Molecular dynamics simulations refine the pathogenicity of ACVRL1 kinase domain variants by quantifying impacts on ATP binding in pulmonary arterial hypertension

I. Borovikova; Uporov I.; G. Okhrimenko; V. Zamyatin; Dankovtseva E.; Zateyshchikov D.; M. Poptsova

doi:10.1016/j.jsb.2026.108315

Публикации

?

Molecular dynamics simulations refine the pathogenicity of ACVRL1 kinase domain variants by quantifying impacts on ATP binding in pulmonary arterial hypertension

Journal of Structural Biology. 2026. Vol. 218. No. 2. Article 108315.

Боровикова И. И., Uporov I., Охрименко Г. С., Замятин В. И., Dankovtseva E., Zateyshchikov D., Попцова М. С.

Научное направление: Естественные науки Биология

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: Pulmonary arterial hypertension Molecular dynamics ACVRL1 ATP binding BMP signaling Pathogenicity reclassification Variants of uncertain significance

Molecular mechanisms regulating differential expression of individual miRNAs within polycistronic clusters

Мальцева Д. В., Тоневицкий А. Г., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 P. 1–28

Добавлено: 23 октября 2026 г.

Intentionally versus spontaneously prolonged Gaze: A MEG study of active gaze-based interaction

Vasilyev A., Svirin EP, Dubynin I. и др., Cortex 2025 Vol. 189 P. 76–96

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Role of Bach1 Transcription Factor in the Mechanisms of Cell Death

Karina V. Klycheva, Mariia O. Silkina, Dmitry M. Hushpulian и др., Biochemistry. Biokhimiia 2026 Vol. 91 P. 1842–1858

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Десинхронизация сенсомоторных ритмов при совершении квазидвижений, основанных на естественных движениях пальцев руки

Свирин Е. П., Бердышев Д. А., Шишкин С. Л., Вестник Российского государственного медицинского университета 2026 № 3 С. 42–50

Квазидвижения (КД) — попытки движения, минимизированные до исчезновения движения, — вызывают ЭЭГ-паттерны, схожие с реальным движением. КД могут моделировать попытки движения у здоровых участников и потому представляют интерес как альтернатива представлению движений (ПД) для реабилитационных интерфейсов мозг–компьютер (ИМК), в которых попытка движения парализованной конечностью используется как управляющий сигнал. КД ранее исследовали на отведении большого пальца. ...

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Large amyloid plaques associate with early behavioral alterations in 6-month-old APPswe/PS1dE9 mice

Sitdikova K., Tsoy A., Chaprov K. и др., Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 2026 Article nlag078

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Effects of Wheat Malt Extract on Molecular and Behavioral Markers in Aged APP/PS1 and Wild-Type Mice

Kassenova A., Svirin E., Sitdikova K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2026 Vol. 27 No. 11 Article 4994

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Partial Serotonin Transporter Deficiency Modulates Plasma Metabolome, Arginine-Nitric Oxide Pathway and Emotional Behavior in Mice Exposed to Western Diet

Cespuglio R., Schmitt-Böhrer A., Deykin A. и др., Metabolites 2026 Vol. 16 No. 2 Article 117

Добавлено: 22 октября 2026 г.

Исследование движения сферического фронта клеток в вязком матриксе: роль клеточных делений и взаимодействия клеток с матриксом при развитии опухолей

Логвенков С. А., Известия РАН. Механика жидкости и газа 2026 № 3 С. 59–75

Решена задача об эволюции объемной концентрации клеток в сферическом агрегате, состоящем из клеток, внеклеточного матрикса и жидкости. Агрегат окружен внеклеточным матриксом. Постановка задачи использует разработанную автором ранее модель многофазной биологической сплошной среды, образованной двумя активно взаимодействующими твердыми фазами и жидкостью. Исследовано распространение сферического фронта клеток в вязком матриксе в результате деления клеток и активных взаимодействий клеток с ...

Добавлено: 20 октября 2026 г.

Mismatch Negativity as a Neural Correlate of Auditory Learning: Evidence From Implicit and Explicit Fine Frequency Discrimination Training

Левкович К. М., Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova 2026 Vol. 76 No. 5 P. 587–598

Добавлено: 19 октября 2026 г.

Interpreting antiviral effects: from experimental measurements to mechanistic viral dynamics

Нерсисян А. Л., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 Article 1995001

Добавлено: 15 октября 2026 г.

Low-frequency vibrational modes in G-quadruplexes reveal the mechanical properties of nucleic acids

Тукачев Н. В., González-Jiménez M., Ramakrishnan G. и др., Physical Chemistry Chemical Physics 2021 Vol. 23 No. 23 P. 13250–13260

Добавлено: 14 октября 2026 г.

Динамика изолированного поселения Spermophilus Suslicus (Rodentia, Sciuridae) в Липецке (Европейская Россия), его перспективы и роль в сохранении вида

Батова О. Н., Савинецкая Л. Е., Проявка С. В. и др., Nature Conservation Research. Заповедная наука 2026 Т. 11 № 4 С. 25–39

Spermophilus suslicus – находящийся под угрозой исчезновения вид, внесенный в Красные книги всех уровней (от региональных до международного Красного списка) и нуждающийся в настоящее время в особых мерах охраны. За последние 30–50 лет его ареал из сплошного стал мозаичным, а численность повсеместно сократилась. В начавшихся в России в 2015 г. экспериментальных работах по реинтродукции вида ...

Добавлено: 13 октября 2026 г.

Detailed data on anatomy of the coelomic system and ultrastructure of the lophophore coelom in brachiopod Novocrania anomala with discussion of the phylogenetic significance

Темерева Е. Н., Zoologischer Anzeiger 2026 Vol. 325 P. 182–195

Добавлено: 11 октября 2026 г.

HLA class I escape drives the evolution of SARS-CoV-2 in human populations

Ekaterina D. Riumina, Alekseeva E., Клинк Г. В. и др., PNAS, США 2026 Vol. 123 No. 35 Article e2619192123

Добавлено: 2 октября 2026 г.

Pericyte-derived cancer-associated fibroblasts correlate with poor survival and are enriched after chemoradiotherapy in glioblastoma

Aly Ismailov, Попцова М. С., Plos One 2026 Vol. 21 No. 9 Article e0355902

Добавлено: 2 октября 2026 г.

Atomistic modeling of phengite and molecular mechanisms of NH4+ and K+ diffusional mobility in its structure

Тарарушкин Е. В., Глушак А. А., Rudmin M. и др., Applied Clay Science 2026 Vol. 291 Article 108288

Добавлено: 6 июня 2026 г.

Compression-Induced Lattice Tilting Quenches Ion Migration at Metal Halide Perovskite Grain Boundaries: A Machine Learning Molecular Dynamics Study

Mikhail R. Samatov, Лю Д., Emir S. Amirov и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2025 Vol. 16 No. 51 P. 13068–13074

Добавлено: 20 декабря 2025 г.

Moment tensor potential and equivariant tensor network potential with explicit dispersion interactions

Chalykh O., Korogod D., Ivan S. Novikov и др., Journal of Chemical Physics 2025 Vol. 163 No. 13 Article 134112

Добавлено: 12 октября 2025 г.

Механические характеристики модели молекулярной динамики и полиномы Коробова

Устинов А. В., Гузев М. А., Дальневосточный математический журнал 2016 Т. 16 № 1 С. 39–43

Методы теории чисел использованы для точного вычисления статического поля напряжений в одномерной цепочке взаимодействующих гармонических осцилляторов. Для сумм, определяющих поле, получено представление через полиномы Коробова при произвольном числе осцилляторов и масштабе усреднения. ...

Добавлено: 9 октября 2025 г.

The prevalence of pathogenic variants in the BMPR2 gene in patients with the idiopathic pulmonary arterial hypertension in the Russian population: sequencing data and meta-analysis

Охрименко Г. С., Боровикова И. И., Dankovtseva E. и др., Respiratory Research 2025 Vol. 26 Article 146

Добавлено: 29 сентября 2025 г.

The role of surface material properties on the behavior of ionic liquids in nanoconfinement: A critical review and perspective of theory and simulations

Nesterova I., Кондратюк Н. Д., Будков Ю. А. и др., Advances in Colloid and Interface Science 2025 Vol. 346 Article 103623

Добавлено: 2 сентября 2025 г.

Microsecond-scale observation of phase transition and diffusion in 5CB liquid crystal at the molecular level

Kasapenko N., Orlova T., N. Kondratyuk, Journal of Chemical Physics 2025 Vol. 162 No. 15 Article 154901

Добавлено: 12 августа 2025 г.

Structure and properties of thaumasite and its aqueous interfaces revealed by molecular dynamics simulations

Тарарушкин Е. В., Смирнов Г. С., Кондратюк Н. Д. и др., Cement and Concrete Research 2025 Vol. 197 Article 107944

Добавлено: 6 июня 2025 г.

Uranium coordination on clay surface at nanoscale: Integration of EXAFS data and Ab initio molecular dynamics

Krot A., Evgeny V. Tararushkin, Trigub A. и др., Applied Clay Science 2025 Vol. 274 Article 107863

Добавлено: 18 мая 2025 г.