Preliminary modelling as the first stage of targeted organic synthesis

?

Preliminary modelling as the first stage of targeted organic synthesis

Russian Chemical Reviews. 2021. Vol. 90. No. 7. P. 831–867.

Титов И. Ю., Stroylov V., Rusina P. V., Свитанько И. В.

В обзоре представлены классификация и анализ применимости методов предварительного молекулярного моделирования для направленного органического, каталитического и биокаталитического синтеза. В качестве классификатора методов рассматриваются три основных подхода: моделирование координации лиганд–мишень при отсутствии информации как о мишени, так и о структуре полученного комплекса; вычисления на основе экспериментально полученной структурной информации о мишени; динамическое моделирование комплекса лиганд–мишень, а также механизма реакции с расчетом энергетической составляющей процесса.

Обзор предназначен для химиков-синтетиков в качестве руководства для построения алгоритма предварительного моделирования и синтеза структур с заданными свойствами.

Библиография – 353 ссылки.

Научное направление: Компьютерные науки Химия

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Proceedings of the 43rd International Conference on Machine Learning (ICML 2026)

Seul: PMLR, 2026.

Добавлено: 4 июня 2026 г.

DFT-guided charge-state engineering of gold clusters for levodopa recognition: fundamental principles for drug delivery applications

Новиков А. С., New Journal of Chemistry 2026 Vol. - No. - Article 0

Rational design of gold-based nanocarriers for neurotherapeutics requires atomic-scale understanding of drug-material interactions. Density functional theory calculations were performed to investigate levodopa (L-DOPA) adsorption on small gold clusters (Au2–Au4) with cationic, neutral, and anionic charges, with additional validation on a larger Au10 cluster using multiple low-energy isomers. Binding free energies (ΔGbind), charge transfer, and electronic descriptors ...

Добавлено: 3 июня 2026 г.

Facile and Green Approach to Synthesize Biomass-Derived Zero-/Two-Dimensional Carbon Dots/g-C3N4 Heterojunction for Efficient Photocatalytic and Photoelectrocatalytic Applications

Дас А., Saikia J., Maji N. и др., ChemNanoMat 2026 Vol. 12 No. 5 Article e202500733

Добавлено: 2 июня 2026 г.

Optimal Design of Copper-Doped ZnO Heterostructures for Photocatalytic and Photoeletrochemical Performance: A Combined Experimental and DFT Study

Wary R. R., Mahato B., Sharma N. и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2026 Vol. 17 No. 17 P. 5099–5107

Добавлено: 2 июня 2026 г.

OpenAtom Foundation. Консорциум, развивающий Open Source в Китае.

Силаков Д. В., Системный администратор 2026 № 3 С. 28–33

В статье про платформы для разработки открытого ПО в Китае мы рассказали про GitCode – молодой проект, позиционируемый как площадка для разработчиков со всего мира. Сейчас на GitCode размещаются проекты, созданные в КНР, но некоторые из них уже известны и на международной арене. Помочь открытым проектам в становлении, развитии и расширению аудитории призван фонд OpenAtom ...

Добавлено: 2 июня 2026 г.

Synergistic Multimetal Effects in a High-Entropy Perovskite Oxide Anchored on Reduced Graphene Oxide for Accelerated Water Oxidation

Остовари М. А., Mehrabi-Kalajahi S., Hossein Vasigh S. A. и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2026 Vol. 17 No. 13 P. 3978–3985

Добавлено: 1 июня 2026 г.

The advent of generative chemistry

Ванхэлен К. Б., Lin Y., Zhavoronkov A., ACS Medicinal Chemistry Letters 2020 Vol. 11 No. 8 P. 1496–1505

Генеративные состязательные сети (GAN), впервые описанные в 2014 году, являются одними из важнейших концепций в современном искусственном интеллекте (ИИ). Объединяя глубокое обучение и теорию игр, GAN используются для генерации или «воображения» новых объектов с желаемыми свойствами. С 2016 года множество GAN с подкреплением (RL) успешно применяются в фармакологии для проектирования молекул de novo. Эти методы ...

Добавлено: 1 июня 2026 г.

The recognition-by-components method

Slivnitsin P., Мыльников Л. А., Engineering Applications of Artificial Intelligence 2026 Vol. 179 Article 115185

Добавлено: 29 мая 2026 г.

Brain-Computer Interfaces for Gait Rehabilitation After Stroke A Scoping Review

Мокиенко О. А., Zisman M. A., Бобров П. Д. и др., American Journal of Physical Medicine and Rehabilitation 2026 Vol. 105 No. 6 P. 555–563

Добавлено: 28 мая 2026 г.

An IQA/QTAIM Approach to the Chalcogen Bond

Jiménez-Grávalos F., Alexander S. Novikov, Pendás Á. M., Communications in Computational Chemistry 2026 Vol. 8 No. 2 P. 203–210

Добавлено: 27 мая 2026 г.

Singlet oxygen-mediated oxidation of sulfides with palladium(II) porphyrinates: The effect of partly conjugated peripheral substituents

Uskov F., Korobkov S., Бирин К. П. и др., Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry 2026 Vol. 474 Article 116936

Добавлено: 27 мая 2026 г.

ИНФОРМАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ И ТЕХНИЧЕСКИЕ СРЕДСТВА УПРАВЛЕНИЯ (ICCT-2024)

М.: Институт проблем управления им. В.А. Трапезникова РАН, 2024.

В сборник вошли материалы VIII Международной научной конференции «Информационные технологии и технические средства управления» (ICCT-2024). На конференции были рассмотрены вопросы, касающиеся перспектив развития научного приборостроения в телекоммуникационных и управляющих системах, биомедицинской информатики, аппаратного и программного обеспечения информационнокоммуникационных систем, надежности, диагностики и неразрушающего контроля, систем управления и автоматизации, цифровых экосистем, управления производством и логистикой, методов математического ...

Добавлено: 27 мая 2026 г.

Synthesis of Zwitterionic conjugates of cobalt Bis(dicarbollide) with BODIPY and their Photophysical properties and biological studies

Mezentsev I., Dudarova N., Druzina A. и др., Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry 2026 Vol. 479 Article 117316

Добавлено: 27 мая 2026 г.

Non-linear in-band interference cancellation on base of conjugate gradients method

Degtyarev A., Bakhurin S., Юдин Н. Е., DSPA 2026 P. 1–6

Добавлено: 26 мая 2026 г.

28th European Conference on Artificial Intelligence, 25-30 October 2025, Bologna, Italy – Including 14th Conference on Prestigious Applications of Intelligent Systems (PAIS 2025)

IOS Press, 2025.

Добавлено: 26 мая 2026 г.

КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ МЕХАНИЗМА ЭКСТРАКЦИИ Fe(III) ИЗ СОЛЯНОКИСЛОГО ВОДНОГО РАСТВОРА ЭВТЕКТИЧЕСКИМИ РАСТВОРИТЕЛЯМИ НА ОСНОВЕ 1-ОКТАНОЛА

Мальцева В. Е., Ананьев И. В., Милевская А. В. и др., Теоретические основы химической технологии 2025 Т. 59 № 3 С. 13–22

Проведено квантово-химическое моделирование механизма экстракции Fe(III) из солянокислого раствора с использованием гидрофобных эвтектических растворителей на основе 1-октанола. Установлено, что путь реакции существенно различается в зависимости от того, является ли инертный компонент донором или акцептором водородной связи в димере с октанолом. На основе оценки прочности водородных связей показано, что более слабое взаимодействие между компонентами упрощает протекание ...

Добавлено: 13 мая 2026 г.

Understanding the electric double layer at the electrode–electrolyte interface: Part II - specific adsorption and partial charge transfer

Daria A. Mazur, Petr E. Brandyshev, Doronin S. и др., Electrochimica Acta 2026 Vol. 545 Article 147660

Добавлено: 11 ноября 2025 г.

Combining Experimental and Computational Methods to Produce Conjugates of Anticholinesterase and Antioxidant Pharmacophores with Linker Chemistries Affecting Biological Activities Related to Treatment of Alzheimer's Disease

Махаева Г. Ф., Ковалева Н. В., Рудакова Е. В. и др., Molecules 2024 Vol. 29 No. 2 Article 321

В мире весьма высока потребность в эффективных препаратах для лечения болезни Альцгеймера (БА). В нашей предыдущей работе в этом направлении были синтезированы новые кандидатные препараты, состоящие из 4-амино-2,3-полиметиленхинолинов, конъюгированных с бутилированным гидрокситолуолом с помощью алкилиминовых или алкиламиновых линкеров фиксированной длины (спейсеров), и исследована их биологическая активность, важная для лечения БА. Здесь мы сообщаем о значительном ...

Добавлено: 14 сентября 2025 г.

An efficient algorithm for the eigenvalue problem of a Hermitian quaternion matrix in quantum chemistry

Guo Z., Jiang T., Wang G. и др., Journal of Computational and Applied Mathematics 2025 Vol. 463

Добавлено: 16 декабря 2024 г.

Structural Basis of Activity of HER2-Targeting Construct Composed of DARPin G3 and Albumin-Binding Domains

Konshina A., Bocharov E., Konovalova E. и др., International Journal of Molecular Sciences (Швейцария) 2024 Vol. 25 No. 21 Article 11370

Добавлено: 9 декабря 2024 г.

Add-Ons To Molecular Modeling Methods: Improvement In Activity Prediction

Svitanko I. V., Novikov F. N., Medvedev M. G., , in: XXII Mendeleev Congress on General and Applied Chemistry, October 7-12, 2024, Federal Territory “Sirius”, Russia. Book of abstracts in 7 volumesVol. 5.: “Admiral Print” LLC, 2024.

Надстройки к методам молекулярного моделирования, улучшающие точность прогнозирования активности ...

Добавлено: 14 октября 2024 г.

Inconspicuous yet indispensable: the coronavirus spike transmembrane domain

Aliper E., Roman G. Efremov, International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 22 Article 16421

Добавлено: 15 сентября 2024 г.

Molecular Dynamics Simulations of Nucleosomes Are Coming of Age

Fedulova A., Armeev G., Romanova T. и др., Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science 2024 Vol. 14 No. 4 Article e1728

Understanding the function of eukaryotic genomes, including the human genome, is undoubtedly one of the major scientific challenges of the 21st century. The cornerstone of eukaryotic genome organization is nucleosomes—elementary building blocks of chromatin about 10 nm in size that wrap DNA around an octamer of histone proteins. Nucleosomes are integral players in all genomic processes, ...

Добавлено: 29 августа 2024 г.

Molecular modeling in synthesis: from statistical methods to quantum chemistry and practical applications

I. V. Svitanko, Pivina T. S., Russian Chemical Bulletin 2024 Vol. 73 No. 5 P. 1093–1108

Добавлено: 21 июня 2024 г.