?
PQ, a new program for phylogeny reconstruction
BMC Bioinformatics. 2018. Vol. 19. No. 374. P. 1-14.
Приоритетные направления:
компьютерно-математическое
Язык:
английский
Ключевые слова: алгоритмalgorithmОткрытое программное обеспечениеFree and open source softwareвеб-интерфейсweb interfacePhylogenetic inferenceProtein evolutionРеконструкция филогенииЭволюция белков
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Сироткин А. В., Информатика и автоматизация (Труды СПИИРАН) 2013 № 25 С. 204-220
В статье рассматриваются ключевые элементы програмной реализации фрагмента знаний алгебраической байесовской сети на языке С++. Фрагмент знаний реализован в виде отдельношо класса, обеспечивающего хранение оценок истинности и имеющего ряд методов реализующих алгоритмы обработки фрагмента знаний, таких как поддержания непротиворечивости и апостериорный вывод ...
Добавлено: 24 марта 2014 г.
Bliznets Ivan, Fomin F., Pilipczuk M. и др., Algorithmica 2016 Vol. 76 No. 2 P. 569-594
Добавлено: 26 октября 2018 г.
Викентьева О. Л., Полякова О. А., Пермь : Издательство Пермского национального исследовательского политехнического университета, 2019
В учебном пособии рассмотрены вопросы применения основных принципов структурного программирования в сложных программных системах на языке высокого уровня С++, которые демонстрируются на содержательных примерах. ...
Добавлено: 16 сентября 2020 г.
Силаков Д. В., Системный администратор 2017 № 1-2 С. 32-35
В статье мы рассмотрим Virtuozzo Automator – инструментарий, позволяющий контролировать как серверы Virtuozzo, так и развернутые на них виртуальные окружения с помощью веб-браузера. ...
Добавлено: 17 августа 2017 г.
Викентьева О. Л., Дерябин А. И., Шестакова Л. В., International Journal "Information Models and Analyses" 2014 Vol. 3 No. 3 P. 271-279
Changes of professional environment, caused by introduction of new technologies and techniques, create a necessity in continuous education and development of professional competences. In these conditions, managers and other company employees face the choice of methods and tools of personnel training. A business game is one of the most productive tools of business-education This paper ...
Добавлено: 19 августа 2014 г.
Богданов Д. С., Дали Ф. А., Миронкин В. О., Современные информационные технологии и ИТ-образование 2018 Т. 14 № 2 С. 419-425
Классические подходы к построению режимов работы хэш-функций, основанные на использовании итеративных процедур, не позволяют обеспечить эффективную обработку больших объемов данных и не могут быть адаптированы к параллельным вычислительным архитектурам. Это касается как российского криптографического стандарта ГОСТ Р 34.11-2012, определяющего алгоритм и процедуру вычисления хэш-функции, так и многих других зарубежных стандартов (например, SHA-3). Отсутствие действующих стандартов ...
Добавлено: 8 ноября 2018 г.
Силаков Д. В., Системный администратор 2017 № 4 С. 18-23
Virtuozzo Automator, предоставляющий веб-интерфейс для управления парком машин, рассчитан в первую очередь на обслуживающих эти машины системных администраторов, но что если необходимо предоставить пользователям возможность управлять своими контейнерами и ВМ через веб?
в линейку Virtuozzo 7 включен отдельный продукт, ориентированный исключительно на пользователей – Virtuozzo PowerPanel (сокращенно PP). Именно его мы и рассмотрим в данной статье. ...
Добавлено: 17 августа 2017 г.
Bliznets Ivan, Fomin F., Golovach P. и др., Algorithmica 2017 Vol. 79 No. 3 P. 798-813
Добавлено: 29 октября 2018 г.
Миронкин В. О., Тимохин И. С., Обозрение прикладной и промышленной математики 2018 Т. 25 № 2 С. 103-112
В статье рассмотрены режимы распараллеливания процесса вычисления хэш-кода и передачи данных, основанные на l-арных деревьях. Проведен сравнительный анализ их реализаций на языке программирования Python, и описаны некоторые функциональные особенности. Предложены перспективные направления в области синтеза древовидных режимов работы хэш-функций. ...
Добавлено: 25 января 2019 г.
Дали Ф. А., Миронкин В. О., Проблемы информационной безопасности. Компьютерные системы 2018 № 1 С. 113-121
В статье предложены две модели древовидных режимов работы хэш-функций. Для каждой модели построены алгоритмы вычисления хэш-кода и найдены их численные характеристики. В терминах соответствующих моделей классифицирован ряд действующих алгоритмов параллельного хэширования, а также выявлены некоторые присущие им слабости. ...
Добавлено: 28 мая 2018 г.
Анисимов В. Г., Анисимов Е. Г., Гарькушев А. Ю. и др., Известия Российской академии ракетных и артиллерийских наук 2015 № 4 С. 34-39
Предложены модель и метод решения задачи формирования оптимального плана выполнения комплекса взаимосвязанных мероприятий в интересах подготовки космических систем. Предложенная модель учитывает ограниченность, разнообразие, взаимозаменяемость, производительность и стоимость возобновляемых ресурсов (исполнителей), привлекаемых в процессе подготовки. Она обеспечивает минимизацию времени выполнения комплекса взаимосвязанных мероприятий. Алгоритм основан на общих идеях метода ветвей и границ. ...
Добавлено: 28 февраля 2016 г.
Доморацкий Е. П., Информационные технологии 2016 Т. 22 № 8 С. 605-609
Рассмотрен алгоритм синтеза геометрических характеристик одномерных и двумерных проекционных изображений выпуклых трехмерных объектов неправильной формы, аппроксимируемых эллипсоидом общего вида. Алгоритм содержит математические модели последовательности операций (процедур) получения проекционных изображений, их морфологического анализа (получения базовых геометрических признаков) и получения численных значений пространственных геометрических характеристик проекционных изображений. ...
Добавлено: 16 октября 2017 г.
Алескеров Ф. Т., Vyacheslav V. Chistyakov, Procedia Computer Science 2013 Vol. 17 P. 1103-1106
Изучается задача аксиоматических и алгоритмических конструкций порогового правила принятия решений в случае, когда индивидуальные предпочтения выражаются как m-градационные строгие предпочтения при m ≥ 3. Показано, что единственным правилом, удовлетворяющим введенным аксиомам, является пороговое правило. Представлено два явных алгоритма: упорядочивающий алгоритм, при котором векторные оценки альтернатив последовательно выписываются, и функция перечисления, соответствующая естественному слабому порядку следования классов ...
Добавлено: 29 августа 2013 г.
Голяев Ю. Д., Житенев О. С., Иванов М. А. и др., Качество. Инновации. Образование 2015 № 10 С. 39-53
Рассмотрены вопросы построения программного обеспечения для инерциального измерительного блока на зеемановских лазерных гироскопах, работающих в квазичетырехчастотном режиме, и кварцевых акселерометрах. Описаны математические алгоритмы, обеспечивающие полную компенсацию как магнитной, так и немагнитной составляющих дрейфа лазерного гироскопа, и алгоритмы компенсации ошибок акселерометров с периодической калибровкой АЦП. ...
Добавлено: 25 января 2016 г.
Трубочкина Н. К., Кондратьев Н. В., Мир техники кино 2015 Т. 37 № 3 С. 6-16
Предложен новый подход в развитии трёхмерного кино без очков, а точнее, методика создания с помощью математики и компьютерных программ фантастических графических сред и миров, основы для последующей кодировки под линзовый растр. Предложена модель расчёта параметрических фракталов, учитывающая положение виртуальных камер для получения наборов ракурсов фрактального изображения, создания параллакспанорамограмм и демонстрации полученных стереоскопических изображений фрактальных объектов. ...
Добавлено: 23 октября 2015 г.
Гнатенко А. Р., Захаров В. А., Proceedings of the Institute for System Programming of the RAS 2018 Vol. 30 No. 3 P. 303-324
Добавлено: 14 июня 2018 г.
Nurk S., Bankevich A., Antipov D. и др., Journal of Computational Biology 2013 Vol. 20 No. 10 P. 714-737
Добавлено: 21 марта 2014 г.
Нольде Д. Е., Крылов Н. А., Телегин П. Н. и др., Труды НИИСИ РАН 2018 Т. 7 № 4 С. 157-161
На примере программного пакета Gromacs проведено исследование скорости расчета
классической молекулярной динамики на различных компьютерных системах: настольных компьютерах,
кластеров на основе процессоров x86_64, многоядерных процессоров архитектуры MIC, а также
гетерогенных систем с использованием «игровых» видеокарт или графических ускорителей. Рассмотрен
вопрос выбора оптимальной платформы для проведения расчетов молекулярной динамики. ...
Добавлено: 10 февраля 2020 г.
Добавлено: 15 октября 2018 г.
Verfaillie A., Светличный Д. В., Imrichova H. и др., Genome Research 2016
Добавлено: 22 октября 2018 г.
Красноярск : ИВМ СО РАН, 2013
Труды Пятой Международной конференции «Системный анализ и информационные технологии» САИТ-2013 (19–25 сентября 2013 г., г.Красноярск, Россия): ...
Добавлено: 18 ноября 2013 г.
В статье представлена технология, позволяющая собирать в полевых исследованиях пространственно локализованные данные об объектах городской среды. Технология основана на автоматической привязке фотографий к пространственным координатам. Приведен план полевых и камеральных мероприятий, предложены варианты ГИС-обработки собираемых таким образом данных. В качестве примера приведены данные об использовании белорусского языка в общественном пространстве городов Белоруссии. ...
Добавлено: 12 апреля 2015 г.
M. : HSE, 2013
Human reasoning uses to distinguish things that do change and things do not. The latter are commonly expressed in the reasoning as objects, which may represent classes or instances, and classes being further divided into concept types and relation types. These became the main issue of knowledge engineering and have been well tractable by computer. ...
Добавлено: 27 октября 2013 г.
Dubois J., Poupon C., Thirion B. и др., Cerebral Cortex 2015 Vol. 26 No. 5 P. 2283-2298
Linguistic processing is based on a close collaboration between temporal and frontal regions connected by two pathways: the “dorsal” and “ventral pathways” (assumed to support phonological and semantic processing, respectively, in adults). We investigated here the development of these pathways at the onset of language acquisition, during the first post-natal weeks, using cross-sectional diffusion imaging ...
Добавлено: 22 октября 2015 г.