• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • Analysis of Ion Atmosphere Around Nucleosomes Using Supercomputer MD Simulations
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
13 августа 2026 г.
Социальная интеграция: на перекрестках знаний и ценностей
Международная лаборатория исследований социальной интеграции (МЛИСИ) НИУ ВШЭ занимается изучением проблем уязвимых слоев населения и поиском методов их вовлечения в полноценную повседневную жизнь. Для поиска решений ученые лаборатории сочетают разработку передовых методов с практической работой «в поле». О деятельности лаборатории новостной службе «Вышка.Главное» рассказала ее заведующая Елена Ярская-Смирнова.
12 августа 2026 г.
Студенты Вышки, вероятно, обнаружили новый вид медузы во время практики на Сахалине
Учащиеся факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ стали первыми студентами, которые приехали в экспедицию на биостанцию «Анива» на острове Сахалин. Их целью было изучение морских полипов и медуз. Молодым ученым удалось получить неожиданные результаты: возможно, во время полевых работ они обнаружили новые для региона виды. Теперь часть находок привезут в Москву для детального изучения. Об экспедиции студентки рассказали «Вышке.Главное».
12 августа 2026 г.
«Я бы назвал атмосферу в лаборатории и в университете творческой и стимулирующей»
Научный сотрудник Международной лаборатории стохастического анализа и его приложений НИУ ВШЭ французский ученый Жан-Франсуа Жабир работает в НИУ ВШЭ с 2017 года. Его привлекла возможность вести исследования совместно с ведущими зарубежными и российскими учеными, свобода академических дискуссий и открытость университета. Своими впечатлениями о Вышке и Москве Жан-Франсуа Жабир поделился с новостной службой «Вышка.Главное».

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Analysis of Ion Atmosphere Around Nucleosomes Using Supercomputer MD Simulations

Supercomputing Frontiers and Innovations. 2022. Vol. 9. No. 2. P. 56–67.
Nikita A. Kosarim, Armeev G., Alexey K. Shaytan, Kirpichnikov M.
Научное направление: Биология Компьютерные науки
Язык: английский
Полный текст
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: molecular modeling molecular dynamics simulationsnucleosomesMonovalent cationsProtein-dna interactions
Похожие публикации
Generative geospatial modelling with geometric algebra
Yu Z., Wang J., Wang Z. и др., Philosophical Transactions of the Royal Society A: Mathematical, Physical and Engineering Sciences 2026 Vol. 384 P. 1–16
Добавлено: 13 августа 2026 г.
Empowering Novel Geometric Algebra for Graphics and Engineering. ENGAGE 2025 (Hong Kong, July 14, 2025), Lecture Notes in Computer Science
Cham: Springer, 2026.
Добавлено: 13 августа 2026 г.
Reconstruction of EEG signals using next-generation reservoir computing
Ратников Ф. Д., European Physical Journal: Special Topics 2026 P. 1–10
Добавлено: 12 августа 2026 г.
CAD2TechSpec: a framework for automating design processes within computer-aided design systems
Минец М. В., Красноженов Г. Г., Трофимова Е. А. и др., PeerJ Computer Science 2026 Vol. 12 Article e4063
Добавлено: 12 августа 2026 г.
Parametric study of hand dorsal vein biometric recognition vulnerability to spoofing attacks
Мизинов П. В., Journal of Computer Virology and Hacking Techniques 2023 No. 20 P. 383–396
Системы биометрического распознавания вен уязвимы для атак типа «биометрическое предъявление». Традиционно исследователи использовали изображение сосудистого русла пользователя, полученное в ближнем инфракрасном диапазоне (БИК), для создания инструмента атаки на биометрическое предъявление (ИАБП). В данной статье исследуется возможность использования свободного программного обеспечения для сбора данных о венозном рисунке кисти без использования БИК при нормальном освещении и создания ...
Добавлено: 11 августа 2026 г.
HPRC2: A human pangenome reference with near-complete coverage of common genetic variation
Lucas J., Hebbar P., Рябов Ф. Д. и др., / Series 10.64898/2026.07.21.739710 "10.64898/2026.07.21.739710". 2026.
Пангеномный референс позволяет преодолеть фундаментальное ограничение любого отдельного референсного генома за счёт интеграции генетической вариабельности, представленной в популяции. Мы представляем Release 2 Консорциума по созданию референсного пангенома человека (Human Pangenome Reference Consortium, HPRC2) — общедоступную пангеномную сборку второго этапа, которая примерно в пять раз превосходит HPRC Release 1 (HPRC1) по числу представленных геномов и демонстрирует ...
Добавлено: 10 августа 2026 г.
Encyclopedia of Ecology, 3rd Edition
Сандлерский Р. Б., Elsevier USA, 2026.
Добавлено: 9 августа 2026 г.
Трубочкина, Н. К. Основы технологии производства и машинное обучение : учебник для вузов / Н. К. Трубочкина. — Москва : Издательство Юрайт, 2026. — 383 с. — (Высшее образование). — ISBN 978-5-534-22010-0.
Трубочкина Н. К., М.: Издательство «Юрайт», 2026.
Учебник  посвящен формированию у студентов целостного представления о современных производственных процессах и методах их анализа и управления на основе технологий машинного обучения. В условиях четвертой промышленной революции, когда традиционные инженерные дисциплины неразрывно переплетаются с интеллектуальными методами обработки данных, возникает потребность в специалистах, способных интегрировать знания из обеих областей. Настоящий учебник призван удовлетворить эту потребность, предлагая ...
Добавлено: 8 августа 2026 г.
Structure of the Obligate Heterodimer of the IHF Protein in Solution and in the Crystal
Dadinova L., Petoukhov M., Можаев А. А. и др., Crystallography Reports 2026 Vol. 71 P. 52–58
Добавлено: 6 августа 2026 г.
Functional Brain Connectivity and Musical Training: Insights from EEG Phase Synchronization during Music Perception
Радыгина А. А., Куликова С. П., Herald of the Russian Academy of Sciences 2025 Vol. 95 No. 6 P. 963–970
Музыкальное обучение оказывает значительное влияние на организацию мозга, вызывая функциональные и структурные адаптации, которые усиливают слуховые, зрительные, моторные и когнитивные процессы. В данном исследовании изучается, как интенсивное музыкальное обучение формирует функциональную связность мозга, путём сравнения профессиональных музыкантов и не-музыкантов. С использованием анализа значения фазовой синхронизации (PLV) по данным ЭЭГ мы оценили нейронную синхронизацию в альфа-, ...
Добавлено: 5 августа 2026 г.
WWW '23 Companion: Companion Proceedings of the ACM Web Conference 2023
Фирсанова В. И., ACM, 2026.
Добавлено: 4 августа 2026 г.
Joint Proceedings of the ESWC 2025 Workshops and Tutorials co-located with 22nd Extended Semantic Web Conference (ESWC 2025), Portorož, Slovenia, June 1-2, 2025.
Фирсанова В. И., Хлусова Я. К., CEUR Workshop Proceedings, 2025.
Добавлено: 4 августа 2026 г.
Mathematical methods of reinforcement learning
Беломестный Д. В., Гасников А. В., Гладин Е. Л. и др., Russian Mathematical Surveys 2026 Vol. 81 No. 4(490) P. 3–90
Добавлено: 3 августа 2026 г.
Анализ корпусов текстов на естественных языках. Математические методы. Учебное пособие
Чеповский А. М., М.: Мастерская Печати Идей, 2026.
В учебном пособии представлены методы и алгоритмы автоматического анализа корпусов текстов на естественных языках. Предназначено для изучающих методов обработки текстов на естественных языках и создания обучающих массивов текстов.  Для студентов, аспирантов и научных работников, изучающих методы компьютерной лингвистики и обработку текстов. ...
Добавлено: 1 августа 2026 г.
Three Algorithms for Merging Hierarchical Navigable Small World Graphs
Пономаренко А. А., / Series Computer Science "arxiv.org". 2025.
Добавлено: 30 июля 2026 г.
Профессиональная верификация: Руководство по продвинутой функциональной верификации
Уилкокс П., Романов А. Ю., М.: ДМК Пресс, 2025.
Книга, которую вы держите в руках, продолжает серию «Книжная полка истового инженера», которая издается при поддержке компании YADRO. Данная книга представляет собой учебник по теоретическим основам продвинутой функциональной верификации и содержит лучшие практики, используемые в настоящее время. В ней подробно описана унифицированная методология верификации (UVM) и раскрыты такие темы, как функциональный виртуальный прототип, функциональное покрытие, утверждения, формальная верификация, тестбенчи, косимуляция, эмуляция, аппаратное ...
Добавлено: 30 июля 2026 г.
EEG evidence for reproducible neural states during Buddhist Highest Yoga Tantra meditation
Mikhaylets E. V., Razorenova A. М., Chernyshev V. L. и др., Scientific Reports 2026 Vol. 16 Article 23560
Добавлено: 29 июля 2026 г.
Machine Learning-based Adaptive Reconstruction of Video Stream Fragments Taking into Account Scene Dynamics. Proceedings of the Institute for System Programming of the RAS
Думкин Н. А., Александров Д. В., Прозорский М. А., Труды Института системного программирования РАН 2026 Т. 38 № 1 С. 255–274
Предложен теоретически обоснованный подход к адаптивному восстановлению видеофрагментов на стороне клиента с использованием методов машинного обучения и анализа сцены. Метод включает формальную постановку задачи, модель конечного автомата для принятия решений, функцию стоимости восстановления, а также новый этап в подготовке видео – оценку динамики сцены с последующей записью признака в HLS-плейлист. Такой признак позволяет повысить точность выбора методов восстановления фрагментов видео. ...
Добавлено: 27 июля 2026 г.
Automated Reasoning: 13th International Joint Conference, IJCAR 2026, Lisbon, Portugal, July 26–29, 2026, Proceedings, Part II. (LNCS, volume 16689)
Cham: Springer, 2026.
Добавлено: 26 июля 2026 г.
The advent of generative chemistry
Ванхэлен К. Б., Lin Y., Zhavoronkov A., ACS Medicinal Chemistry Letters 2020 Vol. 11 No. 8 P. 1496–1505
Генеративные состязательные сети (GAN), впервые описанные в 2014 году, являются одними из важнейших концепций в современном искусственном интеллекте (ИИ). Объединяя глубокое обучение и теорию игр, GAN используются для генерации или «воображения» новых объектов с желаемыми свойствами. С 2016 года множество GAN с подкреплением (RL) успешно применяются в фармакологии для проектирования молекул de novo. Эти методы ...
Добавлено: 1 июня 2026 г.
Linking transport, structural and relaxation properties of supercooled 1-methylnaphthalene at high pressures via molecular modeling
Nikitiuk B., Nikolay Kondratyuk, Писарев В. В., Journal of Molecular Liquids 2025 Vol. 440 Article 128894
Добавлено: 12 ноября 2025 г.
Structural Basis of Activity of HER2-Targeting Construct Composed of DARPin G3 and Albumin-Binding Domains
Konshina A., Bocharov E., Konovalova E. и др., International Journal of Molecular Sciences (Швейцария) 2024 Vol. 25 No. 21 Article 11370
Добавлено: 9 декабря 2024 г.
Add-Ons To Molecular Modeling Methods: Improvement In Activity Prediction
Svitanko I. V., Novikov F. N., Medvedev M. G., , in: XXII Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry, October 7-12, 2024, Federal Territory “Sirius”, Russia. Book of abstracts in 7 volumesVol. 5.: “Admiral Print” LLC, 2024.
Надстройки к методам молекулярного моделирования, улучшающие точность прогнозирования активности ...
Добавлено: 14 октября 2024 г.
Липид-опосредованная адаптация белков и пептидов в клеточных мембранах
Полянский А. А., Ефремов Р. Г., Биологические мембраны 2024 Т. 41 № 4 С. 403–421
Представлены результаты исследований в компьютерном эксперименте молекулярных механизмов адаптации модельных клеточных мембран, реализующейся в ходе их взаимодействия с белками и пептидами. Речь идет об изменении структурно-динамических параметров водно-липидной среды, гидрофобной/гидрофильной организации поверхности липидного бислоя (так называемой «мозаичности») и пр. Взятые в совокупности, эти эффекты получили название «мембранного ответа» (МО) – важнейшей способности клеточных мембран специфично и устойчиво ...
Добавлено: 19 сентября 2024 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика обработки персональных данных
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору