Lipid II as a Target for Novel Antibiotics:Structural and Molecular Dynamics Studies.

Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 2018. Vol. 44. No. 6. P. 653–664.

Panina I. S., Чугунов А. О., Ефремов Р. Г.

Ввиду нарастающей проблемы антибиотикорезистентности в медицине, большое внимание уделяется антимикробным веществам, действующим на небелковые молекулы, устроенные более консервативно, чем белки. Одной из наиболее перспективных и изученных таких мишеней является компонент биосинтетического пути формирования бактериальной клеточной стенки — липид II, который присутствует только в мембране бактерий и имеет консервативную химическую структуру. Существуют несколько классов природных антибиотиков, действующих на липид II, часть из которых блокируют синтез пептидогликанового слоя клеточной стенки, связывая липид II в прочный комплекс, а другие имеют дополнительный бактерицидный механизм, заключающийся в нарушении целостности мембраны. В обзоре рассмотрены перспективы использования таких антибактериальных веществ в качестве новых лекарств для борьбы с устойчивыми к антибиотикам патогенами. Основной акцент сделан на исследованиях структуры липида II и механизмов его распознавания антибиотиками, а также на компьютерном моделировании их взаимодействия.

Ключевые слова: молекулярная динамика, биомембраны, antimicrobial peptides, intermolecular recognition, biomembranes, computer simulation of macromolecules, molecular dynamics, антимикробные пептиды, межмолекулярное распознавание, компьютерное моделирование макромолекул

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА: Атомистическое многомасштабное моделирование свойств и процессов в материалах и живых системах; анализ эффективности новых суперкомпьютерных технологий (2018)