?
Tissue-specific impact of stem-loops and quadruplexes on cancer breakpoints formation
BMC Cancer. 2019. Vol. 19. No. 434. P. 1-17.
Приоритетные направления:
компьютерно-математическое
Язык:
английский
Ключевые слова: cancerstem-loopsquadruplexesmachine-learning methodsG-quadruplexescancer breakpoints
ПУБЛИКАЦИЯ ПОДГОТОВЛЕНА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПРОЕКТА:
Челошкина К. С., Bzhikhatlov I., Попцова М. С., Journal of Computational Biology 2021 Vol. 28 No. 7 P. 716-731
Cancer genomes are susceptible to multiple rearrangements by deleting, inserting, and translocating genomic regions. Recently, the problem of finding determinants of breakpoint formations was approached with machine learning methods; however, unlike cancer point mutations, breakpoint prediction appeared to be a more difficult task, and various machine learning models did not achieve high prediction power often ...
Добавлено: 10 сентября 2021 г.
Челошкина К. С., Попцова М. С., , in : Сборник трудов 42-й междисциплинарной школы-конференции ИППИ РАН "Информационные технологии и системы 2018". : Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича РАН, 2018. P. 1-5.
With the advances in the sequencing technology the International Cancer Genome Consortium (ICGC) [1] and The Cancer Genome Atlas (TCGA) [2] collected data on more than 16 000 genome-wide pairs tumor-normal tissue providing a valuable resource to study cancer mutations. In this research we focus on pre- evaluation of the relationship between cancer breakpoint hotspots ...
Добавлено: 15 января 2019 г.
Springer, 2020
Добавлено: 7 октября 2020 г.
Добавлено: 15 октября 2018 г.
Нольде Д. Е., Крылов Н. А., Телегин П. Н. и др., Труды НИИСИ РАН 2018 Т. 7 № 4 С. 157-161
На примере программного пакета Gromacs проведено исследование скорости расчета
классической молекулярной динамики на различных компьютерных системах: настольных компьютерах,
кластеров на основе процессоров x86_64, многоядерных процессоров архитектуры MIC, а также
гетерогенных систем с использованием «игровых» видеокарт или графических ускорителей. Рассмотрен
вопрос выбора оптимальной платформы для проведения расчетов молекулярной динамики. ...
Добавлено: 10 февраля 2020 г.
Nurk S., Bankevich A., Antipov D. и др., Journal of Computational Biology 2013 Vol. 20 No. 10 P. 714-737
Добавлено: 21 марта 2014 г.
Ижевск : Ижевский институт компьютерных исследований, 2017
Процессы трансформации энергии и регуляции этих процессов при изменении характеристик внешней и внутренней среды лежат в основе устойчивого существования всех живых систем. Монография содержит главы, посвященные физико-химическим механизмам регуляции процессов на молекулярном, субклеточном и клеточном уровнях. В книге описаны результаты последних достижений отечественной науки в области фолдинга белка (Финкельштейн и др.), молекулярных основ взаимодействия белков ...
Добавлено: 14 ноября 2017 г.
Боброва Е. В., Решетникова В. В., Волкова К. В. и др., Журнал высшей нервной деятельности им. И.П. Павлова 2017 Т. 67 № 4 С. 485-492
Исследовали обучение управлению системой “Интерфейс мозг-компьютер” (ИМК) с помощью специально разработанного тренинга. Тренинг включал осуществление медленных циклических движений правой и левой рукой (длительность каждого движения соответствовала длительности представлений движений руки при работе с ИМК), представление этих движений, а также спокойное сидение до начала движений. До проведения тренинга и после него осуществлялось управление ИМК. По тесту ...
Добавлено: 20 октября 2017 г.
Рябенко Е.А., Математическая биология и биоинформатика 2012 Т. 7 № 2 С. 554-566
Рассматривается нелинейная модель данных ДНК-микрочипов, в которой интенсивность флуоресценции проб описывается функцией Лэнгмюра. Разработан метод настройки параметров модели на основе общедоступных данных нескольких тысяч экспериментов, основанный на минимизации функции потерь из класса AB-дивергенций; для выбора оптимальных значений гиперпараметров проведены численные эксперименты. Полученная модель описывает интенсивности флуоресценции проб микрочипа точнее стандартной линейной, а полученные на её ...
Добавлено: 14 октября 2016 г.
Сорокин К. С., Айзенберг А. А., Анохин К. В. и др., / Cornell University. Series Computer Science "arxiv.org". 2022.
Добавлено: 17 ноября 2022 г.
Herbert A., Fedorov A., Попцова М. С., International Journal of Molecular Sciences 2022 Vol. 23 No. 6 Article 3079
Добавлено: 31 октября 2022 г.
Красноярск : ИВМ СО РАН, 2013
Труды Пятой Международной конференции «Системный анализ и информационные технологии» САИТ-2013 (19–25 сентября 2013 г., г.Красноярск, Россия): ...
Добавлено: 18 ноября 2013 г.
В статье представлена технология, позволяющая собирать в полевых исследованиях пространственно локализованные данные об объектах городской среды. Технология основана на автоматической привязке фотографий к пространственным координатам. Приведен план полевых и камеральных мероприятий, предложены варианты ГИС-обработки собираемых таким образом данных. В качестве примера приведены данные об использовании белорусского языка в общественном пространстве городов Белоруссии. ...
Добавлено: 12 апреля 2015 г.
Polykovskiy D., Zhebrak A., Sanchez-Lengeling B. и др., Frontiers in Pharmacology 2020 Vol. 11 P. 1-10
Добавлено: 21 апреля 2021 г.
Кертес-Фаркаш А., Noble W., Journal or Proteome Research 2015 Vol. 14 No. 8 P. 3027-3038
Добавлено: 25 сентября 2015 г.
Байдин Г. С., Титов А. С., Биомедицинская радиоэлектроника 2020 Т. 23 № 5 С. 59-71
Постановка проблемы. С ростом сложности исследования химических соединений в различных средах и усложнением обработки результатов экспериментов возникает необходимость в автоматизации данного процесса для улучшения точ-ности и достоверности полученных результатов. Цель работы – разработка методики для автоматизированного подсчета количества частиц в веществе на изображениях электронного микроскопа. Результаты. Разработана методика автоматизированного подсчета количества частиц в веществе на изображениях электронного ...
Добавлено: 5 сентября 2021 г.
Коротаев А. В., Вестник Института экономики Российской академии наук 2015 № 1 С. 149-162
В XIX в. произошел скачкообразный рост разрыва по ВВП на душу населения и уровню жизни населения между «первым» и «третьим» миром, получивший в начале 2000-х годов название «Великая дивергенция». В XX в. Великая дивергенция продолжалась вплоть до начала 1970-х годов, а затем, в конце 1980-х годов на смену ей пришла Вели- кая конвергенция, когда темпы ...
Добавлено: 3 декабря 2015 г.
М. : Издательский дом "Типография" Россельхозакадемии, 2014
Настоящий сборник подготовлен по материалам всероссийской научной конференции «Математика, информатика, естествознание в экономике и обществе» (МИЕСЭКО 2014), проведенной по инициативе Московского финансово-юридического университета МФЮА 31 января 2014 года. В сборнике представлены доклады по различным проблемам математики, информатики, есте- ствознания, экономики и других дисциплин. ...
Добавлено: 7 февраля 2014 г.
Нерсисян С. А., Галатенко А. В., Галатенко В. В. и др., Plos One 2021 Vol. 16 No. 4 Article e0249424
Добавлено: 10 мая 2021 г.
Здоровье всегда являлось весомым капиталом человека, а грамотное распоряжением им всегда приносило ощутимые инвестиции. В современном мире с его темпами, задачами и вызовами у большинства людей все меньше времени остается на сохранение, поддержание и тем более укрепление здоровья. Но на возникающий запрос, формируется решение, продиктованное самим обществом, а именно, его цифровым отражением. Оцифровка общественной и ...
Добавлено: 15 мая 2023 г.
[б.и.], 2019
. ...
Добавлено: 15 января 2020 г.
Rusinov I. S., Ershova A. S., Karyagina A. S. и др., BMC Genomics 2018 Vol. 19 No. 885 P. 1-11
Добавлено: 20 декабря 2018 г.
M. : HSE, 2013
Human reasoning uses to distinguish things that do change and things do not. The latter are commonly expressed in the reasoning as objects, which may represent classes or instances, and classes being further divided into concept types and relation types. These became the main issue of knowledge engineering and have been well tractable by computer. ...
Добавлено: 27 октября 2013 г.
Карпычев В. В., Balatskaya A., Utyashev N. и др., Frontiers in Human Neuroscience 2022 No. 16 Article 984306
Добавлено: 1 октября 2022 г.