Evolution of transcriptional regulation of histidine metabolism in Gram-positive bacteria

German A. Ashniev; Sernova N.; Shevkoplias A.; Rodionov I.; Rodionova I.; Vitreschak A.; Gelfand M.; Rodionov D.

doi:10.1186/s12864-022-08796-y

Публикации

?

Evolution of transcriptional regulation of histidine metabolism in Gram-positive bacteria

BMC Genomics. 2022. Vol. 23. Article 558.

German A. Ashniev, Sernova N., Shevkoplias A., Rodionov I., Rodionova I., Vitreschak A., Gelfand M., Rodionov D.

Научное направление: Биология Медицинские биотехнологии Здравоохранение Клиническая медицина

Язык: английский

DOI

Ключевые слова: Comparative genomics metagenomics Metabolic networks Gut microbiota Histidine metabolism

Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction

Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., BMC Biology 2026 No. 24 Article 181

Добавлено: 18 сентября 2026 г.

A functional systems view on neural tracking of natural speech

Anton Rogachev, Сысоева О. В., Frontiers in Systems Neuroscience 2025 Vol. 19 Article 1658243

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Neural tracking of natural speech in children in relation to their receptive speech abilities

Rogachev A.O., Sysoeva O. V., Cognitive Systems Research 2024 Vol. 86 Article 101236

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Validation of novel naturalistic limb movement stimuli for studying biological motion perception in adults

Корякина М. М., Ntoumanis I., Благовещенский Е. Д. и др., Frontiers in Human Neuroscience 2026 Vol. 20 Article 1754368

Введение Человек взаимодействует с другими людьми, выживает и ориентируется в меняющейся среде благодаря тому, что воспринимает и понимает движения других живых существ. Исследователи биологического движения традиционно использовали упрощённые стимулы, например точечно-световые изображения. Такие стимулы дают строгий контроль над условиями эксперимента, но снижают экологическую валидность. Методы Чтобы преодолеть это ограничение, мы создали новый набор стимулов, а именно натуралистичные видеозаписи ...

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Vague stimulating ideas, images and metaphors in scientific thinking: researchers' work with horizons of unclear knowledge

Поддьяков А. Н., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2026. No. 7437658.

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Структура потребления табачных и никотинсодержащих изделий среди взрослых в Российской Федерации: репрезентативные исследования 2019–2024 гг.

Салагай О. О., Сахарова Г. М., Антонов Н. С. и др., Здоровье населения и среда обитания 2026 Т. 34 № 6 С. 7-17

Введение. Употребление табака и никотина является фактором риска НИЗ, злокачественных новообразований и влияет на развитие и течение инфекционных болезней. При этом данный фактор риска является управляемым и может регулироваться профилактическими программами, учитывающими тенденции и особенности употребления различных видов табачной и никотинсодержащей продукции. Цель исследования: провести анализ динамики распространенности употребления различных видов табачной и никотинсодержащей продукции среди взрослого населения ...

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Структура потребления табачных и никотинсодержащих изделий участниками СВО

Салагай О. О., Сахарова Г. М., Антонов Н. С. и др., Медицинский вестник Юга России 2026 Т. 17 № 2 С. 109–119

Цель: анализ структуры и особенностей потребления участниками СВО различных видов табачной и никотинсодержащей продукции. Материалы и методы: анализ проводился по результатам опроса участников СВО с использованием разработанного вопросника. Вопросник включал 44 вопроса. Опрос проводился на базе офисов Фонда «Защитники Отечества». Рассчитаны доли респондентов, потреблявших различные виды изделий и подвергавшихся пассивному курению, показатели интенсивности курения и знаний о вреде ...

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Surgery for gliomas of Broca’s area

Dimertsev A. V., Batmanova Y. V., Zhikhar T. V. и др., Burdenko's Journal of Neurosurgery, Россия 2025 Vol. 6 P. 38–45

Добавлено: 14 сентября 2026 г.

“Reading the Mind in the Eyes Test”: Development of a Russian-Language Version Expanded for Neuroimaging Applications

Zheltyakova M., Korotkov A., Бурсов К. Г. и др., Herald of the Russian Academy of Sciences 2026 Vol. 95 P. 1048–1057

Добавлено: 13 сентября 2026 г.

Global burden of amphetamine, cannabis, cocaine and opioid use in 204 countries, 1990–2023: a Global Burden of Disease Study

Kang J., Kim H. J., Kim M. S. и др., Nature Medicine 2026 No. 32 P. 527–544

Drug use disorders (DUDs) are emerging global public health challenges. Here we investigated the global and regional estimates of the prevalence and burden of DUDs, including amphetamine, cannabis, cocaine and opioid use disorders, from 1990 to 2023 for 204 countries and territories by using the Global Burden of Disease Study 2023. Overall, trends in global ...

Добавлено: 9 сентября 2026 г.

Разработка методик на основе айтрекинга для диагностики когнитивных функций у детей

Ребрейкина А. Б., Левкович К. М., Современная зарубежная психология 2024 Т. 13 № 2 С. 33–43

Создание методик диагностики на основе анализа движений глаз является особенно актуальным для оценки когнитивных функций у детей, которые не могут дать речевой или моторный ответ в силу своего возраста или из-за нарушений развития. Для таких детей использование объективных методов оценки когнитивных функций на основе айтрекинга может стать полезным диагностическим инструментом, дополняющим традиционные поведенческие опросники и ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

Развитие когнитивных функций детей с помощью методик, использующих видеоокулографию

Ребрейкина А. Б., Левкович К. М., Современная зарубежная психология 2023 Т. 12 № 4 С. 51–61

Активное развитие метода видеоокулографии, т. е. регистрации движений глаз, создает возможности для создания новых подходов для развития когнитивных функций и обучения. Методики, основанные на видеоокулографии, могут быть полезны не только для детей с серьезными нарушениями моторных функций, но и детей с нарушениями развития когнитивных функций, прежде всего внимания, так как контроль движений глаз тесно связан ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

Вегетативные и поведенческие показатели при увеличении когнитивной нагрузки у здоровых добровольцев

Портнова Г. В., Левкович К. М., Васильева Л. Н. и др., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2022 Т. 72 № 4 С. 504–519

Когнитивная и эмоциональная нагрузка в ходе увеличения сложности задач приводит к активации различных звеньев вегетативной нервной системы и может сопровождаться как увеличением эффективности решения задач, так и способствовать дестабилизации эмоционального состояния и уменьшению продуктивности. Увеличение когнитивной нагрузки при условии высокой мотивации испытуемых является стрессовым фактором и выражается в различной реакции симпатического и парасимпатического звеньев в ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

DSCA-HLAII: A dual-stream cross-attention model for predicting peptide–HLA class II interaction and presentation

Шайтан А. К., Ke Y., Hongjun Y. и др., PLoS Computational Biology 2026 Article e1013836

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Salivary Antioxidant Capacity and Magnesium in Generalized Anxiety Disorder

Proskurnina E., Liaukovich K., Bychkovskaya L. и др., Metabolites 2023 Vol. 13 No. 1 P. 73

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Metagenomic profiling of viral and microbial communities from the pox lesions of lumpy skin disease virus and sheeppox virus-infected hosts

Sharko F., Mazloum A., Krotova A. и др., Frontiers in Veterinary Science 2024 Vol. 11 Article 1321202

Было признано, что инфекции каприпоксвируса имеют сильный тропизм к коже с проявлением поражений кожи в виде узелков и струпьев у соответствующих хозяев, за которыми следует некроз и шелушение. Учитывая, что микробиота кожи представляет собой сложное сообщество комменсальных бактерий, грибов и вирусов, на которые влияют инфекции, приводящие к патологическим состояниям, нет никаких данных о том, как ...

Добавлено: 25 августа 2025 г.

GENA-LM: a family of open-source foundational DNA language models for long sequences

Fishman V., Kuratov Y., Шмелев А. В. и др., Nucleic Acids Research 2025 Vol. 53 No. 2 Article gkae1310

Добавлено: 1 августа 2025 г.

Genomics-Based Reconstruction and Predictive Profiling of Amino Acid Biosynthesis in the Human Gut Microbiome

German A. Ashniev, Petrov S., Iablokov S. и др., Microorganisms 2022 Vol. 10 No. 4 Article 740

Добавлено: 31 января 2023 г.

Comparative Genomic Analysis of Holospora spp., Intranuclear Symbionts of Paramecia

Garushyants S., Beliavskaia A., Малько Д. Б. и др., Frontiers in Microbiology 2018 Vol. 9 Article 738

Добавлено: 16 декабря 2021 г.

Learning from Metabolic Networks: Current Trends and Future Directions for Precision Medicine

Granata I., Manzo M., Kusumastuti A. и др., Current Medicinal Chemistry 2021 Vol. 28 No. 32 P. 6619–6653

Добавлено: 25 августа 2021 г.

Clustering analysis of tumor metabolic networks

Manipur I., Granata I., Maddalena L. и др., BMC Bioinformatics 2020 Vol. 21 No. 10 P. 349

Добавлено: 22 ноября 2020 г.

Supervised Classification of Metabolic Networks

Granata I., Guarracino M., Калягин В. А. и др., , in: Proceedings 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine.: Madrid: IEEE, 2018. P. 2688–2693.

Добавлено: 24 ноября 2019 г.

Model simplification for supervised classification of metabolic networks

Granata I., Guarracino M., Калягин В. А. и др., Annals of Mathematics and Artificial Intelligence 2020 Vol. 88 P. 91–104

Добавлено: 24 ноября 2019 г.

The genes of the sulphoquinovose catabolism in Escherichia coli are also associated with a previously unknown pathway of lactose degradation

Гельфанд М. С., Scientific Reports 2018 Vol. 8 No. 1 P. 1–12

Добавлено: 17 марта 2019 г.