Спирин Сергей Александрович
- Доцент:Факультет компьютерных наук / Департамент больших данных и информационного поиска / Базовая кафедра Института проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН
- Начал работать в НИУ ВШЭ в 2018 году.
- Научно-педагогический стаж: 38 лет.
Образование, учёные степени
- 2001Кандидат физико-математических наук
- 1985
Специалитет: Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, специальность «Математика», квалификация «Специалист»
Учебные курсы (2023/2024 уч. год)
- Алгоритмы в биоинформатике (Маго-лего; 4 модуль)Рус
- Алгоритмы в биоинформатике (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 4 модуль)Рус
- Прикладная статистика (Маго-лего; 3 модуль)Рус
- Прикладная статистика (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 3 модуль)Рус
- Семинар наставника "Исследование медико-биологических данных" (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 2-й курс, 1-3 модуль)Рус
- Архив учебных курсов
Учебные курсы (2022/2023 уч. год)
- Алгоритмы в биоинформатике (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 4 модуль)Рус
- Scientific and Research Seminar ''Computational Phylogenetics'' (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 2-й курс, 1, 2 модуль)Анг
- Прикладная статистика (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 3 модуль)Рус
- Прикладная статистика (Маго-лего; 3 модуль)Рус
Учебные курсы (2021/2022 уч. год)
- Научно-исследовательский семинар "Вычислительная филогенетика" (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 2-й курс, 1, 2 модуль)Рус
- Прикладная статистика (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 2, 3 модуль)Рус
- Современные методы принятия решений: Алгоритмы в биоинформатике (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 3, 4 модуль)Рус
Учебные курсы (2020/2021 уч. год)
- Научно-исследовательский семинар "Вычислительная филогенетика" (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 2-й курс, 1, 2 модуль)Рус
- Прикладная статистика (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 2, 3 модуль)Рус
- Современные методы принятия решений: Алгоритмы в биоинформатике (Магистратура; где читается: Факультет компьютерных наук; 1-й курс, 3, 4 модуль)Рус
Публикации8
- Статья Spirin S., Sigorskikh A. I., Efremov A., Penzar D., Karyagina A. S. PhyloBench: A Benchmark for Evaluating Phylogenetic Programs // Molecular Biology and Evolution. 2024. Vol. 41. No. 6. Article msae084. doi
- Статья Kassian A. S., Starostin G., Zhivlov M., Sergey A. Spirin. Calibrated weighted permutation test detects ancient language connections in the Circumpolar area (Chukotian-Nivkh and Yukaghir-Samoyedic) // Journal of Historical Linguistics. 2023. Article 1. doi
- Статья Фокина А. С., Карягина А. С., Русинов И. С., Мошенский Д. М., С. А. Спирин, Алексеевский А. В. Эволюция систем рестрикции-модификации, содержащих одну эндонуклеазу рестрикции и две ДНК-метилтрансферазы. // Биохимия. 2023. Т. 88. № 2. С. 285-294. doi
- Статья Сигорских А. И., Латорцева Д. Д., Карягина А. С., С.А. Спирин Насколько часто фильтрация колонок выравнивания улучшает реконструкцию филогении двухдоменных белков? // Биохимия. 2022. Т. 87. № 12. С. 2078-2088. doi
- Статья Poverennaya I. V., Potapova N. A., Spirin Sergey. Is there any intron sliding in mammals? // BMC Evolutionary Biology. 2020. Vol. 20. Article 164. doi
- Статья Rusinov I. S., Ershova A. S., Karyagina A. S., Spirin S., Alexeevski A. V. Avoidance of recognition sites of restriction-modification systems is a widespread but not universal anti-restriction strategy of prokaryotic viruses // BMC Genomics. 2018. Vol. 19. No. 885. P. 1-11. doi
- Статья Penzar D., Krivozubov M., Spirin S. PQ, a new program for phylogeny reconstruction // BMC Bioinformatics. 2018. Vol. 19. No. 374. P. 1-14. doi
- Статья Ершова А. С., Русинов И. С., Карягина А. С., Спирин С. А., Алексеевский А. В. СРАВНЕНИЕ МЕТОДОВ ОБНАРУЖЕНИЯ ИСКЛЮЧИТЕЛЬНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ В ГЕНОМАХ ПРОКАРИОТ // Биохимия. 2018. Т. 83. № 2. С. 225-237. doi
Опыт работы
Ведущий научный сотрудник НИИ физико-химической биологии им. А.Н.Белозерского МГУ им. М.В.Ломоносова
Информация*
- Общий стаж: 45 лет
- Научно-педагогический стаж: 38 лет
- Преподавательский стаж: 9 лет
Данные выводятся в соответствии с требованиями приказа N 831 от 14 августа 2020 г. Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки
Школа-конференция "Информационные технологии и системы" 2019
Сотрудники лаборатории - участники конференции
Московская конференция по вычислительной молекулярной биологии 2019 (Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB))
Сотрудники лаборатории - участники конференции
Состоялась школа-конференция “Информационные технологии и системы. Биоинформатика”
С 7 по 10 марта в учебном центре Вороново прошла межвузовская студенческая научная школа-конференция “Информационные технологии и системы. Биоинформатика”, организатором которой стал факультет компьютерных наук.