждание и динамика белковых молекул

Труды Математического института им. В.А. Стеклова РАН. 2014. Т. 285. С. 3–25.

Аветисов В. А., Бикулов А. Х., Зубарев А. П.

Представлен краткий обзор использования p-адического уравнения ультраметрического случай- ного блуждания для описания конформационной динамики белковых молекул. Рассмотрены два основных эксперимента, определяющих свойства флуктуационно-динамической подвижности бел- ковых молекул от 300 до 4 K, — исследование кинетики связывания CO миоглобином и исследо- вание спектральной диффузии в белках. Показано, что ультраметрическое описание позволяет сложить единуюк артину конформационной подвижности белковой молекулы во всей этой обла- сти температур и осознать тот факт, что она меняется самоподобным образом. Эта особенность белковых молекул, до сих пор остававшаяся скрытой, существенно расширяет представление об устройстве структур наноразмерного масштаба, относящихся к семейству молекулярных машин.

Ключевые слова: p-adic numbers, ultrametric random walk, ультраметрическое случайное блуждание, р-адические числа, proteins, белковые молекулы