?
A uniquely stable trimeric model of SARS-CoV-2 spike transmembrane domain
International Journal of Molecular Sciences. 2022. Vol. 23(16). Article 9221.
Ключевые слова: molecular hydrophobicity potentialмолекулярный гидрофобный потенциалtransmembrane domainтрансмембранный доменМоделирование молекулярной динамикиMolecular dynamics simulationstructure predictionviral fusion proteinhelical trimertemplate-based modelingMonte Carlo conformational searchпредсказание структурывирусные белки слияниятример из спиралей моделирование на основании шаблонаконформационный поиск методом Монте-Карло
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Крыжановская Н. В., Махов И. С., Драгунова А. С., St. Petersburg Polytechnical University Journal: Physics and Mathematics 2026 Vol. 19 No. 1.1 P. 98–104
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Diachkova E., Nikulin D., Кубкин Я. В. и др., American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine 2026 Vol. 212
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Centromeres ensure chromosome segregation, but their chromatin organization within repetitive alpha-satellite DNA has been difficult to resolve. To address this, we generated haplotype-resolved satellite DNA annotations for the complete diploid T2T-HG002 human genome assembly, then we mapped centromere protein A (CENP-A), H3K9me3, and CpG methylation on ultra-long, adaptively sampled nanopore reads using directed methylation with ...
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Обыкновенная игрунка — обезьяна Нового Света, широко используемая для изучения эволюции приматов и заболеваний человека. Мы представляем референсную сборку генома этого вида «от теломеры до теломеры» (T2T), а также три гаплотипа, собранных почти до уровня T2T. Эти сборки позволяют охарактеризовать ранее недоступные участки генома, включая центромеры, половые хромосомы, субтеломерные сателлитные повторы, акроцентрические хромосомы и главный ...
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Андреева С. А., Gavrilov A. A., Dzhikirba K. R. и др., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2026 Vol. 114 Article 134515
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Образцова А. А., Иванов К. А., Моисеев Э. И. и др., Journal of Physics D: Applied Physics 2026 Vol. 59 No. 30 P. 305103
Добавлено: 23 сентября 2026 г.
Будков Ю. А., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 165 No. 12 Article 124105
Добавлено: 22 сентября 2026 г.
Боровицкая И. В., Пименов В. Н., Коршунов С. Н. и др., Перспективные материалы 2026 № 10 С. 37–54
Проведено сравнение, обобщение и систематизация механизмов эрозии и разрушения
поверхности малоактивируемых материалов, перспективных для использования в
качестве материалов вакуумной камеры термоядерных реакторов: ванадия, его сплава
V – 10 Ti – 6 Cr – 0,05 Zr – 0,1 Si и вольфрама при последовательном воздействии на
них ионных и тепловых потоков. Тепловые потоки имитировали с помощью мощного
импульсного лазерного излучения (ЛИ), создаваемого ...
Добавлено: 22 сентября 2026 г.
Iontsev M.A., Mukhin S. I., Fistul M. V., Physical Review B: Condensed Matter and Materials Physics 2016 Vol. 94 No. 17 P. 174–510
Добавлено: 22 сентября 2026 г.
Shilov A. L., Elesin L., Kravtsov M. и др., Nature Communications 2026 Vol. 17 No. 1 Article 9734
Добавлено: 20 сентября 2026 г.
Ибрахим А., Деркач Д. А., Каледин М. Л. и др., Computer Physics Communications 2026 Vol. 329 Article 110407
Мы представляем RLABC (Reinforcement Learning for Accelerator Beamline Control) — фреймворк с открытым исходным кодом на языке Python, который автоматически преобразует стандартные конфигурации пучковых линий, используемые в Elegant, в среды для обучения с подкреплением. RLABC интегрируется с широко используемым программным комплексом моделирования динамики пучка Elegant посредством интерфейсов на основе SDDS, что позволяет исследователям применять современные алгоритмы обучения с подкреплением для оптимизации ...
Добавлено: 20 сентября 2026 г.
Копьев А., JETP Letters 2026 Vol. 123 No. 5 P. 310–316
Добавлено: 18 сентября 2026 г.
Добавлено: 18 сентября 2026 г.
С помощью молекулярно-динамического моделирования были изучены структурные свойства нематических жидких кристаллов (ЖК) на основе пентилцианобифенила (5CB) и пентилоксицианобифенила (5OCB), легированных наночастицами золота (НЧЗ) разного количества, формы и размера. В жидкие кристаллы на основе цианобифенила 5CB и 5OCB были добавлены сферические НЧЗ двух разных радиусов и стержнеобразные НЧЗ. Для описания структурных свойств цианобифениловых нематических жидких кристаллов, ...
Добавлено: 17 сентября 2026 г.
Anton Rogachev, Сысоева О. В., Frontiers in Systems Neuroscience 2025 Vol. 19 Article 1658243
Добавлено: 17 сентября 2026 г.
Rogachev A.O., Sysoeva O. V., Cognitive Systems Research 2024 Vol. 86 Article 101236
Добавлено: 17 сентября 2026 г.
Andreev D. V., Kornev S. A., Bondarenko G.G. и др., Inorganic Materials: Applied Research 2026 Vol. 17 No. 5 P. 1226–1230
Добавлено: 15 сентября 2026 г.
Поддьяков А. Н., / Series Social Science Research Network "Social Science Research Network". 2026. No. 7437658.
Добавлено: 15 сентября 2026 г.
Сысоэв, Э., Bashirov I., Sychov M. и др., ACS Applied Materials & Interfaces 2025 Vol. 17 No. 22 P. 33108 – 33120
Добавлено: 12 ноября 2025 г.
Aliper E. T., Ефремов Р. Г., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2025 Vol. 1867 No. 8 Article 184445
The coronavirus spike protein, the key entity effectuating membrane fusion, cannot exist without membraneactive
fragments. In addition to fusion peptides, among such domains are HR1 and HR2. Crucial to the spike’s
refolding and membrane fusion, they are believed to both interact with each other and bind to the membranes
that are merged. To elucidate HR2’s precise role in ...
Добавлено: 12 октября 2025 г.
Volynsky P., Urban A., Pavlov K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2025 Vol. 26 No. 2 Article 553
Alzheimer’s disease (AD) pathogenesis is correlated with the membrane content
of various lipid species, including cholesterol, whose interactions with amyloid precursor
protein (APP) have been extensively explored. Amyloid-β peptides triggering AD are
products of APP cleavage by secretases, which differ depending on the APP and secretase location
relative to ordered or disordered membrane microdomains. We used high-resolution
NMR to probe ...
Добавлено: 12 октября 2025 г.
Veretenenko I. I., Trofimov Y. A., Krylov N. A. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2024 Vol. 1866 No. 7 Article 184376
Добавлено: 19 сентября 2024 г.
Aliper E., Roman G. Efremov, International Journal of Molecular Sciences 2023 Vol. 24 No. 22 Article 16421
Добавлено: 15 сентября 2024 г.
Одинцова Е. Г., Journal of Supercritical Fluids 2017 Vol. 126 P. 47–54
Добавлено: 29 августа 2024 г.