Application of Rational Design and Molecular Metadynamics for the Estimation of Changes in Trans-Splicing Efficiency during the Mutagenesis of Ssp DnaE Intein

Sabantsev M.; Brovin A.; M. Gureev; Y. Porozov; Chuvpilo S.; Karabelsky A.

doi:10.1021/acsbiomedchemau.5c00091

Публикации

?

Application of Rational Design and Molecular Metadynamics for the Estimation of Changes in Trans-Splicing Efficiency during the Mutagenesis of Ssp DnaE Intein

ACS Bio and Med Chem Au. 2025. Vol. 5. No. 4. P. 738–752.

Sabantsev M., Brovin A., Гуреев М. А., Порозов Ю. Б., Chuvpilo S., Karabelsky A.

Научное направление: Биология

Язык: английский

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: gene therapy protein−protein docking molecular metadynamics simulation rational mutagenesis protein trans-splicing inteins

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Молекулярная эволюция, подвижность белков и компьютерное молекулярное конструирование (2024)

Peptide language pragmatic analysis and two-stage hierarchical learning framework for therapeutic peptide prediction

Шайтан А. К., Ke Y., Shutao C. и др., BMC Biology 2026 No. 24 Article 181

Добавлено: 18 сентября 2026 г.

A functional systems view on neural tracking of natural speech

Anton Rogachev, Сысоева О. В., Frontiers in Systems Neuroscience 2025 Vol. 19 Article 1658243

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Neural tracking of natural speech in children in relation to their receptive speech abilities

Rogachev A.O., Sysoeva O. V., Cognitive Systems Research 2024 Vol. 86 Article 101236

Добавлено: 17 сентября 2026 г.

Vague stimulating ideas, images and metaphors in scientific thinking: researchers' work with horizons of unclear knowledge

Поддьяков А. Н., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2026. No. 7437658.

Добавлено: 15 сентября 2026 г.

Разработка методик на основе айтрекинга для диагностики когнитивных функций у детей

Ребрейкина А. Б., Левкович К. М., Современная зарубежная психология 2024 Т. 13 № 2 С. 33–43

Создание методик диагностики на основе анализа движений глаз является особенно актуальным для оценки когнитивных функций у детей, которые не могут дать речевой или моторный ответ в силу своего возраста или из-за нарушений развития. Для таких детей использование объективных методов оценки когнитивных функций на основе айтрекинга может стать полезным диагностическим инструментом, дополняющим традиционные поведенческие опросники и ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

Развитие когнитивных функций детей с помощью методик, использующих видеоокулографию

Ребрейкина А. Б., Левкович К. М., Современная зарубежная психология 2023 Т. 12 № 4 С. 51–61

Активное развитие метода видеоокулографии, т. е. регистрации движений глаз, создает возможности для создания новых подходов для развития когнитивных функций и обучения. Методики, основанные на видеоокулографии, могут быть полезны не только для детей с серьезными нарушениями моторных функций, но и детей с нарушениями развития когнитивных функций, прежде всего внимания, так как контроль движений глаз тесно связан ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

Вегетативные и поведенческие показатели при увеличении когнитивной нагрузки у здоровых добровольцев

Портнова Г. В., Левкович К. М., Васильева Л. Н. и др., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2022 Т. 72 № 4 С. 504–519

Когнитивная и эмоциональная нагрузка в ходе увеличения сложности задач приводит к активации различных звеньев вегетативной нервной системы и может сопровождаться как увеличением эффективности решения задач, так и способствовать дестабилизации эмоционального состояния и уменьшению продуктивности. Увеличение когнитивной нагрузки при условии высокой мотивации испытуемых является стрессовым фактором и выражается в различной реакции симпатического и парасимпатического звеньев в ...

Добавлено: 8 сентября 2026 г.

DSCA-HLAII: A dual-stream cross-attention model for predicting peptide–HLA class II interaction and presentation

Шайтан А. К., Ke Y., Hongjun Y. и др., PLoS Computational Biology 2026 Article e1013836

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Salivary Antioxidant Capacity and Magnesium in Generalized Anxiety Disorder

Proskurnina E., Liaukovich K., Bychkovskaya L. и др., Metabolites 2023 Vol. 13 No. 1 P. 73

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Liaukovich K., Sazhin S., Bobrov P. и др., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 No. 19 P. 11785

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Implicit auditory perception of local and global irregularities in passive listening condition

Liaukovich K., Ukraintseva Y., Martynova O., Neuropsychologia 2022 Vol. 165 P. 108129

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Pupillometry and autonomic nervous system responses to cognitive load and false feedback: an unsupervised machine learning approach

Alshanskaia E., Portnova G., Liaukovich K. и др., Frontiers in Neuroscience 2024 Vol. 18

Добавлено: 7 сентября 2026 г.

Characteristics of the Frequency-Following Response to Changes in the Acoustic Parameters of a Speech Signal (Isolated Syllable)

Oknina L. B., Podlepich V. V., Зибер И. А. и др., Human Physiology 2026 Vol. 52 No. 3 P. 295–301

Добавлено: 6 сентября 2026 г.

Что такое Свобода? Свобода воли, свободы личности, конституционная модель и законодательное регулирование

Момджян К. Х., Кржевов В. С., Поддьяков А. Н. и др., М.: Новые печатные технологии, 2025.

При всей кажущейся ясности и недвусмысленности понятия «свобода» дать ему исчерпывающую научную дефиницию весьма затруднительно. У каждой отрасли знания свой подход к трактовке этого многоаспектного понятия. В ходе обсуждения, материалы которого вошли в настоящий сборник, свобода рассматривается с позиций философии, социологии, юриспруденции, психологии, нейрофизиологии и т.д. Участники дискуссии рассуждают о границах свободы воли и субъектности человека, о соотношении свободы и ...

Добавлено: 6 сентября 2026 г.

Liaukovich K., Panfilova E., Khayrullina G. и др., International Journal of Psychophysiology 2025 Vol. 207 P. 112475

Добавлено: 5 сентября 2026 г.

The acoustic features of sincere joyful, sad, and fearful human non-verbal vocalizations and its effect on the emotional valence of cat’s meowing

Portnova G., Liaukovich K., Sharaev M., Cognitive Neurodynamics 2025 Vol. 19 Article 181

Добавлено: 5 сентября 2026 г.

Validation of the obsessive–compulsive disorder-triggering image set (OCD-TIS)

Liaukovich K., Bainbridge E., Khayrullina G. и др., Neuroscience and Behavioral Physiology 2026 Vol. 56 P. 10–19

Добавлено: 5 сентября 2026 г.

Commentary: Deep learning in obsessive-compulsive disorder: a narrative review

Kashevarova O., Portnova G., Khayrullina G. и др., Frontiers in Psychiatry 2026 Vol. 17 P. 1776019

Добавлено: 5 сентября 2026 г.

Does Sound Timing Organization Matter? How Time Interval Influences the Perception of Closely Spaced Frequencies

Liaukovich K., Martynova O., Brain Sciences 2026 Vol. 5 No. 16 P. 439

Добавлено: 4 сентября 2026 г.

Прогностическое значение полигенного профиля риска при дилатационной кардиомиопатии: анализ краткосрочной выживаемости

Волчкова Е. А., Легкова К. С., Минушкина Л. О. и др., Российский кардиологический журнал 2026 Т. 31 № 8S Статья 6987

Цель. Оценить вклад полигенных шкал риска в модель краткосрочного прогнозирования летальности у пациентов с дилатационной кардиомиопатией (ДКМП). Материал и методы. В исследование включены 137 пациентов с ДКМП. Средний возраст составил 56,8±13,5 года; мужчин было 115 (83,9%). Медиана периода наблюдения составила 17 [13; 22] месяцев. За время наблюдения умерли 26 пациентов (19,0%). Для выявления предикторов краткосрочной общей летальности построена ...

Добавлено: 24 августа 2026 г.

The Efficacy of HGF/VEGF Gene Therapy for Limb Ischemia in Mice with Impaired Glucose Tolerance: Shift from Angiogenesis to Axonal Growth and Oxidative Potential in Skeletal Muscle

Stafeev I I., Болдырева М. А., Michurina S. и др., Cells 2022 Vol. 11 No. 23 Article 3824

Добавлено: 26 февраля 2025 г.

Plasmid-based gene therapy with hepatocyte growth factor stimulates peripheral nerve regeneration after traumatic injury

M.А. Boldyreva, Bondar I. V., Stafeev I. S. и др., Biomedicine and Pharmacotherapy 2018 Vol. 101 P. 682–690

Добавлено: 22 июня 2021 г.

Angiogenic and pleiotropic effects of VEGF165 and HGF combined gene therapy in a rat model of myocardial infarction.

Makarevich P., Dergilev K., Tsokolaeva Z. и др., Plos One 2018 Vol. 13 No. 5 P. 1–25

Добавлено: 21 июня 2021 г.

Therapeutic Angiogenesis by a “Dynamic Duo”: Simultaneous Expression of HGF and VEGF165 by Novel Bicistronic Plasmid Restores Blood Flow in Ischemic Skeletal Muscle

Slobodkina E., Maria Boldyreva, Karagyaur M. и др., Pharmaceutics 2020 Vol. 12 P. 1–23

Добавлено: 21 июня 2021 г.