• A
  • A
  • A
  • АБВ
  • АБВ
  • АБВ
  • A
  • A
  • A
  • A
  • A
Обычная версия сайта
  • RU
  • EN
  • Национальный исследовательский университет «Высшая школа экономики»
  • Публикации ВШЭ
  • Статьи
  • Оптимизация параллельного алгоритма подсистемы распределенного молекулярно-динамического моделирования
  • RU
  • EN
Расширенный поиск
Высшая школа экономики
Национальный исследовательский университет
Приоритетные направления
  • бизнес-информатика
  • государственное и муниципальное управление
  • гуманитарные науки
  • инженерные науки
  • компьютерно-математическое
  • математика
  • менеджмент
  • право
  • социология
  • экономика
по году
  • 2027
  • 2026
  • 2025
  • 2024
  • 2023
  • 2022
  • 2021
  • 2020
  • 2019
  • 2018
  • 2017
  • 2016
  • 2015
  • 2014
  • 2013
  • 2012
  • 2011
  • 2010
  • 2009
  • 2008
  • 2007
  • 2006
  • 2005
  • 2004
  • 2003
  • 2002
  • 2001
  • 2000
  • 1999
  • 1998
  • 1997
  • 1996
  • 1995
  • 1994
  • 1993
  • 1992
  • 1991
  • 1990
  • 1989
  • 1988
  • 1987
  • 1986
  • 1985
  • 1984
  • 1983
  • 1982
  • 1981
  • 1980
  • 1979
  • 1978
  • 1977
  • 1976
  • 1975
  • 1974
  • 1973
  • 1972
  • 1971
  • 1970
  • 1969
  • 1968
  • 1967
  • 1966
  • 1965
  • 1964
  • 1963
  • 1958
  • еще
Тематика
Новости
19 мая 2026 г.
Физики НИУ ВШЭ выяснили, что происходит внутри устойчивого вихря
В атмосфере и в океане часто наблюдаются крупные вихри с характерными спиральными рукавами. Физики из НИУ ВШЭ объяснили, как они формируются и почему сохраняют свою структуру. Оказалось, что скорости в точках, расположенных вдоль одной дуги вихря, остаются связанными даже на больших расстояниях. При этом в направлении от центра вихря эта связь быстро ослабевает. Такие различия помогают объяснить образование рукавов и могут улучшить модели атмосферных и океанических течений. Результаты опубликованы в Physical Review Fluids.
18 мая 2026 г.
В Вышке прошла XXX юбилейная научно-техническая конференция имени Е.В. Арменского
Организатором научного события выступает Московский институт электроники и математики им. А.Н. Тихонова ВШЭ. В этом году главный инженерный студенческий форум проходил 30-й раз и собрал рекордное число участников. Студенты, аспиранты и молодые специалисты из 50 вузов и организаций России представили научно-исследовательские доклады в ИТ-области. Отдельная секция была посвящена научно-исследовательским работам школьников.
15 мая 2026 г.
В НИУ ВШЭ разрабатывают нейросеть для сферы науки и инноваций
Исследователи НИУ ВШЭ учат большие языковые модели понимать русскоязычную научную терминологию, увеличивая при этом их энергоэффективность. Адаптированная модель работает в 2,7 раза быстрее и требует на 73% меньше памяти, чем исходная открытая модель, что позволяет запускать ее на более доступном оборудовании. Программа прошла государственную регистрацию.

 

Нашли опечатку?
Выделите её, нажмите Ctrl+Enter и отправьте нам уведомление. Спасибо за участие!

Публикации
  • Книги
  • Статьи
  • Главы в книгах
  • Препринты
  • Верификация публикаций
  • Расширенный поиск
  • Правила использования материалов
  • Наука в ВШЭ

?

Оптимизация параллельного алгоритма подсистемы распределенного молекулярно-динамического моделирования

Межотраслевая информационная служба. 2011. № 3. С. 3–11.
Воронова Л. И., Трунов А. С.

Одной из важнейших задач при разработке автоматизированных систем научных исследований (АСНИ) является обеспечение приемлемого быстродействия вычислительных машин и обеспечение их эффективной работы. В статье рассмотрен алгоритм, реализующий разделение задач между процессорами подсистемы распределенного молекулярно-динамического моделирования информационно-исследовательской системы "Шлаковые расплавы". Предложена методика оптимизации данного алгоритма, произведена оценка эффективности и расчет ускорения предложенного решения.

 

Приоритетные направления: менеджмент инженерные науки
Язык: русский
Ключевые слова: parallel algorithmshigh-performance computingautomated systems of scientific researchesmolecular-dynamicSlag Meltsпараллельный алгоритмвысокопроизводительные вычисленияавтоматизированные системы научных исследованиймолекулярная динамикашлаковые расплавы
Похожие публикации
Parallel Computational Technologies. PCT 2025
Springer, 2025.
Добавлено: 18 мая 2026 г.
Perovskite nanoparticles Cs4PbBr6 and CsPbBr3: synthesis, analysis and peculiar optical properties
Гущина В. А., / Series chemrxiv-2023-vpzhz-v2 "ChemRxiv". 2023.
Наночастицы полностью неорганических перовскитов CsPbBr3 и Cs4PbBr6 интенсивно изучаются благодаря их уникальным свойствам и широкому спектру применений; однако природа их оптических свойств до сих пор полностью не изучена из-за сложности синтеза однофазных наночастиц. В данной статье мы описываем особенности синтеза однофазных частиц и результаты их химического и фазового анализа. Используя данные о концентрациях наночастиц, мы ...
Добавлено: 14 мая 2026 г.
КВАНТОВО-ХИМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ МЕХАНИЗМА ЭКСТРАКЦИИ Fe(III) ИЗ СОЛЯНОКИСЛОГО ВОДНОГО РАСТВОРА ЭВТЕКТИЧЕСКИМИ РАСТВОРИТЕЛЯМИ НА ОСНОВЕ 1-ОКТАНОЛА
Мальцева В. Е., Ананьев И. В., Милевская А. В. и др., Теоретические основы химической технологии 2025 Т. 59 № 3 С. 13–22
Проведено квантово-химическое моделирование механизма экстракции Fe(III) из солянокислого раствора с использованием гидрофобных эвтектических растворителей на основе 1-октанола. Установлено, что путь реакции существенно различается в зависимости от того, является ли инертный компонент донором или акцептором водородной связи в димере с октанолом. На основе оценки прочности водородных связей показано, что более слабое взаимодействие между компонентами упрощает протекание ...
Добавлено: 13 мая 2026 г.
Ising models on the hydrogen peroxide and other lattices
Qin X., Deng Y., Щур Л. Н. и др., / Series arXiv "math". 2026. No. 2603.02962.
Добавлено: 20 апреля 2026 г.
Algorithmic overlaps as thermodynamic variables: from local to cluster Monte Carlo dynamics in critical phenomena
Пиле Я. Э., Deng Y., Щур Л. Н., / Series arXiv "math". 2026. No. 2604.10254.
Добавлено: 20 апреля 2026 г.
Parallel Processing and Applied Mathematics. 15th International Conference, PPAM 2024, Ostrava, Czech Republic, September 8–11, 2024, Revised Selected Papers, Part I
Springer, 2025.
Добавлено: 26 декабря 2025 г.
Compression-Induced Lattice Tilting Quenches Ion Migration at Metal Halide Perovskite Grain Boundaries: A Machine Learning Molecular Dynamics Study
Mikhail R. Samatov, Лю Д., Emir S. Amirov и др., The Journal of Physical Chemistry Letters 2025 Vol. 16 No. 51 P. 13068–13074
Добавлено: 20 декабря 2025 г.
Being Innovative or Being on the Safe Side - Managing the Risk of Failure
Майснер Д., Salati Marcondes de Moraes G. H., Brandão Fischer B. и др., / NRU Higher School of Economics. Series WP BRP "Science, Technology and Innovation". 2025. No. WP BRP /STI/2025.
Добавлено: 28 ноября 2025 г.
Assessing the Effects of Chemical Composition and Short-Range Ordering on the Tensile Deformation Behavior of Nanocrystalline High-Entropy Alloys Nb–Ta–Hf–Zr: A Combined Study on Molecular Dynamics and Monte Carlo Simulation
Babicheva R., Kumar A., Kiran R. и др., Metallurgical and Materials Transactions A: Physical Metallurgy and Materials Science 2025 Vol. 56 P. 5646–5663
В работе проводятся моделирования методами Монте-Карло (МК) и молекулярной динамики (МД) для исследования тугоплавких высокоэнтропийных сплавов (ВЭС) на основе системы Nb–Ta–Hf–Zr. В частности, в рамках комбинированного МК/МД-моделирования релаксации, имитирующей диффузионные процессы, исследуется влияние химического состава и структуры границ зёрен (ГЗ) на короткодальний порядок (КДП) в монокристаллических и нанокристаллических (НК) ВЭС. Кроме того, с помощью МД-моделирования ...
Добавлено: 27 ноября 2025 г.
Determining the boundary of dynamical chaos in the generalized Chirikov map via machine learning
Чернышов Д. П., Сатанин А. М., Щур Л. Н., / Series arXiv "math". 2025.
Добавлено: 21 ноября 2025 г.
Enabling the ‘Education Revolution’ through the Sustainability Mindset Principles
Cripps K., Иванова Е. А., Sridaran K. и др., / Series 0 "0". 2024.
Добавлено: 5 ноября 2025 г.
Immune Antibodies Recognizing the Stem Region of SARS-CoV-2 Spike Protein: Molecular Modelling and In Vitro Study of Synthetic Peptides Presentation to the Antibodies
Aliper E., Ryzhov I., Obukhova P. и др., Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes 2026 Vol. 1868 No. 1 Article 184472
Antibodies to peptide 1147 (amino acids 1147-61) of the SARS-CoV-2 protein S are highly diagnostic. Peptide 1147, although located in a region that is partly spatially hidden in the intact protein, is not subject to mutations, suggesting therapeutic potential. The aim of this study was to elucidate the architecture of this region and the way ...
Добавлено: 20 октября 2025 г.
"Информационные технологии и высокопроизводительные вычисления": Материалы VIII Международной научно-практической конференции, Хабаровск, 15-17 сентября 2025 г.
Хабаровск: Хабаровский Федеральный исследовательский центр, 2025.
В сборнике опубликованы результаты исследований, представленные на VIII Международной научно-практической конференции «Информационные технологии и высокопроизводительные вычисления». Материалы публикуются в авторской редакции. VIII Международная научно-практическая конференция «Информационные технологии и высокопроизводительные вычисления» была приурочена к объявленному в России Десятилетию науки и технологий и предстоящему 55-летию образования ДВНЦ АН СССР - ДВО РАН. Партнерами конференции выступили Правительство Хабаровского ...
Добавлено: 15 октября 2025 г.
Diverse Interactions of Sterols with Amyloid Precursor Protein Transmembrane Domain Can Shift Distribution Between Alternative Amyloid-β Production Cascades in Manner Dependent on Local Lipid Environment
Volynsky P., Urban A., Pavlov K. и др., International Journal of Molecular Sciences 2025 Vol. 26 No. 2 Article 553
Alzheimer’s disease (AD) pathogenesis is correlated with the membrane content of various lipid species, including cholesterol, whose interactions with amyloid precursor protein (APP) have been extensively explored. Amyloid-β peptides triggering AD are products of APP cleavage by secretases, which differ depending on the APP and secretase location relative to ordered or disordered membrane microdomains. We used high-resolution NMR to probe ...
Добавлено: 12 октября 2025 г.
Механические характеристики модели молекулярной динамики и полиномы Коробова
Устинов А. В., Гузев М. А., Дальневосточный математический журнал 2016 Т. 16 № 1 С. 39–43
Методы теории чисел использованы для точного вычисления статического поля напряжений в одномерной цепочке взаимодействующих гармонических осцилляторов. Для сумм, определяющих поле, получено представление через полиномы Коробова при произвольном числе осцилляторов и масштабе усреднения. ...
Добавлено: 9 октября 2025 г.
The role of surface material properties on the behavior of ionic liquids in nanoconfinement: A critical review and perspective of theory and simulations
Nesterova I., Кондратюк Н. Д., Будков Ю. А. и др., Advances in Colloid and Interface Science 2025 Vol. 346 Article 103623
Добавлено: 2 сентября 2025 г.
Интеллектуальное прогнозирование времени выполнения вычислительных задач GROMACS для оптимизации работы планировщика задач суперкомпьютера «cHARISMa» НИУ ВШЭ
Саликова М. Т., Костенецкий П. С., Мишенин Р. М., В кн.: Параллельные вычислительные технологии – XIX всероссийская научная конференция с международным участием, ПаВТ’2025, г. Москва, 8–10 апреля 2025 г. Короткие статьи и описания плакатов.: Челябинск: Издательский центр ЮУрГУ, 2025. С. 331–331.
Современные суперкомпьютеры являются незаменимыми инструментами для решения сложных научных и промышленных задач. Эффективное планирование потока вычислительных задач суперкомпьютера требует информации о времени, за которое может завершится каждая из ожидающих запуска задач. Нередко пользователи устанавливают задаче временной лимит с большим запасом, что снижает эффективность работы планировщика. Разработка метода предсказания времени выполнения задач Gromacs на суперкомпьютере позволит ...
Добавлено: 28 мая 2025 г.
Разработка подсистемы динамического изменения приоритета задач в очереди суперкомпьютера
Рыбаков Г. С., Костенецкий П. С., В кн.: Параллельные вычислительные технологии – XIX всероссийская научная конференция с международным участием, ПаВТ’2025, г. Москва, 8–10 апреля 2025 г. Короткие статьи и описания плакатов.: Челябинск: Издательский центр ЮУрГУ, 2025. С. 329–329.
С ростом числа задач в различных областях науки, требующих высокопроизводительных вычислений, правильное распределение приоритетов задач и квот пользователей стало одним из важнейших факторов, влияющих на эффективную работу суперкомпьютерных центров. На суперкомпьютере НИУ ВШЭ «cHARISMa» настроено множество дополняющих друг друга алгоритмов планирования потока задач, а также ограничений, таких как проектные лимиты и пользовательские квоты. Алгоритмы и ...
Добавлено: 28 мая 2025 г.
Анализ и визуализация данных в системе мониторинга эффективности задач НРС TaskMaster суперкомпьютерного комплекса
Мазаев И. А., Костенецкий П. С., В кн.: Параллельные вычислительные технологии – XIX всероссийская научная конференция с международным участием, ПаВТ’2025, г. Москва, 8–10 апреля 2025 г. Короткие статьи и описания плакатов.: Челябинск: Издательский центр ЮУрГУ, 2025. С. 321–321.
Данная работа посвящена созданию подсистемы визуализации данных о вычислительных задачах пользователей для системы HPC TaskMaster [1], разработанной Отделом суперкомпьютерного моделирования НИУ ВШЭ для суперкомпьютера cHARISMa. Основная цель этой подсистемы – предоставить пользователям и администраторам удобный инструмент для исследования большого массива данных о задачах. В качестве платформы визуализации выбрана система Grafana, уже используемая для мониторинга нагрузки ...
Добавлено: 28 мая 2025 г.
Моделирование потока задач вычислительного кластера НИУ ВШЭ с использованием SLURM Simulator
Мишенин Р. М., Костенецкий П. С., В кн.: Параллельные вычислительные технологии – XIX всероссийская научная конференция с международным участием, ПаВТ’2025, г. Москва, 8–10 апреля 2025 г. Короткие статьи и описания плакатов.: Челябинск: Издательский центр ЮУрГУ, 2025. С. 324–324.
Задача эффективного распределения ресурсов вычислительной системы широко известна. Она становится критически важной в многопользовательских многопроцессорных системах, таких как суперкомпьютеры. В НИУ ВШЭ функционирует высокопроизводительный вычислительный кластер «cHARISMa», состоящий из 48 вычислительных узлов шести типов. Основными характеристиками узлов являются наличие графических ускорителей и их модели, типы центральных процессоров и объем оперативной памяти. На суперкомпьютере используется планировщик задач ...
Добавлено: 28 мая 2025 г.
Causal Estimands for Policy Evaluation and Beyond
Соколов Б. О., / Series OSF "SocArXiv". 2025.
This paper reviews various estimands used in modern scientific and applied research to operationalize causal inquiries within the Rubin Causal Model framework. I first introduce the most widely utilized average treatment effects, such as ATE, ATT, and ATC. I then describe their popular extensions, including those targeting local and conditional treatment effects; causal interactions and mediation; effects ...
Добавлено: 6 мая 2025 г.
Supercomputing. 10th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2024, Moscow, Russia, September 23–24, 2024, Revised Selected Papers, Part I
Springer, 2025.
Добавлено: 21 февраля 2025 г.
Supercomputing. 10th Russian Supercomputing Days, RuSCDays 2024, Moscow, Russia, September 23–24, 2024, Revised Selected Papers, Part II
Springer, 2025.
Добавлено: 21 февраля 2025 г.
Cultural characteristics of Digital Ecosystem Product Teams and Operational Efficiency
Ованесова Ю. С., Мошиашвили М. М., Типсина Н. О., / Series "Working Papers". 2021.
Цель данной статьи - анализ и оценка культурных характеристик лидеров продуктовых команд цифровой экосистемы с точки зрения операционной эффективности. Используя модели бинарного выбора (основные выводы были сделаны на основе логит-регрессий), была обнаружена отрицательная взаимосвязь между вероятностью достижения бизнес-целей командой и отношением лидера к дистанции власти и неопределенности. Дистанция власти и неприятие неопределенности также влияют на ...
Добавлено: 17 февраля 2025 г.
  • О ВЫШКЕ
  • Цифры и факты
  • Руководство и структура
  • Устойчивое развитие в НИУ ВШЭ
  • Преподаватели и сотрудники
  • Корпуса и общежития
  • Закупки
  • Обращения граждан в НИУ ВШЭ
  • Фонд целевого капитала
  • Противодействие коррупции
  • Сведения о доходах, расходах, об имуществе и обязательствах имущественного характера
  • Сведения об образовательной организации
  • Людям с ограниченными возможностями здоровья
  • Единая платежная страница
  • Работа в Вышке
  • ОБРАЗОВАНИЕ
  • Лицей
  • Довузовская подготовка
  • Олимпиады
  • Прием в бакалавриат
  • Вышка+
  • Прием в магистратуру
  • Аспирантура
  • Дополнительное образование
  • Центр развития карьеры
  • Бизнес-инкубатор ВШЭ
  • Образовательные партнерства
  • Обратная связь и взаимодействие с получателями услуг
  • НАУКА
  • Научные подразделения
  • Исследовательские проекты
  • Мониторинги
  • Диссертационные советы
  • Защиты диссертаций
  • Академическое развитие
  • Конкурсы и гранты
  • Внешние научно-информационные ресурсы
  • РЕСУРСЫ
  • Библиотека
  • Издательский дом ВШЭ
  • Книжный магазин «БукВышка»
  • Типография
  • Медиацентр
  • Журналы ВШЭ
  • Публикации
  • http://www.minobrnauki.gov.ru/
    Министерство науки и высшего образования РФ
  • https://edu.gov.ru/
    Министерство просвещения РФ
  • http://www.edu.ru
    Федеральный портал «Российское образование»
  • https://elearning.hse.ru/mooc
    Массовые открытые онлайн-курсы
  • НИУ ВШЭ1993–2026
  • Адреса и контакты
  • Условия использования материалов
  • Политика конфиденциальности
  • Правила применения рекомендательных технологий в НИУ ВШЭ
  • Карта сайта
Редактору