• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • Unraveling Epistatic Interactions Between Sites Under Drug-Dependent Selection in the Mycobacterium tuberculosis Genome
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
21 октября 2026 г.
Ученые НИУ ВШЭ систематизировали методы защиты изображений
Исследователи МИЭМ ВШЭ проанализировали схемы полухрупких цифровых водяных знаков для изображений, опубликованные за последние десять лет. Такие водяные знаки сохраняются при обычном сжатии или изменении яркости, но выдают подделку, если в снимок добавили объект или заменили лицо. Авторы предложили классификацию этих схем и выделили главные нерешенные проблемы. Результаты опубликованы в журнале Computer Science Review.
20 октября 2026 г.
«Наши работы можно назвать исследованиями на переднем крае науки»
Международная лаборатория кластерной геометрии, действующая на факультете математики НИУ ВШЭ, занимается формированием новой научной дисциплины, соединяющей в себе знания из различных областей математики. Выполненные в ней работы вызывают большой интерес, в том числе у зарубежных коллег. Лаборатория изучает семейства кривых и разрабатывает методы, применяемые в исследованиях физического микромира. Новостная служба «Вышка.Главное» побеседовала с заведующим лабораторией профессором Сергеем Ландо.
20 октября 2026 г.
За гранью возможного: в Вышке прошел финал IX сезона «Научных боев»
В конце сентября в Центре культур НИУ ВШЭ прошел финал IX сезона «Научных боев» с заглавной темой «За гранью возможного». Исследователи представили четыре работы. На каждое выступление отводилось по десять минут, после чего участники отвечали на вопросы жюри и зрителей. Спикеры искали границы между человеком и искусственным интеллектом, цифровой платформой и ее пользователями, государством и социальной инфраструктурой, а также между тем, как общество определяет человека, и тем, как он определяет себя сам.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Unraveling Epistatic Interactions Between Sites Under Drug-Dependent Selection in the Mycobacterium tuberculosis Genome

Molecular Biology and Evolution. 2025. Vol. 42. No. 11. Article msaf264.
Anfisa V. Popova, Bykova D., Fedonin G., Bosov D., Reshetnikov K., Alexey D. Neverov
Научное направление: Биология
Язык: английский
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: Drug resistancefitness landscapeMycobacterium tuberculosisEpistasis
Похожие публикации
Исследование движения сферического фронта клеток в вязком матриксе: роль клеточных делений и взаимодействия клеток с матриксом при развитии опухолей
Логвенков С. А., Известия РАН. Механика жидкости и газа 2026 № 3 С. 59–75
Решена задача об эволюции объемной концентрации клеток в сферическом агрегате, состоящем из клеток, внеклеточного матрикса и жидкости. Агрегат окружен внеклеточным матриксом. Постановка задачи использует разработанную автором ранее модель многофазной биологической сплошной среды, образованной двумя активно взаимодействующими твердыми фазами и жидкостью. Исследовано распространение сферического фронта клеток в вязком матриксе в результате деления клеток и активных взаимодействий клеток с ...
Добавлено: 20 октября 2026 г.
Mismatch Negativity as a Neural Correlate of Auditory Learning: Evidence From Implicit and Explicit Fine Frequency Discrimination Training
Левкович К. М., Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova 2026 Vol. 76 No. 5 P. 587–598
Добавлено: 19 октября 2026 г.
Interpreting antiviral effects: from experimental measurements to mechanistic viral dynamics
Нерсисян А. Л., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 Article 1995001
Добавлено: 15 октября 2026 г.
Low-frequency vibrational modes in G-quadruplexes reveal the mechanical properties of nucleic acids
Тукачев Н. В., González-Jiménez M., Ramakrishnan G. и др., Physical Chemistry Chemical Physics 2021 Vol. 23 No. 23 P. 13250–13260
Добавлено: 14 октября 2026 г.
Динамика изолированного поселения Spermophilus Suslicus (Rodentia, Sciuridae) в Липецке (Европейская Россия), его перспективы и роль в сохранении вида
Батова О. Н., Савинецкая Л. Е., Проявка С. В. и др., Nature Conservation Research. Заповедная наука 2026 Т. 11 № 4 С. 25–39
Spermophilus suslicus – находящийся под угрозой исчезновения вид, внесенный в Красные книги всех уровней (от региональных до международного Красного списка) и нуждающийся в настоящее время в особых мерах охраны. За последние 30–50 лет его ареал из сплошного стал мозаичным, а численность повсеместно сократилась. В начавшихся в России в 2015 г. экспериментальных работах по реинтродукции вида ...
Добавлено: 13 октября 2026 г.
Detailed data on anatomy of the coelomic system and ultrastructure of the lophophore coelom in brachiopod Novocrania anomala with discussion of the phylogenetic significance
Темерева Е. Н., Zoologischer Anzeiger 2026 Vol. 325 P. 182–195
Добавлено: 11 октября 2026 г.
HLA class I escape drives the evolution of SARS-CoV-2 in human populations
Ekaterina D. Riumina, Клинк Г. В., Alekseeva E. и др., PNAS, США 2026 Vol. 123 No. 35 P. 1–20
Добавлено: 2 октября 2026 г.
Pericyte-derived cancer-associated fibroblasts correlate with poor survival and are enriched after chemoradiotherapy in glioblastoma
Aly Ismailov, Попцова М. С., Plos One 2026 Vol. 21 No. 9 Article e0355902
Добавлено: 2 октября 2026 г.
Профессиональная учебная практика: I курс. Введение в биотехнологию, клеточную и молекулярную биологию : учебно-методическое пособие для студентов и преподавателей. Третье издание, пересмотренное
Князев Е. Н., Чеботарева О. Е., М.: Издательский дом НИУ ВШЭ, 2026.
В пособии кратко изложены теоретические и практические аспекты первичных навыков, необходимых для работы в биологической лаборатории, а также приведены протоколы практических занятий в рамках профессиональной учебной практики (ознакомительной) I курса бакалаврской программы «Клеточная и молекулярная биотехнология» факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ. Учебно-методическое пособие предназначено для студентов и преподавателей факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ и ...
Добавлено: 30 сентября 2026 г.
Анализ in silico вероятных зависимостей «структура-активность» этанола
Рыскина Е. А., Князев Е. Н., Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии 2026 Т. 29 № 9 С. 84–91
Введение. Активная интеграция стремительно развивающихся омиксных и компьютерных технологий в XXI веке позволяет осуществить прорыв в понимании принципов функционирования живых систем. Одним из динамично развивающихся интегративных направлений в биологии является биологическое моделирование. Фундаментальной парадигмой стала методология, позволяющая спрогнозировать биологическую активность молекул на основе анализа их структуры Structure-Activity Relationship (SAR). Цель работы - предсказать in silico возможность ...
Добавлено: 29 сентября 2026 г.
A New Recruitable E3 Ligase UHRF1 Supporting Targeted Protein Degradation: A Minimal Azide as a Recruitment Ligand
Lin Z., Duan K., Wan R. и др., Advanced Science 2026 P. 1–13
Добавлено: 26 сентября 2026 г.
A28-04 Measuring the Polygenic Risk of Thrombosis May Accelerate the Detection of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Among Other Forms of Pulmonary Hypertension
Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. и др., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Haplotype-resolved DiMeLo-seq maps centromeric chromatin in a complete diploid human genome
Xu Y., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., USA 2026 Vol. 6 No. 8 Article 101324
Centromeres ensure chromosome segregation, but their chromatin organization within repetitive alpha-satellite DNA has been difficult to resolve. To address this, we generated haplotype-resolved satellite DNA annotations for the complete diploid T2T-HG002 human genome assembly, then we mapped centromere protein A (CENP-A), H3K9me3, and CpG methylation on ultra-long, adaptively sampled nanopore reads using directed methylation with ...
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
A complete genome for the common marmoset
Hebbar P., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., Cell 2026 Vol. 189 P. 4891–4908.e12
Обыкновенная игрунка — обезьяна Нового Света, широко используемая для изучения эволюции приматов и заболеваний человека. Мы представляем референсную сборку генома этого вида «от теломеры до теломеры» (T2T), а также три гаплотипа, собранных почти до уровня T2T. Эти сборки позволяют охарактеризовать ранее недоступные участки генома, включая центромеры, половые хромосомы, субтеломерные сателлитные повторы, акроцентрические хромосомы и главный ...
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction
Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., 2026 No. 24 Article 181
Добавлено: 18 сентября 2026 г.
Feature selection and aggregation for antibiotic resistance GWAS in Mycobacterium tuberculosis: a comparative study
Reshetnikov K., Bykova D., Kuleshov K. и др., Frontiers in Microbiology 2025 Vol. 16 Article 1586476
Добавлено: 22 июля 2025 г.
Senescence and entrenchment in evolution of amino acid sites
Попова А. В., Неверов А. Д., Nature Communications 2020 Vol. 11 Article 4603
Добавлено: 9 июня 2025 г.
Episodic evolution of coadapted sets of amino acid sites in mitochondrial proteins
Попова А. В., Неверов А. Д., PLoS Genetics 2021
Добавлено: 9 июня 2025 г.
Allele-specific nonstationarity in evolution of influenza A virus surface proteins
Попова А. В., Неверов А. Д., Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 2019 Vol. 116 No. 42 P. 21104–21112
Добавлено: 9 июня 2025 г.
Deep learning captures the effect of epistasis in multifactorial diseases
Перелыгин В. Р., Kamelin A., Syzrantsev N. и др., Frontiers in Medicine 2025 Vol. 11 Article 1479717
Добавлено: 4 марта 2025 г.
Metformin increases antitumor activity of MEK inhibitor binimetinib in 2D and 3D models of human metastatic melanoma cells
Prokofieva A., Ryabaya O., Akasov R. и др., Biomedicine and Pharmacotherapy 2019 Vol. 109 P. 2548–2560
Добавлено: 30 октября 2024 г.
Phylogenetic inference of changes in amino acid propensities with single-position resolution
Клинк Г. В., Kalinina O. V., Bazykin G. A., PLoS Computational Biology 2022 Vol. 18 No. 2 Article e1009878
Fitness conferred by the same allele may differ between genotypes and environments, and these differences shape variation and evolution. Changes in amino acid propensities at protein sites over the course of evolution have been inferred from sequence alignments statistically, but the existing methods are data-intensive and aggregate multiple sites. Here, we develop an approach to ...
Добавлено: 26 июня 2024 г.
Changing selection on amino acid substitutions in Gag protein between major HIV-1 subtypes
Клинк Г. В., Kalinina O., Bazykin G., Virus Evolution 2024 Vol. 10 No. 1 Article veae036
Amino acid preferences at a protein site depend on the role of this site in protein function and structure as well as on external constraints. All these factors can change in the course of evolution, making amino acid propensities of a site time-dependent. When viral subtypes divergently evolve in different host subpopulations, such changes may ...
Добавлено: 26 июня 2024 г.
Coordinated evolution at amino acid sites of SARS-CoV-2 spike
Alexey Dmitrievich Neverov, Fedonin G. G., Popova A. V. и др., eLife 2023 Vol. 12 Article e82516
Добавлено: 10 февраля 2023 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика обработки персональных данных
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору