Probing temperature and capsaicin-induced activation of TRPV1 channel via computationally guided point mutations in its pore and TRP domains

Лубова К.; A. Chugunov; Волынский П.; Y. Trofimov; Королькова Ю.; Мошарова И.; Козлов С.; Андреев Я.; R. Efremov

doi:10.1016/j.ijbiomac.2020.04.239

?

Probing temperature and capsaicin-induced activation of TRPV1 channel via computationally guided point mutations in its pore and TRP domains

International Journal of Biological Macromolecules. 2020. Vol. 158. P. 1175–1183.

Лубова К., Чугунов А. О., Волынский П., Трофимов Ю. А., Королькова Ю., Мошарова И., Козлов С., Андреев Я., Ефремов Р. Г.

Научное направление: Биология

Приоритетные направления: компьютерно-математическое

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: computational modeling Site-directed mutagenesis Ion channel gating TPRV1

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Методы анализа эффективности суперкомпьютерного комплекса, новые параллельные алгоритмы для молекулярно-динамических расчетов и моделирование транспортных процессов в жидкостях и биомембранах (2020)

Исследование движения сферического фронта клеток в вязком матриксе: роль клеточных делений и взаимодействия клеток с матриксом при развитии опухолей

Логвенков С. А., Известия РАН. Механика жидкости и газа 2026 № 3 С. 59–75

Решена задача об эволюции объемной концентрации клеток в сферическом агрегате, состоящем из клеток, внеклеточного матрикса и жидкости. Агрегат окружен внеклеточным матриксом. Постановка задачи использует разработанную автором ранее модель многофазной биологической сплошной среды, образованной двумя активно взаимодействующими твердыми фазами и жидкостью. Исследовано распространение сферического фронта клеток в вязком матриксе в результате деления клеток и активных взаимодействий клеток с ...

Добавлено: 20 октября 2026 г.

Mismatch Negativity as a Neural Correlate of Auditory Learning: Evidence From Implicit and Explicit Fine Frequency Discrimination Training

Левкович К. М., Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova 2026 Vol. 76 No. 5 P. 587–598

Добавлено: 19 октября 2026 г.

Interpreting antiviral effects: from experimental measurements to mechanistic viral dynamics

Нерсисян А. Л., Frontiers in Molecular Biosciences 2026 Vol. 13 Article 1995001

Добавлено: 15 октября 2026 г.

Low-frequency vibrational modes in G-quadruplexes reveal the mechanical properties of nucleic acids

Тукачев Н. В., González-Jiménez M., Ramakrishnan G. и др., Physical Chemistry Chemical Physics 2021 Vol. 23 No. 23 P. 13250–13260

Добавлено: 14 октября 2026 г.

Динамика изолированного поселения Spermophilus Suslicus (Rodentia, Sciuridae) в Липецке (Европейская Россия), его перспективы и роль в сохранении вида

Батова О. Н., Савинецкая Л. Е., Проявка С. В. и др., Nature Conservation Research. Заповедная наука 2026 Т. 11 № 4 С. 25–39

Spermophilus suslicus – находящийся под угрозой исчезновения вид, внесенный в Красные книги всех уровней (от региональных до международного Красного списка) и нуждающийся в настоящее время в особых мерах охраны. За последние 30–50 лет его ареал из сплошного стал мозаичным, а численность повсеместно сократилась. В начавшихся в России в 2015 г. экспериментальных работах по реинтродукции вида ...

Добавлено: 13 октября 2026 г.

Detailed data on anatomy of the coelomic system and ultrastructure of the lophophore coelom in brachiopod Novocrania anomala with discussion of the phylogenetic significance

Темерева Е. Н., Zoologischer Anzeiger 2026 Vol. 325 P. 182–195

Добавлено: 11 октября 2026 г.

Polarization of opinions in the group: a modeling algorithm considering the dynamics of social bonds

Chebotarev V., Andreyuk D., Elizarova Anastasiya и др., Procedia Computer Science 2022 Vol. 213 No. C P. 596–601

Добавлено: 2 октября 2026 г.

HLA class I escape drives the evolution of SARS-CoV-2 in human populations

Ekaterina D. Riumina, Клинк Г. В., Alekseeva E. и др., PNAS, США 2026 Vol. 123 No. 35 P. 1–20

Добавлено: 2 октября 2026 г.

Pericyte-derived cancer-associated fibroblasts correlate with poor survival and are enriched after chemoradiotherapy in glioblastoma

Aly Ismailov, Попцова М. С., Plos One 2026 Vol. 21 No. 9 Article e0355902

Добавлено: 2 октября 2026 г.

Профессиональная учебная практика: I курс. Введение в биотехнологию, клеточную и молекулярную биологию : учебно-методическое пособие для студентов и преподавателей. Третье издание, пересмотренное

Князев Е. Н., Чеботарева О. Е., М.: Издательский дом НИУ ВШЭ, 2026.

В пособии кратко изложены теоретические и практические аспекты первичных навыков, необходимых для работы в биологической лаборатории, а также приведены протоколы практических занятий в рамках профессиональной учебной практики (ознакомительной) I курса бакалаврской программы «Клеточная и молекулярная биотехнология» факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ. Учебно-методическое пособие предназначено для студентов и преподавателей факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ и ...

Добавлено: 30 сентября 2026 г.

Анализ in silico вероятных зависимостей «структура-активность» этанола

Рыскина Е. А., Князев Е. Н., Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии 2026 Т. 29 № 9 С. 84–91

Введение. Активная интеграция стремительно развивающихся омиксных и компьютерных технологий в XXI веке позволяет осуществить прорыв в понимании принципов функционирования живых систем. Одним из динамично развивающихся интегративных направлений в биологии является биологическое моделирование. Фундаментальной парадигмой стала методология, позволяющая спрогнозировать биологическую активность молекул на основе анализа их структуры Structure-Activity Relationship (SAR). Цель работы - предсказать in silico возможность ...

Добавлено: 29 сентября 2026 г.

A Three-Party W-State Quantum Secret Sharing Protocol with X-Gate Encoding and Forbidden-Outcome Detection

Терегулов Т. Р., Лубенец Е. Р., / Series Quantum Physics "arXiv". 2026. No. 2609.31472.

Добавлено: 28 сентября 2026 г.

A New Recruitable E3 Ligase UHRF1 Supporting Targeted Protein Degradation: A Minimal Azide as a Recruitment Ligand

Lin Z., Duan K., Wan R. и др., Advanced Science 2026 P. 1–13

Добавлено: 26 сентября 2026 г.

A28-04 Measuring the Polygenic Risk of Thrombosis May Accelerate the Detection of Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension Among Other Forms of Pulmonary Hypertension

Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. и др., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Haplotype-resolved DiMeLo-seq maps centromeric chromatin in a complete diploid human genome

Xu Y., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., USA 2026 Vol. 6 No. 8 Article 101324

Centromeres ensure chromosome segregation, but their chromatin organization within repetitive alpha-satellite DNA has been difficult to resolve. To address this, we generated haplotype-resolved satellite DNA annotations for the complete diploid T2T-HG002 human genome assembly, then we mapped centromere protein A (CENP-A), H3K9me3, and CpG methylation on ultra-long, adaptively sampled nanopore reads using directed methylation with ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

A complete genome for the common marmoset

Hebbar P., Рябов Ф. Д., Alexandrov I. и др., Cell 2026 Vol. 189 P. 4891–4908.e12

Обыкновенная игрунка — обезьяна Нового Света, широко используемая для изучения эволюции приматов и заболеваний человека. Мы представляем референсную сборку генома этого вида «от теломеры до теломеры» (T2T), а также три гаплотипа, собранных почти до уровня T2T. Эти сборки позволяют охарактеризовать ранее недоступные участки генома, включая центромеры, половые хромосомы, субтеломерные сателлитные повторы, акроцентрические хромосомы и главный ...

Добавлено: 23 сентября 2026 г.

Specialized Non-local Blocks for Recognizing Tumors on Computed Tomography Snapshots of Human Lungs

Aleksei Samarin, Aleksei Toropov, Dzestelova A. и др., , in: Proceedings of the 35th Conference of Open Innovations Association FRUCT, 24-26 April 2024, Tampere, FinlandIssue 1.: FRUCT Oy, 2024. P. 659–664.

Добавлено: 19 сентября 2026 г.

Universal Filter-Based Lightweight Image Enhancement Model with Unpaired Learning Mode

Aleksei Samarin, Назаренко А. А., Aleksei Toropov и др., , in: Proceedings of the 36th Conference of Open Innovations Association FRUCT, Helsinki, Finland, 30 October - 1 November 2024Vol. 36.: FRUCT Oy, 2024. P. 711–720.

Добавлено: 19 сентября 2026 г.

Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction

Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., 2026 No. 24 Article 181

Добавлено: 18 сентября 2026 г.

On calibration of remote sensing retrievals of ecosystem respiration (Reco) with tower measurements over,Russian forests and wetlands