Актуальные вопросы биологической физики и химии. БФФХ-2016: материалы XI международной научной-технической конференции, г. Севастополь, 25-29 апреля 2016 г.. Т. 1

?

Актуальные вопросы биологической физики и химии. БФФХ-2016: материалы XI международной научной-технической конференции, г. Севастополь, 25-29 апреля 2016 г.

Т. 1. Вып. 1. Sevastopol : Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Севастопольский государственный университет", 2016.

Editor-in-chief: М. П. Евстигнеев

The proceedings is a compilation of the reports of XI International science-technical conference "Modern Trends in Biological Physics and Chemistry. BPPC-2016", organized by Sevastopol State University 25-29 of April, 2016. The proceedings contains materials of research papers, devoted to modern trends in general and molecular biophysics, nanobiophysics, and problems of modern biological, biophysical and medicinal chemistry. The publication is intended for scientists, postgraduate, students.

Оценка влияния среды на димеризацию трансмембранных доменов гликофорина А в компьютерном эксперименте

Kuznetsov A., Efremov R., В кн.: Актуальные вопросы биологической физики и химии. БФФХ-2016: материалы XI международной научной-технической конференции, г. Севастополь, 25-29 апреля 2016 г.Т. 1. Вып. 1.: Севастополь: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Севастопольский государственный университет", 2016. С. 250–254.

Here we present a combined method to study mutual effects of a protein and a membrane upon the dimerization of transmembrane (TM) α-helical peptides. The approach is based on the numerical decomposition of dimerization free energy profiles for TM helices into components corresponding to different interaction types and on the mapping of the distribution of the average lipid ...

Added: November 14, 2017

Research target: Earth Sciences Biology Physics

Priority areas: IT and mathematics

Language: Russian

Full text

Keywords: биофизика Computational biophysics биохимия и биоэнергетика Biochemistry

Актуальные вопросы биологической физики и химии. БФФХ-2016: материалы XI международной научной-технической конференции, г. Севастополь, 25-29 апреля 2016 г.

Разработка методик на основе айтрекинга для диагностики когнитивных функций у детей

Ребрейкина А. Б., Liaukovich K., Современная зарубежная психология 2024 Т. 13 № 2 С. 33–43

Создание методик диагностики на основе анализа движений глаз является особенно актуальным для оценки когнитивных функций у детей, которые не могут дать речевой или моторный ответ в силу своего возраста или из-за нарушений развития. Для таких детей использование объективных методов оценки когнитивных функций на основе айтрекинга может стать полезным диагностическим инструментом, дополняющим традиционные поведенческие опросники и ...

Added: September 8, 2026

Развитие когнитивных функций детей с помощью методик, использующих видеоокулографию

Ребрейкина А. Б., Liaukovich K., Современная зарубежная психология 2023 Т. 12 № 4 С. 51–61

Активное развитие метода видеоокулографии, т. е. регистрации движений глаз, создает возможности для создания новых подходов для развития когнитивных функций и обучения. Методики, основанные на видеоокулографии, могут быть полезны не только для детей с серьезными нарушениями моторных функций, но и детей с нарушениями развития когнитивных функций, прежде всего внимания, так как контроль движений глаз тесно связан ...

Added: September 8, 2026

Вегетативные и поведенческие показатели при увеличении когнитивной нагрузки у здоровых добровольцев

Портнова Г. В., Liaukovich K., Васильева Л. Н. et al., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2022 Т. 72 № 4 С. 504–519

Когнитивная и эмоциональная нагрузка в ходе увеличения сложности задач приводит к активации различных звеньев вегетативной нервной системы и может сопровождаться как увеличением эффективности решения задач, так и способствовать дестабилизации эмоционального состояния и уменьшению продуктивности. Увеличение когнитивной нагрузки при условии высокой мотивации испытуемых является стрессовым фактором и выражается в различной реакции симпатического и парасимпатического звеньев в ...

Added: September 8, 2026

Bridging experiment and molecular dynamics: Mefenamic acid confinement in nanocrystalline cellulose aerogels under scCO2 conditions

Gurina D., Fashchevsky K. A., Oparin R. D. et al., Surfaces and Interfaces 2026 Vol. 98 Article 110545

In this work, we combine experimental characterization and molecular dynamics (MD) simulations to elucidate the molecular mechanisms governing the impregnation of mefenamic acid (MFA) into nanocrystalline cellulose (NCC) aerogels. NCC aerogels were impregnated with MFA in scCO2, and low-temperature nitrogen adsorption revealed a concentration-dependent decrease in surface area, pore volume, and pore size, with an ...

Added: September 8, 2026

Configuration-dependent edge and corner superconductivity in 𝑠-wave kagome superconductors

Huang D., Chen Y., Luo X. et al., Chinese Journal of Physics 2026 Vol. 103 P. 1803–1814

Using self-consistent Bogoliubov-de Gennes calculations for kagome flakes framed by armchair and flat edges, we observe a configuration-dependent spatial inhomogeneity of an 𝑠-wave superconducting condensate. Specifically, at half-filling, the local pair potential is significantly enhanced by up to 77.8% at edge centers and up to 148.9% at corners, subsequently boosting their local critical temperatures by up to 13.5% and ...

Added: September 7, 2026

DSCA-HLAII: A dual-stream cross-attention model for predicting peptide–HLA class II interaction and presentation

Shaitan A., Ke Y., Hongjun Y. et al., PLoS Computational Biology 2026 Article e1013836

The interaction between peptides and human leukocyte antigen class II (HLA-II) molecules plays a pivotal role in adaptive immune responses, as HLA-II mediates the recognition of exogenous antigens and initiates T cell activation through peptide presentation. Accurate prediction of peptide-HLA-II binding serves as a cornerstone for deciphering cellular immune responses, and is essential for guiding the optimization of antibody therapeutics. ...

Added: September 7, 2026

Salivary Antioxidant Capacity and Magnesium in Generalized Anxiety Disorder

Proskurnina E., Liaukovich K., Bychkovskaya L. et al., Metabolites 2023 Vol. 13 No. 1 P. 73

Added: September 7, 2026

Liaukovich K., Sazhin S., Bobrov P. et al., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 No. 19 P. 11785

Added: September 7, 2026

Implicit auditory perception of local and global irregularities in passive listening condition

Liaukovich K., Ukraintseva Y., Martynova O., Neuropsychologia 2022 Vol. 165 P. 108129

Added: September 7, 2026

Pupillometry and autonomic nervous system responses to cognitive load and false feedback: an unsupervised machine learning approach

Alshanskaia E., Portnova G., Liaukovich K. et al., Frontiers in Neuroscience 2024 Vol. 18

Added: September 7, 2026

Interband effects in the intertype regime of dirty two-band superconductors

Marychev P., Shanenko A., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 No. 7 Article 074509

We investigate the effect of weak interband impurity scattering on the intertype (IT) domain between type-I and type-II superconductivity in diffusive two-band superconductors. Our results show that the significant broadening of the IT domain with increasing band diffusivity ratio, previously established in the absence of interband scattering, persists under weak interband scattering. However, depending on ...

Added: September 7, 2026

Элементы теории топологических изоляторов

Denis K., Н. Новгород: Нижегородский государственный университет им. Н.И. Лобачевского, 2025.

В учебном пособии излагаются элементы теории и описание избранных экспериментальных результатов, полученных в активно развивающейся физике топологических изоляторов. Рассмотрены наиболее простые модели поверхностных и краевых состояний в двумерных и трёхмерных топологических изоляторах, их структура в магнитном поле, а также основы топологических методов для определения их свойств. Обсуждаются модели квантовых точек, формируемых в топологических изоляторах. Приведены ...

Added: September 6, 2026

Characteristics of the Frequency-Following Response to Changes in the Acoustic Parameters of a Speech Signal (Isolated Syllable)

Oknina L. B., Podlepich V. V., Sieber I. et al., Human Physiology 2026 Vol. 52 No. 3 P. 295–301

The aim of this study was to evaluate the potential use of the frequency-following response (FFR) for assessing preserved perception of simple speech stimuli in humans. To this end, event-related potentials (ERPs) elicited by isolated Russian syllables were recorded and analyzed in 29 healthy subjects in two frequency ranges, the standard range (1—40 Hz) and ...

Added: September 6, 2026

Импульсное лазерное облучение светоизлучающих структур со слоем (Ga,Mn)As

Denis K., Звонков Б. Н., Вихрова О. В. et al., Физика твердого тела 2021 Т. 63 № 9 С. 1245–1252

Сочетанием методов МОС-гидридной эпитаксии и импульсного лазерного нанесения изготовлены гетеронаноструктуры InGaAs/GaAs со слоем (Ga, Mn)As на поверхности, и исследовано влияние воздействия импульсного эксимерного лазера (длина волны 248 nm, длительность импульса ~30 ns, плотность энергии в диапазоне 200-360 mJ/cm2) на их излучательные, структурные и гальваномагнитные свойства. При исследованиях использовалась спектроскопия фотолюминесценции, дополненная возможностью анализа поляризационных характеристик ...

Added: September 6, 2026

Воздействие импульсов эксимерного лазера на светоизлучающие InGaAs/GaAs-структуры с (Ga, Mn)As-слоем

Denis K., Вихрова О. В., Данилов Ю. А. et al., Физика твердого тела 2021 Т. 63 № 3 С. 346–355

Исследована возможность модифицирования лазерным отжигом свойств слоя (Ga, Mn)As, расположенного на поверхности квантово-размерной InGaAs/GaAs-структуры, с сохранением ее излучательных свойств. Для проведения исследований сочетанием методов МОС-гидридной эпитаксии и импульсного лазерного нанесения были изготовлены структуры с четырьмя квантовыми ямами InGaAs/GaAs, (содержание индия от 0.08 до 0.25), расположенными на различном расстоянии от слоя (Ga, Mn)As. В процессе исследований ...

Added: September 6, 2026

Quasistationary states in a quantum dot formed at the edge of a topological insulator by magnetic barriers with finite transparency

Denis K., Lavrukhina E. A., Journal of Physics: Conference Series 2021 Vol. 2103 Article 012201

A model of quasistationary states is constructed for the one-dimensional edge states propagating along the edge of a two-dimensional topological insulator based on HgTe/CdTe quantum well in the presence of magnetic barriers with finite transparency. The lifetimes of these quasistationary states are found analytically and numerically via different approaches including the solution of the stationary ...

Added: September 6, 2026

Role of resident electrons in the manifestation of a spin polarization memory effect in Mn delta-doped GaAs heterostructures

Denis K., Dorokhin M. V., Ved M. V. et al., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2021 Vol. 104 No. 12 Article 125309

The GaAs/InGaAs quantum wells with a ferromagnetic δ〈Mn〉 layer in GaAs barrier demonstrate a set of interesting spin-related phenomena originating from Mn-hole interaction. One of such phenomena is a spin-memory effect which consists of Mn spin polarization induced by interaction with vicinity spin-polarized holes generated under the exposure by short circularly polarized light pulses. Here long Mn ...

Added: September 6, 2026

Спин-зависимое туннелирование в двойной квантовой точке в режиме "медленной" эволюции

Denis K., Запруднов Н. А., Физика и техника полупроводников 2022 Т. 56 № 10 С. 973–978

Исследована динамика туннелирования и спина для дырочных состояний в двойной квантовой точке на основе GaAs при наличии сильного спин-орбитального взаимодействия и периодического электрического поля. Рассмотрены режимы туннелирования с переворотом спина в условиях "медленной" эволюции, при которой частота поля меньше остальных энергетических параметров стационарной части гамильтониана. Обнаружено, что в таких условиях туннелирование с переворотом спина может ...

Added: September 6, 2026

Effect of pulsed laser annealing on the properties of (Ga,Mn)As layers

Denis K., Kalentyeva I. L., Vikhrova O. V. et al., Journal of Magnetism and Magnetic Materials 2022 Vol. 556 Article 169360

We have investigated the layers of the (Ga,Mn)As diluted magnetic semiconductor with the thickness in the range of 150 – 400 nm, which have been formed by the combination of the methods of a pulsed laser deposition and a post-growth pulsed laser annealing. It has been found that the laser annealing has a significant effect on the structural, ...

Added: September 6, 2026

Formation of bound states from the edge states of 2D topological insulator by macroscopic magnetic barriers

Denis K., Konakov A. A., Lavrukhina E. A., Journal of Physics: Condensed Matter 2022 Vol. 34 Article 405302

A model of bound state formation from the delocalized edge states of 2D topological insulator (TI) is derived by considering the effects of magnetic barriers attached to the edge of the HgTe/CdTe quantum well. The resulting structure has a spatial form of 1D quantum dot (QD) with variable number of bound states depending on barrier ...

Added: September 6, 2026

Single-spin Landau-Zener-Stückelberg-Majorana interferometry of Zeeman-split states with strong spin-orbit interaction in a double quantum dot

Denis K., Studenikin S. A., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2022 Vol. 106 No. 19 Article 195414

Single-spin state evolution induced by the Landau-Zener-Stückelberg-Majorana (LZSM) interference in a Zeeman-spit four-level system in a periodically driven double quantum dot is studied theoretically by the Floquet stroboscopic method. An interplay between spin-conserving and spin-flip tunneling processes with the electric dipole spin resonance (EDSR) that is induced in an individual dot and enhanced by the ...

Added: September 6, 2026

Формирование связанных состояний и управление их локализацией в двойной квантовой точке на крае двумерного топологического изолятора с магнитными барьерами

Denis K., Лаврухина Е. А., Тележников А. В., Физика и техника полупроводников 2023 Т. 57 № 7 С. 551–554

Разработана модель локализованных состояний в двойной квантовой точке на крае топологического изолятора на основе квантовой ямы HgTe/CdTe, сформированной тремя магнитными барьерами. Исследованы особенности энергетического спектра, плотности вероятности и спиновой плотности квантовых состояний в зависимости от ориентации векторов намагниченности магнитных барьеров. Изучена локализация волновых функций слева и справа от точки антикроссинга в спектре и сделан вывод ...

Added: September 6, 2026

On calibration of remote sensing retrievals of ecosystem respiration (Reco) with tower measurements over,Russian forests and wetlands

Shabanov N., Kuricheva O., Kurbatova J. et al., / Series Working Papers SSRN "Department of Economics Ca’ Foscari University of Venice". 2026.

The carbon balance of an ecosystem is the difference between Gross Primary Productivity (GPP) and Ecosystem Respiration (Reco) as expressed by Net Ecosystem Exchange (NEE). While remote sensing retrievals of GPP have reached maturity, Reco estimation remains underexplored and ultimately cast bias on NEE. Here we present an end-to-end multi-scale analysis of the mechanism of ...

Added: August 21, 2026

Three Algorithms for Merging Hierarchical Navigable Small World Graphs

Ponomarenko A., / Series Computer Science "arxiv.org". 2025.

This paper addresses the challenge of merging hierarchical navigable small world (HNSW) graphs, a critical operation for distributed systems, incremental indexing, and database compaction. We propose three algorithms for this task: Naive Graph Merge (NGM), Intra Graph Traversal Merge (IGTM), and Cross Graph Traversal Merge (CGTM). These algorithms differ in their approach to vertex selection ...

Added: July 30, 2026