• A
  • A
  • A
  • АБB
  • АБB
  • АБB
  • А
  • А
  • А
  • А
  • А
Обычная версия сайта

Статья

Выбор функции плотности вероятности распределения экспрессии генов при обработке данных в методе RNA-Seq

Информационные процессы. 2013. Т. 13. № 2. С. 118-123.
Андрианов Г. А., Кременецкая О. С.

В настоящий момент для выравнивания гистограммы распределения ридов, полученных в результате обработки транскриптомов различных особей, предлагают использовать отрицательное биномиальное распределение. В данной работе проанализировано “физическое” обоснование возникновения уширения пуассоновского распределения и сделан вывод, что истинный вид распределения есть действительно сложное распределение Пуассона (частным случаем которого является отрицательное биномиальное распределение), однако представляет собой другой частный случай данного распределения — случай n-кратной (n — случайная величина с распределением Пуассона) свертки случайных величин с экспоненциальным распределением, а не логарифмически распределенных случайных величин. Показано, что распределение интенсивности экспрессии генов у группы лиц, вычисленное по опубликованным данных, лучше описывается сверткой с экспоненциальным ядром.