?
Метод быстрого множественного попарного выравнивания на основе префиксных деревьев
Доклады Академии наук. 2019. Т. 484. № 4. С. 401-404.
Yakovlev P.
Granata I., Manzo M., Kusumastuti A. et al., Current Medicinal Chemistry 2021 Vol. 28 No. 32 P. 6619-6653
Purpose: Systems biology and network modeling represent, nowadays, the hallmark approaches for the development of predictive and targeted-treatment based precision medicine. The study of health and disease as properties of the human body system allows the understanding of the genotype-phenotype relationship through the definition of molecular interactions and dependencies. In this scenario, metabolism plays a ...
Added: August 25, 2021
Blagodatskikh K., Romaniuk D., Malko Dmitry, Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 2020 Vol. 8 Article 353
Minor histocompatibility antigens (MiHA) are critical elements for the immune response after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation. They may cause both beneficial and detrimental effects in form of graft-versus-tumor and graft-versus-host accordingly. MiHAs originate from donor-recipient discrepancies in single nucleotide polymorphisms, insertions, and deletions. To determine the genetic mismatches between a donor and a recipient, ...
Added: December 6, 2021
Grigory Andreevich Puzanov, Scientific Reports 2022 Vol. 12 No. 1 Article 14588
Clear cell renal carcinoma has been reported in many research studies as a rather heterogeneous disease. Identification of different subtypes and their molecular characteristics can help in choosing a more effective treatment and predicting a response to it. In this study, using multi-omics clustering of RNA-Seq data of patients with clear cell renal carcinoma from ...
Added: September 23, 2022
Novosibirsk : Институт вычислительной математики и математической геофизики Сибирского отделения РАН, 2018
Problems of mathematical modeling in biomedicine, direct and inverse problems of determining the parameters of biophysical processes with the help of computer simulations will be discussed. The second international conference MM-HPC-BBB-2018 will include the following research sections and meetings:– High-performance and distributed computing in biomedicine; – Applications of bioinformatics and systems biology; – Data mining ...
Added: September 24, 2021
Loukachevitch N., Manandhar S., Baral E. et al., Bioinformatics 2023 Vol. 39 No. 4 Article btad161
Motivation
This paper describes NEREL-BIO – an annotation scheme and corpus of PubMed abstracts in Russian and smaller number of abstracts in English. NEREL-BIO extends the general domain dataset NEREL (Loukachevitch et al., 2021) by introducing domain-specific entity types. NEREL-BIO annotation scheme covers both general and biomedical domains making it suitable for domain transfer experiments. NEREL-BIO ...
Added: April 5, 2023
Долгопрудный : МФТИ, 2021
Труды 63-й Всероссийской научной конференции МФТИ. Включены результаты оригинальных исследований студентов, аспирантов, преподавателей и научных сотрудников МФТИ и дружественных учебных и научных организаций. Статьи представляют интерес для специалистов, работающих в области радиотехники и компьютерных технологий ...
Added: October 29, 2021
Karpychev V., Balatskaya A., Utyashev N. et al., Frontiers in Human Neuroscience 2022 No. 16 Article 984306
High-frequency oscillations (HFO) are a promising biomarker for the identification of epileptogenic tissue. While HFO rates have been shown to predict seizure outcome, it is not yet clear whether their morphological features might improve this prediction. We validated HFO rates against seizure outcome and delineated the distribution of HFO morphological features. We collected stereo-EEG recordings ...
Added: October 1, 2022
Polykovskiy D., Zhebrak A., Sanchez-Lengeling B. et al., Frontiers in Pharmacology 2020 Vol. 11 P. 1-10
Generative models are becoming a tool of choice for exploring the molecular space. These models learn on a large training dataset and produce novel molecular structures with similar properties. Generated structures can be utilized for virtual screening or training semi-supervized predictive models in the downstream tasks. While there are plenty of generative models, it is ...
Added: April 21, 2021
Фонд им. В.И. Вернадского, 2022
В сборнике студенческих и аспирантских работ стипендиатов Неправительственного экологического фонда имени В.И. Вернадского 2021–2022 года представлены статьи, отражающие промежуточные научные исследования стипендиатов, проводимые как самостоятельно, так и в составе научных коллективов, а также итоги исследований, опыта, описание идей, сделанных в ходе выполнения проектов в рамках масштабной годовой Стипендиальной программы. Тематика исследований, представленных в сборнике, является весьма разносторонней, но все работы посвящены актуальным ...
Added: May 13, 2023
Байдин Г. С., Букреев Д. Д., Биомедицинская радиоэлектроника 2019 Т. 22 № 5 С. 5-14
Постановка проблемы. С ростом сложности диагностики злокачественных новообразований в желудке человека, хранения результатов исследований в цифровом формате и увеличения их объема возникает необходимость в автоматизации клинической диагностики данного заболевания, что может улучшить точность и достоверность ее результатов. Цель – разработка методики для автоматизированного распознавания злокачественных новообразований в желудке человека на снимках компьютерной томографии. Результаты. Разработана методика автоматизированного ...
Added: September 5, 2021
Cheloshkina K., Poptsova M., BMC Cancer 2019 Vol. 19 No. 434 P. 1-17
Background: Chromosomal rearrangements are the typical phenomena in cancer genomes causing gene disruptions and fusions, corruption of regulatory elements, damage to chromosome integrity. Among the factors contributing to genomic instability are non-B DNA structures with stem-loops and quadruplexes being the most prevalent. We aimed at investigating the impact of specifically these two classes of non-B ...
Added: March 13, 2019
Gromov V., Zvorykina E., Beschastnov Y. et al., Working papers by Cornell University. Series math "arxiv.org" 2023 Article 14399
The paper explores mathematical methods that differentiate regular and chaotic time series, specifically for identifying pathological fistulas. It proposes a noise-resistant method for classifying responding rows of normally and pathologically functioning fistulas. This approach is grounded in the hypothesis that laminar blood flow signifies normal function, while turbulent flow indicates pathology. The study explores two ...
Added: September 27, 2023
Krouk E., Овчинников А. А., ГУАП, 2014
Учебное пособие представляет собой курс лекций, предназначенных для студентов направлений 10.03.01,11.03.02. ...
Added: August 7, 2017
Springer, 2020
The volume contains selected revised papers of the First National Congress on Cognitive Research, Artificial Intelligence and Neuroinformatics. ...
Added: October 7, 2020
Байдин Г. С., Титов А. С., Биомедицинская радиоэлектроника 2020 Т. 23 № 5 С. 59-71
Постановка проблемы. С ростом сложности исследования химических соединений в различных средах и усложнением обработки результатов экспериментов возникает необходимость в автоматизации данного процесса для улучшения точ-ности и достоверности полученных результатов. Цель работы – разработка методики для автоматизированного подсчета количества частиц в веществе на изображениях электронного микроскопа. Результаты. Разработана методика автоматизированного подсчета количества частиц в веществе на изображениях электронного ...
Added: September 5, 2021
Kuznetsov V. V., Moskalenko V. A., Gribanov D. et al., Frontiers in Genetics 2021 Article 638191
We propose a method for generating an electrocardiogram (ECG) signal for one cardiac cycle using a variational autoencoder. Our goal was to encode the original ECG signal using as few features as possible. Using this method we extracted a vector of new 25 features, which in many cases can be interpreted. The generated ECG has ...
Added: October 29, 2021
Jaaskelainen I., Sams M., Glerean E. et al., Neuroimage 2021 Vol. 224 Article 117445
Using movies and narratives as naturalistic stimuli in human neuroimaging studies has yielded significant ad- vances in understanding of cognitive and emotional functions. The relevant literature was reviewed, with em- phasis on how the use of naturalistic stimuli has helped advance scientific understanding of human memory, attention, language, emotions, and social cognition in ways that ...
Added: March 10, 2021
Alshanskaia Sokolova E. I., Martynova O., Ivanov I. et al., Электронное издательство «Эгитас», 2022
Здоровье всегда являлось весомым капиталом человека, а грамотное распоряжением им всегда приносило ощутимые инвестиции. В современном мире с его темпами, задачами и вызовами у большинства людей все меньше времени остается на сохранение, поддержание и тем более укрепление здоровья. Но на возникающий запрос, формируется решение, продиктованное самим обществом, а именно, его цифровым отражением. Оцифровка общественной и ...
Added: May 15, 2023
Aaij R., Abdelmotteleb A. S., Abellan Beteta C. et al., The European Physical Journal C - Particles and Fields 2023 Vol. 83 Article 543
https://link.springer.com/article/10.1140/epjc/s10052-023-11673-x#Abs1 ...
Added: December 4, 2023
Gostev I. M., М. : Юрайт, 2016
В настоящее время компьютерные науки стремительно развиваются. Новые версии операционных систем появляются каждые полтора-два года, поэтому было принято решение о включении в данную книгу такого материала, который не будет устаревать. Содержание учебника представляет собой некоторые наиболее общие принципы построения операционных систем, которые были разработаны более 50 лет назад и практически не изменились за прошедшее время. ...
Added: October 13, 2009
Beklemishev L. D., Оноприенко А. А., Математический сборник 2015 Т. 206 № 9 С. 3-20
We formulate some term rewriting systems in which the number of computation steps is finite for each output, but this number cannot be bounded by a provably total computable function in Peano arithmetic PA. Thus, the termination of such systems is unprovable in PA. These systems are derived from an independent combinatorial result known as the Worm ...
Added: March 13, 2016
Furmanov K. K., Nikol'skii I. M., Computational Mathematics and Modeling 2016 Vol. 27 No. 2 P. 247-253
Added: December 22, 2016
Toldova S., Azerkovich I., Гришина Ю. et al., / НИУ ВШЭ. Series WP BRP "Linguistics". 2015.
Building benchmark corpora in the domain of coreference and anaphora resolution is an important task for developing and evaluating NLP systems and models. Our study is aimed at assessing the feasibility of enhancing corpora with information about coreference relations. The annotation procedure includes identification of text segments that are subjects to annotation (markables), marking their ...
Added: December 15, 2015
Baibikova T., Domoratsky E., Вестник Московского финансово-юридического университета 2017 № 1 С. 200-206
Some questions of scientific visualization are under consideration in this paper. This article also discusses the peculiarities of application of cognitive computer graphics, singles out a range of tasks of scientific visualization. The paper gives a brief overview of modern support tools for program visualization, tendencies of their development and their main characteristics. A module ...
Added: June 10, 2017