• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • From DNA-protein interactions to the genetic circuit design using CRISPR-dCas systems
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
6 ноября 2026 г.
Ученые НИУ ВШЭ - Санкт-Петербург разработали новый инструмент для речевой терапии после инсульта
Ученые НИУ ВШЭ — Санкт-Петербург совместно с коллегами из отделения нейрореабилитации Федерального Сибирского научно-клинического центра ФМБА в Красноярске разработали корпус упрощенных текстов для пациентов с афазией разной степени тяжести. Клинические исследования показали, что материалы по актуальным тематикам мотивируют активнее заниматься восстановлением речи после инсульта. Исследование опубликовано в журнале Aphasiology.
3 ноября 2026 г.
Физики научили ИИ настраивать пучок частиц в ускорителе
Исследователи Института искусственного интеллекта и цифровых наук ФКН НИУ ВШЭ и Института ядерной физики СО РАН разработали RLABC — программу, которая помогает подбирать оптимальные настройки ускорителя частиц с помощью обучения с подкреплением. В компьютерном эксперименте программа настроила модель так, что до конца ускорителя доходило около 70% частиц. Исследование опубликовано в журнале Computer Physics Communications.
3 ноября 2026 г.
«Органы на чипе позволяют проверять лекарства без экспериментов на животных»
Лаборатория молекулярной физиологии факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ изучает, как молекулярные регуляторы (микроРНК) управляют работой генов и влияют на развитие болезней — онкологических, вирусных и воспалительных, а также осложнений беременности. В Вышке выращивают модели органов человека на чипе: крошечные устройства с живыми клетками, воспроизводящие работу, например, плаценты или кишечника. Модели помогают понять, как возникают болезни и как на них действуют лекарства. «Вышка.Главное» побеседовала с заведующим лабораторией Евгением Князевым.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

From DNA-protein interactions to the genetic circuit design using CRISPR-dCas systems

Frontiers in Molecular Biosciences. 2022. Vol. 9. Article 1070526.
Шайтан А. К., Novikov R., Vinnikov R., Gribkova A., Glukhov G.

В последнее десятилетие технология CRISPR-Cas приобрела широкую популярность в самых разных областях: от редактирования генома и обнаружения специфических последовательностей ДНК/РНК до контроля экспрессии генов. В основе этой технологии лежит способность комплексов CRISPR-Cas программироваться для нацеливания на определенные локусы ДНК даже при использовании каталитически неактивных dCasпротеинов. Репертуар природных и сконструированных dCas-белков, включая слитые белки, представляет собой многообещающий инструментарий, который можно использовать для конструирования функциональных синтетических генетических цепей. Рациональный дизайн генетических цепей, помимо практической значимости, является важным шагом на пути к более глубокому количественному пониманию основных принципов, управляющих регуляцией экспрессии генов и функционированием живых организмов. В этом мини-обзоре мы представляем краткий обзор применения систем на основе CRISPR-dCas в новой области проектирования синтетических генетических цепей. Мы обсуждаем разнообразие инструментов на основе dCas, их свойства и их применение в различных типах генетических цепей, а также намечаем проблемы и направления дальнейших исследований в этой области.

Научное направление: Биология
Язык: английский
Полный текст
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: DNAДНКCRISPR/Cas9genetic circuitsCRISPR/Casгенетические схемы
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Анализ взаимосвязи альтернативных структур ДНК с эпигенетическим кодом (2022)
Похожие публикации
Vague Stimulating Ideas, Images and Metaphors in Scientific Thinking: Researchers’ Work with Horizons of Unclear Knowledge
Поддьяков А. Н., Integrative Psychological and Behavioral Science 2026 Vol. 60 No. 4 P. 1–50
Добавлено: 3 ноября 2026 г.
Молекулярные механизмы резистентности клеток рака мочевого пузыря RT112/GR к гемцитабину
Четверикова М. М., Потемкин А. Н., Степанова Е. В., Бюллетень экспериментальной биологии и медицины 2026 Т. 182 № 9 С. 242–247
Препарат первой линии при раке мочевого пузыря гемцитабин часто теряет эффективность из-за резистентности, механизмы которой изучены недостаточно. Путём длительной селекции получена высокорезистентная к гемцитабину клеточная линия RT112/GR. МТТ-тест показал 9312-кратное снижение чувствительности к гемцитабину и умеренную резистентность к цисплатину (2,60×, p < 0,0001). Резистентные клетки приобрели мезенхимальные признаки. ОТ-ПЦР выявила гиперэкспрессию цитидиндезаминазы (CDA) (FC = 7,2) и гипоэкспрессию дезоксицитидинкиназы (dCK) (FC ...
Добавлено: 26 октября 2026 г.
Molecular mechanisms regulating differential expression of individual miRNAs within polycistronic clusters
Мальцева Д. В., Тоневицкий А. Г., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 P. 1–28
Добавлено: 23 октября 2026 г.
Intentionally versus spontaneously prolonged Gaze: A MEG study of active gaze-based interaction
Vasilyev A., Svirin EP, Dubynin I. и др., Cortex 2025 Vol. 189 P. 76–96
Добавлено: 22 октября 2026 г.
Role of Bach1 Transcription Factor in the Mechanisms of Cell Death
Karina V. Klycheva, Mariia O. Silkina, Dmitry M. Hushpulian и др., Biochemistry. Biokhimiia 2026 Vol. 91 P. 1842–1858
Добавлено: 22 октября 2026 г.
Десинхронизация сенсомоторных ритмов при совершении квазидвижений, основанных на естественных движениях пальцев руки
Свирин Е. П., Бердышев Д. А., Шишкин С. Л., Вестник Российского государственного медицинского университета 2026 № 3 С. 42–50
Квазидвижения (КД) — попытки движения, минимизированные до исчезновения движения, — вызывают ЭЭГ-паттерны, схожие с реальным движением. КД могут моделировать попытки движения у здоровых участников и потому представляют интерес как альтернатива представлению движений (ПД) для реабилитационных интерфейсов мозг–компьютер (ИМК), в которых попытка движения парализованной конечностью используется как управляющий сигнал. КД ранее исследовали на отведении большого пальца. ...
Добавлено: 22 октября 2026 г.
Large amyloid plaques associate with early behavioral alterations in 6-month-old APPswe/PS1dE9 mice
Sitdikova K., Tsoy A., Chaprov K. и др., Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 2026 Article nlag078
Добавлено: 22 октября 2026 г.
Effects of Wheat Malt Extract on Molecular and Behavioral Markers in Aged APP/PS1 and Wild-Type Mice
Kassenova A., Svirin E., Sitdikova K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2026 Vol. 27 No. 11 Article 4994
Добавлено: 22 октября 2026 г.
Partial Serotonin Transporter Deficiency Modulates Plasma Metabolome, Arginine-Nitric Oxide Pathway and Emotional Behavior in Mice Exposed to Western Diet
Cespuglio R., Schmitt-Böhrer A., Deykin A. и др., Metabolites 2026 Vol. 16 No. 2 Article 117
Добавлено: 22 октября 2026 г.
Исследование движения сферического фронта клеток в вязком матриксе: роль клеточных делений и взаимодействия клеток с матриксом при развитии опухолей
Логвенков С. А., Известия РАН. Механика жидкости и газа 2026 № 3 С. 59–75
Решена задача об эволюции объемной концентрации клеток в сферическом агрегате, состоящем из клеток, внеклеточного матрикса и жидкости. Агрегат окружен внеклеточным матриксом. Постановка задачи использует разработанную автором ранее модель многофазной биологической сплошной среды, образованной двумя активно взаимодействующими твердыми фазами и жидкостью. Исследовано распространение сферического фронта клеток в вязком матриксе в результате деления клеток и активных взаимодействий клеток с ...
Добавлено: 20 октября 2026 г.
Mismatch Negativity as a Neural Correlate of Auditory Learning: Evidence From Implicit and Explicit Fine Frequency Discrimination Training
Левкович К. М., Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova 2026 Vol. 76 No. 5 P. 587–598
Добавлено: 19 октября 2026 г.
Interpreting antiviral effects: from experimental measurements to mechanistic viral dynamics
Нерсисян А. Л., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 Article 1995001
Добавлено: 15 октября 2026 г.
Low-frequency vibrational modes in G-quadruplexes reveal the mechanical properties of nucleic acids
Тукачев Н. В., González-Jiménez M., Ramakrishnan G. и др., Physical Chemistry Chemical Physics 2021 Vol. 23 No. 23 P. 13250–13260
Добавлено: 14 октября 2026 г.
Динамика изолированного поселения Spermophilus Suslicus (Rodentia, Sciuridae) в Липецке (Европейская Россия), его перспективы и роль в сохранении вида
Батова О. Н., Савинецкая Л. Е., Проявка С. В. и др., Nature Conservation Research. Заповедная наука 2026 Т. 11 № 4 С. 25–39
Spermophilus suslicus – находящийся под угрозой исчезновения вид, внесенный в Красные книги всех уровней (от региональных до международного Красного списка) и нуждающийся в настоящее время в особых мерах охраны. За последние 30–50 лет его ареал из сплошного стал мозаичным, а численность повсеместно сократилась. В начавшихся в России в 2015 г. экспериментальных работах по реинтродукции вида ...
Добавлено: 13 октября 2026 г.
Detailed data on anatomy of the coelomic system and ultrastructure of the lophophore coelom in brachiopod Novocrania anomala with discussion of the phylogenetic significance
Plandin F., Elena N. Temereva, Zoologischer Anzeiger 2026 Vol. 325 P. 182–195
Добавлено: 11 октября 2026 г.
HLA class I escape drives the evolution of SARS-CoV-2 in human populations
Ekaterina D. Riumina, Alekseeva E., Клинк Г. В. и др., PNAS, США 2026 Vol. 123 No. 35 Article e2619192123
Добавлено: 2 октября 2026 г.
(Re)defining the human chromatome: an integrated meta-analysis of localization, function, abundance, physical properties, and domain composition of chromatin proteins
Gribkova A., Armeev G. A., Kirpichnikov M. и др., Nucleic Acids Research 2026 Vol. 54 No. 2 Article gkaf1489
Полный набор белков, ассоциированных с хроматином (совокупно называемый хроматомом), обеспечивает функционирование генома у эукариот, участвуя в широком спектре физико-химических процессов. К ним относятся опосредование разнообразных специфических и неспецифических межмолекулярных взаимодействий, катализ синтеза и модификации макромолекул *in situ*, содействие АТФ-зависимому ремоделированию хроматина и т. д. Несмотря на значительный прогресс в области эпигеномики и структурной характеристики многих ...
Добавлено: 17 февраля 2026 г.
Generation of a HEK293 Cell Line with Stable Expression of Molecular Tools for Thermogenetic Activation
Ovechkina V., Suvorova P., Andrianova S. и др., Bulletin of Experimental Biology and Medicine 2025 No. 179 P. 373–377
Добавлено: 14 октября 2025 г.
The need to implement FAIR principles in biomolecular simulations
Amaro R., Åqvist J., Bahar I. и др., Nature Methods 2025 Vol. 22 P. 641–645
Добавлено: 18 апреля 2025 г.
Z-DNA formation in promoters conserved between human and mouse are associated with increased transcription reinitiation rates.
Бекназаров Н. С., Dmitry Konovalov, Herbert A. и др., Scientific Reports 2024 Vol. 14 Article 17786
Добавлено: 24 октября 2024 г.
Protective Dps–DNA co‐crystallization in stressed cells: an in vitro structural study by small‐angle X‐ray scattering and cryo‐electron tomography
Dadinova L., Chesnokov Y., Kamyshinsky R. и др., FEBS Letters 2019 Vol. 593 No. 12 P. 1360–1371
Добавлено: 4 февраля 2024 г.
Polymorphic Protective Dps–DNA Co-Crystals by Cryo Electron Tomography and Small Angle X-Ray Scattering
Kamyshinsky R., Chesnokov Y., Dadinova L. и др., Biomolecules 2019 Vol. 10 No. 1 P. 39–0
Добавлено: 4 февраля 2024 г.
Применение лекарственных препаратов на основе нуклеиновых кислот в терапии различных заболеваний
Трошин Д. С., В кн.: Сборник научно-исследовательских работ студентов и аспирантов – стипендиатов Фонда им. В.И. Вернадского.: Фонд им. В.И. Вернадского, 2022. С. 78–82.
Нуклеиновые кислоты (НК) представляют собой молекулярную основу всех живых организмов. Данный класс химических соединений был открыт в 1968 году Фридрихом Мишером. С тех пор их свой ства изучались учеными со всего мира. Первоначально нуклеиновые кислоты были получены в виде нуклеопротеидов из гнойных выделений. Далее такой источник НК был заменен Мишером на молоки лососевых рыб. Данная альтернатива оказалась довольно целесообразной ...
Добавлено: 13 мая 2023 г.
Electron microscopy analysis of ATP-independent nucleosome unfolding by FACT
Sivkina A., Karlova M., McCullough L. и др., Communications Biology 2022 Vol. 5 No. 1 Article 2
FACT является шапероном гистонов, который участвует в удалении и повторной сборке нуклеосом во время транскрипции и репликации. Мы использовали электронную микроскопию для изучения комплексов FACT, FACT:Nhp6 и FACT:Nhp6:нуклеосома и обнаружили, что все комплексы принимают широкий диапазон конфигураций, что указывает на высокую гибкость. Мы неожиданно обнаружили, что ДНК-связывающий белок Nhp6 также связывается с С-концевыми хвостами субъединиц ...
Добавлено: 9 декабря 2022 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика обработки персональных данных
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору