Differences in medium-induced conformational plasticity presumably underlie different cytotoxic activity of ricin and viscumin

Volynsky P.; D. Maltseva; Tabakmakher V.; Bocharov E.; Raygorodskaya M.; Zakharova G.; Britikova E.; A. Tonevitsky; R. Efremov

doi:10.3390/biom12020295

?

Differences in medium-induced conformational plasticity presumably underlie different cytotoxic activity of ricin and viscumin

Biomolecules. 2022. Vol. 12. No. 2. Article 295.

Volynsky P., Мальцева Д. В., Tabakmakher V., Bocharov E., Raygorodskaya M., Zakharova G., Britikova E., Тоневицкий А. Г., Ефремов Р. Г.

Научное направление: Биология Физика

Язык: английский

Полный текст

DOI

Текст на другом сайте

Ключевые слова: молекулярная динамика protein-membrane interactions molecular dynamics взаимодействия белок-мембрана Membrane trafficking of proteins medium effects on protein structure type II ribosome inactivating proteins мембранный транспорт белков влияние среды на структуру белков рибосом-инактивирующие белки 2-го типа

ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:

Суперкомпьютерные технологии, теория и атомистическое многомасштабное моделирование в физике материалов и науках о живом (2022)

An Approximate Method for Calculating Kinetic Coefficients of Heavy Ions in He-Containing Mixtures in a Strong Electric Field

Пономарев А. А., Александров Н. Л., Plasma Physics Reports 2026 Vol. 52 No. 3 P. 367–378

Добавлено: 27 апреля 2026 г.

Influence of the Normal Magnetic Component to Magnetotail Current Sheet Forma

Domrin V. I., Malova H. V., V. Yu. Popov и др., Cosmic Research 2026 Vol. 64 No. 2 P. 238–252

Добавлено: 27 апреля 2026 г.

Asymmetric Equilibrium Structures of Superthin Current Sheets: The Asymmetry of Plasma Sources

Tsareva O. O., Malova H. V., V. Yu. Popov и др., Plasma Physics Reports 2026 Vol. 52 No. 2 P. 179–185

Добавлено: 27 апреля 2026 г.

Особенности генерации квазипериодических ОНЧ-излучений с существенной частотной динамикой внутри плазмосферы

П.А.Беспалов, О.Н. Савина, Геомагнетизм и аэрономия 2025 Т. 65 № 5 С. 620–628

Рассмотрены несколько базовых моделей частотной динамики в квазипериодических ОНЧ-излучениях с периодами повторения спектральных форм от 10 до 300 с. Во всех случаях речь идет о проявлениях циклотронной неустойчивости электронных радиационных поясов, которые хорошо описываются в рамках теории плазменного магнитосферного мазера, основанной на усредненной самосогласованной системе квазилинейных уравнений для частиц и волн. Не очень четкие спектральные элементы характерны для QP-всплесков, представляющих ...

Добавлено: 25 апреля 2026 г.

Modeling of Influence of a Thin Dielectric Film at a Fraction of Cathode Surface on Transition of a Glow Gas Discharge into an Arc Discharge

Bondarenko G.G., Fisher M. R., Kristya V. I., Bulletin of the Russian Academy of Sciences: Physics 2026 Vol. 90 No. 4 P. 572–576

Добавлено: 25 апреля 2026 г.

Multimodal EEG, ECG, and video dataset of yoga practitioners during concentration and mind-wandering tasks

Kashevnik A., Glekler E., Артёменко Е. Д. и др., Scientific data 2026 Article 7209

Добавлено: 23 апреля 2026 г.

Stable Multi-Wavelength Resonant Metal-dielectric Hybrid Nanostructure in the Infrared Range

Задков В. Н., Plasmonics 2026 Vol. 21 P. 1503–1512

Добавлено: 22 апреля 2026 г.

Rapid synthesis of redox-responsive trithiocyanuric acid-based nanocarriers: in vitro multidrug resistance reversal and In vivo safety assessment

Kopoleva E., Sergey A. Tsymbal, Кучур О. А. и др., Drug Delivery and Translational Research 2026 P. 1–16

Добавлено: 20 апреля 2026 г.

Cross-influence of two societies in deterministic evolutionary game

Щур Л. Н., Antonov D., Burovski E., International Journal of Bifurcation and Chaos in Applied Sciences and Engineering 2026 P. 1–9

Добавлено: 20 апреля 2026 г.

Ising models on the hydrogen peroxide and other lattices

Qin X., Deng Y., Щур Л. Н. и др., / Series arXiv "math". 2026. No. 2603.02962.

Добавлено: 20 апреля 2026 г.

Algorithmic overlaps as thermodynamic variables: from local to cluster Monte Carlo dynamics in critical phenomena

Пиле Я. Э., Deng Y., Щур Л. Н., / Series arXiv "math". 2026. No. 2604.10254.

Добавлено: 20 апреля 2026 г.

Функциональные признаки листьев и экологические стратегии важны для формирования растительных сообществ субальпийских болот и высокотравья

G.V.Klink, Gulov D. M., Elumeeva T. G. и др., Журнал общей биологии 2024 Т. 85 № 2 С. 83–94

Функциональные признаки растений важны для формирования состава растительных сообществ и доминирования в них. Сравнение средних значений признаков у организмов внутри сообщества с таковым для случайных выборок местной биоты позволяет оценить значимость признака для формирования состава сообществ. Сравнение средних и средневзвешенных значений признаков позволяет оценить их роль для доминирования в том или ином сообществе. Мы исследовали ...

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

The partitioning of mobile fractions of chemical elements in the mineral loamy soils during natural regeneration after plowing in Western Russia

G.V.Klink, Semenkov I. N., Enchilik P. R., Science of the Total Environment 2025 Vol. 998 Article 180219

Добавлено: 19 апреля 2026 г.

Theory of capillary-induced self-coacervation in zwitterionic polymer solutions

Каликин Н. Н., Брандышев П. Е., Будков Ю. А., Journal of Chemical Physics 2026 Vol. 164 Article 154904

Добавлено: 18 апреля 2026 г.

UV-C microdisk lasers based on AlGaN heterostructures on sapphire

Моисеев Э. И., Масютин Д. А., Мельниченко И. А. и др., Optics and Laser Technology 2025 Vol. 201 No. 115289 P. 1–5

Добавлено: 18 апреля 2026 г.

Self-face viewing attenuates cardiac modulation of corticospinal excitability

Макарова М. М., Федосов Н. П., Mikhailova I. и др., FRONTIERS IN SIGNAL PROCESSING 2026

Добавлено: 17 апреля 2026 г.

Compression-Induced Lattice Tilting Quenches Ion Migration at Metal Halide Perovskite Grain Boundaries: A Machine Learning Molecular Dynamics Study

Mikhail R. Samatov, Лю Д., Emir S. Amirov и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2025 Vol. 16 No. 51 P. 13068–13074

Добавлено: 20 декабря 2025 г.

Assessing the Effects of Chemical Composition and Short-Range Ordering on the Tensile Deformation Behavior of Nanocrystalline High-Entropy Alloys Nb–Ta–Hf–Zr: A Combined Study on Molecular Dynamics and Monte Carlo Simulation

Babicheva R., Kumar A., Kiran R. и др., Metallurgical and Materials Transactions A: Physical Metallurgy and Materials Science 2025 Vol. 56 P. 5646–5663

В работе проводятся моделирования методами Монте-Карло (МК) и молекулярной динамики (МД) для исследования тугоплавких высокоэнтропийных сплавов (ВЭС) на основе системы Nb–Ta–Hf–Zr. В частности, в рамках комбинированного МК/МД-моделирования релаксации, имитирующей диффузионные процессы, исследуется влияние химического состава и структуры границ зёрен (ГЗ) на короткодальний порядок (КДП) в монокристаллических и нанокристаллических (НК) ВЭС. Кроме того, с помощью МД-моделирования ...

Добавлено: 27 ноября 2025 г.

MDProcessing.jl: Julia Programming Language Application for Molecular Dynamics Trajectory Processing

Писарев В. В., Panov M., , in: Supercomputing: 9th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2023, Moscow, Russia, September 25–26, 2023, Revised Selected Papers, Part II* 2.: Springer, 2023. P. 209–222.

Добавлено: 11 ноября 2025 г.

Immune Antibodies Recognizing the Stem Region of SARS-CoV-2 Spike Protein: Molecular Modelling and In Vitro Study of Synthetic Peptides Presentation to the Antibodies

Aliper E., Ryzhov I., Obukhova P. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2026 Vol. 1868 No. 1 Article 184472

Antibodies to peptide 1147 (amino acids 1147-61) of the SARS-CoV-2 protein S are highly diagnostic. Peptide 1147, although located in a region that is partly spatially hidden in the intact protein, is not subject to mutations, suggesting therapeutic potential. The aim of this study was to elucidate the architecture of this region and the way ...

Добавлено: 20 октября 2025 г.

Diverse Interactions of Sterols with Amyloid Precursor Protein Transmembrane Domain Can Shift Distribution Between Alternative Amyloid-β Production Cascades in Manner Dependent on Local Lipid Environment

Volynsky P., Urban A., Pavlov K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2025 Vol. 26 No. 2 Article 553

Alzheimer’s disease (AD) pathogenesis is correlated with the membrane content of various lipid species, including cholesterol, whose interactions with amyloid precursor protein (APP) have been extensively explored. Amyloid-β peptides triggering AD are products of APP cleavage by secretases, which differ depending on the APP and secretase location relative to ordered or disordered membrane microdomains. We used high-resolution NMR to probe ...

Добавлено: 12 октября 2025 г.

Механические характеристики модели молекулярной динамики и полиномы Коробова

Устинов А. В., Гузев М. А., Дальневосточный математический журнал 2016 Т. 16 № 1 С. 39–43

Методы теории чисел использованы для точного вычисления статического поля напряжений в одномерной цепочке взаимодействующих гармонических осцилляторов. Для сумм, определяющих поле, получено представление через полиномы Коробова при произвольном числе осцилляторов и масштабе усреднения. ...

Добавлено: 9 октября 2025 г.

The role of surface material properties on the behavior of ionic liquids in nanoconfinement: A critical review and perspective of theory and simulations

Nesterova I., Кондратюк Н. Д., Будков Ю. А. и др., Advances in Colloid and Interface Science 2025 Vol. 346 Article 103623

Добавлено: 2 сентября 2025 г.

Effect of the Cut-Off Radius of the Interatomic Potential on the Surface Tension of n-Nonane in the SAFT-γ Mie Model

Smirnov O. M., Писарев В. В., Lenev D. Y., Russian Journal of Physical Chemistry A 2024 Vol. 98 No. 14 P. 3384–3388

Добавлено: 25 июня 2025 г.