• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • ИСТОРИЯ И ПЕРСПЕКТИВЫ АТОМИСТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ПОЛИСАХАРИДОВ
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
8 июня 2026 г.
«За 12 лет на нашем счету почти 1000 операций с пробуждением»
В НИУ ВШЭ прошла XIII Летняя нейролингвистическая школа, организованная Центром языка и мозга при поддержке факультета гуманитарных наук НИУ ВШЭ. В центре внимания слушателей была совместная работа нейролингвистов, нейрохирургов и нейрофизиологов в операционной, стандартизация лингвистических парадигм и практические подходы к сохранению речевой функции пациентов.
5 июня 2026 г.
Аспирантка НИУ ВШЭ открыла «невидимую» планировку античного Париона
Исследовательница из НИУ ВШЭ Идиль Малгиль изучила с помощью дрона с лазерным сканером сверхвысокого разрешения древнеримский город Парион, расположенный на территории современной Турции. Благодаря высокой плотности сканирования удалось зафиксировать крошечные неровности рельефа, скрытые под землей и растительностью. Обнаружены следы целых кварталов, террасных систем и стен, которые невозможно было различить ни при обычных раскопках, ни с помощью аэрофотосъемки. Результаты исследованияо публикованы в международном научном журнале Ancient Civilizations from Scythia to Siberia.
2 июня 2026 г.
От Волги до Янцзы: математики из Нижнего Новгорода и Шанхая изучают устойчивость систем
Математики НИУ ВШЭ в Нижнем Новгороде совместно с коллегами из шанхайского Университета Тунцзи исследуют фундаментальные причины структурной устойчивости систем и механизмы их нарушения. О развитии проекта Qualitative Theory of Systems of Ordinary and Partial Differential Equations в рамках программы НИУ ВШЭ «Международное академическое сотрудничество» «Вышке.Главное» рассказала его руководитель, профессор Ольга Починка, заведующая Международной лабораторией динамических систем и приложений НИУ ВШЭ в Нижнем Новгороде.


 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

ИСТОРИЯ И ПЕРСПЕКТИВЫ АТОМИСТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ПОЛИСАХАРИДОВ

Высокомолекулярные соединения. Серия С. 2023. Т. 65. № 1. С. 91–109.
Дещеня В. И., Кондратюк Н. Д.

Представлены история и перспективы развития потенциалов межатомного взаимодействия для моделирования молекулярных систем и, в частности, полисахаридов. Рассмотрены популярные семейства потенциалов, такие как CHARMM, GROMOS, AMBER и OPLS. Обозначены проблемы применимости данных моделей для мономеров сахаров: плохая воспроизводимость экспериментальных свойств и гиперагрегация при малых концентрациях. Также рассмотрены векторы развития данной области: модификация невалентных взаимодействий в потенциале и использование поляризуемых потенциалов. Продемонстрированы примеры применения атомистического моделирования полисахаридов в актуальных фундаментальных и промышленных задачах на примере целлюлозы. Приведены важные вычислительные работы, внесшие существенный вклад в понима- ние структуры и процессов, происходящих в кристалле целлюлозы. Кроме того, дан обзор доступ- ных на сегодня масштабов времен и характерных размеров систем для моделирования в пакетах GROMACS, LAMMPS, OpenMM и AMBER для модели раствора сахарозы.

Научное направление: Физика Компьютерные науки
Язык: русский
DOI
Текст на другом сайте
Ключевые слова: потенциал взаимодействия частицвязкостьклассическая молекулярная динамикаполисахариды
Похожие публикации
Спонтанное образование скин-слоя в воде с деформацией ОН-полосы КР вкладом компоненты льда 3200 см-1
Першин С. М., Степанов Е. В., Артемова Д. Г. и др., Письма в Журнал экспериментальной и теоретической физики 2026 Т. 123 № 6 С. 383–390
Открыто спонтанное образование в течение 4 ч скин-слоя дистиллированной воды толщиной до 3 мм при комнатной температуре с новыми свойствами. Обнаружены деформация ОН-полосы комбинационного рассеяния вкладом компоненты льда ( 3200 см-1), снижение коэффициента упругого рассеяния и его флуктуаций, а также увеличение на 20 капиллярах. Восстановление слоя после обогащения воздухом в результате перемешивания указывает на стабильность ...
Добавлено: 8 июня 2026 г.
Innovations in Information and Decision Sciences
Springer, 2026.
Добавлено: 8 июня 2026 г.
Structural and broadband radio-frequency properties of InGaZnO4 nanoparticles synthesized by gel decomposition method
Zirnik G., Остовари М. А., Zhukov S. и др., Journal of Materials Science: Materials in Electronics 2026 Vol. 37 Article 738
Добавлено: 6 июня 2026 г.
Wave dynamics within the Whitham-Ostrovsky equation
Flamarion M. V., Пелиновский Е. Н., Nonlinear Dynamics 2026 Vol. 114 Article 784
Добавлено: 5 июня 2026 г.
Proceedings of the 43rd International Conference on Machine Learning (ICML 2026)
Seul: PMLR, 2026.
Добавлено: 4 июня 2026 г.
Green synthesis of Bi-functional silica nanoparticles towards highly efficient photocatalysis and antibacterial application
Hazarika A. P., Дас А., Das S. K. и др., Physica B: Condensed Matter 2026 Vol. 738 Article 418803
Добавлено: 4 июня 2026 г.
Signatures of Reconnection and a Split Heliospheric Tail in High-energy Energetic Neutral Atoms
Kornbleuth M., Opher M., Drake J. F. и др., Astrophysical Journal 2026 Vol. 1004 No. 1 Article 1
Добавлено: 3 июня 2026 г.
Two-dimensional hexagonal boron nitride-ferrofluid hybrids enable efficient magnetic cooling
Nishant T., Карцев А. И., Saswata G. и др., Journal of Materials Chemistry C 2026 Article -
Добавлено: 2 июня 2026 г.
The critical role of shear antiphase boundaries in τ-Mn(Al,Ga) rapidly quenched alloy
Fortuna A. S., A.I. Kartsev, Gorshenkov M. V. и др., Journal of Alloys and Compounds 2026 Vol. 1070 Article 188711
Добавлено: 2 июня 2026 г.
OpenAtom Foundation. Консорциум, развивающий Open Source в Китае.
Силаков Д. В., Системный администратор 2026 № 3 С. 28–33
В статье про платформы для разработки открытого ПО в Китае мы рассказали про GitCode – молодой проект, позиционируемый как площадка для разработчиков со всего мира. Сейчас на GitCode размещаются проекты, созданные в КНР, но некоторые из них уже известны и на международной арене. Помочь открытым проектам в становлении, развитии и расширению аудитории призван фонд OpenAtom ...
Добавлено: 2 июня 2026 г.
Combined Experimental and Ab Initio Study of Sc Doping in MgB2: Decoupling Electronic and Microstructural Effects on Superconductivity
Dikhtievskaya K., Argunov E., Alexey I. Kartsev и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2026 Vol. 17 No. 17 P. 4999–5004
Добавлено: 2 июня 2026 г.
Bridging Superconductors With United Nations Development Goals: Perspectives and Applications
Duran E. ., Pulgar A., Izquierdo R. и др., Physica Status Solidi (A) Applications and Materials 2026 Vol. 223 No. 7 Article e202500942
Добавлено: 1 июня 2026 г.
From solvation to sorption: a comprehensive molecular dynamics study of mefenamic acid conformer behavior in pure scCO2 and scCO2/cellobiose systems
Гурина Д. Л., Fashchevsky K. A., Будков Ю. А. и др., Journal of Molecular Liquids 2026 Vol. 448 Article 129401
Добавлено: 25 февраля 2026 г.
Long-range spatial velocity statistics in a rotating coherent turbulent vortex
Leon L. Ogorodnikov, Sergey S. Vergeles, Physical Review Fluids 2025 Vol. 10 No. 12 Article 124702
Добавлено: 24 февраля 2026 г.
Molecular-scale origin of extreme disjoining pressure in water confined in carbon and silica nanopores
Ekaterina G. Odintsova, Darya L. Gurina, Yury A. Budkov, Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects 2026 Vol. 736 Article 139693
Добавлено: 24 января 2026 г.
How water reverse micelles solubilize polyphenols: An all-atom simulation perspective
Гурина Д. Л., Будков Ю. А., Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects 2026 Vol. 733 Article 139276
Добавлено: 17 декабря 2025 г.
Влияние состава на вязкость растворов и структуру высокопористых композиционных материалов альгинат–поливинилпирролидон– карбонатгидроксиапатит
Гречишникова А. А., Трофимчук Е. С., Егоров А. А. и др., Перспективные материалы 2025 № 11 С. 17–28
Получены композиционные гели на основе поливинилпирролидона (ПВП) и альгината (Алг) с карбонатгидроксиапатитом (КГА). Измерена их кинематическая и динамическая вязкости. Показано, что введение в полимер КГА в количестве до 40 масс. % приводит к снижению кинематической вязкости, а введение 50 масс. % КГА значительно ее повышает. Зависимость динамической вязкости гелей ПВП с Алг 1:1 и композиционных ...
Добавлено: 26 ноября 2025 г.
A fluctuation theory of liquid-phase solutions: Shear viscosity
Yury A. Budkov, Nikolai N. Kalikin, Petr E. Brandyshev, Journal of Chemical Physics 2025 Vol. 163 No. 2 Article 024502
Добавлено: 8 июля 2025 г.
Exploring the relationship between water impurities, electrode charge density, and electric double layer structure and capacitance in carbon micropores
Darya L. Gurina, Kruchinin S. E., Yury A. Budkov, Electrochimica Acta 2025 Vol. 535 Article 146711
Supercapacitors are becoming increasingly important in energy storage applications due to their high power density, long cycle life, and fast charging capabilities. However, to further enhance supercapacitor performance, a deeper understanding of the electric double layer (EDL) structure at the electrode-electrolyte interface is essential. This molecular dynamics (MD) study explores the structure and electrochemical behavior ...
Добавлено: 16 июня 2025 г.
Shear Viscosity of Short-Chain Imidazolium Ionic Liquids from Equilibrium and Nonequilibrium Molecular Dynamics: Atomistic and Coarse-Grained Levels
Одинцова Е. Г., Darya L. Gurina, Kruchinin S. E. и др., Industrial & Engineering Chemistry Research 2025 Vol. 64 No. 6 P. 3531–3543
Добавлено: 5 февраля 2025 г.
Understanding the role of confinement in the behavior of ionic liquid–organic solvent mixtures in slit carbon micropores: Insights from molecular dynamics
Darya Gurina, Будков Ю. А., Journal of Molecular Liquids 2025 Vol. 419 Article 126734
Добавлено: 22 декабря 2024 г.
Molecular aspects on impregnation of silica-based aerogels with mefenamic acid in supercritical carbon dioxide
Darya L. Gurina, Yury A. Budkov, Kiselev M. G., Journal of Molecular Liquids 2024 Vol. 415 Article 126358
This article reports on a full-atomic simulation by classical molecular dynamics, investigating the impregnation of silica-based aerogels with mefenamic acid in supercritical carbon dioxide (sc-CO2). Silica aerogel samples were modeled by a set of primary particles obtained by complete or partial condensation of tetramethylorthosilicate and vinyltrimethoxysilane. The influence of such factors as the nature of ...
Добавлено: 31 октября 2024 г.
The self-assembly of water reverse micelles with imidazolium ionic liquids in supercritical carbon dioxide: A molecular dynamics simulation study
Darya L. Gurina, Yury A. Budkov, Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects 2024 Vol. 695 Article 134209
Добавлено: 20 мая 2024 г.
Disjoining Pressure Decay Length in Room-Temperature Ionic Liquids: A Molecular Simulation Study
Darya L. Gurina, Odintsova E., Yury A. Budkov, Journal of Physical Chemistry B 2024 Vol. 128 No. 9 P. 2215–2218
Добавлено: 4 марта 2024 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • http://www.edu.ru
    Федеральный портал «Российское образование»
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика конфиденциальности
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору